SummaryObjectivesTo investigate an

Summary
Objectives

To investigate an unusual cluster of Y. enterocolitica 4/O:3/VIII human infections that occurred in Creuse (France) during the summer 2008, and to perform retrospective and prospective analyses of yersiniosis cases to get a better view of the general trend.

Methods

33 pathogenic Y. enterocolitica strains isolated between 2008 and 2010 in Creuse were subjected to phenotypic and molecular typing. The database of the Yersinia National Reference Laboratory was used to compare the number of human cases over 23 years in Creuse and at the national level.

Results

The 33 isolates had three distinct phenotypes and a high genetic diversity, ruling out a unique source of contamination. A long-term analysis of yersiniosis cases in Creuse showed a progressive increase over years, with a peak in 2008 and a subsequent decrease. This trend contrasted with the national cases that showed an opposite pattern.

Conclusions

Local environmental conditions were most likely responsible for a transient expansion of pathogenic Y. enterocolitica strains in Creuse.

Keywords
Yersinia enterocolitica; epidemiology; enteropathogen; diarrhoea; MLVA; PFGE
1. Introduction
Enteropathogenic Yersinia enterocolitica are the third leading cause of bacterial diarrhoea in France 1 and Europe. 2 These bacteria have an animal reservoir and are transmitted by the faecal-oral route. The real incidence of Yersinia infections is unknown because reporting of human yersiniosis cases is not compulsory in France. Based on the number of strains sent to the French Yersinia National Reference Laboratory (YNRL), the rate of Yersinia isolation has been estimated to be 2.1/100,000. 3 This number is probably largely underestimated because the recovery of these bacteria from stools is difficult. In France and in Europe yersinioses usually occur as sporadic cases, 4 although a few outbreaks have been described. 5 and 6

Between July 1st and September 27, 2008, two clinical pathology laboratories in Creuse (central France), 83 kilometres distant, isolated 8 Y. enterocolitica strains from diarrhoeal patients. The YNRL confirmed that they were pathogenic strains. The very uncommon isolation of pathogenic Y. enterocolitica from this region suggested a possible common source of contamination. An in depth analysis of Y. enterocolitica strains isolated from this area and a temporal follow up of human yersinioses cases was performed.

2. Methods and materials
All strains were subjected to phenotypic analyses (biotyping, serotyping, and for biotype 4 isolates phage typing).7 For Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) of biotype 4 isolates, genomic DNA was prepared in agarose plugs and digested with PmeI. The macrorestriction fragments were resolved with a CHEF-DRIII apparatus (Bio-Rad Laboratories) in 1% agarose gels at 14 °C, using an electric field of 6 V/cm and an angle of 120°. For Multiple-Locus Variable tandem repeat Analysis (MLVA), genomic DNA was extracted with the Gentra Puregen kit (Qiagen), and the six repeats previously selected 8 were subjected to PCR amplification. The sizes of the PCR products were determined by capillary electrophoresis with an ABI Prism 310 genetic analyzer (Applied Biosystems).

3. Results and discussion
All 8 strains isolated in Creuse during summer 2008 were pathogenic Y. enterocolitica biotype 4, serotype O:3 and phage type VIII (4/O:3/VIII) ( Table 1, highlighted in grey), suggesting a possible exposure to a common source of contamination. However, an epidemiological investigation launched at the regional level did not identify any links between the cases. A PFGE analysis yielded 3 distinct restriction profiles for these 8 strains ( Table 1), arguing against a unique source of contamination. This was confirmed by MLVA typing, which identified 5 different profiles ( Table 1). Three strains had the same MLVA profile and pulsotype 2, and a fourth strain also of pulsotype 2 differed from the other 3 at a single MLVA locus. This suggested that despite the absence of identified epidemiological links between the clinical cases, half of the patients might have been exposed to the same pathogenic strain. However, since unrelated Y. enterocolitica 4/O:3 strains were isolated from the four other cases, it nevertheless indicated an unusual increase in the circulation of different pathogenic strains in Creuse.Summary
Objectives

To investigate an unusual cluster of Y. enterocolitica 4/O:3/VIII human infections that occurred in Creuse (France) during the summer 2008, and to perform retrospective and prospective analyses of yersiniosis cases to get a better view of the general trend.

Methods

33 pathogenic Y. enterocolitica strains isolated between 2008 and 2010 in Creuse were subjected to phenotypic and molecular typing. The database of the Yersinia National Reference Laboratory was used to compare the number of human cases over 23 years in Creuse and at the national level.

Results

The 33 isolates had three distinct phenotypes and a high genetic diversity, ruling out a unique source of contamination. A long-term analysis of yersiniosis cases in Creuse showed a progressive increase over years, with a peak in 2008 and a subsequent decrease. This trend contrasted with the national cases that showed an opposite pattern.

Conclusions

Local environmental conditions were most likely responsible for a transient expansion of pathogenic Y. enterocolitica strains in Creuse.

Keywords
Yersinia enterocolitica; epidemiology; enteropathogen; diarrhoea; MLVA; PFGE
1. Introduction
Enteropathogenic Yersinia enterocolitica are the third leading cause of bacterial diarrhoea in France 1 and Europe. 2 These bacteria have an animal reservoir and are transmitted by the faecal-oral route. The real incidence of Yersinia infections is unknown because reporting of human yersiniosis cases is not compulsory in France. Based on the number of strains sent to the French Yersinia National Reference Laboratory (YNRL), the rate of Yersinia isolation has been estimated to be 2.1/100,000. 3 This number is probably largely underestimated because the recovery of these bacteria from stools is difficult. In France and in Europe yersinioses usually occur as sporadic cases, 4 although a few outbreaks have been described. 5 and 6

Between July 1st and September 27, 2008, two clinical pathology laboratories in Creuse (central France), 83 kilometres distant, isolated 8 Y. enterocolitica strains from diarrhoeal patients. The YNRL confirmed that they were pathogenic strains. The very uncommon isolation of pathogenic Y. enterocolitica from this region suggested a possible common source of contamination. An in depth analysis of Y. enterocolitica strains isolated from this area and a temporal follow up of human yersinioses cases was performed.

