Methods to evaluate protein binding

Methods to evaluate protein binding to
nanoparticles
Many methods are commonly used to study nanoparticle-protein
interactions, several of which have already been mentioned in
the sections above, such as FTIR, CD spectroscopy, ITC, SPR, mass
spectrometry, and fluorescence spectroscopy2,13,15,16,18,31.
We have recently reported the use of size-exclusion
chromatography to study nanoparticle-protein interactions, with
specific emphasis on the determination of the residence times of
proteins on nanoparticles in order to identify those proteins that
may be relevant on the biological timescale2. This method is based
on the fact that nanoparticles are too big to enter the pores of the
size-exclusion matrix, and thus pass through the column in the void
volume, whereas proteins are small enough to enter the pores, and the
time they spend inside the pores depends on their molecular weight.
Thus, each protein elutes with a characteristic volume. However,
in the presence of nanoparticles, the elution volume of proteins is
shifted toward earlier elution times depending on the duration of
the interaction between the protein and the nanoparticle – that is the protein hitches a ride through the column on the nanoparticle,
and thus the nanoparticle-associated proteins are separated from the
nonassociated proteins (Fig. 3). Using this technique, we have been
able to identify those proteins that bind, as well as their association
times2.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

วิธีการประเมินรวมโปรตีนเพื่อเก็บกักโดยทั่วไปใช้วิธีในการศึกษาโปรตีน nanoparticleการโต้ตอบ การต่าง ๆ ที่มีได้กล่าวแล้วในส่วนด้านบน เช่น FTIR กซีดี ซี คอฟฟี่ช็อป/, มวลspectrometry และ fluorescence spectroscopy2, 13, 15, 16, 18, 31เราเพิ่งมีรายงานการใช้แยกขนาดchromatography เรียนโต้ตอบ nanoparticle โปรตีนเน้นเฉพาะกำหนดเวลาเรสซิเดนซ์โปรตีนในการเก็บกักเพื่อระบุโปรตีนเหล่านั้นที่อาจเกี่ยวข้องใน timescale2 ชีวภาพ วิธีการนี้อยู่ในความเป็นจริงเก็บกักขนาดใหญ่เกินไปใส่รูขุมขนของแยกขนาดของเมตริกซ์ และผ่านคอลัมน์โมฆะดังนั้นปริมาตร ใน ขณะที่โปรตีนมีขนาดเล็กพอที่จะใส่รูขุมขน และเวลาภายในรูขุมขนขึ้นอยู่กับน้ำหนักโมเลกุลของดังนั้น โปรตีนแต่ละ elutes ด้วยลักษณะ อย่างไรก็ตามในต่อหน้าของเก็บกัก ปริมาตร elution ของโปรตีนคือเปลี่ยนไปก่อนหน้า elution ครั้งขึ้นอยู่กับระยะเวลาของปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนและ nanoparticle – ที่โปรตีน hitches ขี่คอลัมน์บน nanoparticleและดังนั้น แยกโปรตีน nanoparticle ที่เกี่ยวข้องจากการnonassociated โปรตีน (Fig. 3) การใช้เทคนิคนี้ เราได้รับสามารถระบุโปรตีนเหล่านั้นผูก และความสัมพันธ์ของพวกเขาtimes2

