Eurosurveillance, Volume 20, Issue 49, 10 December 2015Rapid communica การแปล - Eurosurveillance, Volume 20, Issue 49, 10 December 2015Rapid communica ไทย วิธีการพูด

Eurosurveillance, Volume 20, Issue

Eurosurveillance, Volume 20, Issue 49, 10 December 2015
Rapid communication
DETECTION OF MCR-1 ENCODING PLASMID-MEDIATED COLISTIN-RESISTANT ESCHERICHIA COLI ISOLATES FROM HUMAN BLOODSTREAM INFECTION AND IMPORTED CHICKEN MEAT, DENMARK 2015

H Hasman 1 , AM Hammerum 1 , F Hansen 1 , RS Hendriksen 2 , B Olesen 3 , Y Agersø 2 , E Zankari 2 , P Leekitcharoenphon 2 , M Stegger 1 4 , RS Kaas 2 , LM Cavaco 2 , DS Hansen 3 , FM Aarestrup 2 , RL Skov 1
+ Author affiliations

1. Department of Microbiology and Infection Control, Statens Serum Institut, Copenhagen, Denmark
2. National Food Institute, Technical University of Denmark, Lyngby, Denmark
3. Department of Clinical Microbiology, Herlev and Gentofte Hospital, Copenhagen University Hospital, Herlev, Denmark
4. Pathogen Genomics Division, Translational Genomics Research Institute (TGen), Flagstaff, Arizona, USA

Correspondence: Henrik Hasman (henh@ssi.dk)

Citation style for this article: Hasman H, Hammerum A, Hansen F, Hendriksen R, Olesen B, Agersø Y, Zankari E, Leekitcharoenphon P, Stegger M, Kaas R, Cavaco L, Hansen D, Aarestrup F, Skov R. Detection of mcr-1 encoding plasmid-mediated colistin-resistant Escherichia coli isolates from human bloodstream infection and imported chicken meat, Denmark 2015. Euro Surveill. 2015;20(49):pii=30085. DOI: http://dx.doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2015.20.49.30085

Received:04 December 2015
The plasmid-mediated colistin resistance gene, mcr-1, was detected in an Escherichia coli isolate from a Danish patient with bloodstream infection and in five E. coli isolates from imported chicken meat. One isolate from chicken meat belonged to the epidemic spreading sequence type ST131. In addition to IncN2, an incX4 replicon was found to be linked to mcr-1. This report follows a recent detection of mcr-1 in E. coli from animals, food and humans in China.

Very recently, in November 2015, Liu et al. reported the finding of a transferable plasmid-mediated colistin resistance gene, mcr-1, detected in Escherichia coli isolates from animals, food and patients in China. Moreover, they found mcr-1 in Klebsiella pneumoniae isolates from patients [1]. Horizontal gene transfer represents a paradigm shift in colistin resistance, which until then only was found to be mediated by chromosomal mutations and thus spread by vertical transmission.

National surveillance of antimicrobial resistance in food animals, food and humans in Denmark using whole genome sequencing

Since 2012, the national surveillance of antimicrobial resistance in food animals, food and humans in Denmark (www.DANMAP.org) has used whole-genome sequence (WGS) analysis for detection of resistance genes and multilocus sequence typing (MLST) using the open-access bioinformatic web-tools ResFinder and MLST, respectively from www.genomicepidemiology.org for characterisation of extended spectrum beta-lactamase (ESBL)- and AmpC-producing E. coli isolates [2-4]. The mcr-1 sequence from China was added on 24 November 2015 to the ResFinder database as soon as it was available from The National Center for Biotechnology Information (NCBI).

Investigation of presence of mcr-1 in E. coli isolates from food animals, food and human bloodstream infections

The updated version of ResFinder was used to analyse the WGS data from ESBL- and AmpC-producing E. coli isolates from food animals and food for the years 2012 to 2014, as well as ESBL- and AmpC-producing E. coli isolates from human bloodstream infections, and carbapenemase-producing organisms (CPOs) from humans, from January 2014 to beginning of November 2015 (Table 1), for the presence of mcr-1. Furthermore, fluoroquinolone resistance determinants were investigated by searching manually for mutations in the GyrA, ParC and ParE. [5].

Table 1

Numbers of extended spectrum beta-lactamase and AmpC-producing E. coli isolates obtained and analysed by WGS from chicken meat, humans and carbapenemase-producing isolates from humans tested for mcr-1 using ResFinder, Denmark, November 2015 (n=914)

Isolate origin No. of isolates analysed by WGS No. of sequences positive for mcr-1
ESBL- and AmpC-producing E. coli isolates from Danish chicken meat (2012–2014) 125 0
ESBL- and AmpC-producing E. coli isolates from imported chicken meat (2012–2014) 255 5
ESBL- and AmpC-producing E. coli isolates from human bloodstream infections (January 2014– beginning of November 2015) 417 1
Carbapenemase-producing isolates from humans (January 2014– beginning of November 2015) 117 0
ESBL: extended spectrum beta-lactamase; No: number; WGS: whole-genome sequence.

The mcr-1 gene was detected in one E. coli isolate from a human bloodstream infection from 2015 and in five E. coli isolates obtained from chicken meat of European origin imported to Denmark from 2012, 2013 and 2014 (Table 2). None of the CPOs were positive for mcr-1 (Table 1).

