It has been hypothesized that endop

It has been hypothesized that endophytic fungi originate from local environmental sources, and endophyte identity and composition can be predicted based on surrounding ex planta fungi. As part of a pilot study to characterize endophytes and ex planta fungi (e.g. saprotrophs) of wild Hevea trees, endophytes were isolated with almost identical ITS sequences, but these were unidentifiable using GenBank database. Along with the endophytes, ex planta fungi on Hevea leaves were also collected at the sampling sites. The objective of this study was to determine if selected unknown Hevea endophytes could be linked with the ex planta fungi using DNA sequences. Methods included BLAST searches, phylogenetic analysis, and morphological characterizations of the endophytes and saprotrophs. Results show that the BLAST-unidentifiable Hevea endophytes belong in the fungal genus Perisporiopsis (Parodiopsidaceae, Dothideomycetes, Ascomycota). In addition, this Hevea endophyte is at least 98 % identical to >20 other sequences from GenBank, demonstrating that Perisporiopsis is a common endophyte from various plants, and a leaf litter and soil fungus. Connecting a DNA sequence with a name that has biological meaning enables microbial (i.e. fungal) biologists to make more accurate inferences about the functional ecology of a particular species in a community or ecosystem.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มันได้ถูกตั้งสมมติฐานว่าเชื้อ endophytic รามาจากแหล่งข้อมูลสิ่งแวดล้อมท้องถิ่น และ endophyte เอกลักษณ์และองค์ประกอบสามารถจะทำนายตามรอบอดีตเชื้อราลเวียมานอร์ เป็นส่วนหนึ่ง ของการศึกษานำร่องกับลักษณะ endophytes และ อดีตลเวียมานอร์เชื้อรา (เช่น saprotrophs) ของต้นไม้ป่า Hevea, endophytes ได้แยกกับลำดับของเกือบเหมือนกัน แต่เหล่านี้ได้ใช้ฐานข้อมูลของ GenBank unidentifiable พร้อม ด้วย endophytes อดีตเชื้อราลเวียมานอร์ใน Hevea ใบไม้ถูกยังเก็บรวบรวมไซต์สุ่มที่ วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้คือการ ตรวจเลือกไม่รู้จัก Hevea endophytes สามารถเชื่อมโยงกับอดีตเชื้อราลเวียมานอร์ที่ใช้ลำดับดีเอ็นเอ วิธีรวมระเบิดค้นหา วิเคราะห์ phylogenetic และ characterizations ของ endophytes และ saprotrophs ผลลัพธ์แสดงว่า endophytes Hevea unidentifiable ระเบิดอยู่ในเชื้อรา Perisporiopsis (Parodiopsidaceae, Dothideomycetes, Ascomycota) แห่ง endophyte Hevea นี้เป็นเหมือนกับน้อย 98% > 20 ลำดับอื่น ๆ จาก GenBank เห็นว่า Perisporiopsis endophyte ทั่วไปจากพืชต่าง ๆ และใบไม้แคร่และดินเชื้อรา การเชื่อมต่อลำดับดีเอ็นเอที่มีความหมายชีวภาพ มีชื่อช่วยให้ biologists จุลินทรีย์ (เชื้อราเช่น) ให้ inferences ถูกต้องมากขึ้นเกี่ยวกับนิเวศวิทยาฟังก์ชันพันธุ์เฉพาะในชุมชนหรือระบบนิเวศ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

