Conjugation
As mentioned, conjugation is often viewed as the most promiscuous of the gene transfer mechanisms, showing the least restriction in relatedness of host/recipients. Although conjugation has been observed in soils, insect larvae (Vila-Boas et al., 1998) seed surfaces (Lilley and Baily, 1997; Lilley et al., 1996), in raw salmon on a cutting board (Kruse and Sorum, 1994), in porcine feces (Kruse and Sorum, 1994), crown gall tumors (Zhang et al., 1993) and a variety of other environments, few studies have focused on the indigenous flora, particularly in the marine environment. A problem in the study of gene transfer in aquatic or novel environments is that conjugative plasmids used in
such studies are of terrestrial origin and may not be representative of or behave like those indigenous to the environment in question. Dahlberg et al. (1997) isolated 95 mercury resistance conjugative plasmids from a variety of marine environments by transfer to a model recipient. There was a tremendous diversity in plasmids and 12 general structural groups were differentiated. Plasmids from different environments showed little similarity as determined by RFLP’s. The plasmids were further-tested for similarity to known plasmid incompatibility groups using inc/rep probes (Couturier et al., 1988). Hybridization studies showed no similarity between any of the twelve groups of naturally occurring marine plasmids and the well characterized plasmids often used in gene transfer studies. This study shows the need to develop more environmentally relevant plasmids and probes for the study of conjugation in situ. Sandaa and Enger (1994) noted transfer of the highly promiscuous plasmid pRAS1 from the fish pathogen Aeromonas salmonicida to the indigenous flora in marine sediments. If oxytetracycline was added as a selective pressure, transfer frequencies increased to 3.4 x 10-1 transconjugants per recipient and 3.6 transconjugants per donor, perhaps the highest reported gene transfer frequency for any environmental gene transfer study. The plasmid was transferred to a variety of biotypes as determined by phenotypic characterization of the recipients. The transfer frequencies expressed per recipient are undoubtedly overestimates, because recipients were enumerated as cultivatable CFU’s and not direct counts. None-the-less, this work illustrates the promiscuity of certain conjugative plasmids, and the ease at which antibiotic resistances can spread through natural marine
bacterial communities. Perhaps one of the most elegant demonstrations of conjugation to the indigenous marine flora was the work of Dahlberg et al. (1998). These investigators used the conjugative plasmid pBF1 which contains the green fluorescent protein (GFP) gene in Pseudomonas putida as a donor. This gene is not expressed in the donor because
of a chromosomal repressor. Gene transfer was noted when cultivated recipients were used as well as the natural marine population. Transfer to the indigenous population could be observed directly by epifluorescence microscopy, without the need of cultivation of transconjugants. Transfer frequencies ranged from 2x10-6 to 1.4 x10-4, with transfer highest in filter mating compared to bulk matings. The plasmid used also encoded for mercury resistance, but selection in mercury did not facilitate or enhance transfer frequencies. Thus, selective pressure may or may not enhance transfer to the indigenous population.