Table 2

Genotypic characterisation of mcr-1-positive E. coli isolates, Denmark, November 2015 (n=6)

Isolate name Origin Year of detection MLST Resistance genes detected by ResFinder besides mcr-1 Detection of chromosomal mutations encoding resistance to quinolones
0412016126 Chicken meat 2012 ST359 aadA1, aadA5, aph(3')-Ic, bla CMY-2, blaTEM-1B,dfrA1,strA, strB, sul1, sul2, tet(B) GyrA (S83L, D87N) ParC (E62K)
0412044854 Chicken meat 2012 ST48 aadA1, bla CMY-2, blaTEM-1B,dfrA1, mph(B), strA, strB, sul1, sul2, tet(A) GyrA (S83L)
0412049521 Chicken meat 2012 ST131 aadA1, bla SHV-12, bla CMY-2 , strA, strB, sul1, dfrA1, tet(A) ND
0413040864 Chicken meat 2013 ST1112 aadA1, aadA2, blaSHV-12, cmlA1, sul3, tet(A) ND
14042624 Chicken meat 2014 ST2063 aadA1, aadA2, bla SHV-12, cmlA1, sul3 ND
ESBL20150072 Human, bloodstream infection 2015 ST744 aadA5, blaCMY-2, blaCTX-M-55, blaTEM-1B, catA1, dfrA17, floR, fosA, mph(A), rmtB, strA, strB, sul1, sul2, tet(A) GyrA (S83L, D87N) ParC (E62K)
MLST: multilocus sequence typing; ND: not detected.

The patient infected with the mcr-1-positive E. coli was an elderly man with prostate cancer and repeated urinary tract infections with ESBL-producing E. coli resulting in four positive urine samples over five month prior to the bloodstream infection, all resistant to third generation cephalosporins, gentamicin, sulfamethoxazole, trimethoprim and ciprofloxacin (these isolates were not investigated further). He had been treated empirically with piperacillin/tazobactam and subsequently meropenem after susceptibility testing of the bloodstream isolate, but not with colistin according to the available patient data.

Besides mcr-1, the human isolate from the Danish patient contained 15 different resistance genes including blaCTX-M-55 and blaCMY-2 conferring resistance to extended-spectrum beta-lactam antibiotics as well as two GyrA mutations (S83L, D87N) and a ParC mutation (E62K) leading to high-level fluoroquinolone resistance (Table 2). The human mcr-1 positive E. coli isolate belonged to ST744, a rare sequence type in both humans and animals in Denmark. The patient had not been travelling abroad recently and the origin of the isolate is unknown.

The blaCMY-2 gene was detected in three of the five mcr-1-positive chicken meat isolates. In addition, three of the chicken meat E. coli isolates carried blaSHV-12 conferring resistance to extended-spectrum beta-lactam antibiotics excluding cephamycins.

One of the mcr-1 positive E. coli isolates from chicken meat belonged to ST131. The other chicken meat isolates belonged to sequence types not frequently found in Denmark (Table 2). The human MCR-1-producing E. coli isolate was only susceptible to piperacillin/tazobactam, carbapenems and tigecycline according to the European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) breakpoints [6], whereas the chicken meat isolates were less resistant (Table 3).

Click here to see the full table
Table 3

Antimicrobial susceptibility profiles of the five MCR-1-producing E. coli isolates from chicken meat and the MCR-1-producing E. coli isolate from human bloodstream infection, Denmark November 2015

Origin Human Chicken meat
Isolate name ESBL20150072 14042624 0413040864 0412049521 0412016126 0412044854
Antimicrobial agent MIC (mg/L) S/R MIC (mg/L) S/R MIC (mg/L) S/R MIC (mg/L) S/R MIC (mg/L) S/R MIC (mg/L) S/R
Polymyxins
Colistin > 4 R > 4 R > 4 R > 4 R > 4 R > 4 R
Polymyxin Ba 4 R > 4 R 4 R > 4 R > 4 R 4 R
Beta-lactam/beta-lactam inhibitor combinations
Ticarcillin/clavulanic acid 128/2 R > 128/2 R ≤ 16/2 S 64/2 R 64/2 R ≤ 16/2 S
Piperacillin/tazobactam ≤ 8/4 S ≤ 8/4 S ≤ 8/4 S ≤ 8/4 S ≤ 8/4 S ≤ 8/4 S
Cephalosporins
Cefotaxime > 32 R 8 R 8 R 8 R 8 R 4 R
Ceftazidime > 16 R > 16 R 8 R > 16 R 16 R 8 R
Cefepime > 2 R ≤ 2 S ≤ 2 S ≤ 2 S ≤ 2 S ≤ 2 S
Monobactams
Aztreonam > 16 R > 16 R > 16 R > 16 R 8 R 8 R
Carbapenems
Ertapenem ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S
Meropenem ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S
Imipenem ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S
Doripenem ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S
Aminoglycosides
Gentamicin > 8 R ≤ 1 S 2 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S
Tobramycin > 8 R ≤ 1 S 2 S ≤ 1 S 2 S ≤ 1 S
Amikacin > 4 R ≤ 4 S ≤ 4 S ≤ 4 S ≤ 4 S ≤ 4 S
Fluoroquinolones
Ciprofloxacin > 2 R ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S > 2 R ≤ 0.25 S
Levofloxacin 8 R ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S > 8 R ≤ 1 S
Tetracyclines
Doxycyclineb 8 I ≤ 2 S 16 R 8 I 16 R 8 I
Minocyclineb 4 S ≤ 2 S 4 S ≤ 2 S 16 R ≤ 2 S
Glycylcyclines
Tigecycline ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S
Folate pathway inhibitors
Trimethoprim/sulfamethoxazole > 4/76 R ≤ 0.5/9.5 S ≤ 0.5/9.5 S > 4/76 R > 4/76 R > 4/76 R

R/S according to the European Committee on Antimicrobial Susceptibility (EUCAST) clinical breakpoints [6].