2. Methods and materials
All strains were subjected to phenotypic analyses (biotyping, serotyping, and for biotype 4 isolates phage typing).7 For Pulsed Field Gel Electrophoresis (PFGE) of biotype 4 isolates, genomic DNA was prepared in agarose plugs and digested with PmeI. The macrorestriction fragments were resolved with a CHEF-DRIII apparatus (Bio-Rad Laboratories) in 1% agarose gels at 14 °C, using an electric field of 6 V/cm and an angle of 120°. For Multiple-Locus Variable tandem repeat Analysis (MLVA), genomic DNA was extracted with the Gentra Puregen kit (Qiagen), and the six repeats previously selected 8 were subjected to PCR amplification. The sizes of the PCR products were determined by capillary electrophoresis with an ABI Prism 310 genetic analyzer (Applied Biosystems).

3. Results and discussion
All 8 strains isolated in Creuse during summer 2008 were pathogenic Y. enterocolitica biotype 4, serotype O:3 and phage type VIII (4/O:3/VIII) ( Table 1, highlighted in grey), suggesting a possible exposure to a common source of contamination. However, an epidemiological investigation launched at the regional level did not identify any links between the cases. A PFGE analysis yielded 3 distinct restriction profiles for these 8 strains ( Table 1), arguing against a unique source of contamination. This was confirmed by MLVA typing, which identified 5 different profiles ( Table 1). Three strains had the same MLVA profile and pulsotype 2, and a fourth strain also of pulsotype 2 differed from the other 3 at a single MLVA locus. This suggested that despite the absence of identified epidemiological links between the clinical cases, half of the patients might have been exposed to the same pathogenic strain. However, since unrelated Y. enterocolitica 4/O:3 strains were isolated from the four other cases, it nevertheless indicated an unusual increase in the circulation of different pathogenic strains in Creuse.
A retrospective analysis of the database of the YNRL showed that between 1991 and 2001, the average number of pathogenic Y. enterocolitica isolated by these two laboratories was 1.5/year. This trend increased between 2002 and 2007, with an average of 4.7 strains/year ( Figure 1). A prospective study of the strains isolated in Creuse during the entire year 2008 and over the following two years confirmed the increasing trend, with a total of 33 pathogenic Y. enterocolitica strains isolated between 2008 and 2010 (average of 11 strains/year). Most of these strains were of bioserotype 4/O:3 (26 strains) and had the common phage type VIII (24 strains), but two had the infrequent phage type IXa ( Table 1). The seven remaining pathogenic strains were of bioserotype 2/O:9 ( Table 1), which is the second most common bioserotype in France. 7 Therefore, the increased number of human yersiniosis cases in Creuse was caused by at least three phenotypically distinct pathogenic Y. enterocolitica strains.
To further evaluate the diversity of the 4/O:3/VIII strains isolated between 2008 and 2010 in Creuse, a PFGE analysis was carried out. Eight pulsotypes were found among the 24 strains. Pulsotype 2 predominated in 2008, but was not found later on.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สรุปวัตถุประสงค์การตรวจสอบคลัสเตอร์การผิดปกติของ Y. enterocolitica 4 / O:3 / VIII ติดเชื้อบุคคลที่เกิดใน Creuse (ฝรั่งเศส) ใน ช่วงฤดูร้อน 2008 และการวิเคราะห์คาด และมีแนวโน้ม yersiniosis กรณีจะได้รับมุมมองที่ดีขึ้นของแนวโน้มทั่วไปวิธีการ33 pathogenic Y. enterocolitica สายพันธุ์แยกต่างหากระหว่างปี 2008 และ 2010 ใน Creuse ถูกต้องพิมพ์ไทป์ และโมเลกุล ฐานข้อมูลห้องปฏิบัติ Yersinia แห่งชาติอ้างอิงถูกใช้เพื่อเปรียบเทียบจำนวนของกรณีมนุษย์กว่า 23 ปี ใน Creuse และ ในระดับชาติผลลัพธ์แยก 33 มีฟีทั้งสามและความสูงพันธุ ออกมาเฉพาะการปนเปื้อน