2.2. Sequence compositional feature

2.2. Sequence compositional features
Calculating the base content (totally and in each position for all codons) in percent, GC content (totally and GC1, 2, 3) in percent, number of codons and their frequencies and synonymous codon usage features – the percentage of each synonymous codon in each codon family that codes for the same amino acid –was donewith FREQSQ program (http://www.bioinfo.hku.hk). Also, for estimating the codon usage bias for each gene, codon adaptation index (CAI) was assessed for each gene (http://genomes.urv.es/CAIcal/).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

2.2 การจัดลำดับคุณลักษณะ compositionalการคำนวณ (ทั้งหมด และ ในแต่ละตำแหน่งทั้งหมด codons) เนื้อหาพื้นฐานในเนื้อหา GC เปอร์เซ็นต์ (ทั้งหมด และ GC1, 2, 3) ในเปอร์เซ็นต์ จำนวน codons และความถี่ และ คุณลักษณะการใช้งานรหัสพันธุกรรมพ้อง – เปอร์เซ็นต์ของรหัสพันธุกรรมแต่ละพ้องในครอบครัวแต่ละรหัสพันธุกรรมที่รหัสสำหรับกรดอะมิโนเดียว – นั้นโปรแกรม FREQSQ donewith (http://www.bioinfo.hku.hk) ยัง สำหรับการประเมินความโน้มเอียงใช้รหัสพันธุกรรมในยีนแต่ละ ดัชนีปรับรหัสพันธุกรรม (ไก) เป็นประเมินแต่ละยีน (http://genomes.urv.es/CAIcal/)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

2.2 ลำดับคุณสมบัติ compositional
คำนวณเนื้อหาฐาน (ทั้งหมดและในแต่ละตำแหน่ง codons ทั้งหมด) ในสัดส่วนร้อยละเนื้อหา GC (ทั้งหมดและ GC1, 2, 3) ร้อยละจำนวน codons และความถี่ของพวกเขาและคุณสมบัติการใช้งาน codon ความหมายเหมือนกัน - ร้อยละของแต่ละ codon ความหมายเหมือนกันในแต่ละครอบครัว codon ที่รหัสสำหรับกรดอะมิโนเดียวกัน -was donewith โปรแกรม FREQSQ (http://www.bioinfo.hku.hk) นอกจากนี้สำหรับการประเมินการใช้อคติ codon ยีนแต่ละดัชนีปรับตัว codon (CAI) ได้รับการประเมินในแต่ละยีน (http://genomes.urv.es/CAIcal/)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

2.2 . ลำดับคุณลักษณะส่วนประกอบ
การคำนวณฐานเนื้อหา ( ทั้งหมด และในแต่ละตำแหน่งทั้งหมดในซิส ) และเนื้อหา ( GC โดยสิ้นเชิงและ gc1 , 2 , 3 ) ร้อยละ จำนวนและความถี่ของ codon ras และการใช้งานพ้องคุณสมบัติ–เปอร์เซ็นต์ของแต่ละพ้องรหัสในแต่ละรหัส ครอบครัวที่เป็นรหัสเดียวกัน–กรด กรดอะมิโนเป็นโปรแกรม freqsq donewith ( http://www.bioinfo.hku .HK ) นอกจากนี้ การตั้งค่าการใช้รหัสของแต่ละยีน ดัชนีปรับโคดอน ( CAI ) และแต่ละยีน ( http : / / หา . urv ES / caical / )