06; Dello Ioio et al., 2007).Gene o

06; Dello Ioio et al., 2007).
Gene ontology (GO) enrichment analysis revealed
transcription factors were over-represented amongst DEGs
in most pairwise comparisons (Table S1). This category
contained 61 differentially expressed homeobox genes,
some of which have known roles in meristem and organ
initiation. For example, WOX13 is dynamically expressed
during RAM/LRP initiation, and showed decreased expression on 2iP. Conversely, ARABIDOPSIS THALIANA
HOMEOBOX 1 (ATH1) and PENNYWISE (PNY) interact with
SHOOT MERISTEMLESS 1 (STM1) in the SAM, and their
expression was increased.
Comparison with callus-based regeneration reveals an
overlap with DEGs identified in LRP? SM conversion
To identify potential key regulators of shoot regeneration
common to different in vitro systems, we compared
targets identified in studies of shoot organogenesis from
callus with LRP ? SM conversion. Che et al. (2006)
analysed transcriptome changes during root or shoot
organogenesis from callus, and described the ‘top-20’
DEGs with increased/decreased expression during callus
induction, or subsequent shoot or root induction. Of the
Figure 3. Distribution of differentially expressed genes (DEGs) during conversion of lateral root promordia (LRP) to shoot meristems (SMs) in a pairwise comparison of three different durations of cytokinin treatment (4.4 lM
2iP). ‘0 h’ corresponds to 24 h of LRP-induction using 10 lM 1-naphthaleneacetic acid (1-NAA). Overlap in DEGs between time points is high, suggesting substantial common transcriptional responses to auxin ? cytokinin
transfer.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

06 Dello Ioio et al. 2007)ยีนภววิทยา (GO) เพิ่มคุณค่าวิเคราะห์เปิดเผยปัจจัยการถอดรหัสเป็นตัวแทนในหมู่ DEGs มากกว่าในแพร์ไวส์สุดเปรียบเทียบ (ตาราง S1) หมวดหมู่นี้มีอยู่ 61 homeobox differentially แสดงยีนบางส่วนที่ทราบบทบาทในอวัยวะและเนื้อเยื่อปลายเริ่มต้น เช่น WOX13 เป็นแบบไดนามิกในช่วงเริ่มต้น RAM/LRP นิพจน์ 2iP ลดลงแสดงให้เห็น ในทางกลับกัน ARABIDOPSIS THALIANAHOMEOBOX 1 (ATH1) และ PENNYWISE (PNY) ที่โต้ตอบกับยิง MERISTEMLESS 1 (STM1) ใน SAM และนิพจน์ถูกเพิ่มขึ้นฟื้นฟูจากแคลลัสแสดงให้เห็นการเปรียบเทียบการทับซ้อนกับใน LRP DEGs แปลง SMระบุศักยภาพ สำคัญหน่วยงานกำกับดูแลของยิงฟื้นฟูทั่วไปแตกต่างกันในหลอดทดลองระบบ ที่เราเปรียบเทียบยิงเป้าหมายที่ระบุไว้ในการศึกษาพัฒนาอวัยวะจากcallus กับ LRP การแปลง SM Che et al. (2006)transcriptome วิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงระหว่างรากหรือยิงพัฒนาอวัยวะจากแคลลัส และอธิบายไว้ใน 'ด้านบน-20'DEGs ด้วยเพิ่มขึ้น/ลดลงระหว่างแคลลัสเหนี่ยว นำ หรือยิงมา หรือเหนี่ยวนำราก ของการรูปที่ 3 กระจายของยีนที่แสดงออก differentially (DEGs) ในระหว่างการแปลงของรากด้านข้าง promordia (LRP) ยิง meristems (SMs) ในการเปรียบเทียบระยะเวลาที่ต่างกันสามของการรักษาในทางการค้าแพร์ไวส์ (4.4 lM2iP) . '0 h' ตรงกับ LRP-เหนี่ยวนำโดยใช้กรด 1-naphthaleneacetic lM ที่ 10 (1-NAA) 24 ชม ซ้อนใน DEGs ระหว่างจุดเวลาคือสูง แนะนำตอบ transcriptional พบทั่วไปในการออกซิ ในทางการค้าโอน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

