by other anthropogenic sources. S. enterica was not detected
at all, or was detected at a very low frequency from three of
the four reference sites, suggesting that very low levels of S.
enterica of wildlife origin make their way to streams in these
remote regions; however, certain wildlife species are
attracted to agricultural and urban areas where food is
abundant and could play a more important role in dissemination
of salmonellae in these environments. In the current
study, agricultural sites were also in closer proximity to
additional potential sources of contamination such as residential
septic systems; therefore, many of the agricultural
sites are likely to be receiving inputs from humans, domestic
animals, and wildlife. Isolation rates were similar between
the reference and agricultural sites in the South Nation. This
same site was identified previously as having one of the
highest human-specific Bacteroides prevalence rates; therefore,
contributions to surface water contamination by S.
enterica at this site are likely due to wildlife and human activity
in otherwise natural, undeveloped land (Marti et al.,
2013).
Several factors (e.g., hydrological, topographical, climatic,
etc.) may impact the presence of pathogens in surface water,
accounting for differences among watersheds and sampling
sites within the same watershed, and these have been discussed
elsewhere (Wilkes et al., 2011). For this study, we
compared data on the leading S. enterica serovars responsible
for clinical illness across Canada collected by NESP to S.
enterica serovars and subtypes observed in surface water. As
FoodNet Canada sentinel sites evolve, region-specific Salmonella
serovar strain collections will be available from human
clinical, sewage, animal, food, and other environmental
sources and these data will be used to examine local transmission
dynamics and inform source attribution studies. In
this study, a high proportion of S. enterica serovars isolated
from surface water (i.e., 11/65 serovars accounted for 40% of
all S. enterica isolated) that are among those most commonly
reported as having caused human illness was observed. This
suggests that there is a link among S. enterica serovars isolated
from humans, animals, and the environment, and that water
is a good indicator of the levels of specific S. enterica serovars in
humans and animals.
In addition to the isolation of many clinically significant S.
enterica serovars, interesting temporal and spatial trends were
observed in this study. Certain serovars appeared to be
widespread across watersheds, while others tended to be
restricted to a particular watershed or region. Likewise, each
watershed contained certain serovars that were isolated
more frequently than any others e either seasonally or yearround
e and also many that were only detected once
throughout the study. Such trends involving the presence or
absence of specific serovars over time may provide clues to
the source(s) of contamination in an area. The spatial and
temporal persistence of particular serovars in this study
suggests there are constantly contributing sources of these
serovars; however, relatively greater survival by a specific
serovar during and after transmission from host to water
(e.g., resistance to desiccation) may also influence persistence.
None the less, areas where certain clinically significant
serovars persist in the environment may require more
extensive monitoring.
Other temporally persistent S. enterica serovars e albeit less
commonly implicated in human salmonellosis e were also
observed in this study (NESP, 2010; Table S1). For example, S.
Kentucky and S. Rubislaw were isolated repeatedly over a
number of years; however, they were restricted to a particular
watershed or region, and also tended to be associated with a
specific season. This information could be useful for risk
management, since such serovars may indicate a unique
source of contamination. S. Kentucky is commonly isolated
from birds and is constantly among the top three serovars
isolated from chicken samples; however, it may also be isolated
from bovine sources (e.g., Demczuk and Pankhurst, 2007;
Johnson et al., 2010; Ravel et al., 2010; Van Kessel et al., 2012). It
was the most frequently isolated serovar in both the South
Nation and Grand Rivers located in southern Ontario, but it
was not obtained from any of the other watersheds studied,
including the Sumas, where poultry production is most
intense in Canada. Given that poultry production is not as
intense in the South Nation and Grand watershed study areas,
the high prevalence of S. Kentucky in these rivers, especially
during the cooler months of October to March (78% prevalence),
is interesting. March and October are critical months
for migratory birds in the province, and could help explain
transmission of this serovar to water. In addition, crops that
are attractive to birds such as wheat and corn are common in
Ontario; therefore, it is possible that several factors associated
with migratory birds (e.g., location of migration channels,
availability of food, and proximity of food source and ‘resting
sites’ to rivers) are influencing surface water contamination
with S. Kentucky in the province.
The identification of temporally and spatially restricted S.
enterica serovars was another interesting finding of the current
study. These serovars were not necessarily restricted to a
particular season, but were restricted to a particular time
period without repeated occurrence at the same time in subsequent
years. This suggests that there may be transient
sources of S. enterica contamination. For example, S.
