3.4. Correspondence among soil phys

3.4. Correspondence among soil physicochemical parameters and functional
characteristics
Enzyme activities and soil respiration were positively correlated
with each other and with soil moisture (Pearson's r = 0.20 to r =0.30, p b 0.05; see Supplementary Tables S4–S5). However, they were
not correlated with corn yields (p ≥ 0.10), and when values were recentered
to location averages, corn yield was not associated with any
soil test or measured function. Although the correlation between yield
and NO3-N was not significant (p = 0.17), treatments with increased
yield (Table 4) corresponded to those with increased NO3-N levels
(Table 2) in 6 out of 7 treatments at the Farmington site, and 4 out of
5 treatments at the Madison site.
When measures of soil nutrient-cycling functions were associated
with soil nutrient levels, the correlations were generally positive.
NAGase (p b 0.001), β-glucosidase (p b 0.001) and phosphatase (p =
0.012) activities were positively correlated with SO4-S, and βglucosidase activity was positively correlated (p b 0.001) with all measured
nutrient levels except Bray-P and NO3-N. Soil respiration was positively
correlated (p b 0.01) with all nutrients tested, except for Bray-P.
Exceptions to this pattern included negative correlations between phosphatase
activity and Bray-P (p = 0.022), and between net N mineralization
and SO4-S (p = 0.005) and exchangeable Ca and Mg (p b 0.001).
3.5. Prediction of soil functional profiles by bacterial phylum and family
abundance
The composition of bacterial communities in these soils and the effects
of cover crop and fertilizer treatments on community structure
are described in detail in a separate publication (Fernandez et al., unpublished,
manuscript submitted). Briefly, averaged across all locations,
we identified a mean of 4258, 3945, and 1549 OTUs in samples of May
and July 2013 bulk soil and July 2013 rhizosphere soil samples, respectively,
comprising 45 bacterial phyla. The bacterial community was predominantly
composed of members of the phyla Actinobacteria (50.1%
and 19.7% of reads in July 2013 bulk and rhizosphere soils, respectively),
Proteobacteria (23.3% and 63.3%), Acidobacteria (6.0% and 2.9%), andglucosidase activity was positively correlated (p b 0.001) with all measured
nutrient levels except Bray-P and NO3-N. Soil respiration was positively
correlated (p b 0.01) with all nutrients tested, except for Bray-P.
Exceptions to this pattern included negative correlations between phosphatase
activity and Bray-P (p = 0.022), and between net N mineralization
and SO4-S (p = 0.005) and exchangeable Ca and Mg (p b 0.001).
3.5. Prediction of soil functional profiles by bacterial phylum and family
abundance
The composition of bacterial communities in these soils and the effects
of cover crop and fertilizer treatments on community structure
are described in detail in a separate publication (Fernandez et al., unpublished,
manuscript submitted). Briefly, averaged across all locations,
we identified a mean of 4258, 3945, and 1549 OTUs in samples of May
and July 2013 bulk soil and July 2013 rhizosphere soil samples, respectively,
comprising 45 bacterial phyla. The bacterial community was predominantly
composed of members of the phyla Actinobacteria (50.1%
and 19.7% of reads in July 2013 bulk and rhizosphere soils, respectively),
Proteobacteria (23.3% and 63.3%), Acidobacteria (6.0% and 2.9%), andBacteroidetes (5.0% and 5.8%). Variation in bacterial community structure
among samples was most strongly associated with differences between
bulk and rhizosphere soil and sampling locations, with a
relatively small portion of variation associated with treatments. Principal
component analysis and redundancy analysis of May and July
post-treatment samples indicated that the observed differences in bacterial
community structure were largely driven by edaphic physicochemical
parameters, including pH, moisture, OM, and nutrient
concentrations.
