Yeasts were identified by analysis o

Yeasts were identified by analysis of the D1/D2 region of the
large subunit of rRNA (LSU rRNA) gene sequence similarities
(Kurtzman & Robnett 1998). Methods for DNA extraction and
amplification of the D1/D2 domain were described previously
(Limtong et al. 2007). The D1/D2 domain of the LSU rRNA gene
was PCR amplified from yeast genomic DNA. The D1/D2 region
of the LSU rRNA gene was amplified and sequenced with
primers, NL1 and NL4 (Kurtzman & Robnett 1998). The PCR
products were checked by agarose gel electrophoresis and purified using HiYieldä Gel/PCR DNA Fragments Extraction Kit
(RBC Bioscience, Chung Ho City, Taipei, Taiwan). The purified
products were submitted to Macrogen (Korea) for sequencing.
Sequencing reactions were performed in a MJ Research PTC225 Peltier Thermal Cycler, using an ABI PRISMÒ BigDyeä Terminator Cycle Sequencing Kit with AmpliTaqÒ DNA polymerase (FS enzyme) (Applied Biosystems, USA), following the
protocols supplied by the manufacturer. Single-pass sequencing was performed on each template using the primers NL1
and NL4 for the D1/D2 region of the LSU rRNA gene. The
fluorescent-labelled fragments were purified from the unincorporated terminators with an ethanol precipitation protocol. The samples were resuspended in distilled water and
subjected to electrophoresis in an ABI 3730XL sequencer (Applied Biosystems, USA). The sequences were compared pairwise using a BLAST search (Altschul et al. 1997).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Yeasts ได้ identified โดยวิเคราะห์ภาคง 1/D2 ของ
ย่อยขนาดใหญ่ของความเหมือน (ชุดปั๊มหมึก rRNA) rRNA ยีนลำดับ
(Kurtzman & Robnett 1998) วิธีการสกัดดีเอ็นเอ และ
amplification โดง 1/D2 ได้อธิบายไว้ก่อนหน้านี้
(ทองร้อยเอ็ด al. 2007) โดง 1/D2 ของยีนชุดปั๊มหมึก rRNA
amplified PCR จากยีสต์ genomic DNA ภูมิภาคง 1/D2
ของ rRNA ชุดปั๊มหมึก ยีนถูก amplified และเรียงลำดับด้วย
ไพรเมอร์ NL1 NL4 (Kurtzman & Robnett 1998) PCR
ผลิตภัณฑ์ถูกตรวจสอบ โดย agarose เจ electrophoresis และ purified ใช้ HiYieldä เจล/PCR ดีเอ็นเอชิ้นส่วนแยกชุด
(RBC ซื้อ ชุโฮจิมินห์ซิตี้ ไทเป ไต้หวัน) Purified
ผลิตภัณฑ์ส่งมาที่ Macrogen (เกาหลี) สำหรับลำดับการ
ลำดับปฏิกิริยาดำเนินในที่ MJ วิจัย PTC225 Peltier ร้อน Cycler ใช้เป็นลักชัวรี่ PRISMÒ BigDyeä เทอร์มิเนเตอร์วงจรลำดับเบสชุด (ใช้ Biosystems สหรัฐอเมริกา), AmpliTaqÒ ดีเอ็นเอพอลิเมอเรส (FS เอนไซม์) ต่อไปนี้
โพรโทคอลโดยผู้ผลิต ทำการจัดลำดับครั้งเดียวผ่านในแต่ละต้นใช้ไพรเมอร์ NL1
NL4 สำหรับภูมิภาคง 1/D2 ของยีนชุดปั๊มหมึก rRNA และ ใน
บางส่วนของ fluorescent มันถูก purified จากต่อ unincorporated กับโพรโทคอลการฝนเอทานอล ตัวอย่างถูก resuspended ในน้ำกลั่น และ
การ electrophoresis ใน sequencer การ 3730XL ABI (ใช้ Biosystems สหรัฐอเมริกา) ลำดับที่ถูกเปรียบเทียบ pairwise ใช้ค้นหาระเบิด (Altschul et al. 1997) .

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ยีสต์เป็น identi จึงเอ็ดโดยการวิเคราะห์ D1 / D2 ภูมิภาคของ
ใบขนาดใหญ่ของ rRNA ( LSU rRNA ลำดับยีนกัน
( เคิร์ทแมน& robnett 1998 ) วิธีการสกัดดีเอ็นเอและ
ampli จึงไอออนบวกของ D1 / D2 โดเมนได้ถูกอธิบายไว้ก่อนหน้านี้
( limtong et al . 2007 ) D1 / D2 domain ของยีน
คือ PCR ampli LSU rRNA จึงเอ็ดจากยีสต์ genomic DNA D1 / D2 ภูมิภาค
ของ LSU rRNA ยีนนี้ด้วย
ampli จึงเอ็ดและไพรเมอร์ nl1 และ nl4 ( เคิร์ทแมน& robnett 1998 ) ผลิตภัณฑ์ PCR
ถูกตรวจสอบโดยวิธีเจล , เจล PCR จึงเอ็ดภูริโดยใช้การสกัดดีเอ็นเอและชุด
hiyield ( RBC วิทยาศาสตร์ชีวภาพ จุงโฮเมืองไทเป , ไต้หวัน ) ที่ Puri จึงเอ็ด
ผลิตภัณฑ์ที่ถูกส่งไปยัง macrogen ( เกาหลี ) สำหรับลำดับ .
ลำดับปฏิกิริยาแสดงในงานวิจัย ptc225 Thermal cycler MJ Peltier , ใช้ abi ปริซึมÒ bigdye และ Terminator รอบลำดับชุดกับ amplitaq Ò ( FS เอนไซม์ DNA polymerase ) ( Applied Biosystems , USA ) , ต่อไปนี้
โปรโตคอลจัดโดยผู้ผลิต ลำดับผ่านเดียวคือใช้แม่แบบแต่ละใช้ไพรเมอร์และ nl1
nl4 สำหรับ D1 / D2 ภูมิภาคของ LSU rRNA ยีน
fl uorescent labelled ชิ้นส่วนถูกพูจึงเอ็ดจากคนเหล็กหน่วยงานด้วยเอทานอลด้วยโปรโตคอล จำนวน resuspended ในน้ำกลั่นและ
ภายใต้ electrophoresis ใน ABI 3730xl ซีเควน ( Applied Biosystems สหรัฐอเมริกา ) ลำดับการเปรียบเทียบคู่ใช้ระเบิด ( แอลเชิล et al .
1997 )