Conjugationดังกล่าว conjugation คือมักดู promiscuous เป็นที่สุดกลไกการถ่ายโอนยีน แสดงข้อจำกัดน้อยที่สุดใน relatedness โฮสต์/ชื่อผู้รับ แม้ว่าจะมีการสังเกตการ conjugation ในดินเนื้อปูน ตัวอ่อนแมลง (วิลล่า Boas และ al., 1998) เมล็ดผิว (Lilley และ Baily, 1997 Lilley et al., 1996), ในปลาแซลมอนดิบในการตัดกระดาน (Kruse และ Sorum, 1994), อุจจาระช่วง (Kruse และ Sorum, 1994), คราวน์ปากปราศรัยน้ำใจเชือดเนื้องอก (Zhang et al., 1993) และหลากหลายอื่น ๆ สภาพแวดล้อม การศึกษาไม่ได้เน้นพืชพื้นเมือง โดยเฉพาะอย่างยิ่งในสภาพแวดล้อมทางทะเล มีปัญหาในการศึกษาการถ่ายโอนยีนในสภาพแวดล้อมทางน้ำ หรือนวนิยายที่ conjugative plasmids ใช้ในการศึกษาดังกล่าวเป็นดวงกำเนิด และไม่ควร หรือทำท่าเหล่านั้นชนพื้นเมืองในสภาพแวดล้อมในคำถาม Dahlberg et al. (1997) แยกต่างหาก 95 พุธต้านทาน conjugative plasmids จากความหลากหลายของสภาพแวดล้อมทางทะเลโดยโอนไปยังผู้รับรุ่น มีความหลากหลายมากใน plasmids และ 12 กลุ่มโครงสร้างทั่วไปไม่แตกต่างกัน Plasmids จากสภาพแวดล้อมที่แตกต่างกันแสดงให้เห็นความคล้ายคลึงกันน้อยที่ของ RFLP Plasmids ถูกเพิ่มเติมทดสอบคล้ายคลึงกับกลุ่มความเข้ากันไม่รู้จัก plasmid ใช้คลิปปากตะเข้ inc/ตัว แทน (Couturier et al., 1988) ศึกษาการ hybridization ที่แสดงให้เห็นว่าไม่มีความคล้ายคลึงกันระหว่างใด ๆ ของกลุ่ม 12 ของ plasmids ทะเลเกิดขึ้นตามธรรมชาติและ plasmids characterized ดีมักใช้ในการศึกษาการถ่ายโอนยีน การศึกษานี้แสดงต้องพัฒนา plasmids สิ่งแวดล้อมที่เกี่ยวข้องเพิ่มเติม และ probes สำหรับการศึกษาใน situ conjugation Sandaa และ Enger (1994) ตามโอน pRAS1 plasmid promiscuous สูงจากปลาศึกษา Aeromonas salmonicida กับพืชพื้นเมืองในตะกอนทะเล ถ้ามีเพิ่มออกซิเตตราไซคลีนเป็นความดันใช้ ความถี่ในการถ่ายโอนเพิ่มขึ้น 3.4 x 10-1 transconjugants ต่อผู้รับและ transconjugants 3.6 ต่อผู้บริจาค บางทีความถี่ถ่ายโอนยีนรายงานสูงสุดสำหรับยีนสิ่งแวดล้อมใด ๆ โอนการศึกษา Plasmid มีการโอนย้ายไปยัง biotypes ไทป์คุณสมบัติของผู้รับ ความถี่ในการโอนย้ายที่แสดงต่อผู้รับจะไม่ต้องสงสัย overestimates เนื่องจากมีระบุผู้รับเป็น cultivatable CFU และไม่ตรงจำนวน ไม่มีเดอะน้อย promiscuity plasmids บาง conjugative และความง่ายในการต้านทานยาปฏิชีวนะสามารถแพร่กระจายผ่านทางทะเลธรรมชาติแสดงให้เห็นงานนี้ชุมชนเชื้อแบคทีเรีย บางทีหนึ่งของชุมนุม conjugation การพืชทะเลพื้นที่สง่างามที่สุดมีการทำงานของ Dahlberg et al. (1998) นักเหล่านี้ใช้ pBF1 conjugative plasmid ที่ประกอบด้วยยีนโปรตีนเรืองแสงสีเขียว (GFP) ในลี putida เป็นผู้บริจาค ยีนนี้จะไม่แสดงในการบริจาคได้เนื่องจากของ repressor ของโครโมโซม โอนย้ายยีนถูกบันทึกเมื่อ cultivated ผู้รับใช้และประชากรทะเลธรรมชาติ โอนย้ายไปยังประชากรพื้นเมืองสามารถจะสังเกตได้โดยตรง โดย epifluorescence microscopy โดยไม่จำเป็นต้องเพาะปลูก transconjugants โอนย้ายความถี่อยู่ในช่วงตั้งแต่ 2 x 10-6 1.4 x 10-4 พร้อมโอนที่สูงที่สุดในกรองผสมพันธุ์ไปจำนวนมาก matings Plasmid ที่ใช้เข้ารหัสความต้านทานต่อสารปรอท แต่เลือกในปรอทได้อำนวยความสะดวก หรือเพิ่มความถี่ในการโอนย้าย ดังนั้น ใช้ความดันอาจ หรืออาจเพิ่มการโอนย้ายไปยังประชากรพื้นเมือง
การแปล กรุณารอสักครู่..