Family and phylum composition of bulk soil bacterial communities,
as well as family composition of rhizosphere communities, was signifi-
cantly predictive (p b 0.0001) of soil functional profiles (Table 5). Variation
in soil function was significantly explained (p = 0.0003) by
bacterial order abundances in bulk soil samples. The power of order
abundances to explain variation in soil function was partially, but
not fully, redundant with that of soil physicochemical values: rhizosphere
and bulk soil bacterial community composition uniquely explained
37.9% and 39.3% of the total explainable variation in function,
respectively.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

3.4. การติดต่อ ระหว่างพารามิเตอร์ทางเคมีกายภาพของดิน และการทำงานลักษณะกิจกรรมของเอนไซม์และการหายใจของดินมีความสัมพันธ์เชิงบวกกับแต่ละอื่น ๆ และ มีความชื้นในดิน (ของ Pearson r = 0.20 ถึง r = 0.30, p b 0.05 ดูตารางเสริม S4 – S5) อย่างไรก็ตาม พวกเขาได้ไม่มีความสัมพันธ์ กับผลผลิตข้าวโพด (p ≥ 0.10), และ เมื่อค่าถูก recenteredการตั้งค่าเฉลี่ย ผลผลิตข้าวโพดไม่ได้เชื่อมโยงกับทดสอบดินหรือฟังก์ชันวัด แม้ว่าความสัมพันธ์ระหว่างอัตราผลตอบแทนและ NO3-N ไม่มีนัยสำคัญ (p = 0.17), เพิ่มขึ้นด้วยผลผลิต (ตาราง 4) ความผูกพันที่มี NO3-N เพิ่มขึ้นระดับ(ตาราง 2) ในการรักษา 6 จาก 7 ที่ไซต์ฟาร์มิงตัน และ 4 ของ5 การรักษาบริเวณเมดิสันเมื่อมาตรการของดินขี่จักรยานสารอาหารฟังก์ชันเกี่ยวข้องระดับธาตุอาหารดิน ความสัมพันธ์ที่เป็นในเชิงบวกชุดพนักงาน (p b 0.001), β-glucosidase (p b 0.001) และฟอสฟา (p =กิจกรรม 0.012) มีความสัมพันธ์เชิงบวกกับ SO4-S และกิจกรรม βglucosidase ก็มีความสัมพันธ์เชิงบวก (p b 0.001) มีวัดทั้งหมดระดับสารอาหารยกเว้น Bray-P และ NO3-n ดินหายใจเป็นบวกมีความสัมพันธ์ (p b 0.01) ด้วยสารอาหารทั้งหมดผ่านทดสอบ ยกเว้น Bray-พีรวมข้อยกเว้นนี้รูปแบบความสัมพันธ์เชิงลบระหว่างฟอสฟากิจกรรมและ Bray-P (p = 0.022), และ ระหว่างสุทธิ N mineralizationและ SO4-S (p = 0.005) Ca และสามารถแลกเปลี่ยนและ Mg (p b 0.001)3.5. การคาดเดาของโพรไฟล์งานดินโดยแบคทีเรียไฟลัมและครอบครัวความอุดมสมบูรณ์องค์ประกอบของชุมชนแบคทีเรียในดินเหล่านี้และผลกระทบของพืชปกคลุมและปุ๋ยรักษาโครงสร้างชุมชนจะอธิบายรายละเอียดในสิ่งพิมพ์แยกต่างหาก (เฟอร์นานเดซ et al. ยกเลิกประกาศฉบับส่ง) สั้น