The genes encoding the lipase (LipA

The genes encoding the lipase (LipA) and lipase chaperone (LipB) from Acinetobacter calcoaceticus RAG-1 were cloned and sequenced. The genes were isolated from a genomic DNA library by complementation of a lipase-deficient transposon mutant of the same strain. Transposon insertion in this mutant and three others was mapped to a single site in the chaperone gene. The deduced amino acid (aa) sequences for the lipase and its chaperone were found to encode mature proteins of 313 aa (32.5kDa) and 347 aa (38.6kDa), respectively. The lipase contained a putative leader sequence, as well as the conserved Ser, His, and Asp residues which are known to function as the catalytic triad in other lipases. A possible trans-membrane hydrophobic helix was identified in the N-terminal region of the chaperone. Phylogenetic comparisons showed that LipA, together with the lipases of A. calcoaceticus BD413, Vibrio cholerae El Tor, and Proteus vulgaris K80, were members of a previously described family of Pseudomonas and Burkholderia lipases. This new family, which we redefine as the Group I Proteobacterial lipases, was subdivided into four subfamilies on the basis of overall sequence homology and conservation of residues which are unique to the subfamilies. LipB, moreover, was found to be a member of an analogous family of lipase chaperones. We propose that the lipases produced by P. fluorescens and Serratia marcescens, which comprise a second sequence family, be referred to as the Group II Proteobacterial lipases. Evidence is provided to support the hypothesis that both the Group I and Group II families have evolved from a combination of common descent and lateral gene transfer.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ยีนที่เข้ารหัส (ลิ) เอนไซม์ไลเปสและเอนไซม์ไลเปส chaperone (LipB) จาก calcoaceticus Acinetobacter RAG 1 โคลน และเรียงลำดับ ยีนได้แยกจากรี genomic DNA โดย complementation mutant transposon ไม่เอนไซม์ไลเปสของสายพันธุ์เดียวกัน แทรก transposon นี้ mutant และสามคนอื่น ๆ ถูกแมปไปยังไซต์เดียวในยีน chaperone ลำดับกรดอะมิโน deduced (aa) สำหรับเอนไซม์ไลเปสและ chaperone ที่พบจะเข้ารหัสโปรตีนผู้ใหญ่ของ 313 เอเอ (32.5kDa) และ 347 aa (38.6kDa), ตามลำดับ เอนไซม์ไลเปสที่ประกอบด้วยลำดับผู้นำ putative ตลอดจน Ser นำ เขา และตก Asp ซึ่งทราบว่าเป็น triad ตัวเร่งปฏิกิริยาใน lipases อื่น ๆ เกลียวเป็น hydrophobic ทรานส์เมมเบรนที่ได้มีการระบุไว้ในแคว้น chaperone เทอร์มินัล N เปรียบเทียบ phylogenetic พบลิที่ ร่วมกับ lipases A. calcoaceticus BD413 ผล cholerae เอลทอร์ และ Proteus vulgaris K80 มีสมาชิกของครอบครัวของ Pseudomonas และ Burkholderia lipases อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ ครอบครัวใหม่นี้ ซึ่งเรากำหนดเป็น lipases กลุ่ม I Proteobacterial ได้ปฐมภูมิเป็น subfamilies สี่ตามลำดับ homology รวมและอนุรักษ์ของตกค้างที่มีเฉพาะที่ subfamilies LipB นอกจากนี้ พบสมาชิกของครอบครัวเป็นคู่ของ chaperones เอนไซม์ไลเปส เราเสนอว่า lipases ผลิต โดย P. fluorescens และ Serratia marcescens ซึ่งประกอบด้วยครอบครัวเป็นลำดับที่สอง จะเรียกว่า lipases กลุ่ม II