Flavivirus nonstructural protein 5

Flavivirus nonstructural protein 5 (NS5) consists of methyltransferase (MTase) and RNA-dependent RNA polymerase (RdRp) domains, which catalyze 5’-RNA capping/methylation and RNA synthesis, respectively, during viral genome replication. Although the crystal structure of flavivirus NS5 is known, no data about the quaternary organization of the functional enzyme are available. We report the crystal structure of dengue virus full-length NS5, where eight molecules of NS5 are arranged as four independent dimers in the crystallographic asymmetric unit. The relative orientation of each monomer within the dimer, as well as the orientations of the MTase and RdRp domains within each monomer, is conserved, suggesting that these structural arrangements represent the biologically relevant conformation and assembly of this multi-functional enzyme. Essential interactions between MTase and RdRp domains are maintained in the NS5 dimer via inter-molecular interactions, providing evidence that flavivirus NS5 can adopt multiple conformations while preserving necessary interactions between the MTase and RdRp domains. Furthermore, many NS5 residues that reduce viral replication are located at either the inter-domain interface within a monomer or at the inter-molecular interface within the dimer. Hence the X-ray structure of NS5 presented here suggests that MTase and RdRp activities could be coordinated as a dimer during viral genome replication.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Flavivirus โปรตีน nonstructural 5 (NS5) ประกอบด้วย methyltransferase (MTase) และโดเมนอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส (RdRp) ขึ้นอยู่กับ RNA ซึ่งกระตุ้น 5'-RNA ฝา/อัณฑะและการสังเคราะห์อาร์เอ็นเอ ตามลำดับ ในระหว่างการจำลองแบบไวรัสกลุ่ม แม้ว่าโครงสร้างผลึกของ flavivirus NS5 เป็นที่รู้จัก ไม่มีข้อมูลเกี่ยวกับองค์กรที่สี่ของเอนไซม์ทำงานได้ เรารายงานโครงสร้างผลึกของไวรัสไข้เลือดออก NS5 แบบเต็มตัว ที่แปดโมเลกุลของ NS5 จัดเรียงเป็นสี่อิสระ dimers ในหน่วย crystallographic สมมาตร การวางแนวที่สัมพัทธ์ของแต่ละน้ำยาภายใน dimer การ เช่นเดียวกับแนวของ MTase และ RdRp ของโดเมนภายในแต่ละโนเมอร์ เป็นป่าสงวน แนะนำว่า เตรียมโครงสร้างเหล่านี้เป็นตัวแทนโครงสร้างทางชีวภาพที่เกี่ยวข้องและการชุมนุมของเอนไซม์นี้อเนกประสงค์ ปฏิสัมพันธ์ที่สำคัญระหว่างโดเมน MTase และ RdRp ถูกเก็บใน dimer NS5 ผ่านปฏิกิริยาระหว่างโมเลกุล การให้หลักฐานว่า flavivirus NS5 สามารถนำมาใช้หลาย conformations รักษาจำเป็นปฏิสัมพันธ์ระหว่างโดเมน MTase และ RdRp นอกจากนี้ NS5 ตกหลายที่ลดการจำลองแบบไวรัสอยู่ ที่ใดส่วนติดต่อระหว่างโดเมนภายในเป็นน้ำยา หรืออินเทอร์เฟซระหว่างโมเลกุลภายในของ dimer ดังนั้น