ๆ เฉลี่ยในทุกสถานเราระบุค่าเฉลี่ยของ OTUs 4258, 3945 และ 1549 ในตัวอย่างของและ 2556 กรกฎาคมจำนวนมากดินและตัวอย่างดินไรโซสเฟียร์ 2556 กรกฎาคม ตามลำดับประกอบด้วยอาณาจักรแบคทีเรีย 45 ชุมชนเชื้อแบคทีเรียเป็นส่วนใหญ่ประกอบด้วยสมาชิกของอาณาจักร Actinobacteria (50.1%และ ดิน 19.7% ของการอ่านในกลุ่ม 2556 กรกฎาคมและไรโซสเฟียร์ ตามลำดับ),Proteobacteria (23.3% และ 63.3%), Acidobacteria (6.0% และ 2.9%), andglucosidase กิจกรรมได้มีความสัมพันธ์เชิงบวก (p b 0.001) มีวัดทั้งหมดระดับสารอาหารยกเว้น Bray-P และ NO3-n ดินหายใจเป็นบวกมีความสัมพันธ์ (p b 0.01) ด้วยสารอาหารทั้งหมดผ่านทดสอบ ยกเว้น Bray-พีรวมข้อยกเว้นนี้รูปแบบความสัมพันธ์เชิงลบระหว่างฟอสฟากิจกรรมและ Bray-P (p = 0.022), และ ระหว่างสุทธิ N mineralizationและ SO4-S (p = 0.005) Ca และสามารถแลกเปลี่ยนและ Mg (p b 0.001)3.5. การคาดเดาของโพรไฟล์งานดินโดยแบคทีเรียไฟลัมและครอบครัวความอุดมสมบูรณ์องค์ประกอบของชุมชนแบคทีเรียในดินเหล่านี้และผลกระทบของพืชปกคลุมและปุ๋ยรักษาโครงสร้างชุมชนจะอธิบายรายละเอียดในสิ่งพิมพ์แยกต่างหาก (เฟอร์นานเดซ et al. ยกเลิกประกาศฉบับส่ง) สั้น ๆ เฉลี่ยในทุกสถานเราระบุค่าเฉลี่ยของ OTUs 4258, 3945 และ 1549 ในตัวอย่างของและ 2556 กรกฎาคมจำนวนมากดินและตัวอย่างดินไรโซสเฟียร์ 2556 กรกฎาคม ตามลำดับประกอบด้วยอาณาจักรแบคทีเรีย 45 ชุมชนเชื้อแบคทีเรียเป็นส่วนใหญ่ประกอบด้วยสมาชิกของอาณาจักร Actinobacteria (50.1%และ ดิน 19.7% ของการอ่านในกลุ่ม 2556 กรกฎาคมและไรโซสเฟียร์ ตามลำดับ),Proteobacteria (23.3% และ 63.3%), Acidobacteria (6.0% และ 2.9%), andBacteroidetes (5.0% และ 5.8%) เปลี่ยนแปลงในโครงสร้างชุมชนแบคทีเรียในตัวอย่างที่เป็นมากที่สุดเกี่ยวข้องกับความแตกต่างระหว่างจำนวนมาก และดินไรโซสเฟียร์ และตำแหน่งที่ตั้ง การสุ่มตัวอย่างด้วยการส่วนค่อนข้างเล็กของการเปลี่ยนแปลงที่เกี่ยวข้องกับการรักษา หลักการวิเคราะห์ส่วนประกอบและการวิเคราะห์ความซ้ำซ้อนพฤษภาคมและกรกฎาคมตัวอย่างหลังการรักษาระบุว่า ความแตกต่างที่สังเกตได้ในเชื้อแบคทีเรียโครงสร้างชุมชนส่วนใหญ่ปัจจัย edaphic ทางเคมีกายภาพพารามิเตอร์ รวมทั้งค่า pH ความชื้น OM และสารอาหารความเข้มข้นองค์ประกอบครอบครัวและไฟลัมของกลุ่มชุมชนแบคทีเรียดินเช่นเดียวกับองค์ประกอบของครอบครัวของชุมชนไรโซสเฟียร์ ถูกพลาดปทำนาย (p b 0.0001) ดินโพรไฟล์งาน (ตาราง 5) การเปลี่ยนแปลงในดินที่ อธิบายได้ทำงานอย่างมีนัยสำคัญ (p = 0.0003) โดยร้านสั่งแบคทีเรียในตัวอย่างดินจำนวนมาก พลังของลำดับร้านอธิบายผันแปรในดินฟังก์ชันบางส่วน แก้ไข แต่ได้ ซ้ำซ้อนกับที่ค่าทางเคมีกายภาพของดิน: ไรโซสเฟียร์และอธิบายองค์ประกอบชุมชนแบคทีเรียดินจำนวนมากโดยเฉพาะ37.9% และ 39.3% ของการเปลี่ยนแปลงของเศรษฐกิจรวมในฟังก์ชันตามลาดับ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

3.4 . การเปรียบเทียบพารามิเตอร์ของดินและประโยชน์ใช้สอยลักษณะกิจกรรมของเอนไซม์และการหายใจของดินมีความสัมพันธ์กับแต่ละอื่น ๆและมีความชื้นในดิน ( ค่าสัมประสิทธิ์สหสัมพันธ์ r = 0.20 r = 0.30 , P + B ; ดูเพิ่มเติมโต๊ะ S4 และ S5 ) อย่างไรก็ตาม , พวกเขาไม่มีความสัมพันธ์กับผลผลิตข้าวโพด ( P ≥ 0.10 ) และเมื่อค่า recenteredที่ตั้งโดยเฉลี่ย ผลผลิตข้าวโพดไม่มีความสัมพันธ์ใด ๆดินทดสอบหรือวัดฟังก์ชัน แม้ว่าความสัมพันธ์ระหว่างผลผลิตและ no3-n อย่างมีนัยสำคัญ ( P = 0.17 ) , การรักษาเพิ่มขึ้นผลผลิต ( ตารางที่ 4 ) ของผู้ที่มีระดับ no3-n เพิ่มขึ้น( ตารางที่ 2 ) ใน 6 จาก 7 รักษาในฟาร์มิงตันและ 4 ออกจากเว็บไซต์5 การรักษาที่เว็บไซต์ของเมดิสันเมื่อมาตรการของดิน ธาตุอาหารจักรยานหน้าที่เกี่ยวข้องระดับธาตุอาหารในดินมีความสัมพันธ์เป็นบวกโดยทั่วไปนากา ( P B 0.001 ) บีตา - กลูโคซิเดส ( P B ( p = 0.001 ) และฟอสฟาเทส0.012 ) กิจกรรมมีความสัมพันธ์กับ so4-s บีตา และกิจกรรมในการดูแลมีความสัมพันธ์ทางบวก ( p B 0.001 ) กับวัดระดับธาตุอาหารในดิน ยกเว้น bray-p no3-n. ทางและการหายใจความสัมพันธ์ ( P B 0.01 ) กับรังทดสอบยกเว้น bray-p.ข้อยกเว้นนี้รวมถึงรูปแบบความสัมพันธ์เชิงลบระหว่างฟอสฟาเตสกิจกรรมและ bray-p ( P = 0.022 ) และระหว่างสารอินทรีย์ไนโตรเจนสุทธิและ so4-s ( p = 0.005 ) และ exchangeable Ca และ Mg ( P B 0.001 )3.5 . คำทำนายของโปรไฟล์งานดินโดยไฟลัม แบคทีเรีย และครอบครัวไพบูลย์องค์ประกอบของชุมชนแบคทีเรียในดินและผลกระทบของพืชที่ครอบคลุมและการรักษาปุ๋ยต่อโครงสร้างชุมชนจะอธิบายในรายละเอียดในสิ่งพิมพ์ที่แยกต่างหาก ( Fernandez et al . , เผยแพร่ ,ต้นฉบับส่ง ) สั้น ๆ อยู่ทั่วทุกสถานที่เราระบุว่า 4258 0 , และในในในตัวอย่าง อาจและเดือนกรกฎาคม 2013 เป็นกลุ่มดินและดินบริเวณราก กรกฎาคม 2013 ตัวอย่าง ตามลำดับประกอบด้วยแบคทีเรียไฟลัม 45 . ชุมชนแบคทีเรียคือเด่นประกอบด้วยสมาชิกของไฟลัมแอคติโนมัยสีท ( 50.1 %และ 19.7 % ของอ่านในเดือนกรกฎาคม 2013 เป็นกลุ่มและดินรอบราก ตามลำดับ )โพรทีโอแบคทีเรีย ( 23.3 ร้อยละ 63.3 % ) acidobacteria ( 6.0% และ 2.9 % ) , กิจกรรม andglucosidase มีความสัมพันธ์กันทางบวก ( p B 0.001 ) กับวัดระดับธาตุอาหารในดิน ยกเว้น bray-p no3-n. ทางและการหายใจความสัมพันธ์ ( P B 0.01 ) กับรังทดสอบยกเว้น bray-p.