การวิเคราะห์ระยะยาวกรณี yersiniosis ใน Creuse แสดงให้เห็นว่าเพิ่มก้าวหน้าปี สูงสุดในปี 2008 และลดลงตามมา แนวโน้มนี้ต่างกับกรณีประเทศที่แสดงให้เห็นว่ามีรูปแบบตรงกันข้ามบทสรุปสภาพแวดล้อมในท้องถิ่นจะรับผิดชอบสำหรับการขยายตัวชั่วคราวของสายพันธุ์ Y. enterocolitica pathogenic ใน Creuse ได้คำสำคัญYersinia enterocolitica ระบาดวิทยา enteropathogen ท้องเสีย MLVA PFGE1. บทนำEnteropathogenic Yersinia enterocolitica สาเหตุสามท้องเสียแบคทีเรียในฝรั่งเศส 1 และยุโรปได้ 2 แบคทีเรียนี้มีอ่างเก็บน้ำมีสัตว์ และส่งตามเส้นทางปาก faecal เกิดการติดเชื้อ Yersinia จริงไม่รู้จักเนื่องจากรายงานกรณี yersiniosis มนุษย์ไม่บังคับในประเทศฝรั่งเศส ขึ้นอยู่กับจำนวนของสายพันธุ์ที่ส่งไปยังฝรั่งเศส Yersinia แห่งชาติอ้างอิงห้องปฏิบัติ (YNRL), อัตราแยก Yersinia ได้ถูกประมาณ 2.1/100, 000 3 หมายเลขนี้เป็น underestimated คงใหญ่เนื่องจากการฟื้นตัวของแบคทีเรียเหล่านี้จากอุจจาระยาก ในฝรั่งเศส และ ในยุโรป yersinioses มักจะเกิดเป็นกรณีมี 4 แม้กี่ระบาดมีการอธิบาย 5 และ 6ระหว่างวันที่ 1 กรกฎาคมและ 27 กันยายน 2008 ห้องปฏิบัติการพยาธิวิทยาคลินิกสองใน Creuse (กลางฝรั่งเศส), ห่างไกล 83 แยกต่างหาก 8 Y. สายพันธุ์ enterocolitica จากผู้ป่วย diarrhoeal YNRL ได้รับการยืนยันว่า พวกเขามีสายพันธุ์ pathogenic โดดเดี่ยวมากใช่ pathogenic Y. enterocolitica จากภูมิภาคนี้แนะนำทั่วไปแหล่งการปนเปื้อน ความลึก วิเคราะห์สายพันธุ์ Y. enterocolitica ที่แยกต่างหากจากพื้นที่นี้และตามขมับค่ากรณี yersinioses ที่มนุษย์ทำ2. วิธีการและวัสดุทุกสายพันธุ์ถูกต้องวิเคราะห์ไทป์ (biotyping, serotyping และ biotype 4 แยก phage พิมพ์) .7 สำหรับ Electrophoresis เจฟิลด์ Pulsed (PFGE) ของ biotype 4 แยก genomic DNA ถูกเตรียมใน agarose ปลั๊ก และเจ่ากับ PmeI บางส่วนของ macrorestriction ได้รับการแก้ไข ด้วยการเครื่องเชฟ DRIII (ห้องปฏิบัติการชีวภาพ Rad) ในเจ 1% agarose ที่ 14 ° C ใช้สนามไฟฟ้าเป็นของ V 6 ซม.และมุม 120° สำหรับตัวแปรหลายโลกัสโพล ตัวตามกันไปซ้ำวิเคราะห์ (MLVA) genomic DNA ถูกสกัด ด้วยชุด Gentra Puregen (Qiagen), และหกซ้ำก่อนหน้านี้ 8 เลือกถูกต้องขยาย PCR ขนาดของผลิตภัณฑ์ PCR ถูกกำหนด โดยเส้นเลือดฝอย electrophoresis มีการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม 310 ปริซึม ABI (Biosystems ใช้)3. ผลลัพธ์ และสนทนาสายพันธุ์ทั้งหมดที่แยกต่างหากใน Creuse ในช่วงฤดูร้อน 2008 8 ถูก pathogenic Y. enterocolitica biotype 4, serotype ชนิด O:3 และ phage VIII (4 / O:3 / VIII) (ตารางที่ 1 เน้นเป็นสีเทา), แนะนำการถ่ายภาพได้ทั่วไปแหล่งการปนเปื้อน อย่างไรก็ตาม การเปิดตัวระดับภูมิภาคสอบสวนความไม่ระบุการเชื่อมโยงระหว่างกรณี PFGE การวิเคราะห์ผล 3 จำกัดหมดโพรไฟล์เหล่านี้สายพันธุ์ 8 (ตารางที่ 1), โต้เถียงกับแหล่งเฉพาะการปนเปื้อน นี้ถูกยืนยัน โดย MLVA พิมพ์ ซึ่งระบุค่าแตกต่างกัน 5 (ตาราง 1) สายพันธุ์ที่สามมีโพ MLVA เดียวกัน และต้องใช้ pulsotype 2 และสี่ยังของ pulsotype 2 แตกต่างจาก 3 ที่โลกัสโพลการ MLVA เดียว แนะนำว่า แม้การขาดงานของการเชื่อมโยงความที่ระบุระหว่างกรณีคลินิก ครึ่งหนึ่งของผู้ป่วยอาจมีการสัมผัสกับ pathogenic พันธุ์เดียวกัน อย่างไรก็ตาม เนื่องจากไม่เกี่ยวข้อง Y. enterocolitica 4 / O:3 สายพันธุ์แยกต่างหากจากสี่กรณีอื่น ๆ แต่ระบุเพิ่มขึ้นผิดปกติในการแพร่กระจายของสายพันธุ์ pathogenic ต่าง ๆ ใน Creuse.Summaryวัตถุประสงค์การตรวจสอบคลัสเตอร์การผิดปกติของ Y. enterocolitica 4 / O:3 / VIII ติดเชื้อบุคคลที่เกิดใน Creuse (ฝรั่งเศส) ใน ช่วงฤดูร้อน 2008 และการวิเคราะห์คาด และมีแนวโน้ม yersiniosis กรณีจะได้รับมุมมองที่ดีขึ้นของแนวโน้มทั่วไปวิธีการ33 pathogenic Y. enterocolitica สายพันธุ์แยกต่างหากระหว่างปี 2008 และ 2010 ใน Creuse ถูกต้องพิมพ์ไทป์ และโมเลกุล ฐานข้อมูลห้องปฏิบัติ Yersinia แห่งชาติอ้างอิงถูกใช้เพื่อเปรียบเทียบจำนวนของกรณีมนุษย์กว่า 23 ปี ใน Creuse และ ในระดับชาติผลลัพธ์แยก 33 มีฟีทั้งสามและความสูงพันธุ ออกมาเฉพาะการปนเปื้อน การวิเคราะห์ระยะยาวกรณี yersiniosis ใน Creuse แสดงให้เห็นว่าเพิ่มก้าวหน้าปี สูงสุดในปี 2008 และลดลงตามมา แนวโน้มนี้ต่างกับกรณีประเทศที่แสดงให้เห็นว่ามีรูปแบบตรงกันข้ามบทสรุปสภาพแวดล้อมในท้องถิ่นจะรับผิดชอบสำหรับการขยายตัวชั่วคราวของสายพันธุ์ Y. enterocolitica