By screening for the conserved term

By screening for the conserved terminalmotifs found in the HAPs in a
draft genome sequence of P. kudriavzevii published (Chan et al., 2012)we
could identify and partially describe a phytase gene (referred to as PHYPk)
on contig 396. A start codon was identified, however, unfortunately, no
stop-codon was found in suitable place inside contig 396. As this was
out of the scope for the present work, further molecular studies are necessary
to find the end of the gene by e.g. RACE-PCR or chromosomewalking
technique, and describe the entire sequence as it was already done for
other yeast phytases (Li et al., 2009; Ragon et al., 2008;Watanabe et al.,
2009). LSC2andACT1 were chosen as reference genes, because in previous
studies they were already used in gene expression analysis in C. albicans
(Kofla and Ruhnke, 2007; Vandenbosch et al., 2012). The reference gene
stabilitywas checked and the expression of both genes was not influenced
by the experimental conditions (data not shown).
In general, PHYPk gene was expressed to a higher extent in the medium
containing phytic acid as the only phosphate source, clearly
underlining its role in this limiting condition of growth. However, the
expression level was strain dependent. The strain chosen as negative
control showed to some extent both intra- and extracellular activity
which confirmed what already underlined by Nuobariene et al. (2011).
Synthesis of phytase by yeast is governed by Pi concentration in the
environment. Our findings suggest that in P. kudriavzevii the regulation
occurs as previously described for S. cerevisiae (Andlid et al., 2004;
Ogawa et al., 2000; Oshima, 1997; Veide and Andlid, 2006; Yoshida
et al., 1989). For themajority of the strainswe observed a strong reduction
of the PHYPk expression in a phosphate-containingmedium. At the
sameconditions, no phytase activitywasmeasured for any of the strains
(data not shown). PHYPk expression seemed to occur in response to
phosphate starvation.
It has previously been reported that a certain Pi concentration will
repress yeast phytase production differently in different media and
pH, and that the temperature has a strong effect of phytase activity
(Andlid et al., 2004; Li et al., 2009; Ushasree et al., 2014). Our findings
on P. kudriavzevii are not in agreement with Quan et al. (2001) which
showed that phytase production by P. kudriavzevii occurs in the late
stage of exponential growth phase. As previously mentioned, this
might be due to different growth conditions of the strains. However,
considering that the enzyme has been secreted during 48 hwe expected
the highest extracellular activity to be at the end of cultivation. At the
moment, we do not have a clear explanation for that.
Expressions of other genes than PHYPk also seemto play a role in the
activity of P. kudriavzevii. Further studies are therefore necessary to better
investigate the molecular basis of the phytase production in P.
kudriavzevii, the presence and interactions with other phytase genes
and a more detailed investigation of the genetic system responsible
for transcriptional regulation of phytases. The identification and study
of regulatory genes in P. kudriavzevii and the identification of appropriatemutants
in the autochthonous strainsmay be an opportunity to improve
even more phytate degradation in fermented foods.
Considering the importance of this species in African traditional
fermentation and the occurrence of micronutrient deficiencies in
African countries, studying phytase production during yeast growth in
fermented foods is of significant importance. In the present work, for
the first time, a phytase-coding gene of P. kudriavzevii PHYPk was identified,
its expression level quantified and correlated with enzyme activity.
Furthermore, the phytase gene expression was for the first time
investigated during growth. The identified gene PHYPk seemed to be
involved in the hydrolysis of phytate allowing the yeast growth in the
absence of free phosphate.