โครงสร้างเอ็กซเรย์ของ NS5 ที่นำเสนอที่นี่แนะนำว่า กิจกรรม MTase และ RdRp อาจเป็น dimer การประสานระหว่างการจำลองแบบไวรัสกลุ่ม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Flavivirus nonstructural โปรตีนที่ 5 (NS5) ประกอบด้วยใบพัด (MTase) และ RNA ขึ้นอยู่กับโพลิเมอร์ rna (RdRp) โดเมนซึ่งกระตุ้น 5'-RNA สูงสุด / methylation RNA และสังเคราะห์ตามลำดับในระหว่างการจำลองจีโนมของไวรัส แม้ว่าโครงสร้างผลึกของ flavivirus NS5 เป็นที่รู้จักข้อมูลเกี่ยวกับองค์กรที่สี่ของการทำงานของเอนไซม์ที่มีอยู่ไม่มี เรารายงานโครงสร้างผลึกของไวรัสไข้เลือดออกยาวเต็มรูปแบบ NS5 ที่แปดโมเลกุลของ NS5 จะถูกจัดเรียงเป็นสี่ dimers อิสระในหน่วยสมมาตร crystallographic การวางทิศทางสัมพัทธ์ของแต่ละโมโนเมอร์ภายใน dimer เช่นเดียวกับการหมุนของ MTase และ RdRp โดเมนภายในแต่ละโมโนเมอร์ที่เป็นป่าสงวนบอกว่าการเตรียมโครงสร้างเหล่านี้เป็นตัวแทนโครงสร้างที่เกี่ยวข้องทางชีวภาพและการชุมนุมของเอนไซม์นี้อเนกประสงค์ ปฏิสัมพันธ์ที่สำคัญระหว่าง MTase และ RdRp โดเมนถูกเก็บรักษาไว้ใน dimer NS5 ผ่านการมีปฏิสัมพันธ์ระหว่างโมเลกุลให้หลักฐานที่แสดงว่า flavivirus NS5 สามารถนำมาใช้หลาย conformations ในขณะที่รักษาปฏิสัมพันธ์ที่จำเป็นระหว่าง MTase และ RdRp โดเมน นอกจากนี้จำนวนมากตกค้าง NS5 ที่ช่วยลดการติดเชื้อจะอยู่ที่ทั้งอินเตอร์เฟซโดเมนระหว่างภายในโมโนเมอร์หรือที่อินเตอร์เฟซระหว่างโมเลกุลภายใน dimer ดังนั้นโครงสร้าง X-ray ของ NS5 นำเสนอที่นี่แสดงให้เห็นว่า MTase และ RdRp กิจกรรมอาจมีการประสานงานเป็น dimer ระหว่างการจำลองแบบจีโนมของไวรัส

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ไวรัสโปรตีน ( 5 ตอบกลับ NS5 ) ประกอบด้วย methyltransferase ( องศาเซลเซียส ) และอาร์เอ็นเอ ( RNA Polymerase ( rdrp ) โดเมน ซึ่งเร่ง 5 " - RNA capping / methylation และการสังเคราะห์ RNA ตามลำดับ ระหว่างไวรัสจีโนมซ้ำ แม้ว่าโครงสร้างผลึกของไวรัส NS5 ที่เป็นที่รู้จักกัน ไม่มีข้อมูลเกี่ยวกับองค์กรวิชาการของเอนไซม์หน้าที่ที่มีอยู่ เรารายงานคริสตัลโครงสร้างของไวรัสไข้เลือดออกเต็มตัว NS5 ที่แปดโมเลกุลของ NS5 จะถูกจัดเรียงเป็นสี่อิสระสายในหน่วยไม่สมมาตรทาง . เทียบกับทิศทางของมอนอเมอร์แต่ละภายใน ตลอดจนทิศทางของการทำงาน และ rdrp โดเมนภายในแต่ละโมโนเมอร์ , ป่าสงวน , ชี้ให้เห็นว่าการจัดเรียงโครงสร้างเหล่านี้เป็นตัวแทนของโครงสร้างทางชีววิทยาที่เกี่ยวข้อง และการชุมนุมของเอนไซม์อเนกประสงค์นี้ ปฏิสัมพันธ์ที่สำคัญระหว่างการทำงาน และ rdrp โดเมนที่มีการรักษาในเมอร์ NS5 ผ่านอินเตอร์ปฏิสัมพันธ์ระดับโมเลกุล ได้ให้หลักฐานว่าไวรัส NS5 สามารถ adopt หลายโครงสร้างในขณะที่รักษาปฏิสัมพันธ์ระหว่างการทำงานที่จำเป็น และ rdrp โดเมน นอกจากนี้ หลาย NS5 ตกค้างที่ลดเชื้อไวรัสจะอยู่ที่ระหว่างโดเมนอินเตอร์เฟซในมอนอเมอร์ หรือระหว่างโมเลกุลภายในอินเตอร์เฟซเมอร์ . ดังนั้น ด้วยโครงสร้างของ NS5 ที่แสดงที่นี่แสดงให้เห็นว่ากิจกรรมและสามารถประสานการทำงาน rdrp เป็นไดเมอร์ในไวรัสจีโนมซ้ำ