pathogenic ใน Creuse ได้คำสำคัญYersinia enterocolitica ระบาดวิทยา enteropathogen ท้องเสีย MLVA PFGE1. บทนำEnteropathogenic Yersinia enterocolitica สาเหตุสามท้องเสียแบคทีเรียในฝรั่งเศส 1 และยุโรปได้ 2 แบคทีเรียนี้มีอ่างเก็บน้ำมีสัตว์ และส่งตามเส้นทางปาก faecal เกิดการติดเชื้อ Yersinia จริงไม่รู้จักเนื่องจากรายงานกรณี yersiniosis มนุษย์ไม่บังคับในประเทศฝรั่งเศส ขึ้นอยู่กับจำนวนของสายพันธุ์ที่ส่งไปยังฝรั่งเศส Yersinia แห่งชาติอ้างอิงห้องปฏิบัติ (YNRL), อัตราแยก Yersinia ได้ถูกประมาณ 2.1/100, 000 3 หมายเลขนี้เป็น underestimated คงใหญ่เนื่องจากการฟื้นตัวของแบคทีเรียเหล่านี้จากอุจจาระยาก ในฝรั่งเศส และ ในยุโรป yersinioses มักจะเกิดเป็นกรณีมี 4 แม้กี่ระบาดมีการอธิบาย 5 และ 6ระหว่างวันที่ 1 กรกฎาคมและ 27 กันยายน 2008 ห้องปฏิบัติการพยาธิวิทยาคลินิกสองใน Creuse (กลางฝรั่งเศส), ห่างไกล 83 แยกต่างหาก 8 Y. สายพันธุ์ enterocolitica จากผู้ป่วย diarrhoeal YNRL ได้รับการยืนยันว่า พวกเขามีสายพันธุ์ pathogenic โดดเดี่ยวมากใช่ pathogenic Y. enterocolitica จากภูมิภาคนี้แนะนำทั่วไปแหล่งการปนเปื้อน ความลึก วิเคราะห์สายพันธุ์ Y. enterocolitica ที่แยกต่างหากจากพื้นที่นี้และตามขมับค่ากรณี yersinioses ที่มนุษย์ทำ2. วิธีการและวัสดุทุกสายพันธุ์ถูกต้องวิเคราะห์ไทป์ (biotyping, serotyping และ biotype 4 แยก phage พิมพ์) .7 สำหรับ Electrophoresis เจฟิลด์ Pulsed (PFGE) ของ biotype 4 แยก genomic DNA ถูกเตรียมใน agarose ปลั๊ก และเจ่ากับ PmeI บางส่วนของ macrorestriction ได้รับการแก้ไข ด้วยการเครื่องเชฟ DRIII (ห้องปฏิบัติการชีวภาพ Rad) ในเจ 1% agarose ที่ 14 ° C ใช้สนามไฟฟ้าเป็นของ V 6 ซม.และมุม 120° สำหรับตัวแปรหลายโลกัสโพล ตัวตามกันไปซ้ำวิเคราะห์ (MLVA) genomic DNA ถูกสกัด ด้วยชุด Gentra Puregen (Qiagen), และหกซ้ำก่อนหน้านี้ 8 เลือกถูกต้องขยาย PCR ขนาดของผลิตภัณฑ์ PCR ถูกกำหนด โดยเส้นเลือดฝอย electrophoresis มีการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม 310 ปริซึม ABI (Biosystems ใช้)3. ผลลัพธ์ และสนทนาสายพันธุ์ทั้งหมดที่แยกต่างหากใน Creuse ในช่วงฤดูร้อน 2008 8 ถูก pathogenic Y. enterocolitica biotype 4, serotype ชนิด O:3 และ phage VIII (4 / O:3 / VIII) (ตารางที่ 1 เน้นเป็นสีเทา), แนะนำการถ่ายภาพได้ทั่วไปแหล่งการปนเปื้อน อย่างไรก็ตาม การเปิดตัวระดับภูมิภาคสอบสวนความไม่ระบุการเชื่อมโยงระหว่างกรณี PFGE การวิเคราะห์ผล 3 จำกัดหมดโพรไฟล์เหล่านี้สายพันธุ์ 8 (ตารางที่ 1), โต้เถียงกับแหล่งเฉพาะการปนเปื้อน นี้ถูกยืนยัน โดย MLVA พิมพ์ ซึ่งระบุค่าแตกต่างกัน 5 (ตาราง 1) สายพันธุ์ที่สามมีโพ MLVA เดียวกัน และต้องใช้ pulsotype 2 และสี่ยังของ pulsotype 2 แตกต่างจาก 3 ที่โลกัสโพลการ MLVA เดียว แนะนำว่า แม้การขาดงานของการเชื่อมโยงความที่ระบุระหว่างกรณีคลินิก ครึ่งหนึ่งของผู้ป่วยอาจมีการสัมผัสกับ pathogenic พันธุ์เดียวกัน อย่างไรก็ตาม เนื่องจากไม่เกี่ยวข้อง Y. enterocolitica 4 / O:3 สายพันธุ์แยกต่างหากจากสี่กรณีอื่น ๆ แต่ระบุเพิ่มขึ้นผิดปกติในการแพร่กระจายของสายพันธุ์ pathogenic ต่าง ๆ ใน Creuseวิเคราะห์คาดของฐานข้อมูลของ YNRL แสดงให้เห็นว่า ระหว่างปีพ.ศ. 2534 ถึงปีค.ศ. 2001 จำนวนเฉลี่ยของ Y. enterocolitica pathogenic ที่แยกต่างหาก โดยห้องปฏิบัติการทั้งสองนี้คือ 1.5 ปี แนวโน้มนี้เพิ่มระหว่าง 2002 และ 2007 โดยเฉลี่ยของสายพันธุ์ 4.7 ปี (รูปที่ 1) การศึกษาอนาคตของสายพันธุ์ที่แยกต่างหากใน Creuse ในปี 2008 และต่อไปนี้สองปียืนยันแนวโน้มเพิ่มขึ้น มีทั้งหมด 33 pathogenic Y. enterocolitica สายพันธุ์แยกต่างหากระหว่างปี 2008 และ 2010 (เฉลี่ยปีละ 11 สายพันธุ์) สายพันธุ์เหล่านี้ส่วนใหญ่อยู่ bioserotype 4 / O:3 (26 สายพันธุ์) และชนิด phage ทั่ว VIII (24 สายพันธุ์), แต่สองชนิด phage ดำรัส IXa (ตารางที่ 1) เซเว่นคงเหลือ สายพันธุ์ pathogenic ได้ bioserotype 2 / O:9 (ตารางที่ 1), ซึ่งเป็น bioserotype ที่สองมากที่สุดในฝรั่งเศส ดังนั้น 7 เพิ่มจำนวน yersiniosis มนุษย์ใน Creuse ที่เกิดจากสามน้อย phenotypically หมด pathogenic Y. enterocolitica สายพันธุ์การประเมินหลากหลาย 4 เพิ่มเติม / O:3 / VIII สายพันธุ์ที่แยกต่างหากระหว่างปี 2008 และ 2010 ใน Creuse วิเคราะห์ PFGE ได้รับการดำเนินการ 8 pulsotypes พบในสายพันธุ์ 24 Pulsotype 2 predominated ในปี 2008 แต่ไม่พบในภายหลัง

