Insertional knock-outs in WUS-respo

Insertional knock-outs in WUS-responsive candidates
affect LRP ? SM conversion
To explore the roles of putative WUS-responsive targets
identified by transcriptome analysis, we refined selection
criteria to test insertional knock-outs of promising targets.
To enrich for potential direct targets of WUS, we surveyed

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

เคาะออก insertional WUS สนองผู้สมัครผล LRP อย่างไร แปลง SMการสำรวจบทบาทของอ้างว่าฝา WUS ตอบสนองเป้าหมายเราระบุการวิเคราะห์ transcriptome กลั่นเลือกเกณฑ์การทดสอบเพื่อ insertional เคาะเป้าหมายสัญญาบริการสำหรับเป้าหมายโดยตรงของ WUS เราได้< 1 kb ต้นน้ำของกลายพันธุ์ wus DEGs สองหรือมากกว่าอินสแตนซ์ที่สอดคล้องกับอ้างว่าฝา WUSbinding cis องค์ประกอบลำดับที่: CACGTG และ TTAATSS เป็น TTAATSS ทำงาน ลำดับเดิมระบุภายในมี intron เรารวม DEGs สองขึ้นไปอินสแตนซ์ภายใน introns ผู้สมัครเหล่านี้ได้จากนั้นสำรวจกับ eFP Arabidopsis เบราว์เซอร์ (ฤดูหนาว et al.,2007) สำหรับยีนที่แสดงส่วนต่างในการSAM (Yadav et al. 2009) หรืออ่อน (Casson et al. 2005)ตอนแรก กลายพันธุ์ wus 32 DEGs เลือก 28 ที่สิงที่สอดคล้องกัน T-ดีเอ็นเอแทรกบรรทัด หลักบรรทัดถูก assayed สำหรับ LRP แปลง SM โดยการให้คะแนนหมายเลขเริ่มต้นบนรากต้นกล้ารักษาหน่อด้วยการ 2iP lM ที่ 4.4 หรือ 2.2 5 – 7 วัน ทางการค้าลดลงความเข้มข้นมาพร้อมหน้าจอสำหรับเพิ่ม shootinduction จำนวน 39 หลักแทรกบรรทัดสอดคล้องกับยีน 27 ทดสอบในน้อยสองเหมือน (รูปที่ 7 S12 ตาราง) สี่บรรทัดเหล่านี้ ที่สอดคล้องกับ DEGs สี่ต่าง ๆ ลดลงด้วยใน wus ระหว่าง LRP การแปลง SM แสดงให้เห็นความสอดคล้องกันการลดในราคาพิเศษเริ่มต้นยิง (รูปที่ 7) สายพันธุ์ทั้งหมดปรากฏปกติ phenotypically นอกเหนือจากการขาดดุลในถ่ายภาพเริ่มต้น อย่างไรก็ตาม การจะต้องพิจารณาความเกี่ยวข้องของการกลายพันธุ์ WUS-ขึ้นอยู่กับกระบวนการและ LRP การแปลง SM

