Supraspecific relationships The DNA

Supraspecific relationships The DNA barcode tree profile exhibited some degree of concordance with current concepts in black fly phylogeny. Members of the subfamily Parasimuliinae (represented in this study by Parasimulium crosskeyi), are considered to be the most plesiomorphic lineage of simuliid (Adler et al. 2004). Exemplars of this divergent lineage were placed as the sister-group of the simuliine genus Cnephia (represented in this study by C. dacotensis), which together formed the sister group of all other Simuliidae. Within this latter lineage, members of the tribe Prosimuliini (Twinnia, Gymnopais, Helodonand Prosimulium) formed a monophyletic lineage, except for the inclusion of Simulium (Eusimulium)bracteatum (a member of the tribe Simuliini). Although not all genera within the Prosimuliini were resolved as monophyletic, monophyly was evident at the subgeneric level in Helodon (subgenera Parahelodon andHelodon) and at the speciesgroup level in Prosimulium (in the hirtipes–macropyga–magnum species groups). The remaining simuliine taxa clustered in different parts of the tree, with Greniera, Stegopterna, Metacnephia, Simulium (Boreosimulium),Simulium (Aspathia), and Simulium (Simulium) all forming monophyletic lineages. In contrast, Simulium (Hellichiella) and Simulium (Nevermannia), although exhibiting a certain degree of cohesion, each formed two different groups in different parts of the tree. This apparent unordered clustering pattern has also been observed in other taxa (e.g. Ball et al. 2005; Cywinska et al. 2006). This lack of cohesion among members of putative monophyletic lineages does not invalidate the effectiveness of the NJ algorithm, as the goal of DNA barcoding is to discriminate species based on sequence divergence ratherthan to reconstruct deep phylogenetic relationships.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Supraspecific ความสัมพันธ์ดีเอ็นเอบาร์โค้ดทรีโพรไฟล์จัดแสดงบางส่วนของสอดคล้องกับแนวคิดปัจจุบันใน phylogeny บินสีดำ สมาชิกของ subfamily Parasimuliinae (แสดงในการศึกษานี้ โดย Parasimulium crosskeyi), จะถือว่าเป็น ลินเนจที่สุด plesiomorphic ของ simuliid (Adler et al. 2004) Exemplars ของลินเนจขันติธรรมนี้ถูกวางเป็นกลุ่มพี่น้องของตระกูลนี้ simuliine Cnephia (แสดงในการศึกษานี้ โดย C. dacotensis), ซึ่งร่วมกันก่อตั้งเครือกลุ่ม Simuliidae อื่น ๆ ภายในลินเนจนี้หลัง สมาชิกของเผ่า Prosimuliini (Twinnia, Gymnopais, Helodonand Prosimulium) เกิดขึ้นคนเชื้อสาย monophyletic ยกเว้นการรวมของ Simulium (Eusimulium) bracteatum (เป็นสมาชิกของเผ่า Simuliini) แม้ว่าบางสกุลใน Prosimuliini ได้รับการแก้ไขเป็น monophyletic, monophyly ได้ชัดระดับ subgeneric ใน Helodon (subgenera Parahelodon andHelodon) และ ที่ระดับ speciesgroup ใน Prosimulium (ในกลุ่มสปีชีส์ hirtipes – macropyga – เมนแมกนัม) Taxa simuliine เหลือจับกลุ่มในส่วนต่าง ๆ ของต้นไม้ กับ Greniera, Stegopterna, Metacnephia (Boreosimulium), Simulium Simulium (Aspathia), และเชื้อชาติ monophyletic ขึ้นรูป Simulium (Simulium) ทั้งหมด ในทางตรงกันข้าม Simulium (Hellichiella) และ Simulium (Nevermannia), แต่อย่างมีระดับปริญญาสามัคคี แต่ละรูปแบบสองกลุ่มแตกต่างกันในส่วนต่าง ๆ ของต้นไม้ สังเกตรูปนี้ระบบคลัสเตอร์นำชัดเจนใน taxa อื่น ๆ (เช่นบอลร้อยเอ็ด al. 2005 ยัง Cywinska et al. 2006) ขาดความสามัคคีในหมู่สมาชิกของ putative เชื้อชาติ monophyletic นี้ทำให้ประสิทธิภาพของอัลกอริธึมที่ NJ เป็นดีเอ็นเอเป้าหมายซอฟต์แวร์จะเหยียดตามลำดับ divergence ratherthan เพื่อสร้างความสัมพันธ์ที่ลึก phylogenetic พันธุ์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

