Population and GenotypesIn Cycle VI

Population and Genotypes
In Cycle VII of the USMARC Germplasm Evaluation
(GPE) Project, purebred Angus (AN), Hereford
(HH), Simmental (SM), Limousin (LI), Charolais
(CH), Gelbvieh (GV), and Red Angus (AR) sires were
mated by AI to composite MARC III [1/4 AN, 1/4 HH,
1/4 Pinzgauer (PZ), 1/4 Red Poll (RP)], AN- and HHbase
cows to produce progeny designated as (but not
strictly) F1, born in 1999, 2000, and 2001. The 1999-
and 2000-born male calves were castrated and fed for
slaughter. Female F1 and the 2001-born F1 males were
kept for breeding, and mated in multiple-sire pastures
to produce 2-, 3-, and 4-breed cross progeny designated
F1
2. The F1
2 calves were born in March through May
of 2003 to 2007, from 3-yr-old and older dams. Male
calves were castrated within 24 h after birth. Calves
were weaned in September at approximately 165 d
of age. After weaning, steers were managed and fed
for slaughter, and heifers were developed for breeding
starting the following May.
BovineSNP50 genotypes of Cycle VII AI sires, F1 and
F1
2 progeny were obtained following manufacturer’s
protocols (Illumina, 2008). BeadStudio software with
the genotyping module (Illumina, 2006) was used to
determine genotypes of the 150 purebred sires, 745 F1
(73 bulls, 517 steers, 155 heifers), and 2,013 F1
2 animals
(1,306 steers, 707 heifers). Only 52 of the 592 F1 heifers
that became dams of F1
2 calves had BovineSNP50 genotypes,
so genotypes of the remaining F1 dams were approximated
with a mixed model method (Gengler et al.,
2007) that used 50K genotypes of the sire of each dam,
progeny, and other known relatives to predict probable
genotypes. The equations to approximate missing genotypes
included covariates of proportion AN, HH, SM,
LI, CH, GV, AR, PZ, and RP to account for allele frequency
differences in the contributing breeds.
Phenotypes and Analyses
Body weights observed at birth, weaning, and approximately
12 mo of age were utilized. Phenotypes
analyzed included birth weight (BWT), BW gain from
birth to weaning, adjusted to 205 d (WG), 205-d adjusted
weaning weight (WW), 160-d adjusted postweaning
BW gain (PWG), and 365-d adjusted yearling weight
(YW), with age-adjusted traits defined as

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ประชากรและยีน
ในรอบเจ็ดของการประเมินเชื้อพันธุกรรม usmarc
(GPE) โครงการพันธุ์แองกัส (), เฮีย
(hh) Simmental (SM), Limousin (li) Charolais
(CH) gelbvieh (GV) และสีแดงตระกูลแองกัส (AR) เป็น
แต่งงานแล้วโดยไอคอมโพสิตรายการ MARC iii [1/4, 1/4 hh,
1/4 Pinzgauer (PZ) 1/4 โพลล์สีแดง (RP)] และ hhbase
วัวเพื่อผลิตลูกหลานรับมอบหมายให้เป็น (แต่ไม่เคร่งครัด
) f1 เกิดในปี 19992000 และ 2001 1999 -
และ 2000 เกิดที่น่องชายถูกตอนและอาหารสำหรับการฆ่า
f1 หญิงและ 2001 เกิดเป็นเพศชาย f1
เก็บไว้สำหรับการเพาะพันธุ์และผสมพันธุ์ในทุ่งหญ้าหลายฝ่าบาท
การผลิต 2 - 3 - และลูกหลานข้าม 4 สายพันธุ์ที่กำหนด f1

2 f1
2 น่องเกิดในเดือนมีนาคมถึงพฤษภาคม
จาก 2003-2007, จากเขื่อน 3-yr-มีอายุ น่อง
ชายถูกตอนภายใน 24 ชั่วโมงหลังคลอด
น่องถูกหย่านมในเดือนกันยายนอยู่ที่ประมาณ 165 d
อายุ หลังจากหย่านมนำพาได้รับการจัดการและการเลี้ยงดู
สำหรับโรงฆ่าสัตว์และโคได้รับการพัฒนาสำหรับการเพาะพันธุ์
เริ่มต้นต่อไปนี้อาจ.
bovinesnp50 จีโนไทป์ของว​​งจร vii Ai ตระกูล, f1 และ
f1
2 ลูกหลานที่ได้รับดังต่อไปนี้ผู้ผลิต
โปรโตคอล (Illumina, 2008 ) ซอฟแวร์ที่มี beadstudio
โมดูล genotyping (Illumina, 2006) ถูกใช้ในการ
ตรวจสอบยีนของตระกูลพันธุ์แท้ 150, 745 f1
(73 วัว 517 นำพา 155 โค) และ 2,013 f1
2
สัตว์ (1,306 นำพา, โค 707) เพียง 52 จาก 592 โค f1
ที่กลายมาเป็นเขื่อนของ f1
2 น่องมี bovinesnp50 ยีน
ดังนั้นยีนของเขื่อน f1 ที่เหลืออยู่ประมาณ
ด้วยวิธีการแบบผสม (gengler et al.
2007) ที่ใช้ 50k ยีนของ ฝ่าบาทของเขื่อนแต่ละลูกหลาน
และญาติที่รู้จักกันอื่น ๆ ที่จะทำนายยีน
น่าจะเป็น สมการที่ยีนที่ขาดหายไปประมาณ
ตัวแปรรวมของสัดส่วน, hh, SM,
li, CH, GV, ar, PZ และ RP บัญชีสำหรับความถี่อัลลีล
แตกต่างในสายพันธุ์ที่เอื้อ. phenotypes

