The Pi-ta gene in rice (Oryza sativ

The Pi-ta gene in rice (Oryza sativa L.) confers resistance to races of Magnaporthe oryzae B. Couch
containing its cognate avirulence gene AVR-Pita. Pi-ta is a single-copy plant resistance (R) gene encoding
a protein belonging to the nucleotide-binding site leucine-rich repeat (NBS-LRR) class. In the present
study, we report alternative splicing events at the Pi-ta locus, the identification of new introns and novel
differentially used splice sites associated with the Pi-ta gene. A total of 12 transcript variants were
predicted with ORFs ranging from 945 to 3099 bp and encoding 11 distinct putative products between
315 and 1033 amino acids. Among them, five preserve complete NBS-LRR domains and two couple the
original NBS-LRR domain of the Pi-ta protein with a C-terminal thioredoxin (TRX) domain. Gene
expression analysis revealed that transcript variants encoding the TRX domain had, in a resistant Pi-ta
containing rice variety, the highest level of expression in comparison to the other full length or truncated
transcripts. These post-transcriptional modifications of Pi-ta produce a series of transcript isoforms that
could have a significant role in the R gene regulation and/or may increase protein diversity. To our
knowledge, this study represents the first report of alternative splicing of a CC-NBS-LRR gene producing
truncated isoforms at both their 50 or 30 terminus and including transcripts with a TRX domain at their Cterminus

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ยีน Pi-ta ในข้าว (Oryza sativa ลิตร.) ฟาโรห์ต้านทานต่อการแข่งขันของ Magnaporthe oryzae ข
ที่นอนที่มีสายเลือด avirulence ยีน AVR-ไฟลนก้นของ Pi-ta เป็นเดียวคัดลอกพืชต้านทาน (R) ยีน
โปรตีนที่เป็นเบื่อหน่ายผูกพันเว็บไซต์ leucine ที่อุดมด้วยซ้ำ (NBS-LRR) ชั้น ในปัจจุบันการศึกษา
เรารายงานเหตุการณ์ทางพันธุวิศวกรรมที่สถานที Pi-ta,บัตรประจำตัวของ introns ใหม่และนวนิยาย
ใช้เว็บไซต์ที่แตกต่างกันต่อกันที่เกี่ยวข้องกับยีน Pi-ta รวมเป็น 12 สายพันธุ์ที่ได้รับการบันทึก
ทำนายด้วย orfs ตั้งแต่ 945-3099 bp และการเข้ารหัส 11 สินค้าสมมุติที่แตกต่างระหว่าง
315 และ 1033 กรดอะมิโน ในหมู่พวกเขาห้ารักษาที่สมบูรณ์โดเมน NBS-LRR และสองคู่
โดเมนเดิม NBS-LRR ของโปรตีน Pi-ta ด้วยคขั้ว thioredoxin (TRX) โดเมน การวิเคราะห์การแสดงออกของยีน
พบว่าสายพันธุ์ที่บันทึกการเข้ารหัสโดเมน TRX มีใน Pi-ta
ความหลากหลายทนที่มีข้าวในระดับสูงสุดของการแสดงออกในการเปรียบเทียบความยาวเต็มรูปแบบอื่น ๆ หรือตัดทอน
บันทึกการปรับเปลี่ยนการโพสต์เหล่านี้การถอดรหัสของปี่-ta ผลิตชุดของไอโซฟอร์มบันทึกที่
อาจมีบทบาทสำคัญในการควบคุม r ยีนและ / หรืออาจจะเพิ่มความหลากหลายของโปรตีน ของเรา
ความรู้การศึกษาครั้งนี้แสดงให้เห็นถึงรายงานครั้งแรกของทางพันธุวิศวกรรมของยีนซีซี NBS--LRR ผลิต
ไอโซฟอร์มตัดทั้ง 50 หรือ 30 สถานีและรวมถึงการบันทึกกับโดเมน TRX ที่ cterminus ของพวกเขา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

พี่ตา ยีนในข้าว (Oryza ซา L.) confers ต่อต้านการแข่งขันของ Magnaporthe แห้งระดับต่าง ๆ โซฟา B.
ประกอบด้วยยีน cognate avirulence ของ AVR Pita พี่ตา เป็นสำเนา เดียวพืชเข้ารหัสยีนต้านทาน (R)
โปรตีนของนิวคลีโอไทด์รวมเว็บไซต์ leucine ริชทำซ้ำชั้น (NBS-LRR) ในปัจจุบัน
ศึกษา เรารายงานเหตุการณ์อื่น splicing ที่โลกัสพี่ตา โพล รหัสใหม่ introns และนวนิยาย
differentially ใช้ไซต์ประกบที่เกี่ยวข้องกับพี่ตา ยีน มีทั้งหมด 12 เสียงบรรยายย่อย
ทำนายกับ ORFs ตั้งแต่ 945 3099 bp และเข้ารหัส 11 ผลิตภัณฑ์ putative แตกต่างระหว่าง
315 และ 1033 กรดอะมิโน ในหมู่พวกเขา ห้ารักษาโดเมน LRR ไซด์สมบูรณ์และสองคู่นี้
เดิม LRR ไซด์โดของพี่ตา โปรตีนกับโดเมน thioredoxin (TRX) C-เทอร์มินัล ยีน
นิพจน์วิเคราะห์เปิดเผยว่า เสียงบรรยายตัวแปรรหัสโดเมน TRX มี ในการทนปี่ตา
ประกอบด้วยข้าวหลากหลาย สูงที่สุดจากระดับของนิพจน์โดยความยาวเต็ม หรือตัด
ใบแสดงผลการ ปรับเปลี่ยนเหล่านี้ post-transcriptional ของพี่ตา ผลิตชุดของเสียงบรรยาย isoforms ที่
อาจมีบทบาทสำคัญในการควบคุมยีน R หรืออาจเพิ่มความหลากหลายของโปรตีน การของเรา
ความรู้ การศึกษานี้แสดงถึง splicing อื่นผลิตยีน CC-ไซด์-LRR เป็นรายงานแรก
isoforms ตัดทั้งตัว 50 หรือ 30 นัสและใบแสดงผลรวมกับโดเมน TRX ที่ Cterminus ของพวกเขา

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ยีน PI - ตาในข้าว(สิ้นกระท่อม Sativa Sanur มีระดับแอล)ได้มอบสิทธิให้แก่การต่อต้านการแข่งของโซฟา magnaporthe oryzae B .
ประกอบด้วยยีน avirulence มาจากรากเดียวกันของ avr - pita Pi Kitchen and Bar - มาบตาพุดเป็นสำเนาการต่อต้านพืช( R )ยีนโปรตีน
ซึ่งจะช่วยการเข้ารหัสที่เป็น Class nucleotide - มีผลผูกพันเว็บไซต์ leucine - ที่ทำซ้ำ( NBS - lrr )ที่ ในปัจจุบันมีการศึกษา
ซึ่งจะช่วยให้เราจะรายงานกิจกรรมฟื้นฟูทางเลือกที่ สภาพ PI - มาบตาพุดได้การระบุตัวตนของนวนิยายและ introns ใหม่
ชนชั้นล่างใช้ไซต์รอยต่อที่เชื่อมโยงกับยีน PI - ตาได้ ยอดรวมที่แตกต่างของทรานสคริปท์ได้
12 คาดว่าด้วย orfs ตั้งแต่ 945 ถึง 3099 BP และการเข้ารหัส 11 สินค้าสมมุติที่แตกต่างกันระหว่าง
315 และ 1033 เป็นกรดอะมิโน ในจำนวนนี้ห้ารักษาเสร็จสมบูรณ์ NBS - lrr และโดเมนสองสามี ภรรยา ที่
โดเมนแสดงแบบดั้งเดิม - lrr ของโปรตีน Pi Kitchen and Bar - ตาให้กับ C - อาคารโดยสาร thioredoxin ( trx )โดเมน. การวิเคราะห์ยีน
ซึ่งจะช่วยการแสดงออกทางความคิดเห็นเกี่ยวกับบริษัททรานสคริปท์เปิดเผยว่าการเข้ารหัสโดเมน trx มีอยู่ในทน PI - ตา
ประกอบด้วยข้าวระดับสูงสุดของการแสดงออกในการเปรียบเทียบกับความยาวเต็มพื้นที่อื่นหรือบันทึกการสนทนาถูกตัดให้สั้นลง
ที่ทำการไปรษณีย์ - transcriptional เหล่านี้การแก้ไขของ PI - ตาผลิต Series ของทรานสคริปท์ isoforms ที่
ไม่สามารถมีบทบาทสำคัญในการกำกับดูแลยีน R และ/หรืออาจจะเพิ่มขึ้นความหลากหลายโปรตีน
ซึ่งจะช่วยให้เรามีความรู้การศึกษานี้เป็นรายงานแรกของฟื้นฟูทางเลือกของยีน - lrr CC
ตามมาตรฐานการผลิตที่แสดงตัดให้สั้นลง isoforms ที่ 50 หรือ 30 สถานีปลายทางของเขาและประกาศนียบัตรรวมถึงมีโดเมน trx ทั้งที่ cterminus ของพวกเขา