16S rRNA gene sequences have been w

16S rRNA gene sequences have been widely used for the identification of prokaryotes. However,
the flood of sequences of non-type strains and the lack of a peer-reviewed database for 16S
rRNA gene sequences of type strains have made routine identification of isolates difficult and
labour-intensive. In the present study, we generated a database containing 16S rRNA gene
sequences of all prokaryotic type strains. In addition, a web-based tool, named EzTaxon, for
analysis of 16S rRNA gene sequences was constructed to achieve identification of isolates based
on pairwise nucleotide similarity values and phylogenetic inference methods. The system
developed provides users with a similarity-based search, multiple sequence alignment and various
phylogenetic analyses. All of these functions together with the 16S rRNA gene sequence
database of type strains can be successfully used for automated and reliable identification of
prokaryotic isolates. The EzTaxon server is freely accessible over the Internet at
http://www.eztaxon.org

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลำดับการยีน 16S rRNA ที่มีการใช้กันอย่างแพร่หลายสำหรับการระบุของ prokaryotes อย่างไรก็ตามน้ำท่วมของลำดับ-ชนิดสายพันธุ์และการขาดฐานข้อมูลตรวจทานเพื่อนสำหรับ 16Sลำดับยีน rRNA ของชนิดสายพันธุ์ได้ทำรหัสประจำของแยกยาก และแรงงานมากขึ้น ในการศึกษาปัจจุบัน เราสร้างฐานข้อมูลที่ประกอบด้วยยีน 16S rRNAลำดับของสายพันธุ์ชนิด prokaryotic ทั้งหมด นอกจากนี้ เครื่องมือเว็บ EzTaxon สำหรับชื่อวิเคราะห์ของ 16S rRNA ที่สร้างขึ้นเพื่อให้บรรลุการระบุแยกตามลำดับยีนนิวคลีโอไทด์แพร์ไวส์ค่าความคล้ายคลึงกันและวิธีการสรุปผล ระบบพัฒนาให้ผู้ใช้ค้นหาตามความคล้ายคลึงกัน จัดลำดับหลายตำแหน่ง และต่าง ๆการวิเคราะห์ผล สิ่งเหล่านี้ทำหน้าที่ร่วมกับลำดับยีน 16S rRNAฐานข้อมูลของชนิดสายพันธุ์สามารถนำมาใช้สำหรับการระบุอัตโนมัติ และเชื่อถือได้แยก prokaryotic เซิร์ฟเวอร์ EzTaxon ไม่สามารถเข้าถึงได้อย่างอิสระผ่านทางอินเทอร์เน็ตที่http://www.eztaxon.org

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

16S rRNA ลำดับยีนที่มีการใช้กันอย่างแพร่หลายสำหรับบัตรประจำตัวของ prokaryotes แต่
น้ำท่วมของลำดับของที่ไม่ใช่ชนิดสายพันธุ์และการขาดฐานข้อมูล peer-reviewed สำหรับ 16S ที่
rRNA ลำดับยีนชนิดสายพันธุ์ที่ได้ทำบัตรประจำตัวประจำของเชื้อที่ยากและ
ใช้แรงงานเข้มข้น ในการศึกษาปัจจุบันเราสร้างฐานข้อมูลที่มี 16S rRNA ยีน
ลำดับของทุกสายพันธุ์ชนิดนิวเคลียส นอกจากนี้ยังมีเครื่องมือบนเว็บชื่อ EzTaxon สำหรับ
การวิเคราะห์ของ 16S rRNA ลำดับยีนที่สร้างขึ้นเพื่อให้บรรลุบัตรประจำตัวของเชื้อตาม
ค่าเบื่อหน่ายความคล้ายคลึงกันคู่และวิธีการอนุมาน phylogenetic ระบบ
การพัฒนาให้ผู้ใช้มีความคล้ายคลึงกันค้นหาตามลำดับการจัดเรียงหลายและต่าง ๆ
การวิเคราะห์สายวิวัฒนาการ ทุกฟังก์ชั่นเหล่านี้ร่วมกันกับ 16S rRNA ยีน
ฐานข้อมูลของชนิดสายพันธุ์ที่สามารถนำมาใช้ประสบความสำเร็จสำหรับการระบุอัตโนมัติและเชื่อถือได้ของ
ไอโซโปรคาริโอ เซิร์ฟเวอร์ EzTaxon สามารถเข้าถึงได้อย่างอิสระผ่านทางอินเทอร์เน็ตที่
http://www.eztaxon.org

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ยีน 16S rRNA ลำดับได้ถูกใช้เพื่อระบุตัวตนของโพรคาริโ . อย่างไรก็ตามน้ำท่วมของลำดับของชนิดสายพันธุ์ และไม่ขาดการทบทวนฐานข้อมูลเพื่อใช้rRNA ยีน ลำดับของสายพันธุ์ประเภทได้ตามปกติ การแยกยากแรงงานเข้มข้น ในการศึกษาครั้งนี้เราสร้างฐานข้อมูลที่มี 16S rRNA ยีนลำดับของโพรคาริโอติกชนิดสายพันธุ์ นอกจากนี้ เครื่องมือบนเว็บที่ชื่อ eztaxon ,การวิเคราะห์ 16S rRNA ลำดับยีนที่ถูกสร้างขึ้นเพื่อให้บรรลุการกำหนดแยกตามค่าความเหมือนคู่เบสและวิธีการอนุมานชนิด . ระบบพัฒนาให้ผู้ใช้ที่มีความคล้ายคลึงกันค้นหาตามแนวลำดับหลายและต่าง ๆการวิเคราะห์ phylogenetic . ฟังก์ชันเหล่านี้ทั้งหมดเข้าด้วยกันกับลำดับเบส 16S rRNA ยีนฐานข้อมูลของสายพันธุ์ชนิดที่สามารถนำมาใช้สำหรับการระบุอัตโนมัติและเชื่อถือได้โพรคาริโอติกเชื้อ การ eztaxon เซิร์ฟเวอร์สามารถเข้าถึงได้อย่างอิสระผ่านทางอินเทอร์เน็ตที่http://www.eztaxon.org