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สรุปวัตถุประสงค์เพื่อศึกษาคลัสเตอร์ที่ผิดปกติของY. enterocolitica 4 / O: 3 / VIII ติดเชื้อในมนุษย์ที่เกิดขึ้นใน Creuse (ฝรั่งเศส) ในช่วงฤดูร้อนปี 2008 และจะดำเนินการวิเคราะห์ย้อนหลังและอนาคตของกรณี yersiniosis ที่จะได้รับมุมมองที่ดีของทั่วไป แนวโน้ม. วิธีการ33 สายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรค Y. enterocolitica แยกระหว่างปี 2008 และ 2010 ใน Creuse ถูกยัดเยียดให้ฟีโนไทป์และการพิมพ์ในระดับโมเลกุล ฐานข้อมูลของ Yersinia แห่งชาติห้องปฏิบัติการอ้างอิงถูกใช้ในการเปรียบเทียบจำนวนของกรณีของมนุษย์กว่า 23 ปีใน Creuse และในระดับชาติ. ผล33 ไอโซเลทมีสาม phenotypes ที่แตกต่างและความหลากหลายทางพันธุกรรมสูงปกครองออกเป็นแหล่งที่เป็นเอกลักษณ์ของการปนเปื้อน การวิเคราะห์ระยะยาวของกรณี yersiniosis ใน Creuse แสดงให้เห็นความก้าวหน้าเพิ่มขึ้นในช่วงหลายปีที่มีจุดสูงสุดในปี 2008 และลดลงตามมา แนวโน้มนี้เทียบกับกรณีของประเทศที่แสดงให้เห็นรูปแบบที่ตรงข้าม. สรุปผลการวิจัยสภาพแวดล้อมในท้องถิ่นส่วนใหญ่มีแนวโน้มที่รับผิดชอบในการขยายตัวชั่วคราวของสายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรค Y. enterocolitica ใน Creuse. คำYersinia enterocolitica; ระบาดวิทยา; enteropathogen; ท้องเสีย; MLVA; PFGE 1 บทนำEnteropathogenic Yersinia enterocolitica เป็นสาเหตุที่สามของโรคอุจจาระร่วงจากเชื้อแบคทีเรียในฝรั่งเศสและยุโรป 1 2 แบคทีเรียเหล่านี้มีอ่างเก็บน้ำสัตว์และจะถูกส่งโดยเส้นทางอุจจาระช่องปาก อุบัติการณ์ที่แท้จริงของการติดเชื้อ Yersinia ไม่เป็นที่รู้จักเพราะรายงานของกรณี yersiniosis มนุษย์ไม่บังคับในฝรั่งเศส ขึ้นอยู่กับจำนวนของสายพันธุ์ที่ส่งไปยังฝรั่งเศส Yersinia ห้องปฏิบัติการแห่งชาติอ้างอิง (YNRL) อัตราการแยก Yersinia ที่ได้รับการคาดว่าจะมี 2.1 / 100,000 3 จำนวนนี้อาจจะประเมินส่วนใหญ่เพราะการฟื้นตัวของเชื้อแบคทีเรียเหล่านี้จากอุจจาระเป็นเรื่องยาก ในประเทศฝรั่งเศสและในยุโรป yersinioses มักจะเกิดขึ้นเป็นระยะ ๆ กรณีที่ 4 แม้จะมีการระบาดของโรคไม่กี่ได้รับการอธิบาย 5 และ 6 ระหว่างวันที่ 1 กรกฎาคมและ 27 กันยายน 2008 สองห้องปฏิบัติการพยาธิวิทยาคลินิกใน Creuse (กลางฝรั่งเศส), 83 กิโลเมตรห่างไกลแยก 8 Y. enterocolitica สายพันธุ์จากผู้ป่วยโรคอุจจาระร่วง YNRL ได้รับการยืนยันว่าพวกเขาเป็นสายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรค แยกเรื่องผิดปกติมาก enterocolitica วายที่ทำให้เกิดโรคจากภูมิภาคนี้แนะนำแหล่งที่พบการปนเปื้อนที่เป็นไปได้ ในการวิเคราะห์เชิงลึกของ Y. enterocolitica สายพันธุ์ที่แยกได้จากพื้นที่นี้และชั่วติดตามกรณีของมนุษย์ได้ดำเนินการ yersinioses. 2 วิธีการและวัสดุสายพันธุ์ทั้งหมดได้ภายใต้การวิเคราะห์ฟีโนไทป์ (พิมพ์ไบโอ, serotyping และ biotype 4 แยกพิมพ์ phage) 0.7 สำหรับ Pulsed สนามเจล Electrophoresis (PFGE) ของไบโอไทป์ 4 ไอโซเลท, ดีเอ็นเอถูกจัดทำขึ้นในปลั๊ก agarose และย่อยด้วย PmeI เศษ macrorestriction ได้รับการแก้ไขด้วยเครื่องมือ CHEF-DRIII (Bio-Rad ห้องปฏิบัติการ) ใน 1% agarose เจลที่ 14 องศาเซลเซียสโดยใช้สนามไฟฟ้า 6 V / cm และมุม 120 องศา สำหรับหลายตัวแปรทีควบคู่การวิเคราะห์ซ้ำ (MLVA) ดีเอ็นเอถูกสกัดด้วยชุด Gentra Puregen (Qiagen) และหกซ้ำเลือกก่อนหน้านี้ 8 ถูกยัดเยียดให้ขยาย PCR ขนาดของผลิตภัณฑ์ที่ได้รับการพิจารณา PCR โดยอิเส้นเลือดฝอยที่มีการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม ABI ปริซึม 310 (Applied Biosystems). 