Nanog, an important transcription f

Nanog, an important transcription factor in embryonic stem cells (ESC), is the key factor in maintaining pluripotency to establish ESC identity and has the ability to induce embryonic germ layers. Nanog is responsible for self-renewal and pluripotency of stem cells as well as cancer invasiveness, tumor cell proliferation, motility and drug-resistance. Understanding the underlying mechanisms of Nanog evolution and regulation can lead to future advances in treatment of cancers. Recent integration of machine learning models with genetics has provided a powerful tool for knowledge discovery and uncovering evolutionary pathways. Herein, sequences of 47 Nanog genes from various species were extracted and two datasets of features were computationally extracted from these sequences. At the first dataset, 76 nucleotide acid attributes were calculated for each Nanog sequence. The second dataset was prepared based on the 10,480 repeated nucleotide sequences (from 5 to 50 bp lengths). Then, various data mining algorithms such as decision tree models were applied on these datasets to find the evolutionary pathways of Nanog diversion. Attribute weighting models were highlighted features such as the frequencies of AA and GC as the most important genomic features in Nanog gene classification and differentiation. Similar findings were obtained by tree induction algorithms. Results from the second database showed that some short sequence strings, such as ACTACT, TCCTGA, CCTGA, GAAGAC, and TATCCC can be effectively used to identify Nanog genes in various species. The outcomes of this study, for the first time, unravels the importance of particular genomic features in Nanog gene evolution paving roads toward better understanding of stem cell development and human targeted disorder therapy.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Nanog ปัจจัยการ transcription สำคัญในเซลล์ต้นกำเนิดตัวอ่อน (ESC), เป็นปัจจัยสำคัญในการรักษา pluripotency สร้างตัว ESC และสามารถก่อให้เกิดตัวอ่อนจมูกชั้น Nanog รับผิดชอบต่อตนเองและ pluripotency ของเซลล์ต้นกำเนิดเป็นมะเร็ง invasiveness การงอกของเซลล์เนื้องอก motility และต่อ ต้านยาเสพติด เข้าใจกลไกพื้นฐานของ Nanog สามารถนำวิวัฒนาการและข้อบังคับเพื่อความก้าวหน้าในอนาคตในการรักษาโรคมะเร็ง รวมล่าสุดของเครื่องรุ่นกับพันธุศาสตร์ได้จัดเตรียมเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพสำหรับการค้นพบความรู้การเรียนรู้ และเปิดเจอทุ่นระเบิดหลักวิวัฒนาการ นี้ ลำดับของยีน Nanog 47 ชนิดต่าง ๆ ถูกสกัด และ datasets สองคุณลักษณะ computationally ถูกสกัดจากลำดับเหล่านี้ ในชุดข้อมูลแรก 76 นิวคลีโอไทด์กรดแอตทริบิวต์ถูกคำนวณสำหรับแต่ละลำดับ Nanog ชุดข้อมูลที่สองถูกจัดเตรียมตามลำดับนิวคลีโอไทด์ซ้ำ 10,480 (ตั้งแต่ 5 ถึง 50 ยาว bp) กระบวนการทำเหมืองข้อมูลต่าง ๆ เช่นรูปแบบแผนภูมิตัดสินใจแล้ว ได้ใช้กับ datasets เหล่านี้หาหลักวิวัฒนาการของ Nanog ผัน รุ่นน้ำหนักแอตทริบิวต์ได้เน้นคุณลักษณะเช่นความถี่ของ AA และ GC เป็นคุณลักษณะสำคัญ genomic Nanog ยีนประเภทและสร้างความแตกต่าง ผลการวิจัยที่คล้ายคลึงกันได้รับ โดยต้นไม้เหนี่ยวนำอัลกอริทึม ผลจากฐานข้อมูลที่สองพบว่า บางสายอักขระลำดับสั้น ACTACT, TCCTGA, CCTGA, GAAGAC และ TATCCC ได้อย่างมีประสิทธิภาพใช้ระบุยีน Nanog ในชนิดต่าง ๆ ผลการศึกษานี้ ครั้งแรก unravels ความสำคัญของคุณลักษณะเฉพาะ genomic ที่วิวัฒนาการยีน Nanog ปูถนนไปทางเข้าใจน่าพัฒนาสเต็มเซลล์รักษาโรคมนุษย์เป้าหมาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

NANOG เป็นปัจจัยสำคัญในการถอดความเซลล์ต้นกำเนิดตัวอ่อน (ESC) เป็นปัจจัยสำคัญในการรักษา pluripotency เพื่อสร้างเอกลักษณ์ ESC และมีความสามารถที่จะทำให้เกิดชั้นเชื้อโรคตัวอ่อน NANOG เป็นผู้รับผิดชอบสำหรับการต่ออายุตนเองและ pluripotency ของเซลล์ต้นกำเนิดเช่นเดียวกับการรุกรานมะเร็งแพร่กระจายของเซลล์มะเร็ง, การเคลื่อนที่และยาเสพติดต้านทาน ทำความเข้าใจเกี่ยวกับกลไกของวิวัฒนาการ NANOG และกฎระเบียบสามารถนำไปสู่​​ความก้าวหน้าในอนาคตในการรักษาโรคมะเร็ง บูรณาการที่ผ่านมาของรูปแบบการเรียนรู้เครื่องกับพันธุศาสตร์ได้จัดให้มีเครื่องมือที่มีประสิทธิภาพสำหรับการค้นพบความรู้และเปิดเผยเส้นทางการวิวัฒนาการ ที่นี้ลำดับของยีน NANOG 47 จากสายพันธุ์ต่างๆถูกสกัดและสองชุดข้อมูลของคุณสมบัติที่ถูกสกัดจากคอมพิวเตอร์ลำดับเหล่านี้ ในชุดแรก 76 คุณลักษณะกรดเบสจะถูกคำนวณสำหรับแต่ละลำดับ NANOG ชุดข้อมูลที่สองถูกจัดทำขึ้นบนพื้นฐานของ 10,480 ซ้ำลำดับเบส (5-50 bp ยาว) จากนั้นขั้นตอนวิธีการทำเหมืองข้อมูลต่างๆเช่นการตัดสินใจแบบต้นไม้ที่ถูกนำมาใช้ในชุดข้อมูลเหล่านี้เพื่อหาเส้นทางวิวัฒนาการของการเบี่ยงเบน NANOG Attribute รุ่นน้ำหนักเป็นไฮไลต์คุณสมบัติเช่นความถี่ของ AA และ GC เป็นคุณสมบัติที่จีโนมที่สำคัญที่สุดในการจัดหมวดหมู่ของยีน NANOG และความแตกต่าง ผลการวิจัยที่คล้ายกันที่ได้จากขั้นตอนวิธีการเหนี่ยวนำต้นไม้ ผลลัพธ์ที่ได้จากฐานข้อมูลที่สองแสดงให้เห็นว่าบางสายลำดับสั้นเช่น ACTACT, TCCTGA, CCTGA, GAAGAC และ TATCCC สามารถนำมาใช้อย่างมีประสิทธิภาพในการระบุยีน NANOG ในรูปแบบต่างๆ ผลการศึกษาครั้งนี้เป็นครั้งแรกที่ unravels ความสำคัญของคุณสมบัติจีโนมโดยเฉพาะอย่างยิ่งในการวิวัฒนาการของยีน NANOG ปูถนนไปสู่​​ความเข้าใจที่ดีของการพัฒนาเซลล์ต้นกำเนิดและการรักษาความผิดปกติของการกำหนดเป้​​าหมายของมนุษย์