Oranienburg was isolated four times between March and
August of 2008 in the Grand, but not at any other time in this
watershed.
Serovars Enteritidis, Typhimurium, and Heidelberg were
chosen for further characterization because they are responsible
for the greatest proportion of human salmonellosis in
Canada (NESP, 2010). Fecal samples were only available at one
watershed, and were disproportionately sampled relative to
surface water (Jokinen et al., 2011); however, it was not our
intention to identify specific sources of contamination at each
watershed. Data were instead used to determine whether
serovars and subtypes present in animals and sewage may
also be found in water and cases of human illness. Some PTs
and PFGE patterns associated with human cases of salmonellosis
were observed among both fecal samples and multiple
water sampling sites/dates within the same watershed.
For example, S. Enteritidis PT8 and PT13 are very common
among human cases of salmonellosis (Nesbitt et al., 2012), and
S. Heidelberg PT19 has been most commonly associated with
salmonellosis in Canada for several years (NESP, 2009; 2010). S.
Heidelberg PT19 was detected in the Grand on one occasion,
although it was reported previously at a higher frequency in
this river (Thomas et al., 2012), and also from wastes from
water r e s e arch 7 6 ( 2 0 1 5 ) 1 2 0e1 3 1 129
โดยแหล่งที่มาของมนุษย์อื่น ๆ เอส enterica
ทั้งหมดไม่พบ หรือพบในความถี่ต่ำมากจาก 3
4 อ้างอิงเว็บไซต์ แนะนำว่า ต่ำมากระดับของ S
enterica กำเนิดสัตว์ป่าให้วิธีการของพวกเขากับกระแสเหล่านี้
ภูมิภาคห่างไกล อย่างไรก็ตาม สัตว์ป่าบางพวก
ชอบเกษตร และพื้นที่ชุมชนที่อาหาร
คือมากมาย และอาจมีบทบาทสำคัญในการเผยแพร่
ของซาลโมเนลล่าในสภาพแวดล้อมเหล่านี้ ในการศึกษาปัจจุบัน
เว็บไซต์เกษตรก็ใกล้
เพิ่มเติมศักยภาพแหล่งปนเปื้อน เช่น ระบบบำบัดน้ำเสีย ที่อยู่อาศัย
; ดังนั้นหลายของการเกษตร
เว็บไซต์มีแนวโน้มที่จะได้รับปัจจัยการผลิตจากมนุษย์ ในประเทศ
สัตว์และสัตว์ป่าอัตราการแยกเชื้อที่คล้ายคลึงกันระหว่าง
อ้างอิงและเว็บไซต์เกษตรในประเทศใต้ เว็บไซต์นี้ถูกระบุก่อนหน้านี้ว่ามีหนึ่ง
สูงสุดของมนุษย์โดยเฉพาะ bacteroides อัตราความชุกของการติดเชื้อ ดังนั้น การปนเปื้อนของน้ำผิวดิน
เขียนโดย S .
enterica ที่เว็บไซต์นี้อาจเนื่องจากสัตว์ป่าและกิจกรรมมนุษย์
ในมิฉะนั้นธรรมชาติ พัฒนาที่ดิน ( มาร์ตี้ et al . ,
2013 .
ปัจจัยหลายประการ เช่น ด้านอุทกวิทยา ภูมิอากาศ ภูมิประเทศ ฯลฯ , ,
) อาจส่งผลกระทบต่อสถานะของเชื้อโรคในน้ำพื้นผิว
บัญชีสำหรับความแตกต่างระหว่างลุ่มน้ำและ
เว็บไซต์ตัวอย่างภายในลุ่มน้ำเดียวกันและเหล่านี้ได้รับการกล่าวถึง
ที่อื่น ( Wilkes et al . , 2011 ) ครั้งนี้เรา
เมื่อเทียบข้อมูลา enterica โนรับผิดชอบ
Sสำหรับคลินิกโรคทั่วแคนาดารวบรวมโดย nesp เพื่อ S .
