Six DNA regions were evaluated as p

Six DNA regions were evaluated as potential DNA barcodes for Fungi, the second largest kingdom of eukaryotic life, by a multinational, multilaboratory consortium. The region of the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 used as the animal barcode was excluded as a potential marker, because it is difficult to amplify in fungi, often includes large introns, and can be insufficiently variable. Three subunits from the nuclear ribosomal RNA cistron were compared together with regions of three representative protein-coding genes (largest subunit of RNA polymerase II, second largest subunit of RNA polymerase II, and minichromosome maintenance protein). Although the protein-coding gene regions often had a higher percent of correct identification compared with ribosomal markers, low PCR amplification and sequencing success eliminated them as candidates for a universal fungal barcode. Among the regions of the ribosomal cistron, the internal transcribed spacer (ITS) region has the highest probability of successful identification for the broadest range of fungi, with the most clearly defined barcode gap between inter- and intraspecific variation. The nuclear ribosomal large subunit, a popular phylogenetic marker in certain groups, had superior species resolution in some taxonomic groups, such as the early diverging lineages and the ascomycete yeasts, but was otherwise slightly inferior to the ITS. The nuclear ribosomal small subunit has poor species-level resolution in fungi. ITS will be formally proposed for adoption as the primary fungal barcode marker to the Consortium for the Barcode of Life, with the possibility that supplementary barcodes may be developed for particular narrowly circumscribed taxonomic groups.

DNA barcoding fungal biodiversity

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หกดีเอ็นเอภูมิภาคถูกประเมินเป็นบาร์โค้ดดีเอ็นเอเกิดเชื้อรา ราชอาณาจักรใหญ่เป็นอันดับสองของ eukaryotic ชีวิต โดยองค์กรข้ามชาติ multilaboratory ภูมิภาคย่อย c oxidase เจาะจงยล 1 ใช้เป็นบาร์โค้ดสัตว์แยกออกเป็นเครื่องหมายที่อาจเกิดขึ้น เพราะมันเป็นเรื่องยากที่จะขยายในเชื้อรา มักมี introns ขนาดใหญ่ และสามารถแปรไม่ กำหนดสามจาก cistron นิวเคลียร์ ribosomal RNA ถูกเมื่อเทียบกับภูมิภาคของสามตัวแทนรหัสโปรตีนยีน (ย่อยที่ใหญ่ที่สุดของอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส II ย่อยใหญ่ของอาร์เอ็นเอพอลิเมอเรส II และโปรตีนบำรุงรักษา minichromosome) แม้ว่าภูมิภาคยีนเข้ารหัสโปรตีนมักมีเปอร์เซ็นต์สูงของรหัสถูกต้องเมื่อเทียบกับเครื่องหมาย ribosomal ปลักต่ำและจัดลำดับความสำเร็จตัดออกให้เป็นผู้สมัครสำหรับเชื้อราบาร์โค้ดสากล ระหว่างภูมิภาค ribosomal cistron ภูมิภาคภายในทับแผ่นรอง (ของ) มีความน่าเป็นสูงสุดของรหัสสำเร็จสำหรับช่วงกว้างของเชื้อรา มีช่องว่างโค้ดชัดเจนมากที่สุดระหว่างอินเตอร์- และการเปลี่ยนแปลงสำนวน การนิวเคลียร์ ribosomal ใหญ่ย่อย เครื่องหมาย phylogenetic ที่นิยมในกลุ่มบาง มีความละเอียดที่เหนือกว่าสายพันธุ์ในกลุ่มอนุกรมวิธาน เช่นชาติ diverging ต้น ascomycete yeasts แต่ก็ไม่ด้อยกว่าเล็กน้อยของการ ย่อยขนาดเล็ก ribosomal นิวเคลียร์ที่มีความละเอียดระดับชนิดไม่ดีในเชื้อรา ของจะรับเสนอสำหรับเป็นหลักเชื้อราหมายบาร์โค้ดการ Consortium ที่สำหรับบาร์โค้ดของชีวิต มีความเป็นไปได้ว่า บาร์โค้ดเสริมอาจใช้ได้กับเฉพาะหวุดหวิดอ้างกลุ่มอนุกรมวิธานหลากหลายทางชีวภาพเชื้อราของชิ้นดีเอ็นเอ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

หกดีเอ็นเอภูมิภาคได้รับการประเมินเป็นบาร์โค้ดดีเอ็นเอที่มีศักยภาพสำหรับเชื้อราอาณาจักรใหญ่เป็นอันดับสองของชีวิต eukaryotic โดยข้ามชาติ, สมาคม multilaboratory ภูมิภาคของยล cytochrome c เด subunit 1 บาร์โค้ดมาใช้เป็นสัตว์ได้รับการยกเว้นเป็นเครื่องหมายที่อาจเกิดขึ้นเพราะมันเป็นเรื่องยากที่จะขยายในเชื้อรามักจะมี introns ขนาดใหญ่และสามารถเป็นตัวแปรที่ไม่เพียงพอ สามหน่วยย่อยจากนิวเคลียร์ cistron โซมอล rna ถูกเมื่อเทียบกับภูมิภาคร่วมกันของตัวแทนสามยีนโปรตีนเข้ารหัส (subunit ที่ใหญ่ที่สุดของอาร์เอ็นเอ ii โพลิเมอร์, subunit ใหญ่อันดับสองของ RNA ii โพลิเมอร์และการบำรุงรักษา minichromosome โปรตีน) แม้ว่าโปรตีนเข้ารหัสภูมิภาคยีนมักจะมีเปอร์เซ็นต์ที่สูงขึ้นของประชาชนที่ถูกต้องเมื่อเทียบกับเครื่องหมายโซมอลต่ำขยาย PCR และการจัดลำดับความสำเร็จกำจัดพวกเขาเป็นผู้สมัครบาร์โค้ดเชื้อราสากล ในภูมิภาคของ cistron ไรโบโซมที่ spacer คัดลอกภายใน (ITS) ภูมิภาคมีความน่าจะเป็นสูงสุดของประชาชนที่ประสบความสำเร็จในช่วงที่กว้างของเชื้อราที่มีช่องว่างบาร์โค้ดส่วนใหญ่กำหนดไว้อย่างชัดเจนระหว่างการเปลี่ยนแปลงระหว่างและสำนวน นิวเคลียร์ subunit ขนาดใหญ่โซมอล, เครื่องหมายสายวิวัฒนาการที่นิยมในคนบางกลุ่มมีความละเอียดชนิดที่เหนือกว่าในกลุ่มอนุกรมวิธานบางเช่น lineages แยกต้นและยีสต์ ascomycete แต่ก็เป็นอย่างอื่นที่ด้อยกว่าเล็กน้อยกับ ITS นิวเคลียร์ขนาดเล็ก subunit โซมอลสายพันธุ์มีความละเอียดระดับยากจนในเชื้อรา มันจะถูกนำเสนออย่างเป็นทางการสำหรับการนำไปใช้เป็นเครื่องหมายบาร์โค้ดหลักเชื้อรากับ Consortium สำหรับบาร์โค้ดของชีวิตที่มีความเป็นไปได้ที่บาร์โค้ดเสริมอาจจะพัฒนาโดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับหวุดหวิด circumscribed กลุ่มอนุกรมวิธาน. ดีเอ็นเอบาร์โค้ดเชื้อราความหลากหลายทางชีวภาพ