3 ผลการทดลองและการอภิปรายทั้งหมด 8 สายพันธุ์ที่แยกได้ใน Creuse ในช่วงฤดูร้อนปี 2008 ที่ทำให้เกิดโรค Y. enterocolitica biotype 4 serotype O: 3 และประเภท phage VIII (4 / O: 3 / VIII) (ตารางที่ 1 เน้นสีเทา) บอกรับเป็นไปได้ ไปยังแหล่งที่พบการปนเปื้อน อย่างไรก็ตามการสอบสวนทางระบาดวิทยาเปิดตัวในระดับภูมิภาคไม่ได้ระบุการเชื่อมโยงใด ๆ ระหว่างกรณี การวิเคราะห์ผล PFGE 3 โปรไฟล์ข้อ จำกัด ที่แตกต่างกันสำหรับทั้ง 8 สายพันธุ์ (ตารางที่ 1) เถียงกับแหล่งที่มาของการปนเปื้อนที่เป็นเอกลักษณ์ของ นี้ได้รับการยืนยันจากการพิมพ์ MLVA ซึ่งระบุ 5 รูปแบบที่แตกต่างกัน (ตารางที่ 1) สามสายพันธุ์ที่มีรายละเอียดเหมือนกัน MLVA และ pulsotype ที่ 2 และสายพันธุ์ที่สี่ยัง 2 pulsotype แตกต่างจาก 3 อื่น ๆ ในสถานที่ MLVA เดียว นี้ชี้ให้เห็นว่าแม้จะขาดการเชื่อมโยงทางระบาดวิทยาระบุระหว่างกรณีคลินิกครึ่งหนึ่งของผู้ป่วยที่อาจจะได้รับการสัมผัสกับสายพันธุ์เดียวกันที่ทำให้เกิดโรค แต่เนื่องจากไม่เกี่ยวข้อง Y. enterocolitica 4 / O: 3 สายพันธุ์ที่แยกได้จากสี่กรณีอื่น ๆ ก็ยังคงแสดงให้เห็นถึงการเพิ่มขึ้นผิดปกติในการไหลเวียนของสายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรคที่แตกต่างกันใน Creuse.Summary วัตถุประสงค์เพื่อศึกษาคลัสเตอร์ที่ผิดปกติของ Y. enterocolitica 4 / O:. 3 / VIII ติดเชื้อในมนุษย์ที่เกิดขึ้นใน Creuse (ฝรั่งเศส) ในช่วงฤดูร้อนปี 2008 และจะดำเนินการวิเคราะห์ย้อนหลังและอนาคตของกรณี yersiniosis ที่จะได้รับมุมมองที่ดีขึ้นของแนวโน้มทั่วไปวิธีการ33 สายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรค Y. enterocolitica แยกระหว่างปี 2008 และ 2010 ใน Creuse ถูกยัดเยียดให้ฟีโนไทป์และการพิมพ์ในระดับโมเลกุล ฐานข้อมูลของ Yersinia แห่งชาติห้องปฏิบัติการอ้างอิงถูกใช้ในการเปรียบเทียบจำนวนของกรณีของมนุษย์กว่า 23 ปีใน Creuse และในระดับชาติ. ผล33 ไอโซเลทมีสาม phenotypes ที่แตกต่างและความหลากหลายทางพันธุกรรมสูงปกครองออกเป็นแหล่งที่เป็นเอกลักษณ์ของการปนเปื้อน การวิเคราะห์ระยะยาวของกรณี yersiniosis ใน Creuse แสดงให้เห็นความก้าวหน้าเพิ่มขึ้นในช่วงหลายปีที่มีจุดสูงสุดในปี 2008 และลดลงตามมา แนวโน้มนี้เทียบกับกรณีของประเทศที่แสดงให้เห็นรูปแบบที่ตรงข้าม. สรุปผลการวิจัยสภาพแวดล้อมในท้องถิ่นส่วนใหญ่มีแนวโน้มที่รับผิดชอบในการขยายตัวชั่วคราวของสายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรค Y. enterocolitica ใน Creuse. คำYersinia enterocolitica; ระบาดวิทยา; enteropathogen; ท้องเสีย; MLVA; PFGE 1 บทนำEnteropathogenic Yersinia enterocolitica เป็นสาเหตุที่สามของโรคอุจจาระร่วงจากเชื้อแบคทีเรียในฝรั่งเศสและยุโรป 1 2 แบคทีเรียเหล่านี้มีอ่างเก็บน้ำสัตว์และจะถูกส่งโดยเส้นทางอุจจาระช่องปาก อุบัติการณ์ที่แท้จริงของการติดเชื้อ Yersinia ไม่เป็นที่รู้จักเพราะรายงานของกรณี yersiniosis มนุษย์ไม่บังคับในฝรั่งเศส ขึ้นอยู่กับจำนวนของสายพันธุ์ที่ส่งไปยังฝรั่งเศส Yersinia ห้องปฏิบัติการแห่งชาติอ้างอิง (YNRL) อัตราการแยก Yersinia ที่ได้รับการคาดว่าจะมี 2.1 / 100,000 3 จำนวนนี้อาจจะประเมินส่วนใหญ่เพราะการฟื้นตัวของเชื้อแบคทีเรียเหล่านี้จากอุจจาระเป็นเรื่องยาก ในประเทศฝรั่งเศสและในยุโรป yersinioses มักจะเกิดขึ้นเป็นระยะ ๆ กรณีที่ 4 แม้จะมีการระบาดของโรคไม่กี่ได้รับการอธิบาย 5 และ 6 ระหว่างวันที่ 1 กรกฎาคมและ 27 กันยายน 2008 สองห้องปฏิบัติการพยาธิวิทยาคลินิกใน Creuse (กลางฝรั่งเศส), 83 กิโลเมตรห่างไกลแยก 8 Y. enterocolitica สายพันธุ์จากผู้ป่วยโรคอุจจาระร่วง YNRL ได้รับการยืนยันว่าพวกเขาเป็นสายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรค แยกเรื่องผิดปกติมาก enterocolitica วายที่ทำให้เกิดโรคจากภูมิภาคนี้แนะนำแหล่งที่พบการปนเปื้อนที่เป็นไปได้ ในการวิเคราะห์เชิงลึกของ Y. enterocolitica สายพันธุ์ที่แยกได้จากพื้นที่นี้และชั่วติดตามกรณีของมนุษย์ได้ดำเนินการ yersinioses. 