I: intermediate; MIC: Minimal Inhibitory Concentration; R: resistant: S: sensitive.

a Breakpoint according to Société Francaise de Microbiologie [7]

b R/I/S accordin
0/5000
จาก: -
เป็น: -
ผลลัพธ์ (ไทย) 1: [สำเนา]
คัดลอก!
Eurosurveillance, Volume 20, Issue 49, 10 December 2015Rapid communicationDETECTION OF MCR-1 ENCODING PLASMID-MEDIATED COLISTIN-RESISTANT ESCHERICHIA COLI ISOLATES FROM HUMAN BLOODSTREAM INFECTION AND IMPORTED CHICKEN MEAT, DENMARK 2015H Hasman 1 , AM Hammerum 1 , F Hansen 1 , RS Hendriksen 2 , B Olesen 3 , Y Agersø 2 , E Zankari 2 , P Leekitcharoenphon 2 , M Stegger 1 4 , RS Kaas 2 , LM Cavaco 2 , DS Hansen 3 , FM Aarestrup 2 , RL Skov 1+ Author affiliations1. Department of Microbiology and Infection Control, Statens Serum Institut, Copenhagen, Denmark2. National Food Institute, Technical University of Denmark, Lyngby, Denmark3. Department of Clinical Microbiology, Herlev and Gentofte Hospital, Copenhagen University Hospital, Herlev, Denmark4. Pathogen Genomics Division, Translational Genomics Research Institute (TGen), Flagstaff, Arizona, USACorrespondence: Henrik Hasman (henh@ssi.dk)Citation style for this article: Hasman H, Hammerum A, Hansen F, Hendriksen R, Olesen B, Agersø Y, Zankari E, Leekitcharoenphon P, Stegger M, Kaas R, Cavaco L, Hansen D, Aarestrup F, Skov R. Detection of mcr-1 encoding plasmid-mediated colistin-resistant Escherichia coli isolates from human bloodstream infection and imported chicken meat, Denmark 2015. Euro Surveill. 2015;20(49):pii=30085. DOI: http://dx.doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2015.20.49.30085Received:04 December 2015ตรวจพบยีนต้านทาน colistin plasmid mediated, mcr-1 ในการ Escherichia coli แยกจากผู้ป่วยติดเชื้อกระแสเลือดเดนมาร์ก และห้า E. coli ที่แยกได้จากเนื้อไก่ที่นำเข้า หนึ่งแยกจากเนื้อไก่อยู่ที่การระบาดแพร่กระจายชนิดลำดับ ST131 นอกจาก IncN2, replicon incX4 การพบลิงค์ mcr-1 รายงานนี้ไปตรวจล่าสุดของ mcr-1 ใน E. coli จากสัตว์ อาหาร และมนุษย์ในประเทศจีนมากเมื่อเร็ว ๆ นี้ ในเดือน 2015 พฤศจิกายน หลิว et al. รายงานการค้นหาของตัวต้านทาน colistin plasmid mediated โอน ยีน mcr-1 พบใน Escherichia coli ที่แยกได้จากสัตว์ อาหาร และผู้ป่วยในจีน นอกจากนี้ พวกเขาพบ mcr 1 ใน Klebsiella pneumoniae ที่แยกได้จากผู้ป่วย [1] โอนย้ายยีนแนวนอนแสดงถึงกระบวนทัศน์ในต้านทาน colistin ซึ่งจนแล้วเท่า ที่พบจะ mediated โดยการกลายพันธุ์ของโครโมโซมจึง แพร่กระจาย โดยการส่งแนวตั้งรักษาความปลอดภัยแห่งชาติต้านจุลินทรีย์ในอาหารสัตว์ อาหาร และมนุษย์ในประเทศเดนมาร์กใช้ลำดับทั้งจีโนมตั้งแต่ 2012 รักษาความปลอดภัยแห่งชาติต้านจุลินทรีย์ในอาหารสัตว์ อาหาร และมนุษย์ในเดนมาร์ก (ส่วน www.DANMAP.org) มีใช้ทั้งจีโนม (WGS) การวิเคราะห์สำหรับการตรวจหายีนที่ต้านทานและลำดับที่ multilocus พิมพ์ (MLST) ที่ใช้ผลเชิงวิวัฒนาการเปิดเข้าเว็บเครื่องมือ ResFinder และ MLST ตามลำดับจากการตรวจลักษณะเฉพาะของของ www.genomicepidemiology.org ขยายคลื่นเบต้า-lactamase (ESBL) - และผลิต AmpC E. coli ที่แยกได้ [2-4] ลำดับ mcr 1 จากจีนเข้ามา 24 2015 พฤศจิกายนในฐานข้อมูล ResFinder เป็นมันมีจากศูนย์แห่งชาติที่สำหรับเทคโนโลยีชีวภาพข้อมูล (NCBI)ตรวจสอบสถานะของ mcr-1 ใน E. coli ที่แยกได้จากอาหารสัตว์ อาหาร และการติดเชื้อในกระแสเลือดมนุษย์รุ่นปรับปรุงของ ResFinder ถูกใช้เพื่อวิเคราะห์ข้อมูล WGS จาก ESBL และ AmpC-ผลิต E. coli ที่แยกได้จากอาหารสัตว์และอาหารสำหรับปี 2012 ไป 2014 รวมทั้งผลิต ESBL และ AmpC E. coli ที่แยกได้จากการติดเชื้อในกระแสเลือดของมนุษย์ และ carbapenemase ผลิตสิ่งมีชีวิต (CPOs) จากมนุษย์ จาก 2014 มกราคมต้น 2015 พฤศจิกายน (ตาราง 1), สำหรับของ mcr-1 นอกจากนี้ ดีเทอร์มิแนนต์ fluoroquinolone ต้านทานถูกสอบสวน โดยค้นหาด้วยตนเองสำหรับการกลายพันธุ์ใน GyrA ปาร์ค และ ParE [5]ตารางที่ 1จำนวนขยายคลื่นเบต้า-lactamase