One of the key take homes from the first 49 sequenced plant species is that we still have a lot to learn about the organization of genomes, function of genes, and how to characterize the non-coding space. Each new genome uncovers novel genes specific to a species, and a vast amount of non-coding space that requires methods for ab initio and functional annotation. One specific challenge is how we will leverage a growing number of high throughput technologies, otherwise referred to as “omics” approaches, to functionally annotate features of the plant genome. In this special issue of The Plant Genome we highlight several omics studies that have used high throughput approaches such as gen-omics (SNP detection), epigen-omics (methylation) metagen-omics (plant-fungal interactions), and ion-omics (element profiling) to refine our functional understanding of several key crop genomes (Eichten et al., 2013; Roorkiwal et al., 2013; Ruzicka et al., 2013; Ziegler et al., 2013). As we have seen through the model organism and human ENCODE projects, the layering of omics data exponentially increases the value of a reference genome (Celniker et al., 2009; ENCODE Project Consortium 2012).
บ้านใช้คีย์จากสปีชีส์พืชตามลำดับแรก 49 อย่างใดอย่างหนึ่งได้ว่า เรายังมีมากที่จะเรียนรู้เกี่ยวกับองค์กร genomes หน้าที่ของยีน และวิธีการกำหนดลักษณะพื้นที่ไม่ได้เขียนโค้ด แต่ละกลุ่มใหม่เปิดโลกแห่งนวนิยายยีนบางชนิด และไม่กำหนดพื้นที่ที่ต้องใช้วิธีการสำหรับ ab initio และคำอธิบายการทำงานจำนวนมาก ความท้าทายหนึ่งที่เฉพาะเจาะจงเป็นวิธีที่เราจะใช้ประโยชน์จากจำนวนที่เพิ่มขึ้นของอัตราความเร็วสูงเทคโนโลยี หรือ เรียกว่า "รุ่น" แนว การอธิบายประกอบฟังก์ชันลักษณะการทำงานของกลุ่มโรงงาน ในปัญหาพิเศษของกลุ่มพืชเราเน้นศึกษารุ่นต่าง ๆ ที่ได้ใช้แนวทางอัตราความเร็วสูงเช่น gen-รุ่น (ตรวจสอบ SNP), epigen-รุ่น (ปรับ) metagen-รุ่น (พืชเชื้อราโต้), และ (องค์ประกอบสร้างโพรไฟล์) รุ่นไอออนกลั่นของเราเข้าใจการทำงานของพืชสำคัญหลาย genomes (Eichten et al., 2013 Roorkiwal et al., 2013 Ruzicka et al., 2013 Ziegler et al., 2013) เราได้เห็นผ่านแบบจำลองสิ่งมีชีวิตและมนุษย์เข้ารหัสโครงการ layering ข้อมูลรุ่นสร้างเพิ่มค่าของกลุ่มอ้างอิง (Celniker และ al., 2009 เข้าโครงการ Consortium 2012)
การแปล กรุณารอสักครู่..