และการวิเคราะห์น้ำหนักตัวสังเกต ที่เกิดหย่านมและประมาณ 12
mo จากอายุที่ถูกนำมาใช้ phenotypes
วิเคราะห์รวมน้ำหนักแรกเกิด (BWT) กำไร BW ตั้งแต่แรกเกิดถึงหย่านม
ปรับถึง 205 d (WG), 205-d
ปรับเปลี่ยนน้ำหนักหย่านม (ww), 160-d ปรับเปลี่ยนหลังหย่านม
กำไร BW (PWG) และ 365 - d ปรับเปลี่ยนน้ำหนักขวบ
(YW) กับลักษณะอายุที่ปรับตามที่กำหนดไว้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ประชากรและการศึกษาจีโนไทป์
ในวงจร VII ของโครงการ Evaluation
(GPE) Germplasm USMARC พ่อพันธุ์โค Angus (AN), Hereford
(HH), Simmental (SM), Limousin (LI), Charolais
(CH), Gelbvieh (จี วี), และสีแดง Angus (AR) พันธุ์แท้ถูก
mated โดย AI เพื่อผสมมาร์ค III [1/4, 1/4 ชช,
1/4 Pinzgauer (PZ), 1/4 สำรวจความคิดเห็นแดง (RP)], AN และ HHbase
แม่โคเพื่อผลิตลูกหลานที่กำหนดให้เป็น (แต่ไม่
อย่างเคร่งครัด) F1เกิดในปี 1999 2000 และ 2001 1999-
และ 2000 เกิดเพศชายถูกตอน และเลี้ยงสำหรับ
ฆ่า F1 ที่หญิงและชาย F1 2001 เกิด
เก็บไว้เพาะพันธุ์ และ mated ใน pastures หลายเดิน
ผลิต 2- 3 และ 4 สายพันธุ์ลูกหลานข้ามกำหนด
F1
2 F1
วัว 2 เกิดในเดือนมีนาคมถึงพฤษภาคม
ของ 2003 กับ 2007 จากเขื่อน อายุ 3 ปี และมากกว่า ชาย
วัวถูกตอนภายใน 24 ชมหลังคลอด วัว
ถูกหย่านมถึงในเดือนกันยายนที่ประมาณ 165 d
อายุ หลังจาก weaning สำเร็จได้จัดการ และติดตาม
สำหรับฆ่า และ heifers ได้พัฒนาขึ้นมาเพื่อผสมพันธุ์
เริ่มต้นต่อไปนี้อาจ
BovineSNP50 ศึกษาจีโนไทป์ของพ่อพันธุ์โครอบ VII AI, F1 และ
F1
2 ลูกหลานได้รับต่อไปนี้ของผู้ผลิต
โพรโทคอล (Illumina, 2008) ซอฟต์แวร์ BeadStudio กับ
โม genotyping (Illumina, 2006) ที่ใช้
กำหนดศึกษาจีโนไทป์ของพ่อพันธุ์ 150 พันธุ์แท้โค 745 F1
(วัว 73, 517 สำเร็จ 155 heifers), และ 2,013 F1
สัตว์ 2
(สำเร็จ 1,306, 707 heifers) 52 เท่าของ 592 F1 heifers
ที่เป็นสายของ F1
2 วัวได้ศึกษาจีโนไทป์ BovineSNP50,
เพื่อศึกษาจีโนไทป์เขื่อน F1 ที่เหลือถูกเลียนแบบ
ด้วยวิธีแบบผสม (Gengler et al.,
2007) ที่ใช้ 50K ศึกษาจีโนไทป์ของเดินแต่ละเขื่อน,
ลูกหลาน และญาติทราบเพื่อทำนายดำรง
ศึกษาจีโนไทป์ สมการการศึกษาจีโนไทป์ที่หายไปประมาณ
รวม covariates สัดส่วน AN ชช SM,
LI, CH จีวี AR, PZ และ RP ให้ความถี่ของ allele
ความแตกต่างในการทำสายพันธุ์
ฟีและวิเคราะห์
สังเกตที่เกิด การ weaning น้ำหนักร่างกาย และประมาณ
หม้อ 12 อายุก็ใช้ ฟี
เกิดรวมวิเคราะห์ (BWT), BW น้ำหนักจาก
เกิดการ weaning ปรับปรุง d 205 (WG), 205-d ปรับ
weaning น้ำหนัก (WW), 160-d ปรับ postweaning
BW ได้รับ (PWG), และ 365-d ปรับปรุง yearling weight
(YW) มีลักษณะอายุการปรับปรุงที่กำหนดเป็น