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

วิธีการในการประเมินโปรตีนผูกพันกับอนุภาคนาโนหลายวิธีที่นิยมใช้ในการศึกษาอนุภาคนาโนโปรตีนปฏิสัมพันธ์หลายแห่งที่ได้รับการกล่าวถึงในส่วนดังกล่าวข้างต้นเช่นFTIR, สเปกโทรสโกซีดี, ITC, SPR มวลspectrometry และ spectroscopy2,13 เรืองแสง , 15,16,18,31. เราได้รายงานเมื่อเร็ว ๆ นี้การใช้ขนาดยกเว้นโคเพื่อศึกษาปฏิสัมพันธ์อนุภาคนาโนโปรตีนที่มีความสำคัญที่เฉพาะเจาะจงในการกำหนดเวลาที่พำนักของโปรตีนในอนุภาคนาโนเพื่อที่จะระบุโปรตีนเหล่านั้นที่อาจจะที่เกี่ยวข้องใน timescale2 ทางชีวภาพ วิธีการนี้จะขึ้นอยู่กับความจริงที่ว่าอนุภาคนาโนมีขนาดใหญ่เกินไปที่จะเข้าไปในรูขุมขนของเมทริกซ์ขนาดยกเว้นและทำให้ผ่านคอลัมน์ในโมฆะปริมาณในขณะที่โปรตีนมีขนาดเล็กพอที่จะเข้าไปในรูขุมขนและเวลาที่พวกเขาใช้จ่ายภายในรูขุมขนจะขึ้นอยู่กับน้ำหนักโมเลกุลของพวกเขา. ดังนั้นแต่ละ elutes โปรตีนที่มีปริมาณลักษณะ แต่ในการปรากฏตัวของอนุภาคนาโนปริมาณการชะของโปรตีนที่มีการขยับตัวต่อครั้งก่อนหน้านี้ชะขึ้นอยู่กับระยะเวลาของการมีปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนและอนุภาคนาโน- นั่นคือโปรตีน Hitches นั่งผ่านคอลัมน์อนุภาคนาโนที่เป็นดังนั้นโปรตีนอนุภาคนาโนที่เกี่ยวข้องจะถูกแยกออกจากโปรตีน nonassociated (รูปที่. 3) การใช้เทคนิคนี้เราได้รับสามารถที่จะระบุโปรตีนที่ผูกเช่นเดียวกับความสัมพันธ์ของพวกเขาtimes2

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

วิธีการประเมินโปรตีนอนุภาค


หลายวิธีที่นิยมใช้เพื่อศึกษาปฏิสัมพันธ์ของโปรตีนสำหรับ
หลายแห่งที่ได้รับการกล่าวถึงใน
ส่วนข้างต้น เช่น FTIR spectroscopy , ซีดี , ITC , SPR , Mass spectrometry และเรืองแสง spectroscopy2,13,15,16,18,31
, .
เราได้รับเมื่อเร็ว ๆนี้รายงานการใช้ข้อยกเว้น
ขนาดโครมาโตกราฟีเพื่อการศึกษาสำหรับโปรตีนปฏิสัมพันธ์กับ
เน้นเฉพาะในการหาที่อยู่อาศัยครั้ง
โปรตีนในอนุภาคนาโนเพื่อระบุผู้โปรตีนที่อาจจะเกี่ยวข้องกับชีวภาพ
timescale2 . วิธีนี้เป็นวิธีที่ใช้
บนความจริงที่ว่า อนุภาคที่ใหญ่เกินกว่าจะใส่ในรูของ
ขนาดยกเว้นเมทริกซ์จึงผ่านคอลัมน์ในความว่างเปล่า
ปริมาณโปรตีน และมีขนาดเล็กพอที่จะใส่เข้าไปในรูและ
เวลาที่พวกเขาใช้จ่ายภายในรูขุมขนขึ้นอยู่กับน้ำหนักของโมเลกุล โปรตีน elutes
ดังนั้นแต่ละที่มีปริมาณ ลักษณะ อย่างไรก็ตาม ,
ในการแสดงตนของอนุภาคนาโนที่ใช้ปริมาณของโปรตีนคือ
เลื่อนต่อครั้งก่อนหน้านี้ ( ทั้งนี้ขึ้นอยู่กับระยะเวลาของ
ปฏิสัมพันธ์ระหว่างโปรตีนและโปรตีนและอนุภาคนาโนที่ hitches นั่งผ่านคอลัมน์ในอนุภาคนาโนสำหรับ , และดังนั้นจึงเกี่ยวข้อง

nonassociated โปรตีนแยกออกจากโปรตีน ( รูปที่ 3 ) การใช้เทคนิคนี้ เราได้รับ
สามารถระบุเหล่านั้นโปรตีนที่ผูกเป็นสมาคมของพวกเขา times2
.