06; dello IOIO et al., 2007).
ยีนอภิปรัชญา (ไป) การวิเคราะห์การเพิ่มปริมาณเปิดเผย
ถอดความปัจจัยถูกกว่าตัวแทนหมู่ degs
ในการเปรียบเทียบจากจำนวนมากที่สุด (ตาราง S1) หมวดหมู่นี้
มี 61 แสดงความแตกต่างของยีน homeobox,
บางส่วนที่ได้รู้จักกันมามีบทบาทสำคัญในเนื้อเยื่อและอวัยวะ
เริ่มต้น ยกตัวอย่างเช่น WOX13 จะแสดงแบบไดนามิก
ระหว่าง RAM / LRP การเริ่มต้นและแสดงให้เห็นลดลงในการแสดงออก 2iP ตรงกันข้าม Arabidopsis thaliana
homeobox 1 (: ath1) และ Pennywise (PNY) โต้ตอบกับ
SHOOT MERISTEMLESS 1 (STM1) ใน SAM ของพวกเขาและ
การแสดงออกเพิ่มขึ้น.
เปรียบเทียบกับการงอกใหม่ของแคลลัสที่ใช้พบว่า
ทับซ้อนกับที่ระบุไว้ใน degs LRP? เอสเอ็มแปลง
การระบุหน่วยงานกำกับดูแลที่สำคัญที่มีศักยภาพของการฟื้นฟูการถ่าย
เรื่องธรรมดาที่จะแตกต่างกันในระบบการเพาะเลี้ยงเนื้อเยื่อเราเมื่อเทียบกับ
เป้าหมายที่ระบุไว้ในการศึกษาของการถ่ายอวัยวะจาก
แคลลัสกับ LRP? แปลงเอสเอ็ม Che, et al (2006)
การวิเคราะห์การเปลี่ยนแปลงของยีนในช่วงรากหรือยิง
อวัยวะจากแคลลัสและอธิบาย 'top-20'
degs มีเพิ่มขึ้น / ลดลงในช่วงการแสดงออกแคลลัส
เหนี่ยวนำหรือยิงตามมาหรือการเหนี่ยวนำราก ของ
รูปที่ 3 การแพร่กระจายของยีนที่แสดงออกที่แตกต่างกัน (degs) ในช่วงการเปลี่ยนแปลงของรากด้านข้าง promordia (LRP) ในการถ่ายภาพ meristems (SMS) ในการเปรียบเทียบคู่สามระยะเวลาที่แตกต่างกันของการรักษาไซโตไคนิ (4.4 LM
2iP) '0 H' สอดคล้องกับ 24 ชั่วโมงของ LRP เหนี่ยวนำโดยใช้ 10 LM 1 แนปธาลี Acid (1 NAA) ที่ทับซ้อนกันใน degs ระหว่างจุดเวลาที่อยู่ในระดับสูงมากแนะนำการตอบสนองการถอดรหัสเรื่องธรรมดาที่จะออกซิน? ไซโตไคนิ
การถ่ายโอน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

06 ; เดลโล่โยโย et al . , 2007 )ยีนอภิปรัชญา ( ไป ) การวิเคราะห์การเปิดเผยปัจจัยการถอดความมาแสดง ท่ามกลาง degsในการเปรียบเทียบคู่มากที่สุด ( ตาราง S1 ) ประเภทนี้ที่อยู่ 61 แสดงออกแตกต่างกัน homeobox ยีนซึ่งบางส่วนได้รู้จักบทบาทในเยื่อและอวัยวะการริเริ่ม ตัวอย่างเช่น wox13 เป็นแบบไดนามิกที่แสดงระหว่าง RAM / LRP ริเริ่ม และมีการแสดงออกลดลงใน 2ip . ในทางกลับกัน thaliana Arabidopsishomeobox 1 ( ath1 ) และ Pennywise ( pny ) โต้ตอบกับยิง meristemless 1 ( stm1 ) แซม และของพวกเขาการแสดงออกที่เพิ่มขึ้นการเปรียบเทียบกับการพบการจากแคลลัสทับซ้อนกับ degs ระบุ LRP ? การแปลงเอสเอ็มต้องระบุคีย์ควบคุมศักยภาพของการยิงทั่วไปที่แตกต่างกันในระบบเพาะเลี้ยง เราเปรียบเทียบเป้าหมายที่ระบุในการศึกษาจากยิงแกโนเจเนซีสแคลลัสกับ LRP ? การแปลง SM เจ๊ et al . ( 2006 )การวิเคราะห์ทราน ริปโตมที่เปลี่ยนแปลงในช่วงราก หรือ ยิงแกโนเจเนซีสจากแคลลัสและอธิบาย " " ที่ติด 20 อันดับแรกของเกาหลีครับdegs กับการแสดงออกในแคลลัสเพิ่มขึ้น / ลดลงการเหนี่ยวนำหรือตามมายิง หรือเหนี่ยวนำให้เกิดราก ของรูปที่ 3 การกระจายของยีนที่แสดงออกแตกต่างกัน ( degs ) ในระหว่างการแปลง promordia รากด้านข้าง ( LRP ) ยิง meristems ( SMS ) ในการเปรียบเทียบคู่ของระยะเวลาที่แตกต่างกันของการรักษา ( 3 ) ผลิตโดย2ip ) " 0 H " สอดคล้องกับ 24 H อุปนัย LRP ใช้ 10 LM บลูเบิร์ด ( 1-naa ) ทับซ้อนกันใน degs ระหว่างจุดเวลาคือสูง แนะนำให้ลองต่อออกซินมากทั่วไป ? ไซโทไคนินการถ่ายโอน