Supplementary data to this article can be found online at http://dx.
doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2015.04.011.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โดยคัดกรองสำหรับ terminalmotifs นำที่พบใน HAPs ในการร่างลำดับกลุ่มของ P. kudriavzevii เผยแพร่ (จันทร์ร้อยเอ็ด al., 2012) เราสามารถระบุ และอธิบายบางส่วนยีนคุณสมบัติที่ (เรียกว่า PHYPk)บน contig 396 รหัสพันธุกรรมเริ่มต้นที่ระบุได้ อย่างไรก็ตาม แต่ ไม่รหัสพันธุกรรมหยุดพบในสถานที่ที่เหมาะภายใน contig 396 นี้เป็นนอกขอบเขตสำหรับงานนำเสนอ เพิ่มเติมการศึกษาโมเลกุลจำเป็นหาจุดสิ้นสุดของยีนเช่นการแข่งขัน PCR หรือ chromosomewalkingเทคนิค และอธิบายลำดับทั้งหมดเป็นมันแล้วทำการอื่น ๆ ยีสต์ phytases (Li et al., 2009 Ragon et al., 2008 เบะ et al.,2009) . LSC2andACT1 ถูกเลือกเป็นยีนที่อ้างอิง เพราะในก่อนหน้านี้การศึกษาจะถูกใช้ในการวิเคราะห์ยีนนิพจน์ใน C. albicans(Kofla และ Ruhnke, 2007 Vandenbosch et al., 2012) ยีนอ้างอิงstabilitywas การตรวจสอบ และไม่ได้รับค่าของยีนทั้งสองโดยการทดลองสภาพ (ข้อมูลไม่แสดง)ทั่วไป ยีน PHYPk ที่แสดงขอบเขตที่สูงในการประกอบด้วยไฟเตตเป็นแหล่งฟอสเฟตเท่านั้น อย่างชัดเจนขีดเส้นใต้บทบาทของมันในสภาพนี้ข้อจำกัดของการเจริญเติบโต อย่างไรก็ตาม การระดับนิพจน์อ้างอิงต้องใช้ สายพันธุ์ที่เลือกเป็นค่าลบควบคุมแสดงให้เห็นบ้างทั้งภายในและกิจกรรม extracellularซึ่งยืนยันอะไรแล้วขีดเส้นใต้โดย Nuobariene et al. (2011)สังเคราะห์ของคุณสมบัติโดยยีสต์เป็นไปตามความเข้มข้นของปี่ในสภาพแวดล้อม ผลการวิจัยของเราแนะนำใน P. kudriavzevii ข้อบังคับที่เกิดขึ้นก่อนหน้านี้เป็น อธิบายใน S. cerevisiae (Andlid et al., 2004โอะงะวะและ al., 2000 Oshima, 1997 Veide และ Andlid, 2006 Yoshidaร้อยเอ็ด al., 1989) สำหรับ themajority ของ strainswe สังเกตลดแรงของนิพจน์ PHYPk ในฟอสเฟต-containingmedium ที่sameconditions, activitywasmeasured ไม่มีคุณสมบัติใด ๆ ของสายพันธุ์(ข้อมูลไม่แสดง) นิพจน์ของ PHYPk ดูเหมือนจะ เกิดขึ้นเพื่อตอบสนองความอดอยากของฟอสเฟตมีก่อนหน้านี้รายงานว่า บางอย่างพี่เข้มข้นจะรำงับยีสต์ผลิตคุณสมบัติแตกต่างกันในสื่อต่าง ๆ และpH และว่า อุณหภูมิมีผลต่อแรงของคุณสมบัติกิจกรรม(Andlid et al., 2004 Li et al., 2009 Ushasree et