Computational resources. To make th

Computational resources. To make thorough maximum-likelihood and boot- strap searches (involving, for example, hundreds of maximum-likelihood search replicates per data matrix) possible under a GTR model, we performed analyses in parallel using grid computing38,42, through The Lattice Project43. Additionally, a dedicated cluster of Linux servers with 40 cores at 2.5 GHz each and 80 GB RAM was set up to allow the computationally very demanding codon-model analyses. Additional analyses were carried out using the CIPRES cluster at the San Diego Supercomputing Center, and on the Duke Shared Resource Cluster.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ทรัพยากรคอมพิวเตอร์ อย่างความเป็นไปได้มากที่สุดและสายคล้องสำหรับค้นหา (เกี่ยวข้องกับ เช่น ร้อยเหมือนกับค้นหาความเป็นไปได้สูงสุดต่อข้อมูลเมตริกซ์) ทำได้ภายใต้แบบจำลอง GTR เราทำวิเคราะห์โดยใช้ตาราง computing38, 42 ผ่าน Project43 โครงตาข่ายประกอบควบคู่กัน นอกจากนี้ เฉพาะคลัสเตอร์ของเซิร์ฟเวอร์ Linux กับแกน 40 ที่ 2.5 GHz และ 80 GB RAM ถูกตั้งค่าให้วิเคราะห์รหัสพันธุกรรม-รุ่น computationally มากเรียกร้อง วิเคราะห์เพิ่มเติมได้ดำเนินการใช้คลัสเตอร์ CIPRES ที่ San Diego Supercomputing Center และดยุร่วมทรัพยากรคลัสเตอร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ทรัพยากรการคำนวณ อย่างละเอียดเพื่อให้โอกาสสูงสุดและการค้นหาสายรัดบูต (ที่เกี่ยวข้องกับการยกตัวอย่างเช่นหลายร้อยของการค้นหาโอกาสสูงสุดต่อการลอกเลียนแบบเมทริกซ์ข้อมูล) เป็นไปได้ภายใต้รูปแบบ GTR เราดำเนินการวิเคราะห์ในแบบคู่ขนานโดยใช้ตาราง computing38,42 ผ่าน Lattice Project43 นอกจากนี้เป็นกลุ่มที่ทุ่มเทของเซิร์ฟเวอร์ลินุกซ์กับ 40 แกนที่ 2.5 GHz แต่ละคนและ 80 GB RAM ถูกจัดตั้งขึ้นเพื่อให้คอมพิวเตอร์มากเรียกร้อง codon รูปแบบการวิเคราะห์ การวิเคราะห์เพิ่มเติมได้ดำเนินการโดยใช้กลุ่มต้นไซเปรซที่ซานดิเอโกศูนย์คอมพิวเตอร์และดยุคทรัพยากรที่ใช้ร่วมกันของคลัสเตอร์

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ทรัพยากรการคำนวณ เพื่อให้การค้นหาอย่างละเอียด และบูตรัดความน่าจะเป็นสูงสุด ( ที่เกี่ยวข้องกับ ตัวอย่างร้อยความเป็นไปได้สูงสุดค้นหาซ้ำต่อข้อมูลเมทริกซ์ ) เป็นไปได้ภายใต้ GTR รุ่น เราดำเนินการวิเคราะห์แบบขนานโดยใช้ตาราง computing38,42 ผ่านตาข่าย project43 . นอกจากนี้ กลุ่มของเซิร์ฟเวอร์ทุ่มเท Linux กับ 40 แกนที่ 25 GHz และ 80 GB RAM แต่ละตั้งขึ้นเพื่อให้ computationally เรียกร้องมากโคดอนรูปแบบองค์ประกอบ การวิเคราะห์เพิ่มเติม พบว่า กลุ่มที่ใช้ cipres San Diego supercomputing ศูนย์และดยุคที่แบ่งปันกลุ่มทรัพยากร