และผลิต AmpC E. coli ที่แยกได้ และ analysed โดย WGS จากเนื้อไก่ มนุษย์และผลิต carbapenemase แยกจากมนุษย์ทดสอบ mcr-1 ใช้ ResFinder เดนมาร์ก 2015 พฤศจิกายน (n = 914)เพราะจุดเริ่มต้นของหมายเลข ของแยก analysed หมายเลข WGS ลำดับบวก mcr-1ผลิต ESBL และ AmpC E. coli ที่แยกได้จากเนื้อไก่เดนมาร์ก (2012-2014) 125 0ผลิต ESBL และ AmpC E. coli ที่แยกได้จากการนำเข้าไก่เนื้อ (2012-2014) 255 5ผลิต ESBL และ AmpC E. coli ที่แยกได้จากการติดเชื้อกระแสเลือดมนุษย์ (2014 มกราคม – ต้น 2015 พฤศจิกายน) 417 1Carbapenemase การผลิตแยกจากมนุษย์ (2014 มกราคม – ต้น 2015 พฤศจิกายน) 117 0ESBL: ขยายคลื่นเบต้า-lactamase No: หมายเลข WGS: ทั้งจีโนมลำดับตรวจพบยีน mcr-1 หนึ่ง E. coli ที่แยกจากการติดเชื้อกระแสเลือดมนุษย์จาก 2015 และ E. coli เพิ่มห้าที่แยกได้จากเนื้อไก่ของยุโรปนำเข้าไปเดนมาร์ก จาก 2012, 2013 2014 (ตาราง 2) ไม่ CPOs มีค่าบวกสำหรับ mcr-1 (ตาราง 1)ตารางที่ 2ตรวจลักษณะเฉพาะของจีโนไทป์ของ mcr-1-บวก E. coli ที่แยกได้ เดนมาร์ก 2015 พฤศจิกายน (n = 6)แยกชื่อปีกำเนิดของยีนต้านทาน MLST ตรวจพบ โดย ResFinder นอกจากตรวจ mcr-1 กลายพันธุ์ของโครโมโซมเข้าต้านทานการ quinolones0412016126 ไก่เนื้อ 2012 ST359 aadA1, aadA5, aph(3') Ic, bla CMY-2, blaTEM 1B, dfrA1, strA, strB, sul1, sul2, tet(B) ปาร์ค GyrA (S83L, D87N) (E62K)0412044854 ไก่เนื้อ 2012 ST48 aadA1, bla CMY-2, blaTEM 1B, dfrA1, mph(B), strA, strB, sul1, sul2, tet(A) GyrA (S83L)0412049521 ไก่เนื้อ 2012 ST131 aadA1, SHV-12 bla, bla CMY-2, strA, strB, sul1, dfrA1, tet(A) ND0413040864 ไก่เนื้อ 2013 ST1112 aadA1, aadA2, blaSHV-12, cmlA1, sul3, tet(A) NDไก่เนื้อปี 2014 ST2063 aadA1 14042624, aadA2, bla SHV-12, cmlA1, sul3 NDESBL20150072 มนุษย์ กระแสเลือดติดเชื้อ 2015 ST744 aadA5, blaCMY 2, blaCTX-M-55, blaTEM 1B, catA1, dfrA17, floR, fosA, mph(A), rmtB, strA, strB, sul1, sul2, tet(A) ปาร์ค GyrA (S83L, D87N) (E62K)MLST: multilocus ลำดับการพิมพ์ ND: ไม่พบผู้ป่วยที่ติดเชื้อ mcr-1-บวก E. coli ถูกคนเป็นผู้สูงอายุโรคมะเร็งที่ต่อมลูกหมากและการติดเชื้อทางเดินปัสสาวะซ้ำกับผลิต ESBL E. coli เป็นผลในตัวอย่างปัสสาวะบวกสี่ห้าเดือนก่อนที่กระแสเลือดติดเชื้อ ทั้งทนต่อ cephalosporins รุ่นที่สาม gentamicin ซัลฟาเมโทซาโซล ไตรเมโทพริม และ ciprofloxacin (แยกเหล่านี้ไม่ตรวจสอบเพิ่มเติม) เขาได้รับการรักษา empirically piperacillin/ทา โซแบคแตมและต่อ meropenem หลังจากภูมิไวรับทดสอบแยกกระแสเลือด แต่ กับ colistin ตามข้อมูลผู้ป่วยไม่นอกจาก mcr-1 บุคคลแยกจากผู้ป่วยเดนมาร์กประกอบด้วยยีนต้านทานแตกต่างกัน 15 blaCTX-M-55 และ blaCMY-2 conferring ต้านทานยาปฏิชีวนะสเปกตรัมขยาย beta-lactam เป็น GyrA กลายพันธุ์ 2 (S83L, D87N) และมีปาร์คกลายพันธุ์ (E62K) นำไปสู่ความต้านทานสูง fluoroquinolone (ตาราง 2) มนุษย์ mcr-1 บวก E. coli ที่แยกเป็นสมาชิก ST744 ลำดับที่หายากชนิดในมนุษย์และสัตว์ในเดนมาร์ก ผู้ป่วยก็ไม่ได้เดินทางต่างประเทศล่าสุด และจุดเริ่มต้นของการแยกระบบไม่รู้จักตรวจพบยีน blaCMY 2 ใน 3 ห้าบวก mcr-1 ไก่เนื้อแยก นอกจากนี้ 3 ตัวไก่เนื้อ E. coli ที่แยกได้ทำ blaSHV 12 conferring ความต้านทานต่อยาปฏิชีวนะสเปกตรัมขยาย beta-lactam ไม่รวมยอด cephamycinsหนึ่ง mcr-1 บวก E. coli ที่แยกได้จากเนื้อไก่เป็นสมาชิก ST131 อื่น ๆ เนื้อไก่แยกเป็นสมาชิกลำดับชนิดมักไม่พบในเดนมาร์ก (ตาราง 2) มนุษย์ MCR 1-ผลิต E. coli แยกได้เท่านั้นไวต่อ การ piperacillin/ทา โซแบคแตม carbapenems tigecycline ตามคณะกรรมการยุโรปจุดสั่งหยุดทดสอบภูมิไวรับของจุลินทรีย์ (EUCAST) [6], ในขณะที่ไก่เนื้อแยกได้น้อยทน (ตาราง 3)คลิกที่นี่เพื่อดูตารางเต็มตาราง 3ภูมิไวรับจุลินทรีย์โพรไฟล์ห้า MCR 1-ผลิต E. coli ที่แยกได้จากเนื้อไก่และ MCR 1-ผลิต E. coli ที่แยกจากการติดเชื้อในกระแสเลือดของมนุษย์ เดนมาร์ก 2015 พฤศจิกายนกำเนิดมนุษย์ไก่เนื้อแยกชื่อ ESBL20150072 14042624 0413040864 0412049521 0412016126 0412044854จุลินทรีย์ไมค์ (mg/L) ไมค์ S/R (mg/L) ไมค์ S/R (mg/L) ไมค์ S/R (mg/L) ไมค์ S/R (mg/L) ไมค์ S/R (mg/L) S/RPolymyxinsColistin > 4 R > 4 R > 4 R > 4 R > 4 R > 4 RPolymyxin บา 4 R > 4 R 4 R > 4 R > 4 R 4 Rชุดสารยับยั้ง beta-lactam/beta-lactamTicarcillin/clavulanic กรด 128/2 R > 128/2 R ≤ 16/2 ≤ R S 64/2 R 64/2 16/2 SPiperacillin/ทา โซแบคแตม≤ 8/4 S ≤ 8/4 S ≤ 8/4 S ≤ 8/4 S ≤ 8/4 S ≤ 8 S 4Cephalosporinsเซฟโฟแทกซิม > 32 R 8 R 8 R 8 R 8 R 4 Rเซฟตาซิดิม > 16 R > 16 R 8 R > 16 R 16 R 8 Rเซฟีพิม > 2 R ≤ 2 S ≤ 2 S ≤ 2 S ≤ 2 S ≤ 2 SMonobactamsAztreonam > 16 R > 16 R > 16 R > 16 R 8 R 8 RCarbapenemsErtapenem ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 SMeropenem ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 SImipenem ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 SDoripenem ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 SAminoglycosidesGentamicin > 8 R ≤ 1 S 2 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 STobramycin > 8 R ≤ 1 S 2 S ≤ 1 S 2 S ≤ 1 SAmikacin > 4 R ≤ 4 S ≤ 4 S ≤ 4 S ≤ 4 S ≤ 4 SFluoroquinolonesCiprofloxacin > 2 R ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S > 2 R ≤ 0.25 SLevofloxacin 8 R ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S > 8 R ≤ 1 STetracyclinesDoxycyclineb 8 ฉัน≤ 2 R S 16 8 16 ฉัน R 8 ฉันMinocyclineb 4 S ≤ 2 S 4 S ≤ 2 S 16 R ≤ 2 SGlycylcyclinesTigecycline ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 Sโฟเลตทางเดิน inhibitorsไตรเมโทพริม/ซัลฟาเมโทซาโซล > 4 76 R ≤ 0.5/9.5 S ≤ 0.5 9.5 S > 4 76 R > 4 76 R > 4 76 RR/S ตามคณะกรรมการยุโรปจุดเปลี่ยนคลินิกจุลินทรีย์ภูมิไวรับ (EUCAST) [6]I:ปานกลาง ไมค์: น้อยลิปกลอสไขสมาธิ R: ทน: s:สำคัญเบรกพอยต์ตาม Société ฝรั่งเศสแบบต้นตำรับเดอ Microbiologie [7]b R/ฉัน/S accordin
การแปล กรุณารอสักครู่..
ผลลัพธ์ (ไทย) 2:[สำเนา]
คัดลอก!
Eurosurveillance เล่มที่ 20, ฉบับที่ 49, 10 ธันวาคม 2015
อย่างรวดเร็วการสื่อสารตรวจของ MCR-1 การเข้ารหัสพลาสมิดพึ่ง Colistin ทนอีโคสายพันธุ์จากมนุษย์สู่กระแสเลือดติดเชื้อและนำเข้าไก่เนื้อ, เดนมาร์ก 2015 H Hasman 1, AM HAMMERUM 1, F แฮนเซน 1 อาร์เอส Hendriksen 2 B Olesen 3 Y Agersø 2 E Zankari 2 P Leekitcharoenphon 2 M Stegger 1 4 อาร์เอส Kaas 2 LM คาวาโก 2 ดีเอสแฮนเซนที่ 3 FM Aarestrup 2 RL Skov 1 + ความผูกพันของผู้เขียน1 ภาควิชาจุลชีววิทยาและควบคุมการติดเชื้อ, Statens Serum Institut, โคเปนเฮเกน, เดนมาร์ก2 สถาบันอาหารแห่งชาติมหาวิทยาลัยเทคนิคแห่งเดนมาร์ก Lyngby, เดนมาร์ก3 ภาควิชาจุลชีววิทยาคลินิกและเฮอร์เลฟ Gentofte โรงพยาบาลโรงพยาบาลมหาวิทยาลัยโคเปนเฮเกน, เฮอร์เลฟ, เดนมาร์ก4 เชื้อโรคฟังก์ชั่นส่วนฟังก์ชั่นการแปล Research Institute (TGen) เสาธงแอริโซนาสหรัฐอเมริกาสารบรรณ: เฮนริก Hasman (henh@ssi.dk) รูปแบบการอ้างอิงสำหรับบทความนี้: Hasman H, HAMMERUM A, F แฮนเซน, Hendriksen R, Olesen B, Agersø Y, Zankari E, Leekitcharoenphon P, Stegger M, Kaas R, L คาวาโกแฮนเซน D, F Aarestrup, อาร์ Skov ตรวจ MCR-1 การเข้ารหัสพลาสมิดพึ่งเชื้อ Escherichia coli Colistin ทนแยกจากการติดเชื้อในกระแสเลือดของมนุษย์และเนื้อไก่ที่นำเข้า เดนมาร์กยูโร 2015 Surveill 2015; 20 (49): PII = 30,085 ดอย: http://dx.doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2015.20.49.30085 ที่ได้รับ: 4 ธันวาคม 2015 Colistin พลาสมิดพึ่งยีนต้านทาน MCR-1 ได้รับการตรวจพบในเชื้อ Escherichia coli แยกจากเดนมาร์ก ผู้ป่วยที่มีการติดเชื้อในกระแสเลือดและในห้าเชื้อ E. coli ที่แยกได้จากเนื้อไก่ที่นำเข้า หนึ่งแยกจากเนื้อไก่เป็นโรคระบาดแพร่กระจาย ST131 ประเภทลำดับ นอกจากนี้ในการ IncN2 เป็น Replicon incX4 ถูกพบว่ามีการเชื่อมโยงกับ MCR-1 รายงานนี้ดังต่อไปนี้การตรวจสอบล่าสุดของ MCR-1 ในเชื้อ E. coli จากสัตว์, อาหารและมนุษย์ในประเทศจีน. มากเมื่อเร็ว ๆ นี้ในเดือนพฤศจิกายนปี 2015 หลิว et al, รายงานการค้นพบของ Colistin สามารถโอนพึ่ง-พลาสมิดยีนต้านทาน MCR-1 ตรวจพบในเชื้อ Escherichia coli ที่แยกได้จากสัตว์, อาหารและผู้ป่วยในประเทศจีน นอกจากนี้พวกเขาพบ MCR-1 ใน Klebsiella pneumoniae แยกจากผู้ป่วย [1] การถ่ายโอนยีนแนวนอนแสดงถึงการปรับเปลี่ยนกระบวนทัศน์ในการต่อต้าน Colistin ซึ่งก่อนหน้านั้นก็พบเพียงเพื่อจะไกล่เกลี่ยโดยการกลายพันธุ์ของโครโมโซมและการแพร่กระจายจึงโดยการส่งแนวตั้ง. เฝ้าระวังแห่งชาติของความต้านทานต่อยาต้านจุลชีพในอาหารสัตว์, อาหารและมนุษย์ในเดนมาร์กใช้ลำดับจีโนมทั้งหมดตั้งแต่2012 การเฝ้าระวังระดับชาติของดื้อยาในสัตว์อาหารอาหารและมนุษย์ในเดนมาร์ก (www.DANMAP.org) ได้ใช้ลำดับทั้งจีโนม (WGS) การวิเคราะห์ในการตรวจหายีนต้านทานและการพิมพ์ลำดับ Multilocus (MLST) ใช้เปิดการเข้าถึง ชีววิทยาเว็บเครื่องมือ ResFinder และ MLST ตามลำดับจาก www.genomicepidemiology.org สำหรับลักษณะของสเปกตรัมขยายเบต้า lactamase (ESBL) - และ AmpC ผลิตแยกเชื้อ E. coli [2-4] MCR-1 ลำดับจากประเทศจีนเพิ่มเป็น 24 พฤศจิกายน 2015 ไปยังฐานข้อมูล ResFinder ทันทีที่ได้จากศูนย์แห่งชาติสำหรับข้อมูลเทคโนโลยีชีวภาพ (NCBI). การสืบสวนของการปรากฏตัวของ MCR-1 ในเชื้อ E. coli ที่แยกได้จากสัตว์อาหาร อาหารและการติดเชื้อในกระแสเลือดของมนุษย์รุ่นที่ปรับปรุงของResFinder ถูกใช้ในการวิเคราะห์ข้อมูลจาก WGS ESBL- และ AmpC ผลิตเชื้อ E. coli ที่แยกได้จากอาหารสัตว์และอาหารสำหรับปี 2012-2014 เช่นเดียวกับ ESBL- และ AmpC ผลิต E . โคไลที่แยกจากการติดเชื้อในกระแสเลือดของมนุษย์และ carbapenemase ผลิตสิ่งมีชีวิต (CPOs) จากมนุษย์ตั้งแต่เดือนมกราคม 2014 จุดเริ่มต้นของพฤศจิกายน 2015 (ตารางที่ 1) การปรากฏตัวของ MCR-1 นอกจากนี้ปัจจัยต้านทาน fluoroquinolone ถูกตรวจสอบโดยการค้นหาด้วยตนเองสำหรับการกลายพันธุ์ใน Gyra, Parc และตัด [5]. ตารางที่ 1 จำนวนคลื่นความถี่ขยายเบต้า lactamase และ AmpC ผลิตเชื้อ E. coli ได้แยกและวิเคราะห์โดย WGS จากเนื้อไก่, มนุษย์และ carbapenemase ผลิตไอโซเลทจากมนุษย์ทดสอบการ MCR-1 ใช้ ResFinder เดนมาร์กพฤศจิกายน 2015 (n = 914) แยกต้นกำเนิดของเชื้อครั้งที่วิเคราะห์โดย WGS จำนวนลำดับในเชิงบวกสำหรับ MCR-1 ESBL- และ AmpC ผลิตอีโคไลที่แยกได้จากเนื้อไก่เดนมาร์ก (2012-2014) 125 0 ESBL- และ AmpC ผลิต เชื้อ E. coli ที่แยกได้จากเนื้อไก่ที่นำเข้า (2012-2014) 255 5 ESBL- และ AmpC ผลิตเชื้อ E. coli ที่แยกได้จากการติดเชื้อในกระแสเลือดของมนุษย์ (มกราคม 2014- จุดเริ่มต้นของพฤศจิกายน 2015) 417 1 Carbapenemase ผลิตไอโซเลทจากมนุษย์ (มกราคม 2014- จุดเริ่มต้นของเดือนพฤศจิกายน 2015) 117 0 ESBL: สเปกตรัมขยายเบต้า lactamase; ไม่มี: หมายเลข; สักคน. ลำดับจีโนมทั้งหมดMCR-1 ยีนที่ตรวจพบในเชื้อ E. coli แยกจากการติดเชื้อในกระแสเลือดของมนุษย์จาก 2015 และในห้าแยกเชื้อ E. coli ที่ได้จากเนื้อไก่แหล่งกำเนิดของยุโรปนำเข้าจากเดนมาร์ก 2012, 2013 และ 2014 (ตารางที่ 2) ไม่มี CPOs เป็นบวกสำหรับ MCR-1 (ตารางที่ 1). ตารางที่ 2 ลักษณะทางพันธุกรรมของ MCR-1-บวกเชื้อ E. coli สายพันธุ์เดนมาร์กพฤศจิกายน 2015 (n = 6) แยกชื่อแหล่งกำเนิดปีของการตรวจสอบยีนต้านทาน MLST ตรวจพบโดย ResFinder นอกจาก MCR-1 การตรวจสอบของความต้านทานการกลายพันธุ์ของโครโมโซมเข้ารหัสเพื่อ quinolones 0412016126 เนื้อไก่ 2012 ST359 aadA1, aadA5, Aph (3) - IC, BLA CMY-2, blaTEM-1B, dfrA1, Stra, strB, sul1, sul2, เทต (B) Gyra (S83L, D87N) Parc (E62K) เนื้อ 0412044854 ไก่ 2012 ST48 aadA1, BLA CMY-2, blaTEM-1B, dfrA1, ไมล์ต่อชั่วโมง (B), Stra, strB, sul1, sul2, เทต (A) Gyra ( S83L) เนื้อ 0412049521 ไก่ 2012 ST131 aadA1, BLA SHV-12, BLA CMY-2, Stra, strB, sul1, dfrA1, เทต (A) ND เนื้อไก่ 0413040864 2013 ST1112 aadA1, aadA2, blaSHV โดย-12 cmlA1, sul3, เทต (A) ND 14042624 เนื้อไก่ 2014 ST2063 aadA1, aadA2, BLA SHV-12 cmlA1, sul3 ND ESBL20150072 มนุษย์ติดเชื้อในกระแสเลือด 2015 ST744 aadA5, blaCMY-2, blaCTX-M-55, blaTEM-1B, catA1, dfrA17, Flor , FOSA, ไมล์ต่อชั่วโมง (A) rmtB, Stra, strB, sul1, sul2, เทต (A) Gyra (S83L, D87N) Parc (E62K) MLST: พิมพ์ลำดับ Multilocus; ND:. ไม่พบผู้ป่วยติดเชื้อMCR-1-บวกเชื้อ E. coli เป็นคนสูงอายุที่มีโรคมะเร็งต่อมลูกหมากและทำซ้ำติดเชื้อทางเดินปัสสาวะมี ESBL ผลิตเชื้อ E. coli ผลในตัวอย่างปัสสาวะสี่บวกกว่าห้าเดือนก่อนที่จะมีกระแสเลือด การติดเชื้อทั้งหมดทนต่อ cephalosporins รุ่นที่สาม gentamicin, sulfamethoxazole, trimethoprim และ ciprofloxacin (สายพันธุ์เหล่านี้ไม่ได้รับการตรวจสอบต่อไป) เขาได้รับการรักษาสังเกตุด้วย piperacillin / tazobactam และ meropenem ต่อมาหลังจากการทดสอบความไวของเชื้อกระแสเลือด แต่ไม่ได้มี Colistin ตามข้อมูลของผู้ป่วยที่มีอยู่. นอกจาก MCR-1, มนุษย์แยกจากผู้ป่วยเดนมาร์กมี 15 ยีนต้านทานที่แตกต่างกันรวมทั้ง blaCTX -M-55 และ blaCMY-2 ความต้านทานการหารือเพื่อขยายสเปกตรัมยาปฏิชีวนะเบต้า lactam เช่นเดียวกับสองกลายพันธุ์ Gyra (S83L, D87N) และการกลายพันธุ์ Parc (E62K) ที่นำไปสู่ระดับสูงต้านทาน fluoroquinolone (ตารางที่ 2) มนุษย์ MCR-1 บวกแยกเชื้อ E. coli เป็น ST744 ประเภทลำดับที่หายากทั้งในมนุษย์และสัตว์ในเดนมาร์ก ผู้ป่วยไม่ได้รับการเดินทางไปต่างประเทศเมื่อเร็ว ๆ นี้และที่มาของเชื้อที่ไม่เป็นที่รู้จัก. ยีน blaCMY-2 ถูกตรวจพบในสามในห้าสายพันธุ์ไก่เนื้อ MCR-1-บวก นอกจากนี้อีกสามของเนื้อไก่เชื้อ E. coli แยกดำเนิน blaSHV โดย-12 การหารือต้านทานต่อยาปฏิชีวนะเบต้า lactam สเปกตรัมขยายไม่รวม cephamycins. หนึ่งในเชิงบวก MCR-1 แยกเชื้อ E. coli จากเนื้อไก่เป็น ST131 เนื้อไก่อื่น ๆ แยกเป็นลำดับชนิดไม่พบบ่อยในเดนมาร์ก (ตารางที่ 2) มนุษย์ MCR-1-การผลิตแยกเชื้อ E. coli เป็นเพียงความเสี่ยงที่จะ piperacillin / tazobactam, carbapenems และ tigecycline ตามที่คณะกรรมาธิการยุโรปในการทดสอบยาต้านจุลชีพไว (EUCAST) จุดพัก [6] ในขณะที่สายพันธุ์ไก่เนื้อมีน้อยทน (ตารางที่ 3 ). คลิกที่นี่เพื่อดูตารางตารางที่ 3 รูปแบบความไวต่อยาต้านจุลชีพในห้า MCR-1-ผลิตเชื้อ E. coli ที่แยกได้จากเนื้อไก่และ MCR-1-ผลิตเชื้อ E. coli แยกจากการติดเชื้อในกระแสเลือดของมนุษย์, เดนมาร์กพฤศจิกายน 2015 แหล่งกำเนิดของมนุษย์ เนื้อไก่ชื่อแยกESBL20150072 14042624 0413040864 0412049521 0412016126 0412044854 ตัวแทนต้านจุลชีพ MIC (mg / L) S / R MIC (mg / L) S / R MIC (mg / L) S / R MIC (mg / L) S / R MIC ( มก. / ลิตร) S / R MIC (mg / L) S / R Polymyxins Colistin> 4 R> 4 R> 4 R> 4 R> 4 R> 4 R polymyxin Ba 4 R> 4 R 4 R> 4 R> 4 R 4 R Beta-lactam / ยับยั้งเบต้า lactam รวมกันticarcillin / clavulanic กรด 128/2 R> R 128/2 ≤ S 64/2 16/2 64/2 R R ≤ 16/2 S piperacillin / tazobactam ≤ 8/4 S 04/08 S ≤≤≤ 8/4 S 04/08 S 04/08 S ≤≤ 8/4 S cephalosporins cefotaxime> 32 R 8 R 8 R 8 R 8 R 4 R ceftazidime> 16 R> 16 R 8 R > 16 R 16 R 8 R เซฟีพิม> 2 R ≤ 2 S ≤ 2 S ≤ 2 S ≤ 2 S ≤ 2 S Monobactams aztreonam> 16 R> 16 R> 16 R> 16 R 8 R 8 R carbapenems Ertapenem ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S Meropenem ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S imipenem ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S Doripenem ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S ≤ 0.125 S aminoglycosides Gentamicin> 8 R ≤ 1 S 2 S ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S Tobramycin> 8 R ≤ 1 S 2 S ≤ 1 S 2 S ≤ 1 S amikacin> 4 R ≤ 4 S ≤ 4 S ≤ 4 S ≤ 4 S ≤ 4 S fluoroquinolones Ciprofloxacin> 2 R ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S ≤ 0.25 S> 2 R ≤ 0.25 S Levofloxacin 8 R ≤ 1 S ≤ 1 S ≤ 1 S> 8 R ≤ 1 S Tetracyclines Doxycyclineb 8 ฉัน≤ 2 S 16 R 8 ฉัน 16 R 8 ฉันMinocyclineb 4 S ≤ 2 S 4 S ≤ 2 S 16 R ≤ 2 S Glycylcyclines Tigecycline ≤ 0.25 S ≤ 0.25 ≤ 0.25 S S ≤ 0.25 ≤ 0.25 S S ≤ 0.25 S โฟเลตสารยับยั้งการเดินTrimethoprim / sulfamethoxazole> 4/76 R ≤ 0.5 / 9.5 S ≤ 0.5 / 9.5 S> 4/76 R> 4/76 R> 4/76 R R / S ตามที่คณะกรรมาธิการยุโรปในการต้านจุลชีพไว (EUCAST) จุดพักทางคลินิก [6]. I: กลาง; MIC: ยับยั้งความเข้มข้นน้อยที่สุด; R: ทน: S: มีความสำคัญ. เบรกพอยต์ตามSociété Francaise de Microbiologie [7] ข R / I / S Accordin











































































