ข้อยกเว้นนี้รวมถึงรูปแบบความสัมพันธ์เชิงลบระหว่างฟอสฟาเตสกิจกรรมและ bray-p ( P = 0.022 ) และระหว่างสารอินทรีย์ไนโตรเจนสุทธิและ so4-s ( p = 0.005 ) และ exchangeable Ca และ Mg ( P B 0.001 )3.5 . คำทำนายของโปรไฟล์งานดินโดยไฟลัม แบคทีเรีย และครอบครัวไพบูลย์องค์ประกอบของชุมชนแบคทีเรียในดินและผลกระทบของพืชที่ครอบคลุมและการรักษาปุ๋ยต่อโครงสร้างชุมชนจะอธิบายในรายละเอียดในสิ่งพิมพ์ที่แยกต่างหาก ( Fernandez et al . , เผยแพร่ ,ต้นฉบับส่ง ) สั้น ๆ อยู่ทั่วทุกสถานที่เราระบุว่า 4258 0 , และในในในตัวอย่าง อาจและเดือนกรกฎาคม 2013 เป็นกลุ่มดินและดินบริเวณราก กรกฎาคม 2013 ตัวอย่าง ตามลำดับประกอบด้วยแบคทีเรียไฟลัม 45 . ชุมชนแบคทีเรียคือเด่นประกอบด้วยสมาชิกของไฟลัมแอคติโนมัยสีท ( 50.1 %และ 19.7 % ของอ่านในเดือนกรกฎาคม 2013 เป็นกลุ่มและดินรอบราก ตามลำดับ )โพรทีโอแบคทีเรีย ( 23.3 ร้อยละ 63.3 % ) acidobacteria ( 6.0% และ 2.9 % ) andbacteroidetes ( 5.0 และร้อยละ 5.8 % ) การเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างชุมชนแบคทีเรียในตัวอย่างคืออย่างมากที่สุดที่เกี่ยวข้องกับความแตกต่างระหว่างขนาดใหญ่และดินบริเวณรากและสถานที่ตัวอย่าง กับส่วนที่ค่อนข้างเล็กของการเปลี่ยนแปลงที่เกี่ยวข้องกับการรักษา ครูใหญ่การวิเคราะห์และการวิเคราะห์ความซ้ำซ้อนของเดือนพฤษภาคมและกรกฎาคม ส่วนประกอบตัวอย่าง พบว่า ความแตกต่างในการตรวจสอบเชื้อโครงสร้างชุมชนขับเคลื่อนส่วนใหญ่โดยการเปลี่ยนแปลงครั้งนี้พารามิเตอร์ ได้แก่ pH , ความชื้น , โอม , และสารอาหารเข้มข้นครอบครัวและองค์ประกอบไฟลัมของดินเป็นกลุ่มแบคทีเรียชุมชนรวมทั้งองค์ประกอบของครอบครัว ของชุมชน คือ ราก signifi - ,อย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ ( P B ลดลงอย่างมีนัยสําคัญเมื่อ 0.0001 ) ของโพรไฟล์หน้าที่ดิน ( ตารางที่ 5 ) การเปลี่ยนแปลงในหน้าที่ดินอย่างมีนัยสำคัญทางสถิติ ( p = 0.0003 ) โดยอธิบายแบคทีเรียในตัวอย่างดินเพื่อ abundances เป็นกลุ่ม พลังของเพื่อการเปลี่ยนแปลงในหน้าที่ดิน abundances อธิบายได้บางส่วน แต่ไม่เต็มที่ ซ้ำซ้อนกับของค่ารากและดินและกลุ่มชุมชน โดยอธิบายองค์ประกอบดินแบคทีเรียบริการและร้อยละ 39.3 ของรูปแบบการอธิบายทั้งหมดในฟังก์ชันตามลำดับ