We are developing a method by which

We are developing a method by which toxicants
can be identified and their putative mechanisms of
action determined by using toxicant-induced gene expression
profiles. In this method, in one or more defined
model systems, dose and time-course parameters
are established for a series of toxicants within a given
prototypic class (e.g., polycyclic aromatic hydrocarbons
(PAHs)). Cells are then treated with these agents
at a fixed toxicity level (as measured by cell survival),
RNA is harvested, and toxicant-induced gene expression
changes are assessed by hybridization to a cDNA
microarray chip (Figure 1). We have developed a custom
DNA chip, called ToxChip v1.0, specifically for
this purpose and will discuss it in more detail below.
The changes in gene expression induced by the test
agents in the model systems are analyzed, and the
common set of changes unique to that class of toxicants,
termed a toxicant signature, is determined.
This signature is derived by ranking across all experiments
the gene-expression data based on rela

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เรากำลังพัฒนาวิธีการ โดย toxicants ซึ่งสามารถระบุ และกลไกของพวกเขาอ้างว่าฝาของการดำเนินการที่กำหนด โดยใช้ยีนเกิด toxicantโปรไฟล์ ในวิธีนี้ หนึ่งการกำหนดแบบจำลองระบบ ยา และพารามิเตอร์เวลาหลักสูตรก่อตั้งขึ้นสำหรับชุดของ toxicants ภายในที่กำหนดคลาส prototypic (เช่น คีนนสูง(กลุ่ม)) เซลล์แล้วถือกับตัวแทนเหล่านี้ในระดับความเป็นพิษที่ถาวร (วัดได้ โดยการอยู่รอดของเซลล์),RNA เป็นยีนที่เก็บเกี่ยว และ เกิด toxicantประเมินการเปลี่ยนแปลง โดย hybridization กับ cDNAชิ microarray (1 รูป) เราได้พัฒนาเองดีเอ็นเอชิป เรียก ToxChip v1.0 โดยเฉพาะนี้วัตถุประสงค์ และจะหารือในรายละเอียดด้านล่างนี้การเปลี่ยนแปลงในยีนที่เกิดจากการทดสอบตัวแทนในระบบแบบจำลองจะถูกวิเคราะห์ และชุดของการเปลี่ยนแปลงเฉพาะที่ระดับ toxicantsเรียกว่าลายเซ็น toxicant มีกำหนดลายเซ็นนี้ได้มาจากการจัดอันดับในการทดลองทั้งหมดข้อมูลการแสดงออกของยีนได้ตามจริง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

เรากำลังพัฒนาวิธีการที่เป็นพิษสามารถระบุและกลไกของกรดอะมิโนการกระทำตัดสินโดยใช้พิษกระตุ้นการแสดงออกของยีนโปรไฟล์ ในวิธีการนี้ ในหนึ่งหรือมากกว่าหนึ่งกำหนดแบบจำลองระบบ , ปริมาณและพารามิเตอร์แน่นอนเวลาจะสร้างชุดของสารพิษภายในให้prototypic คลาส ( เช่น สารโพลีไซคลิกอะโรมาติกไฮโดรคาร์บอน( PAHs ) ) เซลล์จะปฏิบัติกับเจ้าหน้าที่เหล่านี้ที่คงความเป็นพิษระดับ ( วัดโดยการอยู่รอดของเซลล์ )อาร์เอ็นเอจะเก็บเกี่ยว และเป็นพิษต่อการแสดงออกของยีนการเปลี่ยนแปลงจะถูกประเมินโดย hybridization กับดีเอ็นเอไมโคร เรย์ชิ ( รูปที่ 1 ) เราได้พัฒนาขึ้นเองชิปดีเอ็นเอ เรียกว่า toxchip v1.0 , โดยเฉพาะสำหรับวัตถุประสงค์นี้ และจะหารือในรายละเอียดเพิ่มเติมด้านล่างการเปลี่ยนแปลงในการแสดงออกของยีนที่เกิดจากการทดสอบตัวแทนในรูปแบบระบบจะวิเคราะห์และการตั้งค่าทั่วไปของการเปลี่ยนแปลงระดับของสารพิษที่ไม่ซ้ำ ,เรียกว่า ลายเซ็น พิษจะถูกกำหนดลายเซ็นนี้ได้มาโดยการจัดอันดับในทุกการทดลองและข้อมูลการแสดงออกของยีนจากมาร์ติน