การแปล กรุณารอสักครู่..
 
ภาษาอื่น ๆ
การสนับสนุนเครื่องมือแปลภาษา: กรีก, กันนาดา, กาลิเชียน, คลิงออน, คอร์สิกา, คาซัค, คาตาลัน, คินยารวันดา, คีร์กิซ, คุชราต, จอร์เจีย, จีน, จีนดั้งเดิม, ชวา, ชิเชวา, ซามัว, ซีบัวโน, ซุนดา, ซูลู, ญี่ปุ่น, ดัตช์, ตรวจหาภาษา, ตุรกี, ทมิฬ, ทาจิก, ทาทาร์, นอร์เวย์, บอสเนีย, บัลแกเรีย, บาสก์, ปัญจาป, ฝรั่งเศส, พาชตู, ฟริเชียน, ฟินแลนด์, ฟิลิปปินส์, ภาษาอินโดนีเซี, มองโกเลีย, มัลทีส, มาซีโดเนีย, มาราฐี, มาลากาซี, มาลายาลัม, มาเลย์, ม้ง, ยิดดิช, ยูเครน, รัสเซีย, ละติน, ลักเซมเบิร์ก, ลัตเวีย, ลาว, ลิทัวเนีย, สวาฮิลี, สวีเดน, สิงหล, สินธี, สเปน, สโลวัก, สโลวีเนีย, อังกฤษ, อัมฮาริก, อาร์เซอร์ไบจัน, อาร์เมเนีย, อาหรับ, อิกโบ, อิตาลี, อุยกูร์, อุสเบกิสถาน, อูรดู, ฮังการี, ฮัวซา, ฮาวาย, ฮินดี, ฮีบรู, เกลิกสกอต, เกาหลี, เขมร, เคิร์ด, เช็ก, เซอร์เบียน, เซโซโท, เดนมาร์ก, เตลูกู, เติร์กเมน, เนปาล, เบงกอล, เบลารุส, เปอร์เซีย, เมารี, เมียนมา (พม่า), เยอรมัน, เวลส์, เวียดนาม, เอสเปอแรนโต, เอสโทเนีย, เฮติครีโอล, แอฟริกา, แอลเบเนีย, โคซา, โครเอเชีย, โชนา, โซมาลี, โปรตุเกส, โปแลนด์, โยรูบา, โรมาเนีย, โอเดีย (โอริยา), ไทย, ไอซ์แลนด์, ไอร์แลนด์, การแปลภาษา.

Copyright ©2025 I Love Translation. All reserved.

E-mail: