2.4. In silico phylogenetic analysi

2.4. In silico phylogenetic analysis
The accession number for the 16S rDNA sequence of the AAB type strains used for the in silico phylogenetic analysis are shown in Table 1. The 16S rRNA gene sequences were obtained from the European Molecular Biology Laboratory (EMBL) Nucleotide Sequence Database (http://www.ebi.ac.uk/embl/index.html). The sequences of V7–V8 regions of the 16S rDNA were obtained with the primer set WBAC1–WBAC2GC using the software available on the website: http://insilico.ehu.es ( Bikandi et al., 2004). Multiple sequence alignments were created by using CLUSTAL X (version 1.81) ( Thompson et al., 1997). The neighbour-joining method was applied to construct a phylogenetic tree ( Saitou and Nei, 1987).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.4 การในวิเคราะห์ phylogenetic silicoหมายเลขทะเบียนสำหรับ 16S rDNA ลำดับของ aab โดยชนิดสายพันธุ์ที่ใช้สำหรับ silico ใน phylogenetic วิเคราะห์จะแสดงในตารางที่ 1 16S rRNA ยีนลำดับได้รับจากห้องปฏิบัติการอณูชีววิทยายุโรป (EMBL) นิวคลีโอไทด์ลำดับฐานข้อมูล (http://www.ebi.ac.uk/embl/index.html) ลำดับของภูมิภาค V7-V8 ของ 16S rDNA ได้รับกับพื้นที่ตั้ง WBAC1-WBAC2GC การใช้ซอฟต์แวร์ที่มีในเว็บไซต์: http://insilico.ehu.es (Bikandi et al., 2004) สร้างโดย CLUSTAL X (รุ่น 1.81) จัดลำดับหลายแนว (ทอมป์สันและ al., 1997) วิธีการรวมเพื่อนบ้านใช้สร้างต้นไม้ phylogenetic (Saitou และ Nei, 1987)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.4 ใน silico phylogenetic วิเคราะห์
จำนวนการเข้าสำหรับ 16S rDNA ลำดับของสายพันธุ์ชนิด AAB ใช้สำหรับใน silico วิเคราะห์สายวิวัฒนาการที่แสดงในตารางที่ 1 16S rRNA ลำดับยีนที่ได้รับจากยุโรปอณูชีววิทยาทดลอง (EMBL) ฐานข้อมูลลำดับเบส ( http://www.ebi.ac.uk/embl/index.html) ลำดับของภูมิภาค V7-V8 ของ 16S rDNA ที่ได้รับกับไพรเมอร์ตั้ง WBAC1-WBAC2GC ใช้ซอฟต์แวร์ที่มีอยู่บนเว็บไซต์: http://insilico.ehu.es (. Bikandi, et al, 2004) การจัดแนวหลายลำดับที่ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ Clustal X (เวอร์ชั่น 1.81) (ธ อมป์สัน et al., 1997) เพื่อนบ้านเข้าสู่วิธีถูกนำมาใช้ในการสร้างต้นไม้สายวิวัฒนาการ (Saitou และ Nei, 1987)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.4 . สำหรับการวิเคราะห์ phylogenetic
หมายเลขภาคยานุวัติต่อ 16S rDNA ลำดับของ AAB ชนิดสายพันธุ์ที่ใช้ในการวิเคราะห์ ซึ่งโครงข่ายมีแสดงในตารางที่ 1 ลำดับเบส 16S rRNA ยีนที่ได้มาจากยุโรปห้องปฏิบัติการอณูชีววิทยา ( สัตว ) ฐานข้อมูลลำดับนิวคลีโอไทด์ ( http : / / html www.ebi . ac.uk / สัตว / index )ลำดับของ V7 V8 และภูมิภาคของ 16S rDNA ได้ด้วยไพรเมอร์ชุด wbac1 – wbac2gc โดยใช้ซอฟต์แวร์บนเว็บไซต์ : http://insilico.ehu.es ( bikandi et al . , 2004 ) การลำดับหลายถูกสร้างขึ้นโดยใช้ clustal x ( รุ่น 1.81 ) ( Thompson et al . , 1997 ) เพื่อนบ้านเข้าร่วม วิธีประยุกต์การสร้าง phylogenetic ต้นไม้ ( ไซโตะกับเนย , 1987 )