Crohn's disease is an inflammatory

Crohn's disease is an inflammatory bowel disease. Because of strong heritability, it is possible to deploy the pattern of DNA variations, such as single nucleotide polymorphisms (SNPs), to accurately predict the state of this disease. However, there are many possible SNP subsets, which make finding a best set of SNPs to achieve the highest prediction accuracy impossible in one patient's lifetime. In this paper, a new technique is proposed that relies on chromosomes of various lengths with significant order feature selection, a new cross-over approach, and new mutation operations. Our method can find a chromosome of appropriate length with useful features. The Crohn's disease data that were gathered from case–control association studies were used to demonstrate the effectiveness of our proposed algorithm. In terms of the prediction accuracy, the proposed SNP prediction framework outperformed previously proposed techniques, including the optimum random forest (ORF), the univariate marginal distribution algorithm and support vector machine (USVM), the complimentary greedy search-based prediction algorithm (CGSP), the combinatorial search-based prediction algorithm (CSP), and discretized network flow (DNF). The performance of our framework, when tested against this real data set with a 5-fold cross-validation, was 90.4% accuracy with 87.5% sensitivity and 92.2% specificity.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

โรคลำไส้อักเสบเป็นโรค Crohn ของได้ เนื่องจากแข็งแรง heritability มันได้จัดรูปแบบของการเปลี่ยนแปลงของดีเอ็นเอ เช่นนิวคลีโอไทด์เดี่ยว polymorphisms (SNPs), การทำนายสภาพของโรคนี้อย่างถูกต้อง อย่างไรก็ตาม มีหลายได้ SNP ย่อย ซึ่งทำให้การค้นหาชุดดีที่สุดของ SNPs เพื่อทำนายแม่นยำสูงสุดเป็นไปไม่ได้ในชีวิตหนึ่งของผู้ป่วย ในเอกสารนี้ เทคนิคใหม่จะเสนอที่อาศัย chromosomes ยาวต่าง ๆ ด้วยการเลือกคุณลักษณะสำคัญสั่ง วิธีข้ามไปใหม่ และการดำเนินงานใหม่กลายพันธุ์ วิธีของเราสามารถค้นหาโครโมโซมความยาวที่เหมาะสมกับคุณลักษณะที่มีประโยชน์ ข้อมูลโรค Crohn ของที่ถูกรวบรวมจากการศึกษากรณี – ควบคุมสมาคมถูกใช้เพื่อแสดงให้เห็นถึงประสิทธิภาพของอัลกอริทึมของเรานำเสนอ ในแง่ของความถูกต้องของการคาดเดา คาดการณ์กรอบเสนอของ SNP outperformed เทคนิคนำเสนอก่อนหน้านี้ ป่าสุ่มสูงสุด (ORF), อย่างไร univariate กระจายกำไรเหลือและอัลกอริทึมแบบเวกเตอร์เครื่อง (USVM), ขั้นตอนวิธีฟรีทำนายตามค้นหาโลภ (CGSP), อัลกอริทึมทายผลการค้นหาปัญหา (CSP), และเครือข่าย discretized ไหล (DNF) ประสิทธิภาพของกรอบของเรา เมื่อนำมาทดสอบกับข้อมูลชุดนี้จริงด้วยการ 5-fold ขนตรวจสอบ 90.4% มี specificity 92.2% และความไว 87.5% ความแม่นยำได้