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ประชากรและ genotypes
ซึ่งจะช่วยในการ๗ของที่ usmarc เชื้อการประเมิน
( gpe )โครงการ, purebred แองกัส(),เฮียร์ฟอร์ด
( hh ), simmental ( SM ), limousin ( Li ),สเต็ค Charolais
( Ch ), gelbvieh ( GV ),และสีแดงแองกัส(อาร์เจนตินา) sires
ซึ่งจะช่วยเป็นโปรเซสเซอร์โดย AI ในคอมโพสิตมาร์ก III [ 1/4 1/4 1/4 ที่, 1/4 1/4 1/4 HH ,
1/4 1/4 1/4 pinzgauer ( PZ ),สีแดง 1/4 1/4 1/4 เรียกเอกสาร( RP )],ให้และ hhbase
วัวที่จะต้องทำให้เกิดลูกหลานได้รับมอบหมายให้อยู่ในฐานะ(แต่ไม่ใช่
) F 1 ,เกิดมาในปี 1999 ,2000 และ 2001 . 1999 -
ลูกวัวตัวผู้ 2000 - เกิดและได้ castrated และเลี้ยงสำหรับ
การฆ่า หญิง F 1 และ 2001 - เกิด F 1 ผู้ชายที่เป็น
ซึ่งจะช่วยรักษาสำหรับการผสมพันธุ์และโปรเซสเซอร์ในทุ่งหญ้าเลี้ยงสัตว์หลายบิดา
ซึ่งจะช่วยในการผลิต 2-3 2-3 2-3 - และ 4 - พันธุ์ข้ามลูกหลานที่กำหนด

2 F 1 ลูกวัว F 1 ~ 2 ที่เกิดมาในเดือนมีนาคมผ่านอาจ
ซึ่งจะช่วยของ 2003 ถึง 2007 จากเขื่อน 3 - ปีเก่าและรุ่นเก่า ผู้ชาย:
ลูกวัวเป็น castrated ภายใน 24 ชั่วโมงหลังคลอดลูกวัว
ซึ่งจะช่วยได้หย่านมในเดือนกันยายนที่ประมาณ 165 D
ของอายุ หลังจากหย่านมแม่,คัดได้มีการบริหารจัดการและเลี้ยง
ซึ่งจะช่วยในการฆ่าและกลุ่มเอเชียตะวันออกเฉียงใต้ได้พัฒนาขึ้นมาสำหรับการผสมพันธุ์
เริ่มต้นที่ได้ต่อไปนี้อาจ.
bovinesnp 50 genotypes ของวงจร๗ AI sires , F 1 และ

2 F 1 ลูกหลานได้ต่อไปนี้ผู้ผลิต' s
โปรโตคอล( illumina , 2008 ) ซอฟต์แวร์ beadstudio ด้วย
ที่ genotyping โมดูล( illumina 2006 )ได้ถูกนำมาใช้เพื่อตอบแทน
กำหนด genotypes 150 sires purebred ที่วัว 745 F 1
( 73517155 คัดกก)และ 2,013 F 1

2 สัตว์( 1,306 คัดกก 707 ) เพียง 52 ของ 592 F 1 กก
ที่กลายเป็นเขื่อนของ F 1 ~ 2 ลูกวัวได้ bovinesnp 50 genotypes ,
ดังนั้น genotypes ของ F 1 ที่เหลือเป็นเขื่อนโดย
ด้วยวิธีการผสมรุ่น( gengler et al .,
2007 )ที่ใช้ 50 K genotypes ของบิดาของแต่ละเขื่อน,
ลูกหลาน,และญาติสนิทที่มีชื่อเสียงอื่นๆเพื่อทำนายว่าน่าจะเป็นไปได้
genotypes . สมกับที่หายไปประมาณ genotypes
covariates รวมถึงสัดส่วนของที่, HH ,จ.ส.อ.,
Li , ch , gv ,อาร์เจนตินา, PZ ,และ RP ไปยังบัญชีสำหรับ allele ความถี่
ซึ่งจะช่วยความแตกต่างในเรื่องสายพันธุ์.

ซึ่งจะช่วยวิเคราะห์และ phenotypes ร่างกายน้ำหนักสังเกตเห็นในการเกิดทารกและ
ซึ่งจะช่วยประมาณ 12 , MO ของอายุก็ใช้งาน. phenotypes
ตามมาตรฐานนำมาวิเคราะห์รวมถึงการเกิดน้ำหนัก( bwt ),ขาวดำ,ได้รับจาก
เกิดการหย่านมแม่,การปรับ 205 D (น), 205 - D ปรับ
สำหรับทารกน้ำหนัก(บบ), 160 - D ปรับ postweaning
BW อัตราการขยายสัญญาณ( pwg ),และ 365 - D ปรับหญิงซึ่งสมรสได้ปีเดียวน้ำหนัก
(ชิ้นส่วน YW )พร้อมด้วยอายุ - ปรับคุณสมบัติที่กำหนดไว้เป็น