The SGSautoSNP pipeline is implemen

The SGSautoSNP pipeline is implemented in Python 2.7 and runs from the command line on any operating system where Python is available. Most of the SGSautoSNP scripts are multithreaded to improve performance with large genomes. Other requirements are pysam , a Python module for SAM/BAM formats; Biopython ; SAMtools version and soap2sam.pl to covert SOAP results to SAM format.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ตอน SGSautoSNP ใน 2.7 งู และเรียกใช้จากบรรทัดคำสั่งในระบบปฏิบัติการที่งูอยู่ ส่วนใหญ่ของสคริปต์ SGSautoSNP จะให้เพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพ genomes ขนาดใหญ่ Pysam โมดูงูสำหรับรูปแบบ SAM/อำนวย การมูลนิธิ เป็นความต้องการอื่น ๆ Biopython รุ่น SAMtools และ soap2sam.pl ให้สบู่แอบแฝงผลรูปแบบสาม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ท่อ SGSautoSNP จะดำเนินการใน Python 2.7 และวิ่งจากบรรทัดคำสั่งบนระบบปฏิบัติการใดที่งูใหญ่สามารถใช้ได้ ส่วนใหญ่ของสคริปต์ SGSautoSNP จะ multithreaded เพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพการทำงานกับจีโนมที่มีขนาดใหญ่ ข้อกำหนดอื่น ๆ pysam, โมดูลหลามสำหรับ SAM / รูปแบบ BAM; Biopython; รุ่น SAMtools และ soap2sam.pl ไปสู่​​ผลลัพธ์สบู่แอบแฝงเพื่อจัดรูปแบบ SAM

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การ sgsautosnp ท่อดำเนินการในหลาม 2.7 และทำงานจากบรรทัดคำสั่งในระบบปฏิบัติการใด ๆที่ Python เป็นใช้ได้ ที่สุดของ sgsautosnp สคริปต์หลายเธรดเพื่อปรับปรุงประสิทธิภาพกับจีโนมขนาดใหญ่ ความต้องการอื่น ๆ pysam , งูหลามโมดูลรูปแบบแซม / แบม ; ไบโอไพธัน ; samtools รุ่นและ soap2sam.pl ผลสบู่แปลงสามรูปแบบ