A total of 7.5 and 6.4 Gb data were obtained from the control
common carp and GH injection common carp, respectively. The two
cDNA library represented 49,730,178 and 42,303,842 raw reads, respectively.
After filtering out the low-quality sequences (Q b 20 or length
b40 bp) and adaptors, 48,420,076 and 40,986,410 clean reads from
the two cDNA library were selected for the further analysis. All the
sequencing reads were deposited in the Short Read Archive (SRA)
database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/), which are retrievable
under the accession number (SRR2357568, SRR2357588, SRR2357589
and SRR2357620) in SRA database of NCBI. Using Trinity software
(http://trinityrnaseq.sourceforge.net/) and gene annotation by comparing
with gene sequences in NR databases (http://www.ncbi.nlm.nih.
gov/) using BLASTX (E-value b1e-5), 48,786 and 51,863 unigenes
were obtained from the control and GH injection common carp cDNA
library, respectively.
รวม 7.5 และ 6.4 Gb ข้อมูลได้รับจากการควบคุมปลาไนและฉีด GH ทั่วไปปลาคาร์พ ตามลำดับ ทั้งสองห้องสมุด cDNA แสดง 49,730,178 และ 42,303,842 อ่านดิบ ตามลำดับหลังจากกรองออกลำดับคุณภาพต่ำ (Q b 20 หรือความยาวb40 bp) และอะแดปเตอร์ 48,420,076 และ 40,986,410 สะอาดอ่านจากห้องสมุด cDNA ที่สองถูกเลือกสำหรับการวิเคราะห์เพิ่มเติม ทั้งหมดอ่านลำดับถูกฝากไว้ในเก็บถาวรอ่าน (SRA) สั้นฐานข้อมูล (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/), ซึ่งสามารถเรียกภายใต้เลขทะเบียน (SRR2357568, SRR2357588, SRR2357589และ SRR2357620) ในฐานข้อมูล SRA ของ NCBI โดยใช้ซอฟต์แวร์ทรินิตี้(http://trinityrnaseq.sourceforge.net/) และยีนอธิบาย โดยการเปรียบเทียบมีลำดับยีนในฐานข้อมูลยางพารา (http://www.ncbi.nlm.nihตู้ /) โดยใช้ BLASTX (ค่า E b1e-5), 48,786 และ 51,863 unigenesได้รับจากการควบคุมและ GH ฉีด cDNA ปลาคาร์พทั่วไปห้องสมุด ตามลำดับ
การแปล กรุณารอสักครู่..