enterica โนชนิดย่อยพบในน้ำและพื้นผิว เป็นผู้ foodnet
เว็บไซต์แคนาดาคายไนซาลโมเนลลาสายพันธุ์
เฉพาะภูมิภาคคอลเลกชันจะสามารถใช้ได้จากมนุษย์
คลินิก , สิ่งปฏิกูล , สัตว์ , อาหาร , และแหล่งข้อมูลด้านสิ่งแวดล้อม
อื่น ๆ และข้อมูลเหล่านี้จะถูกใช้เพื่อตรวจสอบ
ส่งท้องถิ่นพลวัตและแจ้งแหล่งที่มาศึกษา ใน
การศึกษานี้ สัดส่วนของ S
enterica โนแยกจากน้ำผิวดิน ( เช่น 11 / 65 ซีโรวาร์คิดเป็น 40% ของทั้งหมด enterica
แยก ) ซึ่งอยู่ในหมู่ผู้มัก
ที่มีรายงานว่าเป็นมนุษย์ ทำให้เจ็บป่วย ) นี้
เห็นว่ามีการเชื่อมโยงระหว่าง S . enterica โนแยก
จากมนุษย์ , สัตว์และ สิ่งแวดล้อม และน้ำ
เป็นตัวบ่งชี้ที่ดีของระดับของที่ระบุ enterica โน
ในมนุษย์และสัตว์ นอกจากจะแยกหลายทาง S .
enterica ยาโน น่าสนใจชั่วคราวพื้นที่และแนวโน้มเป็น
ที่พบในการศึกษานี้ บางซีโรวาร์ปรากฏเป็น
ฉาวข้ามลุ่มน้ำ ขณะที่คนอื่นมีแนวโน้มที่จะ
เขตลุ่มน้ำใดหรือภูมิภาค อนึ่ง แต่ละลุ่มน้ำมีบางซีโรวาร์
ที่แยก
บ่อยกว่าคนอื่น อี ทั้งฤดูกาล หรือ yearround
E และอีกหลายที่แต่ที่ตรวจพบเมื่อ
ตลอดการศึกษา แนวโน้มดังกล่าวเกี่ยวข้องกับตนหรือ
ขาดเฉพาะซีโรวาร์ตลอดเวลา อาจให้เบาะแส
แหล่งที่มาของการปนเปื้อนในพื้นที่พื้นที่และเก็บรักษาชั่วคราวเฉพาะโน
แสดงว่ามีการศึกษาอย่างต่อเนื่องให้เกิดแหล่งโนเหล่านี้
; แต่ค่อนข้างมากกว่าการอยู่รอดโดยเฉพาะไน
ในระหว่างและหลังการส่งจากโฮสต์ไปยังน้ำ
( เช่นความต้านทานส่วน ) นอกจากนี้ยังอาจมีผลต่อความคงอยู่ .
ไม่มีใครน้อยพื้นที่ที่บางอย่างทางการแพทย์ ที่สําคัญ
โนคงอยู่ในสภาพแวดล้อมที่อาจต้องมีการตรวจสอบอย่างละเอียดมากขึ้น
.
อื่นชั่วคราวแบบถาวร . enterica โน E แม้ว่าน้อยกว่า
มักพัวพันมนุษย์ ซาลโมเนลโลซีส E ยัง
ที่พบในการศึกษานี้ ( nesp 2010 ; ตาราง S1 ) ตัวอย่างเช่น , S .
เคนตั๊กกี้และ S . rubislaw แยกซ้ำมากกว่า
จำนวนของปี อย่างไรก็ตาม พวกเขามี จำกัด เพื่อประโยชน์เฉพาะ
หรือภูมิภาคและมีแนวโน้มที่จะเชื่อมโยงกับ
ฤดูกาลเฉพาะ ข้อมูลนี้อาจเป็นประโยชน์เพื่อการบริหารความเสี่ยง
ตั้งแต่เช่นโนอาจบ่งบอกถึงแหล่งเฉพาะ
ของการปนเปื้อน ชื่อแม่น้ำในรัฐเคนตั๊กกี้สหรัฐอเมริกาจะถูกแยกโดยทั่วไป
จากนก และตลอดเวลาในด้านบนสามโน
ที่แยกได้จากตัวอย่างไก่ ; อย่างไรก็ตาม , มันอาจจะแยก
จากแหล่ง pantip.com ( เช่น และ demczuk เรือนเบี้ย , 2007 ;
จอห์นสัน et al . , 2010 ; ราเวล et al . , 2010 ; ฟาน เคสเซล et al . , 2012 ) มัน
เป็นแยกบ่อยที่สุดไน ทั้งในประเทศและแม่น้ำใต้
แกรนด์ตั้งอยู่ในภาคใต้ Ontario , แต่มัน
ไม่ได้จากใด ๆของอื่น ๆรวมทั้งลุ่มน้ำศึกษา
sumas ที่การผลิตสัตว์ปีกส่วนใหญ่
รุนแรงในแคนาดา ที่ได้รับการผลิตสัตว์ปีกไม่ได้
ที่รุนแรงในประเทศใต้และแกรนด์สันปันน้ำพื้นที่การศึกษาสูง , ความชุกของสหรัฐอเมริกาในรัฐเคนตั๊กกี้
ในแม่น้ำเหล่านี้ โดยเฉพาะในช่วงเย็น เดือนตุลาคมถึงมีนาคม ( 78 % ความชุก )
น่าสนใจ เดือนมีนาคมและตุลาคม
เดือนสำคัญสำหรับนกอพยพในจังหวัด และช่วยอธิบาย
ส่งซีโรวาร์กับน้ำ นอกจากนี้พืช
ที่น่าสนใจให้กับนก เช่น ข้าวสาลี และข้าวโพดมีทั่วไปใน
Ontario ; ดังนั้น จึงเป็นไปได้ว่า ปัจจัยที่เกี่ยวข้องหลาย
กับนกอพยพ เช่น ตำแหน่งของการโยกย้ายช่อง
ความพร้อมของอาหาร และใกล้แหล่งอาหารและที่พัก
' เว็บไซต์ ' แม่น้ำ ) จะมีผลต่อการปนเปื้อนน้ำกับ S .
เคนตั๊กกี้
ในจังหวัดกำหนดและจำกัด S .
enterica ชั่วคราวเปลี่ยนโนอีกหาที่น่าสนใจของการศึกษาปัจจุบัน
ซีโรวาร์เหล่านี้ไม่ได้ จำกัด ให้ได้
ฤดูกาลโดยเฉพาะ แต่จำกัดระยะเวลาเวลา
เฉพาะโดยไม่ซ้ำที่เกิดขึ้นพร้อมกันในเวลาต่อมา
ปี นี้แสดงให้เห็นว่าอาจมีแหล่งชั่วคราว
S . enterica ปนเปื้อนตัวอย่างเช่น , S .
Oranienburg ได้ 4 ครั้ง ระหว่างเดือน มีนาคม - สิงหาคม ปี 2008 ใน
แกรนด์ แต่เวลาอื่น ๆ ในลุ่มน้ำนี้
.
enteritidis นาโน , และไฮเดลเบิร์กถูก
เลือกการเพิ่มเติมเพราะพวกเขามีความรับผิดชอบสำหรับสัดส่วนของมนุษย์ที่ยิ่งใหญ่ที่สุด
( nesp ซัลโมเนลล่าในแคนาดา , 2010 ) ตัวอย่างอุจจาระมีเพียงหนึ่ง
ลุ่มน้ำและมีสัดส่วนสัมพัทธ์ตัวอย่าง
น้ำผิวดิน ( jokinen et al . , 2011 ) ; อย่างไรก็ตาม , มันไม่ใช่ความตั้งใจของเราที่จะระบุแหล่งที่มาของการปนเปื้อน
เฉพาะในแต่ละลุ่มน้ำ ข้อมูล คือ แทนที่จะใช้เพื่อตรวจสอบว่าชนิดย่อยในปัจจุบันและ
โนในสัตว์และน้ำเสียอาจ
ยังสามารถพบได้ในน้ำและกรณีของการเจ็บป่วยของมนุษย์ บางแต้ม
และรูปแบบ PFGE เกี่ยวข้องกับกรณีมนุษย์ของซาลโมเนลล่า
พบในอุจจาระ ตัวอย่างและการสุ่มตัวอย่างเว็บไซต์หลาย
น้ำ / วันที่ภายในลุ่มน้ำเดียวกัน .
ตัวอย่างเช่นสหรัฐอเมริกาและ enteritidis pt8 pt13 เป็นเรื่องธรรมดามากในหมู่มนุษย์
กรณีของซาลโมเนลล่า ( Nesbitt et al . , 2012 ) และ เอส ไฮเดลเบิร์ก pt19
ได้รับมากที่สุด โดยทั่วไปที่เกี่ยวข้องกับ
ซัลโมเนลล่าในแคนาดาเป็นเวลาหลายปี ( nesp ,2009 ; 2010 ) S .
Heidelberg pt19 ที่ตรวจพบในแกรนด์เมื่อครั้งหนึ่ง
ถึงแม้ว่ามันจะรายงานก่อนหน้านี้ที่ความถี่สูงขึ้นในแม่น้ำนี้
( โทมัส et al . , 2012 ) และจากของเสียจากน้ำ r e s e )
7 6 2 0 1 1 2 3 5 ) 0e1 129
1
การแปล กรุณารอสักครู่..