al., 2014) ผลการวิจัยของเราP. kudriavzevii จะไม่ยังคงควน et al. (2001) ซึ่งพบว่า เกิดคุณสมบัติผลิต โดย P. kudriavzevii ในเอขั้นตอนของระยะเรขา ก่อนหน้านี้เป็น ส้วมอาจเนื่องจากสภาพการเจริญเติบโตแตกต่างกันของสายพันธุ์ อย่างไรก็ตามพิจารณาว่า เอนไซม์ที่มีการ secreted ระหว่าง hwe 48 คาดว่ากิจกรรม extracellular สูงสุดจะเป็นที่สิ้นสุดของการเพาะปลูก ที่ขณะนี้ เราไม่มีคำอธิบายชัดเจนว่านิพจน์ของยีนอื่น ๆ กว่า PHYPk ยัง seemto มีบทบาทในการกิจกรรมของ P. kudriavzevii ศึกษาเพิ่มเติมได้จึงจำเป็นต้องดีตรวจสอบพื้นฐานระดับโมเลกุลของการผลิตคุณสมบัติในพีkudriavzevii การแสดงและโต้ตอบกับยีนอื่น ๆ คุณสมบัติและการตรวจสอบระบบพันธุกรรมที่รับผิดชอบรายละเอียดเพิ่มเติมสำหรับระเบียบ transcriptional ของ phytases ระบุการศึกษาของยีน regulatory P. kudriavzevii และรหัส appropriatemutantsautochthonous strainsmay มีโอกาสที่จะปรับปรุงยิ่งย่อยสลาย phytate ในอาหารหมักพิจารณาความสำคัญของนกชนิดนี้ในแอฟริกาดั้งเดิมหมักและการเกิดขึ้นของข้าม micronutrientประเทศแอฟริกา การศึกษาคุณสมบัติผลิตในระหว่างการเจริญเติบโตของยีสต์ในอาหารหมักมีความสำคัญอย่างมีนัยสำคัญ ในการทำงานปัจจุบัน สำหรับครั้งแรก ยีนที่กำหนดคุณสมบัติของ P. kudriavzevii PHYPk ระบุระดับของนิพจน์ quantified ก correlated เอนไซม์นอกจากนี้ คุณสมบัติยีนเป็นครั้งแรกตรวจสอบในระหว่างการเจริญเติบโต การระบุยีน PHYPk ที่ดูเหมือน จะเกี่ยวข้องกับไฮโตรไลซ์ของ phytate ให้เจริญเติบโตของยีสต์ในการการขาดงานของฟอสเฟตฟรีข้อมูลเสริมบทความนี้สามารถพบออนไลน์ที่ http://dxdoi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2015.04.011

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โดยการตรวจคัดกรองสำหรับ terminalmotifs ป่าสงวนที่พบใน PPHA
จะอยู่ในร่างลำดับจีโนมของพีkudriavzevii ตีพิมพ์ (จัน et al., 2012)
เราสามารถระบุและอธิบายบางส่วนยีนไฟเตส(เรียกว่า PHYPk)
ใน contig 396 codon เริ่มต้น ถูกระบุ
แต่โชคไม่ดีที่ไม่หยุดcodon พบในสถานที่ที่เหมาะสมภายใน contig 396
เช่นนี้ก็ออกจากขอบเขตสำหรับการทำงานปัจจุบันศึกษาในระดับโมเลกุลต่อไปเป็นสิ่งที่จำเป็นที่จะหาจุดสิ้นสุดของยีนด้วยเช่น
RACE-PCR หรือ chromosomewalking
เทคนิคและอธิบายลำดับทั้งหมดขณะที่มันกำลังทำมาแล้วสำหรับ