ผัน
ดังกล่าวผันมักจะถูกมองเป็นที่สุดสำส่อนของกลไกการถ่ายโอนยีนแสดงให้เห็นข้อ จำกัด น้อยในสัมพันธ์ของโฮสต์ / ผู้รับ แม้ว่าผันได้รับการสังเกตในดินตัวอ่อนแมลง (Vila-Boas, et al, 1998.) พื้นผิวเมล็ด (ลิลลี่และ Baily,. 1997; ลิลลี่, et al, 1996) ในปลาแซลมอนดิบบนกระดานตัด (ครูซและ Sorum, 1994 ) ในอุจจาระสุกร (ครูซและ Sorum, 1994), เนื้องอกในถุงน้ำดีมงกุฎ (Zhang et al., 1993) และความหลากหลายของสภาพแวดล้อมอื่น ๆ , การศึกษาน้อยมีความสำคัญกับพืชพื้นเมืองเฉพาะอย่างยิ่งในสภาพแวดล้อมทางทะเล ปัญหาในการศึกษาการถ่ายโอนยีนในสภาพแวดล้อมทางน้ำหรือนวนิยายคือพลาสมิด conjugative ที่ใช้ในการ
ศึกษาดังกล่าวเป็นแหล่งกำเนิดของภาคพื้นดินและอาจจะไม่ได้เป็นตัวแทนหรือทำตัวเหมือนผู้พื้นเมืองกับสภาพแวดล้อมในคำถาม ดาห์ลเบิร์กและคณะ (1997) แยก 95 ต้านทานปรอทพลาสมิด conjugative จากความหลากหลายของสภาพแวดล้อมทางทะเลโดยการโอนเงินไปยังผู้รับรูปแบบ มีความหลากหลายอย่างมากอยู่ในพลาสมิดและ 12 กลุ่มโครงสร้างทั่วไปที่ได้รับแตกต่างกัน พลาสมิดจากสภาพแวดล้อมที่แตกต่างกันแสดงให้เห็นความคล้ายคลึงกันเล็ก ๆ น้อย ๆ ตามที่กำหนดโดย RFLP ของ พลาสมิดที่ถูกเพิ่มเติมผ่านการทดสอบสำหรับความคล้ายคลึงกันกับกลุ่มพลาสมิดเข้ากันไม่ได้เป็นที่รู้จักกันโดยใช้ยานสำรวจ Inc / ตัวแทน (Couturier การ et al., 1988) การศึกษาแสดงให้เห็นว่าการผสมพันธุ์ไม่มีความคล้ายคลึงกันระหว่างใด ๆ ของสิบสองกลุ่มของธรรมชาติที่เกิดขึ้นพลาสมิดทางทะเลและพลาสมิดลักษณะดีมักจะใช้ในการศึกษาการถ่ายโอนยีน การศึกษาครั้งนี้แสดงให้เห็นถึงความจำเป็นในการพัฒนาพลาสมิดอื่น ๆ ที่เกี่ยวข้องกับสิ่งแวดล้อมและ probes สำหรับการศึกษาของผันในแหล่งกำเนิด Sandaa และ Enger (1994) ตั้งข้อสังเกตการโอนสำส่อนสูงพลาสมิด pRAS1 จากเชื้อ Aeromonas ปลา salmonicida กับพืชพื้นเมืองในตะกอนทะเล หาก OXYTETRACYCLINE ถูกเพิ่มเข้ามาในฐานะที่เป็นความดันเลือกความถี่โอนเพิ่มขึ้นถึง 3.4 x 10-1 transconjugants ต่อผู้รับและ 3.6 transconjugants ต่อผู้บริจาคอาจความถี่การถ่ายโอนยีนรายงานสูงสุดสำหรับการศึกษาการถ่ายโอนยีนสิ่งแวดล้อมใด ๆ พลาสมิดที่ถูกย้ายไปความหลากหลายของ biotypes ตามที่กำหนดโดยลักษณะฟีโนไทป์ของผู้รับ ความถี่โอนแสดงต่อผู้รับไม่ต้องสงสัย overestimates เพราะผู้รับถูกนับเป็นพืชที่ปลูกได้ CFU และไม่นับโดยตรง ไม่มี-น้อยงานนี้แสดงให้เห็นถึงความหลากหลายของพลาสมิด conjugative บางและความสะดวกที่ต้านทานยาปฏิชีวนะที่สามารถแพร่กระจายผ่านทางธรรมชาติทางทะเล