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

แทรกลึกหนาบางเคาะผู้สมัคร WUS ตอบสนอง
ผลต่อ LRP? แปลง SM
เพื่อสำรวจบทบาทของเป้าหมาย WUS ตอบสนองสมมุติ
ระบุโดยการวิเคราะห์ยีนที่เราได้จากการกลั่นตัวเลือก
เกณฑ์ในการทดสอบการแทรกเคาะลึกหนาบางของเป้าหมายที่มีแนวโน้ม.
เพื่อเพิ่มสำหรับเป้าหมายโดยตรงศักยภาพของ WUS เราสำรวจ
<1 KB ต้นน้ำของมนุษย์กลายพันธุ์ WUS degs สำหรับสองคนหรือมากกว่า
กรณีของลำดับสอดคล้องกับสมมุติ WUSbinding CIS องค์ประกอบ: CACGTG และ TTAATSS ในฐานะที่เป็นลำดับ TTAATSS การทำงานที่ถูกระบุว่า แต่เดิม
ภายใน intron เรารวม degs กับสองคนหรือมากกว่า
กรณีภายใน introns ผู้สมัครเหล่านี้ได้ทำการสำรวจแล้วกับเบราว์เซอร์ Arabidopsis EFP (ฤดูหนาว et al.,
2007) ยีนแสดงการแสดงออกที่แตกต่างกันใน
SAM (ดัฟ et al., 2009) หรือตัวอ่อน (แคสสัน et al., 2005).
ในขั้นต้น 32 WUS กลายพันธุ์ degs ได้รับการคัดเลือกที่ 28
สิงสอดคล้องเส้นแทรก T-DNA homozygous
เส้นถูก assayed สำหรับ LRP? แปลงเอสเอ็มโดยการให้คะแนน
หมายเลขของหน่อริเริ่มในรากต้นกล้าได้รับการรักษา
ด้วย 4.4 หรือ 2.2 LM 2iP สำหรับ 5-7 วัน ไซโตไคนิที่ต่ำกว่า
ความเข้มข้นที่ถูกรวมอยู่ที่หน้าจอสำหรับอัตรา shootinduction ที่เพิ่มขึ้น ทั้งหมด 39 เส้นแทรก homozygous,
สอดคล้องกับ 27 ยีนได้รับการทดสอบอย่างน้อยสองซ้ำ (รูปที่ 7; ตาราง S12) สี่ของเส้นเหล่านี้สอดคล้องกับสี่ degs ที่แตกต่างกันมีการแสดงออกที่ลดลง
ในช่วง WUS LRP? เอสเอ็มแปลงพบว่ามีความสอดคล้องกัน
ในการลดอัตราการเริ่มต้นถ่าย (รูปที่ 7) การกลายพันธุ์ทั้งหมด
ปรากฏปกติ phenotypically นอกเหนือจากการขาดดุลของพวกเขาใน
การเริ่มต้นการถ่ายทำ อย่างไรก็ตามการทำงานต่อไปจะต้อง
กำหนดความเกี่ยวข้องของการกลายพันธุ์เพื่อกระบวนการ WUS และขึ้นอยู่กับ LRP หรือไม่ แปลงเอสเอ็ม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

insertional เคาะลึกหนาบางในการตอบสนอง wus ผู้สมัครมีผลต่อ LRP ? การแปลงเอสเอ็มเพื่อศึกษาบทบาทของกรดอะมิโน wus ตอบสนองเป้าหมายระบุโดยการวิเคราะห์ทราน ริปโตม เราถึงเลือกเกณฑ์การทดสอบ insertional เคาะลึกหนาบางของเป้าหมายที่มีศักยภาพเพื่อเพิ่มศักยภาพของ wus ตรงเป้าหมายที่เราสำรวจ< 1 กิโลต้นน้ำของ wus กลายพันธุ์ degs สองหรือมากกว่าอินสแตนซ์ของลำดับกรดอะมิโนที่ wusbinding CIS และองค์ประกอบ : cacgtg ttaatss . เป็นลำดับ ttaatss หน้าที่ระบุเดิมภายใน degs iNtRON เรารวมสองหรือมากกว่าอินสแตนซ์ภายใน introns . ผู้สมัครเหล่านี้แล้ว สำรวจกับ Arabidopsis efp เบราว์เซอร์ ( ฤดูหนาว et al . ,2550 ) เพื่อแสดงความแตกต่างในการแสดงออกของยีนแซม ( yadav et al . , 2009 ) หรือตัวอ่อน ( Casson et al . , 2005 )ตอนแรก degs กลายพันธุ์ 32 wus ไว้ที่ 28 ,สิงที่ t-dna แทรกบรรทัด โฮโมไซกัสสายเป็นซีรั่มสำหรับ LRP ? สำหรับการแปลงคะแนนตัวเลขของยอดเริ่มต้นที่รากต้นกล้าที่ปฏิบัติกับ 4.4 หรือ 2.2 LM 2ip 5 – 7 วัน การ ) ลดลงความเข้มข้นรวมหน้าจอเพื่อเพิ่มอัตรา shootinduction . จำนวน 39 เส้น ส่วนแทรก ,สอดคล้องกับ 27 ยีนทดสอบอย่างน้อยสองแบบ ( รูปที่ 7 ; ตาราง s12 ) สี่บรรทัดเหล่านี้ที่แตกต่างกันสี่ degs ลดการแสดงออกในช่วง wus LRP ? การแปลง SM ให้สอดคล้องกันการลดอัตราการยิง ( รูปที่ 7 ) ทุกสายพันธุ์ปรากฏ phenotypically ปกติ นอกจากการขาดดุลของพวกเขาในยิงเริ่มต้น อย่างไรก็ตาม งาน จะ ต้องตรวจสอบความเกี่ยวข้องของการกลายพันธุ์และกระบวนการขึ้นอยู่กับ wus LRP ? การแปลง SM