phytases ยีสต์อื่น ๆ (Li et al, 2009;. Ragon et al, 2008;.. วาตานาเบะ, et al,
2009) LSC2andACT1 ถูกเลือกให้เป็นยีนอ้างอิงเพราะในก่อนหน้านี้การศึกษาที่พวกเขาใช้อยู่แล้วในการแสดงออกของยีนในการวิเคราะห์ albicans ซี (kofla และ Ruhnke 2007. Vandenbosch et al, 2012) ยีนอ้างอิงstabilitywas การตรวจสอบและการแสดงออกของยีนทั้งสองไม่ได้รับอิทธิพลจากสภาพการทดลอง(ไม่ได้แสดงข้อมูล). โดยทั่วไปยีน PHYPk ได้แสดงออกในระดับที่สูงขึ้นในสื่อที่มีกรดไฟติกเป็นแหล่งฟอสเฟตเพียงอย่างเห็นได้ชัดการขีดเส้นใต้ของมีบทบาทในการนี้สภาพการ จำกัด ของการเจริญเติบโต อย่างไรก็ตามระดับการแสดงออกก็ขึ้นอยู่กับสายพันธุ์ สายพันธุ์ที่ได้รับการแต่งตั้งเป็นเชิงลบควบคุมแสดงให้เห็นบางส่วนทั้งกิจกรรม intra- และสารที่ได้รับการยืนยันสิ่งที่ขีดเส้นใต้แล้วโดยNuobariene et al, (2011). การสังเคราะห์ไฟเตสโดยยีสต์จะเป็นไปตามความเข้มข้น Pi ในสภาพแวดล้อม ค้นพบของเราแสดงให้เห็นว่าในพี kudriavzevii ระเบียบที่เกิดขึ้นตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้สำหรับเอสcerevisiae (Andlid et al, 2004. โอกาวา et al, 2000;. Oshima, 1997; Veide และ Andlid 2006; โยชิดะ., et al, 1989) . สำหรับ themajority ของ strainswe สังเกตการลดความแข็งแกร่งของการแสดงออกPHYPk ในฟอสเฟต containingmedium ที่sameconditions, phytase ไม่มี activitywasmeasured สำหรับใด ๆ ของสายพันธุ์(ไม่ได้แสดงข้อมูล) การแสดงออก PHYPk ดูเหมือนจะเกิดขึ้นในการตอบสนองต่อฟอสเฟตอดอยาก. จะได้รับก่อนหน้านี้มีรายงานว่ามีความเข้มข้น Pi บางอย่างจะระงับยีสต์ผลิตไฟเตสที่แตกต่างกันในสื่อที่แตกต่างกันและความเป็นกรดด่างและอุณหภูมิมีผลต่อการที่แข็งแกร่งของกิจกรรมไฟเตส(Andlid et al., 2004; Li et al, 2009;.. Ushasree et al, 2014) ค้นพบของเราใน kudriavzevii พีไม่ได้อยู่ในข้อตกลงกับ Quan et al, (2001) ซึ่งแสดงให้เห็นว่าการผลิตไฟเตสพีkudriavzevii เกิดขึ้นในช่วงปลายขั้นตอนของระยะการเจริญเติบโต ดังกล่าวข้างต้นนี้อาจเนื่องมาจากสภาวะการเจริญเติบโตที่แตกต่างของสายพันธุ์ อย่างไรก็ตามการพิจารณาว่าเอนไซม์ที่ได้รับการหลั่งในช่วง 48 Hwe คาดว่ากิจกรรมextracellular สูงสุดจะเป็นในตอนท้ายของการเพาะปลูก ในช่วงเวลาที่เราไม่ได้มีคำอธิบายที่ชัดเจนว่า. แสดงออกของยีนอื่นที่ไม่ใช่ PHYPk seemto ยังมีบทบาทสำคัญในการทำงานของพีkudriavzevii