ชุมชนแบคทีเรีย บางทีอาจจะเป็นหนึ่งในการสาธิตที่หรูหราที่สุดของการผันพืชทะเลพื้นเมืองเป็นผลงานของดาห์ลเบิร์กและคณะ (1998) นักวิจัยเหล่านี้ใช้พลาสมิด pBF1 conjugative ซึ่งมีโปรตีนเรืองแสงสีเขียว (GFP) ยีนใน Pseudomonas putida เป็นผู้บริจาค ยีนนี้จะไม่แสดงในผู้บริจาคเพราะ
อดกลั้นของโครโมโซม การถ่ายโอนยีนก็สังเกตเห็นว่าเมื่อผู้รับการเพาะปลูกถูกนำมาใช้เช่นเดียวกับประชากรทะเลธรรมชาติ โอนไปยังประชากรในประเทศที่อาจจะสังเกตเห็นได้โดยตรงโดยใช้กล้องจุลทรรศน์ epifluorescence โดยไม่จำเป็นต้องของการเพาะปลูกของ transconjugants ความถี่โอนตั้งแต่ 2x10-6 ถึง 1.4 x10-4 มีการโอนที่สูงที่สุดในการผสมพันธุ์กรองเมื่อเทียบกับถอนรากจำนวนมาก พลาสมิดที่ใช้เข้ารหัสยังต้านทานปรอท แต่ตัวเลือกในปรอทไม่ได้อำนวยความสะดวกหรือเพิ่มความถี่การถ่ายโอน ดังนั้นความดันเลือกอาจหรือไม่อาจช่วยเพิ่มการถ่ายโอนไปประชากรในประเทศ
การแปล กรุณารอสักครู่..
)
) ดังกล่าว มักมองว่าเป็น promiscuous มากที่สุดของการถ่ายโอนยีนกลไกแสดงข้อ จำกัด น้อยในสัมพันธ์ของโฮสต์ / ผู้รับ แม้ว่าการได้รับการตรวจสอบในดิน , แมลงตัวอ่อน ( วิลางูเหลือม et al . , 1998 ) พื้นผิวเมล็ด ( ลิลลี่ และเบลีย์ , 1997 ; ลิลลี่ et al . , 1996 ) ในปลาแซลมอนดิบบนเขียง ( ครูสและ โซรัม , 1994 )ในอุจจาระสุกร ( ครูสและ โซรัม , 1994 ) , มงกุฎเนื้องอกถุงน้ำดี ( Zhang et al . , 1993 ) และความหลากหลายของสภาพแวดล้อมอื่น ๆ มีการศึกษาน้อย เน้นพืชพื้นบ้าน โดยเฉพาะอย่างยิ่งในสิ่งแวดล้อมทางทะเล ปัญหาในการศึกษาการถ่ายโอนยีนในน้ำหรือสภาพแวดล้อมที่ใช้ในนวนิยาย conjugative