มันได้รับการตั้งสมมติฐานว่าราเอนโดไฟท์มาจากแหล่งที่มาของสิ่งแวดล้อมในท้องถิ่นและเอกลักษณ์ endophyte และองค์ประกอบสามารถคาดการณ์บนพื้นฐานของรอบอดีตเชื้อราพืช ในฐานะที่เป็นส่วนหนึ่งของการศึกษานำร่องที่จะอธิบายลักษณะ endophytes และอดีตเชื้อราพืช (เช่น saprotrophs) ของต้นยางพาราป่า endophytes ที่แยกได้เกือบจะเหมือนกันกับลำดับของมัน แต่เหล่านี้เป็นป้อมปราการโดยใช้ฐานข้อมูล GenBank พร้อมกับ endophytes อดีตเชื้อราบนใบพืชยางพารายังถูกเก็บในสถานที่เก็บตัวอย่าง วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้คือการตรวจสอบว่าเลือก endophytes ยางพาราที่ไม่รู้จักอาจจะเชื่อมโยงกับอดีตเชื้อราพืชโดยใช้ลำดับดีเอ็นเอ วิธีการรวมถึงการค้นหาระเบิดวิเคราะห์สายวิวัฒนาการและสมบัติทางสัณฐานวิทยาของ endophytes และ saprotrophs ผลการศึกษาพบว่าระเบิดระ endophytes ยางพาราอยู่ในประเภทเชื้อรา Perisporiopsis (Parodiopsidaceae, Dothideomycetes, Ascomycota) นอกจากนี้ endophyte Hevea นี้เป็นอย่างน้อย 98% เหมือนกับ> 20 ลำดับจาก GenBank แสดงให้เห็นว่า Perisporiopsis เป็น endophyte ที่พบจากพืชต่างๆและใบไม้และเชื้อราในดิน การเชื่อมต่อลำดับดีเอ็นเอที่มีชื่อที่มีความหมายทางชีวภาพจะช่วยให้จุลินทรีย์ (เช่นเชื้อรา) นักชีววิทยาที่จะทำให้การหาข้อสรุปที่ถูกต้องเพิ่มเติมเกี่ยวกับการทำงานของระบบนิเวศชนิดโดยเฉพาะอย่างยิ่งในชุมชนหรือระบบนิเวศ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

มีการตั้งสมมุติฐานว่าราเอนโดไฟต์ที่แยกมาจากแหล่งข้อมูลท้องถิ่น และเอกลักษณ์ endophyte และองค์ประกอบที่สามารถคาดการณ์ได้จากรอบเก่า planta เชื้อรา เป็นส่วนหนึ่งของ โครงการนำร่องเพื่อศึกษา endophytes และอดีต planta เชื้อรา ( เช่น saprotrophs ) ป่ายางพาราต้นไม้ endophytes แยกเกือบเหมือนของลำดับแต่ที่ไม่สามารถพิสูจน์ได้ โดยใช้ฐานข้อมูลขนาด . พร้อมกับ endophytes อดีต planta เชื้อราบนใบยางยังเก็บที่ 1 เว็บไซต์ การวิจัยครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาหากเลือกยางไม่รู้จัก endophytes สามารถเชื่อมโยงกับอดีต planta เชื้อราใช้ดีเอ็นเอลำดับดีเอ็นเอ วิธีการรวมการค้นหาการวิเคราะห์ชนิดระเบิดการศึกษาคุณสมบัติของสาร endophytes และ saprotrophs . ผลการวิจัยพบว่าลักษณะระเบิดที่ไม่สามารถพิสูจน์ endophytes อยู่ใน perisporiopsis สกุล ( dothideomycetes parodiopsidaceae , เชื้อรา , โคไมโคตา ) ขณะเดียวกัน ด้าน endophyte อย่างน้อย 98% เหมือน > 20 ลำดับอื่น ๆจากขนาด , แสดงให้เห็นว่า perisporiopsis เป็น endophyte ทั่วไปจากพืชต่าง ๆและซากใบและเชื้อราในดิน เชื่อมต่อลำดับเบสดีเอ็นเอด้วยชื่อที่มีความหมายช่วยให้จุลินทรีย์ชีวภาพ ( เช่นเชื้อรา ) นักชีววิทยาให้ใช้ที่ถูกต้องมากขึ้นเกี่ยวกับการทำงานนิเวศวิทยาของชนิดโดยเฉพาะในชุมชนหรือระบบนิเวศ