2 วิธีการและวัสดุสายพันธุ์ทั้งหมดได้ภายใต้การวิเคราะห์ฟีโนไทป์ (พิมพ์ไบโอ, serotyping และ biotype 4 แยกพิมพ์ phage) 0.7 สำหรับ Pulsed สนามเจล Electrophoresis (PFGE) ของไบโอไทป์ 4 ไอโซเลท, ดีเอ็นเอถูกจัดทำขึ้นในปลั๊ก agarose และย่อยด้วย PmeI เศษ macrorestriction ได้รับการแก้ไขด้วยเครื่องมือ CHEF-DRIII (Bio-Rad ห้องปฏิบัติการ) ใน 1% agarose เจลที่ 14 องศาเซลเซียสโดยใช้สนามไฟฟ้า 6 V / cm และมุม 120 องศา สำหรับหลายตัวแปรทีควบคู่การวิเคราะห์ซ้ำ (MLVA) ดีเอ็นเอถูกสกัดด้วยชุด Gentra Puregen (Qiagen) และหกซ้ำเลือกก่อนหน้านี้ 8 ถูกยัดเยียดให้ขยาย PCR ขนาดของผลิตภัณฑ์ที่ได้รับการพิจารณา PCR โดยอิเส้นเลือดฝอยที่มีการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม ABI ปริซึม 310 (Applied Biosystems). 3 ผลการทดลองและการอภิปรายทั้งหมด 8 สายพันธุ์ที่แยกได้ใน Creuse ในช่วงฤดูร้อนปี 2008 ที่ทำให้เกิดโรค Y. enterocolitica biotype 4 serotype O: 3 และประเภท phage VIII (4 / O: 3 / VIII) (ตารางที่ 1 เน้นสีเทา) บอกรับเป็นไปได้ ไปยังแหล่งที่พบการปนเปื้อน อย่างไรก็ตามการสอบสวนทางระบาดวิทยาเปิดตัวในระดับภูมิภาคไม่ได้ระบุการเชื่อมโยงใด ๆ ระหว่างกรณี การวิเคราะห์ผล PFGE 3 โปรไฟล์ข้อ จำกัด ที่แตกต่างกันสำหรับทั้ง 8 สายพันธุ์ (ตารางที่ 1) เถียงกับแหล่งที่มาของการปนเปื้อนที่เป็นเอกลักษณ์ของ นี้ได้รับการยืนยันจากการพิมพ์ MLVA ซึ่งระบุ 5 รูปแบบที่แตกต่างกัน (ตารางที่ 1) สามสายพันธุ์ที่มีรายละเอียดเหมือนกัน MLVA และ pulsotype ที่ 2 และสายพันธุ์ที่สี่ยัง 2 pulsotype แตกต่างจาก 3 อื่น ๆ ในสถานที่ MLVA เดียว นี้ชี้ให้เห็นว่าแม้จะขาดการเชื่อมโยงทางระบาดวิทยาระบุระหว่างกรณีคลินิกครึ่งหนึ่งของผู้ป่วยที่อาจจะได้รับการสัมผัสกับสายพันธุ์เดียวกันที่ทำให้เกิดโรค แต่เนื่องจากไม่เกี่ยวข้อง Y. enterocolitica 4 / O: 3 สายพันธุ์ที่แยกได้จากสี่กรณีอื่น ๆ ก็ยังคงแสดงให้เห็นถึงการเพิ่มขึ้นผิดปกติในการไหลเวียนของสายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรคที่แตกต่างกันใน Creuse. การวิเคราะห์ย้อนหลังของฐานข้อมูลของ YNRL แสดงให้เห็นว่าระหว่าง 1991 และปี 2001 ค่าเฉลี่ยของจำนวน enterocolitica วายที่ทำให้เกิดโรคที่แยกจากห้องปฏิบัติการทั้งสองเป็น 1.5 / ปี แนวโน้มนี้เพิ่มขึ้นระหว่างปี 2002 และปี 2007 มีค่าเฉลี่ยของสายพันธุ์ 4.7 / ปี (รูปที่ 1) การศึกษาในอนาคตของสายพันธุ์ที่แยกได้ใน Creuse ในช่วงตลอดทั้งปี 2008 และในช่วงสองปีต่อมาได้รับการยืนยันแนวโน้มเพิ่มขึ้นมีทั้งหมด 33 สายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรค Y. enterocolitica แยกระหว่างปี 2008 และ 2010 (เฉลี่ย 11 สายพันธุ์ / ปี) ที่สุดของสายพันธุ์นี้มาจาก bioserotype 4 / O: 3 (26 สายพันธุ์) และมีการทำลายจุลินทรีย์ชนิดที่พบบ่อย VIII (24 สายพันธุ์) แต่มีสองชนิดที่ทำลายจุลินทรีย์ไม่บ่อยนัก IXA (ตารางที่ 1) เจ็ดสายพันธุ์ที่ทำให้เกิดโรคที่เหลืออยู่ของ bioserotype 2 / O: 9 (ตารางที่ 1) ซึ่งเป็น bioserotype ที่พบมากที่สุดเป็นอันดับสองในประเทศฝรั่งเศส 7 ดังนั้นจำนวนที่เพิ่มขึ้นของผู้ป่วย yersiniosis มนุษย์ใน Creuse เกิดจากอย่างน้อยสามลักษณะภายนอกที่แตกต่างกันทำให้เกิดโรคสายพันธุ์ Y. enterocolitica. เพื่อประเมินความหลากหลายของ 4 / O: 3 / VIII สายพันธุ์ที่แยกได้ระหว่างปี 2008 และ 2010 ใน Creuse เป็น การวิเคราะห์ PFGE ได้ดำเนินการ แปดสายพันธุ์ที่ถูกพบใน 24 สายพันธุ์ Pulsotype 2 อำนาจในปี 2008 แต่ไม่พบในภายหลัง