พลาสมิดการศึกษาดังกล่าวเป็นแหล่งกำเนิดบนโลก และอาจเป็นตัวแทนของ หรือทำตัวเหมือนพวกพื้นเมืองเพื่อสิ่งแวดล้อมในคำถาม ดัลเบิร์ก et al . ( 1997 ) แยกพลาสมิดต้านทาน conjugative 95 ปรอทจากความหลากหลายของสภาพแวดล้อมทางทะเล โดยโอนไปให้ผู้รับแบบ มีความหลากหลายอย่างมากในพลาสมิดและกลุ่มโครงสร้าง 12 ทั่วไปที่แตกต่างกัน .พลาสมิดจากสภาพแวดล้อมที่แตกต่างกันแสดงความเหมือนเพียงกำหนดโดย RFLP . พลาสมิดได้ทดสอบเหมือนรู้จักกันโดยใช้พลาสมิดกลุ่ม Inc / ตัวแทนโพรบ ( นักออกแบบเสื้อผ้า et al . , 1988 )( การศึกษาพบว่าไม่มีความคล้ายคลึงระหว่างใด ๆของสิบสองกลุ่มพลาสมิดของธรรมชาติที่เกิดขึ้นทางทะเลและดีลักษณะ ) มักใช้ในการศึกษาการถ่ายโอนยีน การศึกษานี้แสดงให้เห็นความต้องการที่เกี่ยวข้องกับสิ่งแวดล้อมมากขึ้นและพัฒนาเพื่อติดตามการศึกษาในเชิงทฤษฎีในแหล่งกำเนิดsandaa เกอร์ ( 1994 ) และสังเกตการ pras1 พลาสมิดสำส่อนสูงจากปลา salmonicida เชื้อโรคเชื้อกับพืชพื้นเมืองในตะกอนทะเล ถ้าเพิ่มออกซเป็นแรงดันการโอนความถี่เพิ่มขึ้น 3.4 x 10-1 transconjugants ต่อผู้รับและ 3.6 transconjugants ต่อผู้บริจาคบางทีการย้ายยีนความถี่สูงสุดสำหรับการถ่ายโอนยีนสิ่งแวดล้อมศึกษา พลาสมิดที่ถูกย้ายไปที่หลากหลายของ biotypes ตามที่กำหนดโดยลักษณะฟีโนไทป์ของผู้รับ การโอนความถี่แสดงต่อผู้รับจะไม่ต้องสงสัย overestimates เพราะผู้รับถูกระบุว่า cultivatable เซลล์โดยตรง และไม่นับ ไม่มีน้อยลงงานนี้จะแสดงความสำส่อนของบาง conjugative พลาสมิดและความสะดวกที่ซึ่งยาปฏิชีวนะซึ่งสามารถแพร่กระจายผ่าน
ทางทะเลธรรมชาติของชุมชน บางทีหนึ่งในการชุมนุมที่งดงามที่สุดของพืชทะเลพื้นเมืองคือผลงานของดาลเบิร์ก et al . ( 1998 )นักวิจัยเหล่านี้ใช้ conjugative pbf1 พลาสมิดที่มียีนโปรตีนเรืองแสงสีเขียว ( GFP ) ในส่วนของ enrichment เป็นผู้บริจาค ยีนไม่แสดงออกในผู้บริจาคเพราะ
ของผู้ควบคุมโครโมโซม . การถ่ายโอนยีนถูกบันทึกเมื่อมีผู้รับใช้ ตลอดจนประชากรทะเลธรรมชาติถ่ายโอนไปยังประชากรพื้นเมืองสามารถสังเกตได้โดยตรง ด้วยกล้องจุลทรรศน์ epifluorescence โดยไม่ต้องปลูก transconjugants . ความถี่ถ่ายโอนระหว่าง 2x10-6 1.4 x10-4 กับโอนสูงสุดในกรองผสมพันธุ์เมื่อเทียบกับขนาดใหญ่ matings . การใช้พลาสมิดที่ปรอทต้านทาน แต่การเลือกในปรอทไม่อำนวยความสะดวกหรือเพิ่มความถี่ในการโอนดังนั้น แรงดันที่เลือกอาจจะหรืออาจจะไม่เพิ่มการถ่ายโอนประชากรพื้นเมือง
การแปล กรุณารอสักครู่..