การผลิตกะแช่ เริ่มต้นจากการเก็บน้ำตาลโตนดสดจากต้นมะพร้าวหรือต้นตาลโตนด โดยใช้กระบอกไม้ไผ่ กระบอกอลูมิเนียมหรือพลาสติก รองรับน้ำตาลที่หยด จากงวงตาลโตนดที่ถูกปาด น้ำตาลโตนดสด ที่เก็บจากต้นนี้จะเสียเร็วมาก ดังนั้นภูมิปัญญาไทยจึงมีวิธีถนอมรักษา โดยการใช้ไม้พะยอม ไม้ตะเคียน หรือไม้เคี่ยม ใส่ลงในกระบอกรองน้ำตาลโตนดสด
ไม้เหล่านี้เชื่อว่ามีสารเคมีที่หยุดยั้งการเจริญของแบคทีเรียที่จะทำให้น้ำตาลโตนดสดบูดเสีย ถ้าใช้ไม้พะยอมมากเกินไปจะทำให้น้ำตาลโตนดสดมีรสขม