Composition and diversity of the ba

Composition and diversity of the bacterial communities. DNA in
each ileal and colonic chyme sample was extracted according to the
manufacturer
s protocol (Bocai Biology). The V3 and V4 regions of the
16S ribosomal DNA gene were chosen for PCR. The primers were
338F (5#ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3#) and 806R (5#GGACTACHVGGGTWTCTAAT-
3#). The procedure to obtain amplicons
was previously described, with modifications The products were
examined on a 2% (wt:vol) agarose gel. The amplicons from 6 replicates/
treatment were blended in equimolar ratios on the basis of concentration.
The blended samples were sent out for MiSeq Next-Generation Sequencing
System on an Illumina MiSeq PE300 platform at the Majorbio Bio-
Pharm Technology Company. Only sequences >50 bp were used for
phylotype analysis at the 0.03 operational taxonomic unit level.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

องค์ประกอบและความหลากหลายของชุมชนเชื้อแบคทีเรีย ดีเอ็นเอในแต่ละอย่างของ chyme ileal และ colonic ถูกแยกตามผู้ผลิต s โพรโทคอล (Bocai ชีววิทยา) V3 และ V4 ภูมิภาคของการยีนดีเอ็นเอ ribosomal 16S ถูกเลือกสำหรับ PCR มีไพรเมอร์ที่338F (5 #ACTCCTACGGGAGGCAGCA 3 อันดับ) และ 806R (5 #GGACTACHVGGGTWTCTAAT -อันดับที่ 3) ขั้นตอนการขอรับ ampliconsได้อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ มีการปรับเปลี่ยนผลิตภัณฑ์ได้ตรวจสอบบน agarose เจล 2% (wt:vol) เหมือนกับ amplicons จาก 6 /รักษามาผสมในอัตราส่วน equimolar บนพื้นฐานของความเข้มข้นตัวอย่างผสมส่งออกสำหรับการจัดลำดับรุ่นใหม่ MiSeqระบบบนแพลตฟอร์ม Illumina MiSeq PE300 ในการ Majorbio Bio-บริษัทเทคโนโลยี Pharm เฉพาะ ลำดับ > 50 bp ใช้สำหรับphylotype การวิเคราะห์ในระดับ 0.03 หน่วยอนุกรมวิธานที่ปฏิบัติงาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

องค์ประกอบและความหลากหลายของชุมชนแบคทีเรีย ดีเอ็นเอใน
ตัวอย่าง chyme แต่ละ ileal และลำไส้ใหญ่ถูกสกัดตามที่
ผู้ผลิตหรือไม่? Protocol (Bocai ชีววิทยา) V3 และ V4 ภูมิภาคของ
16S โซมอลดีเอ็นเอของยีนที่ถูกเลือกสำหรับวิธี PCR ไพรเมอร์มี
338F (5 # ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3 #) และ 806R (5 # GGACTACHVGGGTWTCTAAT-
3 #) ขั้นตอนการขอรับ amplicons
ได้อธิบายไว้ก่อนหน้านี้มีการปรับเปลี่ยนผลิตภัณฑ์ที่ได้รับการ
ตรวจสอบใน 2% (WT: ปริมาตร) เจล agarose amplicons จาก 6 ซ้ำ /
การรักษาที่ถูกผสมในอัตราส่วน equimolar บนพื้นฐานของความเข้มข้น.
กลุ่มตัวอย่างที่ผสมถูกส่งออกสำหรับ MiSeq Next-Generation ลำดับ
ระบบบนแพลตฟอร์ม Illumina MiSeq PE300 ที่ Bio- Majorbio
บริษัท Pharm เทคโนโลยี เพียงลำดับ> 50 bp ถูกนำมาใช้สำหรับ
การวิเคราะห์ phylotype ในการดำเนินงานระดับหน่วย 0.03 อนุกรมวิธาน