Proteobacterial หลักฐานไว้เพื่อสนับสนุนสมมติฐานที่ว่า กลุ่มทั้งฉันและครอบครัวกลุ่ม II มีพัฒนาจากการรวมกันของทั่วไปโคตรและด้านข้างยีนโอน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ยีนที่ควบคุมการเอนไซม์ไลเปส (ลิปะ) และพี่เลี้ยงเอนไซม์ไลเปส (LipB) จาก Acinetobacter calcoaceticus RAG-1 ถูกโคลนและติดใจ ยีนที่แยกได้จากห้องสมุดดีเอ็นเอโดย complementation ของเอนไซม์ไลเปสที่กลายพันธุ์ transposon ขาดของสายพันธุ์เดียวกัน แทรกใน transposon กลายพันธุ์นี้และอีกสามคนถูกแมปไปยังเว็บไซต์เดียวในยีนพี่เลี้ยง กรดอะมิโนอนุมาน (AA) ลำดับสำหรับเอนไซม์ไลเปสและพี่เลี้ยงของเขาถูกพบในการเข้ารหัสโปรตีนผู้ใหญ่ 313 AA (32.5kDa) และ 347 AA (38.6kDa) ตามลำดับ เอนไซม์ไลเปสที่มีลำดับผู้นำสมมุติเช่นเดียวกับการอนุรักษ์ Ser ของเขา, และสารตกค้างงูเห่าซึ่งเป็นที่รู้จักทำงานเป็นตัวเร่งปฏิกิริยาในสามเอนไซม์ไลเปสอื่น ๆ เกลียวน้ำทรานส์เมมเบรนที่เป็นไปได้ที่ถูกระบุในภูมิภาค n- ขั้วของพี่เลี้ยง วิวัฒนาการการเปรียบเทียบพบว่า Lipa ร่วมกับเอนไซม์ไลเปสของเอ calcoaceticus BD413, Vibrio cholerae El Tor และ Proteus vulgaris K80 เป็นสมาชิกของครอบครัวที่อธิบายไว้ก่อนหน้าของ Pseudomonas และ Burkholderia ไลเปส เหมาะสำหรับครอบครัวใหม่ที่เรากำหนดเป็นกลุ่ม Proteobacterial ไลเปสที่ถูกแบ่งออกเป็นสี่ครอบครัวบนพื้นฐานของลำดับที่คล้ายคลึงกันโดยรวมและการอนุรักษ์ของสารตกค้างที่เป็นเอกลักษณ์ของครอบครัว LipB ยิ่งไปกว่านั้นพบว่าเป็นสมาชิกของครอบครัวของครูใหญ่คล้ายเอนไซม์ไลเปส เราเสนอว่าเอนไซม์ไลเปสที่ผลิตโดยพี fluorescens Serratia marcescens และซึ่งประกอบด้วยครอบครัวลำดับที่สองจะเรียกว่ากลุ่มที่สอง Proteobacterial ไลเปส หลักฐานที่มีให้เพื่อสนับสนุนสมมติฐานที่ว่าทั้งสองกลุ่มและครอบครัวกลุ่มที่สองมีวิวัฒนาการมาจากการรวมกันของการสืบเชื้อสายมาร่วมกันและการถ่ายโอนยีนด้านข้าง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การเข้ารหัสยีนเอนไซม์ไลเปส ( โครงการ ) และพี่เลี้ยง ( lipb ) จาก Accipitriformes rag-1 ถูกโคลน และนี้ ยีนและดีเอ็นเอที่แยกได้จากห้องสมุด โดยเอนไซม์ของเอนไซม์กลายพันธุ์ขาด ? ? ? ? ? ของสายพันธุ์เดียวกัน ? ? ? ? ? แทรกในนี้กลายพันธุ์และสามคนถูกแมปไปยังเว็บไซต์เดียวในผู้หญิงจีนกรดอะมิโนได้ ( AA ) ลำดับสำหรับเอนไซม์และพาไปพบผู้ใหญ่เพื่อเข้ารหัสโปรตีนจาก 313 AA ( 32.5kda ) และพวก AA ( 38.6kda ) ตามลำดับ เอนไซม์ ประกอบด้วย ผู้นำลำดับกรดอะมิโน รวมทั้งการอนุรักษ์เซอร์ของเขา , และ ASP ตกค้างซึ่งเป็นที่รู้จักที่จะทำงานเป็นแก๊งตัวเร่งปฏิกิริยาในเทคนิคอื่น ๆเป็นไปได้ทรานส์เมมเบรน ) เกลียวที่ถูกระบุในภูมิภาคของกรดอะมิโนของพี่ใหญ่ การเปรียบเทียบ พบว่าโครงการต่างๆ ร่วมกับเทคนิคของ กันที่ bd413 , Vibrio cholerae El Tor และแบบที่มี k80 , สมาชิกของครอบครัวของ Burkholderia ที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้และเขา . ครอบครัวใหม่นี้ซึ่งเรากำหนดให้เป็นกลุ่มผม proteobacterial ไลเปสถูกแบ่งออกได้เป็น 4 วงศ์ย่อยบนพื้นฐานของการเป็นลำดับโดยรวมและอนุรักษ์ตกค้างซึ่งเป็นเอกลักษณ์วงศ์ย่อย . lipb นอกจากนี้ พบว่า มีสมาชิกของครอบครัวที่คล้ายกัน เอนไซม์ไลเปสจากผู้ดูแล . เราเสนอว่า ไลเปสที่ผลิตโดย marcescens โรคเซอร์ราเทีย ,ครอบครัวซึ่งประกอบด้วยลำดับที่สองจะเรียกว่ากลุ่ม proteobacterial ไลเปส . หลักฐานที่เตรียมไว้เพื่อสนับสนุนสมมุติฐานว่า ทั้งกลุ่มผมและกลุ่มครอบครัวที่ได้มาจากการรวมกันของเชื้อสายทั่วไป และการถ่ายโอนยีนแนวขวาง