Depending on the species examined,

Depending on the species examined, lipid droplets have been previously
reported to contain from 40 to 300 different proteins [39–43]. We
performed proteomic analysis on three biological replicates of N2 and
daf-2. Our lipid droplet proteome analysis confidently identified 354
proteins belonging to various functional classes including lipid metabolism,
other metabolism, transcription and translation, ribosome,
trafficking and transport, cytoskeleton, chaperones, and signal transduction
(Table 1, Table S2).
To estimate protein abundance we used a spectrum counting approach
[44] in which the number of MS/MS spectrum identifications
of the peptides belonging to a given protein were normalized (divided)
by protein length (Supplemental Table 2 and Table 1). For further analysis,
we focused on the top 100 most abundant proteins. The most
abundant protein was MDT-28. Even though this protein shares sequence
similarity to transcriptional mediator complex, it also contains
an N-terminal domain similarity to pfam 03036, which is a conserved
domain associated with the Perilipin family [10] (Supplemental
Fig. 1). Perilipins are conserved structural components of lipid droplets
that regulate lipid storage and hydrolysis [10

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ขึ้นอยู่กับสายพันธุ์ที่ตรวจสอบ หยดไขมันได้ก่อนหน้านี้รายงาน มี 40 กับโปรตีนอื่น 300 [39 – 43] เราดำเนินการวิเคราะห์ proteomic ในสามชีวภาพสามารถจำลองของ N2 และเยอรมัน-2 ของเราไขมันหยด proteome วิเคราะห์ระบุ– 354ของการเรียนการทำงานต่าง ๆ รวมทั้งเผาผลาญไขมัน โปรตีนอื่น ๆ เผาผลาญ transcription และแปล ไรโบ โซมการค้า และการขนส่ง cytoskeleton, chaperones และสัญญาณ transduction(ตาราง 1, S2 ตาราง) การประเมินความอุดมสมบูรณ์ของโปรตีน เราใช้สเปกตรัมเป็นวิธีการตรวจนับ[44] ในการหมายเลขของรหัสสเปกตรัม MS/MSของเปปไทด์ของโปรตีนให้ได้ตามปกติ (ถูกแบ่ง)โดยความยาวโปรตีน (เพิ่มเติมตาราง 2 และตารางที่ 1) สำหรับการวิเคราะห์เพิ่มเติมเราเน้นโปรตีนมากที่สุด 100 สูงสุด มากสุดโปรตีนที่อุดมสมบูรณ์ถูก MDT 28 ถึงแม้ว่า โปรตีนนี้ใช้ลำดับคล้ายคลึงกับผู้ไกล่เกลี่ย transcriptional ซับซ้อน นอกจากนี้ยังประกอบด้วยมี N-เทอร์มินัลโดเมนคล้ายกับ pfam 03036 ซึ่งเป็นการนำโดเมนที่เกี่ยวข้องกับครอบครัวอย่างไร Perilipin [10] (SupplementalFig. 1) Perilipins จะนำส่วนประกอบโครงสร้างของหยดไขมันที่กำหนดจัดเก็บไขมันและไฮโตรไลซ์ [10

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ทั้งนี้ขึ้นอยู่กับสายพันธุ์ที่ตรวจสอบหยดไขมันที่ได้รับก่อนหน้านี้มีรายงานว่าจะมี 40-300 โปรตีนที่แตกต่างกัน [39-43]
เราดำเนินการวิเคราะห์โปรตีนสามซ้ำทางชีวภาพของ N2 และ DAF-2 ไขมันในเลือดหยดของเราวิเคราะห์โปรตีนมั่นใจระบุ 354 โปรตีนที่อยู่ในชั้นเรียนการทำงานต่าง ๆ รวมทั้งการเผาผลาญไขมัน, การเผาผลาญอาหารอื่น ๆ ถอดความและแปลไรโบโซม, การค้าและการขนส่ง, โครงร่างของเซลล์, ครูใหญ่และสัญญาณ(ตารางที่ 1 ตารางที่ S2). เพื่อประเมินความอุดมสมบูรณ์ของโปรตีน เราใช้วิธีการนับคลื่นความถี่[44] ซึ่งในจำนวน MS / MS ระบุสเปกตรัมของเปปไทด์ที่เป็นโปรตีนที่กำหนดถูกปกติ (แบ่ง) โดยความยาวโปรตีน (เพิ่มเติมตารางที่ 2 และตารางที่ 1) สำหรับการวิเคราะห์ต่อไปเราจะมุ่งเน้นไปที่ด้านบน 100 โปรตีนที่มีมากที่สุด มากที่สุดของโปรตีนที่อุดมสมบูรณ์เป็น MDT-28 แม้ว่าโปรตีนลำดับหุ้นนี้มีความคล้ายคลึงกันในการถอดรหัสคนกลางที่ซับซ้อนก็ยังมีความคล้ายคลึงกันโดเมนN-terminal เพื่อ Pfam 03036 ซึ่งเป็นป่าสงวนโดเมนที่เกี่ยวข้องกับครอบครัวPerilipin [10] (เพิ่มเติมรูปที่1). Perilipins ป่าสงวนส่วนประกอบโครงสร้างของหยดไขมันที่ควบคุมการจัดเก็บและการย่อยสลายไขมัน[10

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ขึ้นอยู่กับชนิดตรวจไขมันพบได้รับก่อนหน้านี้
รายงานประกอบด้วยจาก 40 ถึง 300 ชนิดที่แตกต่างกัน [ 39 – 43 ] เราทำการวิเคราะห์โปรตีนใน
3 ซ้ำทางชีวภาพของ N2 และ
daf-2 . ของเรา ไขมันแตกตัว การวิเคราะห์โปรตีนก็ระบุ 354
โปรตีนเป็นของบทเรียนการทำงานต่างๆรวมทั้งการเผาผลาญไขมัน
การเผาผลาญอาหารอื่น ๆการถอดความและแปล ไรโบโซม
, การค้าและการขนส่งขาดตอน คนติดตาม และส่งสัญญาณ ,
( ตารางที่ 1 ตาราง S2 )
เพื่อประเมินความอุดมสมบูรณ์โปรตีนที่เราใช้สเปกตรัมนับแนวทาง
[ 44 ] ซึ่งในจำนวนของ MS / MS สเปกตรัมการแสดงตัวของ
ของเปปไทด์ของโปรตีนปกติ ( ให้ แบ่งตามความยาวของโปรตีน )
( โต๊ะเสริม 2 และตารางที่ 1 )สำหรับการวิเคราะห์ต่อไป
เราเน้นในด้านบน 100 สุดมากมาย โปรตีน ที่สุด
มากมายของโปรตีน mdt-28 . แม้ว่าโปรตีนหุ้นลำดับ
ความคล้ายคลึงกับ particle คนกลางที่ซับซ้อนนอกจากนี้ยังมีความคล้ายคลึงกับกรดอะมิโน
เป็นโดเมน pfam 03036 ซึ่งเป็นป่าสงวน
โดเมนที่เกี่ยวข้องกับครอบครัว perilipin [ 10 ] ( เสริม
รูปที่ 1 )perilipins อนุรักษ์องค์ประกอบโครงสร้างของไขมันหยด
ที่ควบคุมไขมันกระเป๋าย่อย [ 10