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สรุปวัตถุประสงค์เพื่อศึกษากลุ่มที่ผิดปกติของวาย enterocolitica 4 o / : 3 / 8 มนุษย์เชื้อที่เกิดขึ้นในจังหวัดเคริซ ( ฝรั่งเศส ) ในช่วงฤดูร้อนปี 2008 และดำเนินการย้อนหลัง และอนาคตการวิเคราะห์กรณีเยอซินิโอซิสได้รับมุมมองที่ดีขึ้นของแนวโน้มทั่วไป

วิธี

33 ใบ Yenterocolitica สายพันธุ์ที่แยกได้ระหว่าง 2008 และ 2010 ในจังหวัดเคริซของเซลล์และโมเลกุลจะถูกพิมพ์ ฐานข้อมูลของเยอซิเนียอ้างอิงแห่งชาติห้องปฏิบัติการที่ใช้ในการเปรียบเทียบจำนวนของกรณีของมนุษย์กว่า 23 ปีในจังหวัดเคริซและในระดับประเทศ ผล

33 แยก 3 เกิดที่แตกต่างกันและมีความหลากหลายทางพันธุกรรมสูง

,ปกครองออกแหล่งที่เป็นเอกลักษณ์ของการปนเปื้อน การวิเคราะห์ระยะยาวกรณีเยอซินิโอซีสในจังหวัดเคริซ แสดงการเพิ่มขึ้นกว่าปี กับยอดในปี 2551 และลดลงตามมา แนวโน้มนี้เปรียบเทียบกับกรณี ที่แสดงรูปแบบแห่งชาติตรงข้าม

สรุป

ท้องถิ่นสิ่งแวดล้อมเงื่อนไขส่วนใหญ่รับผิดชอบสำหรับการขยายตัวชั่วคราวของเชื้อโรค .สายพันธุ์ใน enterocolitica จังหวัดเคริซ

คำสำคัญ
เยอซิเนีย enterocolitica ระบาดวิทยา ; enteropathogen ; ดูดซึม ; mlva ; PFGE
1 บทนำ
enteropathogenic เยอซิเนีย enterocolitica เป็นที่สามที่เป็นสาเหตุของโรคอุจจาระร่วงจากฝรั่งเศส 1 และยุโรป 2 แบคทีเรียเหล่านี้มีอ่างเก็บน้ำสัตว์และจะถูกส่ง โดยเส้นทางในช่องปาก .อุบัติการณ์ที่แท้จริงของเชื้อเยอซิเนียไม่รู้จักเพราะการรายงานกรณีเยอซินิโอซิสมนุษย์ไม่ได้เป็นภาคบังคับในฝรั่งเศส ขึ้นอยู่กับจำนวนของสายพันธุ์ที่ส่งไปยังฝรั่งเศสเยอซิเนียอ้างอิงแห่งชาติห้องปฏิบัติการ ( ynrl ) , อัตราการแยกเยอซิเนียได้ถูกประเมินเป็น 2.1/100000 .3 เลขนี้อาจเป็นเพราะส่วนใหญ่ประเมินการฟื้นตัวของแบคทีเรียเหล่านี้จากอุจจาระยาก ในฝรั่งเศสและในยุโรป yersinioses มักจะเกิดขึ้นเป็นกรณีเป็นระยะ 4 แม้ว่าไม่กี่ระบาดได้อธิบายไว้ 5 และ 6

ระหว่างวันที่ 1 กรกฎาคม และ 27 กันยายน 2008 , สองห้องปฏิบัติการพยาธิวิทยาคลินิกในจังหวัดเคริซส่วนกลาง ( ฝรั่งเศส ) , 83 กิโลเมตรไกลแยก 8 Yenterocolitica สายพันธุ์จากผู้ป่วยอุจจาระร่วง . การ ynrl ยืนยันว่าพวกเขาเป็นสายพันธุ์ที่ก่อโรค . ที่พิสดารมาก การแยกเชื้อ Y enterocolitica จากภูมิภาคนี้แนะนำแหล่งกำเนิดที่เป็นไปได้ของการปนเปื้อน ในการวิเคราะห์ความลึกของ Y enterocolitica สายพันธุ์ที่แยกได้จากพื้นที่และเวลาติดตามกรณี yersinioses มนุษย์แสดง

2วิธีการและวัสดุ
ทุกสายพันธุ์ถูกการวิเคราะห์ฟีโนไทป์ ( biotyping การสำรวจ , และไบโอไทป์ 4 แยกฟาจพิมพ์ ) 7 สำหรับการเจลอิเล็กโตรโฟรีซิสฟิลด์ ( PFGE ) ไบโอไทป์ 4 สายพันธุ์ดีเอ็นเอถูกเตรียมใน , ปลั๊กและย่อยด้วย pmei . การ macrorestriction ชิ้นส่วนถูกแก้ไขได้ด้วย chef-driii ( ห้องปฏิบัติการเครื่องมือ RAD BIO ) 1% เจล ( ที่ 14 ° Cการใช้สนามไฟฟ้า 6 v / cm และมุม 120 องศา . สำหรับหลาย ๆตนตัวแปรตีคู่ซ้ำ ( mlva ) การวิเคราะห์จีโนมดีเอ็นเอกับเจนทรา Puregen ชุด ( เพิ่ม ) และหกซ้ำเลือกก่อนหน้านี้ 8 จะถูกขยายโดย . ขนาดของสินค้าทั้งหมดจะถูกกำหนดโดย capillary electrophoresis โดย ABI ปริซึม 310 พันธุกรรมวิเคราะห์ ( Applied Biosystems ) .

3