การศึกษาต่อไปดังนั้นจึงจำเป็นที่จะต้องดีกว่าตรวจสอบโมเลกุลพื้นฐานของการผลิตไฟเตสในพีkudriavzevii การปรากฏตัวและการมีปฏิสัมพันธ์กับยีน phytase อื่น ๆและการตรวจสอบรายละเอียดเพิ่มเติมของระบบทางพันธุกรรมที่มีความรับผิดชอบสำหรับการควบคุมการถอดรหัสของ phytases บัตรประจำตัวและการศึกษาของยีนที่กำกับดูแลใน kudriavzevii พีและบัตรประจำตัวของ appropriatemutants ใน strainsmay autochthonous เป็นโอกาสที่จะปรับปรุงการย่อยสลายแม้ไฟเตทในอาหารหมักดอง. พิจารณาความสำคัญของสายพันธุ์แอฟริกันในแบบดั้งเดิมนี้การหมักและการเกิดขึ้นของการขาดธาตุอาหารในประเทศในแอฟริกาศึกษาการผลิตไฟเตสระหว่างการเจริญเติบโตของยีสต์ในอาหารหมักดองที่มีความสำคัญอย่างมีนัยสำคัญ ในการทำงานในปัจจุบันสำหรับครั้งแรกที่มีการเข้ารหัส phytase ยีนพี kudriavzevii PHYPk ถูกระบุ, ระดับการแสดงออกของวัดและมีความสัมพันธ์กับการทำงานของเอนไซม์. นอกจากนี้การแสดงออกของยีนไฟเตสได้เป็นครั้งแรกในการตรวจสอบระหว่างการเจริญเติบโต ยีน PHYPk ระบุดูเหมือนจะมีส่วนร่วมในการย่อยสลายของไฟเตทที่ช่วยให้การเจริญเติบโตของยีสต์ในที่ขาดหายไปของฟอสเฟตฟรี. ข้อมูลเพิ่มเติมกับบทความนี้สามารถพบได้ทั่วไปที่ http: //. DX doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro 2015.04.011

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โดยการคัดกรองเพื่อการอนุรักษ์ terminalmotifs พบระหว่างในร่างจีโนมลำดับหน้า
kudriavzevii เผยแพร่ ( ชาน et al . , 2012 ) เรา
สามารถระบุบางส่วนและอธิบายการใช้ยีน ( เรียกว่า phypk )
บน contig 396 . เริ่มต้น codon พบแต่น่าเสียดายที่ไม่มี
รหัสหยุดที่พบในสถานที่ที่เหมาะสมภายใน contig 396 . นี้คือ
ออกจากขอบเขตงานปัจจุบันการศึกษาระดับโมเลกุลเพิ่มเติมเป็นสิ่งจำเป็น
หาจุดสิ้นสุดของยีนด้วย เช่น race-pcr หรือ chromosomewalking
เทคนิคและการอธิบายลำดับทั้งหมดมันก็ทำได้
phytases ยีสต์ ( Li et al . , 2009 ; ragon et al . , 2008 ; วาตานาเบะ et al . ,
2009 ) lsc2andact1 ได้รับเลือกเป็นยีนอ้างอิง เพราะก่อนหน้านี้
การศึกษาพวกเขาได้ใช้ในการวิเคราะห์ใน C . albicans
การแสดงออกของยีน( kofla และ ruhnke , 2007 ; vandenbosch et al . , 2012 ) ยีน stabilitywas
อ้างอิงและตรวจสอบการแสดงออกของยีนทั้งสองไม่ได้รับอิทธิพล
โดยเงื่อนไขการทดลอง ( ข้อมูลไม่แสดง ) .