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Crohn ของโรคเป็นโรคลำไส้อักเสบ เพราะพันธุกรรมที่แข็งแกร่งก็เป็นไปได้ในการปรับใช้รูปแบบของการเปลี่ยนแปลงดีเอ็นเอเช่นหลากหลายเดี่ยวเบื่อหน่าย (SNPs) เพื่อทำนายรัฐของโรคนี้ แต่มีหลายคนที่เป็นไปได้ย่อย SNP ซึ่งทำให้การหาชุดที่ดีที่สุดของ SNPs เพื่อให้เกิดความถูกต้องของการคาดการณ์ที่สูงที่สุดเป็นไปไม่ได้ในชีวิตของผู้ป่วยอย่างใดอย่างหนึ่ง ในบทความนี้เทคนิคใหม่ที่มีการเสนอที่อาศัยโครโมโซมของความยาวต่างๆที่มีการสั่งซื้ออย่างมีนัยสำคัญการเลือกคุณลักษณะวิธีการข้ามไปใหม่และการดำเนินงานการกลายพันธุ์ใหม่ วิธีการของเราสามารถหาโครโมโซมของความยาวที่เหมาะสมกับคุณสมบัติที่มีประโยชน์ ข้อมูล Crohn ของโรคที่ถูกรวบรวมมาจากกรณีศึกษาการควบคุมสมาคมถูกนำมาใช้เพื่อแสดงให้เห็นถึงประสิทธิภาพของอัลกอริทึมที่นำเสนอของเรา ในแง่ของความถูกต้องคาดการณ์กรอบการทำนาย SNP เสนอเฮงเทคนิคที่นำเสนอก่อนหน้านี้รวมทั้งป่าสุ่มที่เหมาะสม (ORF) ขั้นตอนวิธีการกระจายร่อแร่ univariate และการสนับสนุนเครื่องเวกเตอร์ (USVM) ขั้นตอนวิธีการทำนายค้นหาตามโลภฟรี (CGSP) ขั้นตอนวิธีการทำนายค้นหาตาม combinatorial (CSP) และเครือข่ายการไหล discretized (DNF) ประสิทธิภาพการทำงานของกรอบการทำงานของเราเมื่อทดสอบกับข้อมูลจริงชุดนี้มี 5 เท่าข้ามการตรวจสอบความถูกต้องเป็น 90.4% มีความไว 87.5% และความจำเพาะ 92.2%

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

Crohn ของโรค คือ โรคลำไส้อักเสบ เพราะค่าอัตราพันธุกรรมที่แข็งแรง มันเป็นไปได้ที่จะใช้รูปแบบของ DNA การเปลี่ยนแปลง เช่น พันธุ์ซิงเกิลนิวคลีโอไทด์ ( snps ) อย่างถูกต้องทำนายสภาพของโรคนี้ อย่างไรก็ตาม มีข้อมูล SNP เป็นไปได้หลายอย่าง ซึ่งทำให้หาชุดที่ดีที่สุดของ snps บรรลุความถูกต้องเป็นไปไม่ได้ทำนายสูงสุดในชีวิตหนึ่งที่ผู้ป่วยบทความนี้เสนอเทคนิคใหม่ที่อาศัยโครโมโซมของความยาวต่างๆที่มีการสั่งคุณลักษณะสำคัญ วิธีการข้ามใหม่และการเปลี่ยนแปลงใหม่ วิธีที่เราสามารถหาโครโมโซมของความยาวที่เหมาะสมกับคุณสมบัติที่มีประโยชน์ส่วนโรค Crohn ' s ข้อมูลที่รวบรวมจากกรณีการควบคุม–สมาคมการศึกษาถูกใช้เพื่อแสดงให้เห็นถึงประสิทธิภาพของวิธีที่เสนอ . ในแง่ของการคาดการณ์ความถูกต้อง เสนอกรอบในการนำเสนอเทคนิค SNP การคาดการณ์ก่อนหน้านี้ รวมทั้งป่าสุ่มที่เหมาะสม ( ORF ) , กลุ่มชายขอบกระจายขั้นตอนวิธีและสนับสนุนเครื่องเวกเตอร์ ( usvm )ฟรีโลภค้นหาตามขั้นตอนวิธีการทำนาย ( cgsp ) , การค้นหาตามขั้นตอนวิธีการทำนาย ( CSP ) และแบบจุดเครือข่ายการไหล ( DNF ) ประสิทธิภาพของกรอบของเรา เมื่อทดสอบกับชุดข้อมูลนี้จริงกับผู้อื่นข้ามการตรวจสอบคือ 90.4 % ความถูกต้องกับความไวและความจำเพาะร้อยละ 87.5 % อาจ .