Gene expression was studied in Atla

Gene expression was studied in Atlantic cod fed two different diets, fish meal (FM) and dehulled and extracted soybean meal (SBM). RNA was isolated from the distal part of the mid-intestine of Atlantic cod and suppression subtractive hybridization (SSH) was employed to screen for genes that showed changes in expression in response to the two dietary treatments. We made a cDNA subtracted library, isolated and sequenced 192 clones. Identification of 157 clones was predicted by BLAST. Most of the clones were previously unidentified in cod. Expression of 12 selected clones was further studied by quantitative PCR. Expression of four clones showing similarity to aminopeptidase N, transcobalamin I precursor, cytochrome P450 3A40, and ras-related nuclear protein was significantly up regulated in intestine of cod fed SBM compared to cod fed FM. A trend towards up regulation of a clone with similarity to fatty acid binding protein in SBM-fed cod was also observed. No significant differences in expression were observed for: transmembrane 4 superfamily protein member, polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, glutathione peroxidase, peroxiredoxin 4, SEC61, F-BOX, and 14-3-3.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

มีศึกษายีนใน cod แอตแลนติกเลี้ยงสองแตกต่างกัน อาหาร อาหารปลา (FM) และ dehulled และแยกกากถั่วเหลือง (SBM) อาร์เอ็นเอแยกต่างหากจากส่วนกระดูกลำไส้ส่วนกลางของ cod แอตแลนติกและปราบปราม subtractive hybridization (SSH) ถูกจ้างไปจอสำหรับยีนที่แสดงให้เห็นการเปลี่ยนแปลงในนิพจน์ในการรักษาอาหารสอง เราทำรี cDNA ที่ลบออก แยกต่างหาก และเรียงลำดับ 192 โคลน รหัส 157 โคลนถูกทำนาย โดยระเบิด ของโคลนไม่ได้ระบุไว้ก่อนหน้านี้ใน cod นิพจน์ของโคลน 12 เลือกถูกศึกษาเพิ่มเติม โดย PCR เชิงปริมาณ ของสี่ clones แสดงคล้ายกับ aminopeptidase N, transcobalamin ผมสารตั้งต้น cytochrome P450 3A40 และราที่เกี่ยวข้องกับนิวเคลียร์โปรตีนได้มากขึ้นควบคุมในลำไส้ของ cod เลี้ยง SBM เทียบกับ cod รับ FM นอกจากนี้ยังมีสังเกตแนวโน้มต่อค่าบังคับของโคลนที่มีความคล้ายคลึงกันกับกรดไขมันโปรตีนรวมใน cod เลี้ยง SBM ไม่แตกต่างกันในนิพจน์ได้สังเกตสำหรับ: โปรตีน superfamily transmembrane 4 สมาชิก polypeptide N acetylgalactosaminyltransferase, peroxidase กลูตาไธโอน peroxiredoxin 4, SEC61, F-กล่อง และ 14-3-3

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การแสดงออกของยีนได้ศึกษาในแอตแลนติกปลาที่เลี้ยงด้วยอาหารที่แตกต่างกันสองอาหารปลา (FM) และข้าวกล้องและสกัดกากถั่วเหลือง (SBM) อาร์เอ็นเอที่แยกได้จากส่วนปลายของช่วงกลางของมหาสมุทรแอตแลนติกลำไส้ปลาและปราบปรามการผสมพันธุ์ลด (SSH) ถูกจ้างมาเพื่อหน้าจอสำหรับยีนที่แสดงให้เห็นการเปลี่ยนแปลงในการแสดงออกในการตอบสนองต่อการรักษาทั้งสองการบริโภคอาหาร เราทำห้องสมุด cDNA หักที่โดดเดี่ยวและติดใจ 192 โคลน บัตรประจำตัวของ 157 โคลนตามคำทำนายของระเบิด ส่วนใหญ่ของโคลนที่ถูกที่ไม่ได้ระบุก่อนหน้านี้ในปลา การแสดงออกของ 12 โคลนที่เลือกศึกษาต่อไปโดยวิธี PCR เชิงปริมาณ การแสดงออกของสี่โคลนแสดงความคล้ายคลึงกันเพื่อ aminopeptidase N, transcobalamin ฉันสารตั้งต้น, cytochrome P450 3A40 และ ras โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับนิวเคลียร์ควบคุมอย่างมีนัยสำคัญขึ้นในลำไส้ของปลาที่เลี้ยง SBM เมื่อเทียบกับปลาที่เลี้ยง FM แนวโน้มขึ้นต่อกฎระเบียบของโคลนที่มีความคล้ายคลึงกันที่จะมีผลผูกพันกรดไขมันโปรตีนในปลาที่เลี้ยง SBM ยังพบว่า ไม่มีความแตกต่างอย่างมีนัยสำคัญในการแสดงออกถูกตั้งข้อสังเกตสำหรับ: 4 สมาชิกรนโปรตีน superfamily, polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, peroxidase กลูตาไธโอน peroxiredoxin 4 SEC61 F-BOX และ 14-3-3

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การแสดงออกของยีนที่ศึกษาใน Atlantic ซีโอเฟดสองอาหารที่แตกต่างกัน ปลาป่น ( FM ) และ dehulled และแยกกากถั่วเหลือง ( SBM ) ซึ่งถูกแยกจากส่วนปลายของไส้กลางของ Atlantic ซีโอและปราบปรามการหักออก hybridization ( SSH ) ใช้หน้าจอที่แสดงการเปลี่ยนแปลงในการแสดงออกของยีนในการตอบสนองต่อสองอาหารตำรับ เราสร้างห้องสมุด cDNA หักออก ,แยกลำดับ 192 และโคลน การโคลนได้คาดการณ์ไว้ โดยมีระเบิด ที่สุดของโคลนได้ก่อนหน้านี้ในปลา การแสดงออกของ 12 เลือกโคลนยังศึกษาด้วยเทคนิคเชิงปริมาณ การแสดงออกของสี่โคลนแสดงความคล้ายคลึงกับบางหน N , ทรานส์โคบาลามินข้าสารไซโตโครมพี 3a40 , ,ระหว่างที่เกี่ยวข้องและนิวเคลียร์โปรตีนพบในลำไส้ของปลาที่เลี้ยงขึ้นควบคุมเปอร์เซ็นต์เมื่อเทียบกับปลาที่เลี้ยง เอฟเอ็ม แนวทางขึ้นระเบียบของโคลนที่มีความคล้ายคลึงกับกรดไขมัน โปรตีนในถั่วเหลืองเลี้ยงปลาก็สังเกตได้ ไม่มีความแตกต่างในการแสดงออกเป็นสังเกตสำหรับ : ยาว 4 ซูเปอร์แฟมิลี n-acetylgalactosaminyltransferase polypeptide โปรตีน , สมาชิกglutathione peroxidase , peroxiredoxin 4 , sec61 กล่อง , และ 14-3-3 .