ทั่วไป phypk ยีนแสดงออกในระดับที่สูงขึ้นในกลาง
ที่มีกรดไฟติกเป็นแหล่งฟอสเฟตเท่านั้น บทบาทในเรื่องนี้อย่างชัดเจน
ขีดเส้นใต้จำกัดเงื่อนไขในการ อย่างไรก็ตาม
ระดับการแสดงออกเครียดจัด เมื่อยกควบคุมลบ
พบบ้างทั้งภายในและภายนอกกิจกรรม
ซึ่งยืนยันสิ่งที่ได้เน้นย้ำ nuobariene et al . ( 2011 )
การสังเคราะห์เอนไซม์ไฟเตส โดยยีสต์จะถูกควบคุมโดย PI ความเข้มข้นใน
สภาพแวดล้อม ผลการวิจัยบ่งชี้ว่า ในหน้า kudriavzevii ระเบียบ
เกิดขึ้นก่อนหน้านี้ อธิบาย .S . cerevisiae ( andlid et al . , 2004 ;
โอกาว่า et al . , 2000 ; ชิมะ , 1997 ; veide และ andlid , 2006 ; โยชิดะ
et al . , 1989 ) สำหรับส่วนใหญ่ของ strainswe สังเกตแข็งแรงลด
ของ phypk การแสดงออกในฟอสเฟต containingmedium . ที่
sameconditions ไม่ใช้ activitywasmeasured สำหรับใด ๆของสายพันธุ์
( ข้อมูลไม่แสดง ) การแสดงออก phypk ดูเหมือนจะเกิดขึ้นในการตอบสนองต่อ

อาหารฟอสเฟตจะได้รับก่อนหน้านี้รายงานว่า สมาธิจะหยุดการผลิตเอนไซม์ไฟเตส
ดบางยีสต์แตกต่างกันในสื่อที่แตกต่างกันและ
pH และอุณหภูมิมีผลกระทบที่แข็งแกร่งของกลุ่มกิจกรรม
( andlid et al . , 2004 ; Li et al . , 2009 ; ushasree et al . , 2010 ) เราพบ
บนหน้า kudriavzevii ไม่ได้อยู่ในข้อตกลงกับเฉวียน et al . ( 2001 ) ซึ่งพบว่า ระดับการผลิตโดย
Pkudriavzevii เกิดขึ้นในช่วงปลายของระยะการเจริญเติบโต
. ตามที่กล่าวถึงก่อนหน้านี้ นี้
อาจจะเกิดจากเงื่อนไขของสายพันธุ์ที่แตกต่างกันของ . อย่างไรก็ตาม
พิจารณาว่าเอนไซม์ที่ได้รับการหลั่งระหว่าง 48 กับคาด
กิจกรรมภายนอกสูงสุดอยู่ที่จุดสิ้นสุดของการ ที่
ขณะนี้เราไม่ได้มีคำอธิบายที่ชัดเจนว่า
การแสดงออกของยีนอื่นมากกว่า phypk ยัง seemto มีบทบาทในกิจกรรมของ พี kudriavzevii
. ศึกษาเพิ่มเติม จึงดีกว่า
ศึกษาโมเลกุลพื้นฐานของระดับการผลิตในหน้า
kudriavzevii , การแสดงและการปฏิสัมพันธ์กับยีน phytase อื่น
และรายละเอียดเพิ่มเติมการตรวจสอบระบบการควบคุมพันธุกรรมรับผิดชอบ
ลอง phytases .การระบุและการศึกษายีนในหน้า kudriavzevii
กฎระเบียบและการ appropriatemutants
ใน strainsmay autochthonous เป็นโอกาสที่จะเพิ่มมากขึ้นระหว่างการย่อยสลายอาหาร

เปรี้ยว พิจารณาความสำคัญของปลาชนิดนี้ในการหมักแบบดั้งเดิมแอฟริกา และการเสริม

แต่ในประเทศแถบแอฟริกาศึกษาการผลิตเอนไซม์ไฟเตสในช่วงการเจริญเติบโตของยีสต์ในอาหารหมัก
เป็นมีความสำคัญ . ในงานปัจจุบัน สำหรับ
ครั้งแรก , การใช้รหัสของยีนพี kudriavzevii phypk พบ
ระดับการแสดงออกของ และมีความสัมพันธ์กับปริมาณเอนไซม์ .
นอกจากนี้ ระดับของการแสดงออกของยีนเป็นครั้งแรก
ศึกษาในระหว่างการเจริญเติบโตการระบุยีน phypk ดูจะ
เกี่ยวข้องกับการย่อยสลายของไฟเตท ช่วยการเจริญเติบโตของยีสต์ใน

ขาดฟอสเฟตฟรี ข้อมูลเพิ่มเติมบทความนี้สามารถพบออนไลน์ที่ http : / / DX .
doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2015.04.011 .