รายละเอียดต้นไม้บาร์โค้ดดีเอ็นเอความสัมพันธ์ Supraspecific แสดงระดับของความสอดคล้องกับแนวความคิดบางอย่างในปัจจุบันในเชื้อชาติแมลงวันสีดำ สมาชิกของอนุวงศ์ Parasimuliinae (แสดงในการศึกษานี้โดย Parasimulium crosskeyi) จะถือเป็นเชื้อสาย plesiomorphic ที่สุดของ simuliid (แอดเลอร์และคณะ. 2004) โคลงของเชื้อสายแตกต่างนี้ถูกวางไว้เป็นน้องสาวของกลุ่ม simuliine ประเภท Cnephia (แสดงในการศึกษานี้โดย dacotensis C. ) ซึ่งเกิดขึ้นร่วมกันเป็นกลุ่มน้องสาวของอื่น ๆ ทั้งหมด Simuliidae ภายในนี้เชื้อสายหลังสมาชิกของชนเผ่า Prosimuliini (Twinnia, Gymnopais, Helodonand Prosimulium) เกิดเชื้อสายไฟย์เลติยกเว้นสำหรับการรวมของ Simulium (Eusimulium) bracteatum (สมาชิกของชนเผ่า Simuliini) แม้ว่าจะไม่ได้จำพวกทั้งหมดภายใน Prosimuliini มีการแก้ไขเป็นไฟย์เลติ, monophyly เห็นได้ชัดในระดับ subgeneric ใน Helodon (สกุลย่อย Parahelodon andHelodon) และในระดับ speciesgroup ใน Prosimulium (ในกลุ่ม hirtipes-macropyga-ศิลปะชนิด) แท็กซ่า simuliine กลุ่มที่เหลือในส่วนต่างๆของต้นไม้ที่มี Greniera, Stegopterna, Metacnephia, Simulium (Boreosimulium) Simulium (Aspathia) และ Simulium (Simulium) ทั้งหมด lineages ไฟย์เลติไว้ ในทางตรงกันข้าม Simulium (Hellichiella) และ Simulium (Nevermannia) แม้ว่าการแสดงในระดับหนึ่งของการทำงานร่วมกันแต่ละที่เกิดขึ้นทั้งสองกลุ่มที่แตกต่างกันในส่วนต่างๆของต้นไม้ รูปแบบนี้เห็นได้ชัดการจัดกลุ่มเรียงลำดับนอกจากนี้ยังได้รับการปฏิบัติในแท็กซ่าอื่น ๆ (เช่นบอล et al, 2005;.. Cywinska et al, 2006) ขาดการทำงานร่วมกันนี้ในหมู่สมาชิกของ lineages ไฟย์เลติสมมุติไม่ได้ทำให้ประสิทธิภาพของขั้นตอนวิธีนิวเจอร์ซีย์ที่เป็นเป้าหมายของการดีเอ็นเอบาร์โค้ดที่จะเห็นความแตกต่างสายพันธุ์ตามลำดับแตกต่าง ratherthan ที่จะสร้างความสัมพันธ์ของสายวิวัฒนาการลึก

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

supraspecific ความสัมพันธ์ดีเอ็นเอบาร์โค้ดรายละเอียดบางส่วนของต้นไม้มีความสอดคล้องกับแนวคิดปัจจุบันในระบบเชื้อชาติบินสีดำ สมาชิกของ subfamily parasimuliinae ( เป็นตัวแทนในการศึกษาโดย parasimulium crosskeyi ) ถือว่าเป็นเชื้อสาย plesiomorphic ที่สุดของ simuliid ( Adler et al . 2004 )ของวงศ์ตระกูลนี้ถูกวางไว้ Exemplars ซึ่งเป็นน้องสาวของ simuliine กลุ่มสกุล cnephia ( เป็นตัวแทนในการศึกษาโดย dacotensis ) ซึ่งร่วมกันก่อตั้งกลุ่มอื่นๆ ทั้งหมด simuliidae น้องสาว . ภายในวงศ์ตระกูลหลังนี้ สมาชิกของตระกูล prosimuliini ( twinnia gymnopais helodonand , , prosimulium ) รูปแบบที่ monophyletic วงศ์ ,ยกเว้นการ simulium ( eusimulium ) bracteatum ( สมาชิกของเผ่า simuliini ) แม้ว่าจะไม่ได้ทุกสกุลใน prosimuliini ถูกแก้ไขเป็น monophyletic monophyly , ได้ชัดเจนในระดับ subgeneric ใน helodon ( subgenera parahelodon andhelodon ) และที่ speciesgroup ระดับใน prosimulium ( ใน hirtipes – macropyga แม็กนั่มชนิด ( กลุ่ม )เหลือ simuliine ซ่าแบบในส่วนต่างๆของต้นไม้ กับ greniera stegopterna metacnephia simulium ( , , , boreosimulium ) simulium ( aspathia ) และ simulium ( simulium ) ทั้งหมดเป็น monophyletic พันธุ์ . ในทางตรงกันข้าม simulium ( hellichiella ) และ simulium ( nevermannia ) แต่ถึงระดับหนึ่งของการเชื่อมโยงแต่ละรูปแบบแตกต่างกันสองกลุ่มในส่วนต่างๆของต้นไม้นี้ปรากฏเรียงลําดับข้อมูลยังได้รับการตรวจสอบในและรูปแบบอื่น ๆ ( เช่นลูก et al . 2005 cywinska et al . 2006 ) การขาดการทำงานร่วมกันระหว่างสมาชิกของการแสดงออก monophyletic พันธุ์ไม่ได้ประสิทธิผลของ NJ ขั้นตอนวิธีโมฆะเป็นเป้าหมายของดีเอ็นเอ barcoding ที่จะแยกแยะความแตกต่างมากกว่าชนิดตามลำดับเพื่อสร้างความสัมพันธ์ชนิดลึก