Eighteen rRNA sequences of the main

Eighteen rRNA sequences of the main mite species isolated indoors were retrieved from the GenBank database and were aligned using BioEdit Software (Tom Hall Ibis Biosciences, California) to choose the most appropriate areas for primer design. Aligned sequences were those of D. pteronyssinus (accession numbers: EU152579; DQ025512; DQ025511), D. farinae (GQ864309; EU152578; GQ864309), Dermatophagoides evansi (EU152577), A. siro (AF022023; EU152495), L. destructor (EF203771), and T. putrescentiae (DQ025510). Primers and probes were designed using Primer Express® 3.0 for Real-Time PCR software (Applied Biosystems). Parameters used to design primers and probes were chosen to ensure optimal conditions for qPCR. Indeed, the minimum and maximum melting temperatures (Tm) permitted for primers were 58 and 60 °C respectively. The minimum and maximum percentages of C and G contained by either primer were 30 and 80% respectively, with a maximum of two residues on the 3′ end required to be a G or C. The optimal length allowed for each primer was 20 bases (9 bases minimum and 40 bases maximum). Minimum and maximum Tm allowed for probes were 68 and 80 °C respectively. The minimum and maximum percentages of G and C contained by the probes were 30 and 80% respectively for a length range of 13 to 30 bases. No more 3 G repeats were required in probe. The amplified region length permitted ranged from 50 to 150 bases.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สิบแปดลำดับ rRNA ของสารหลักชนิดที่แยกต่างหากในร่มถูกเรียกใช้จากฐานข้อมูลของ GenBank และถูกจัดใช้ซอฟต์แวร์ BioEdit (เวลาออกทอมหอไอบิส แคลิฟอร์เนีย) เพื่อเลือกพื้นที่ที่เหมาะสมที่สุดสำหรับรองพื้นออก ถูกวางลำดับของ D. pteronyssinus (ทะเบียนหมายเลข: EU152579 DQ025512 DQ025511), D. farinae (GQ864309 EU152578 GQ864309), Dermatophagoides evansi (EU152577), ไซโร A. (AF022023 EU152495), L. destructor (EF203771), และตำบล putrescentiae (DQ025510) ไพรเมอร์และคลิปปากตะเข้ถูกออกแบบโดยใช้รองพื้น Express ® 3.0 ซอฟต์แวร์ Real-Time PCR (Biosystems ใช้) พารามิเตอร์ที่ใช้ในการออกแบบไพรเมอร์และคลิปปากตะเข้ถูกเลือกเพื่อให้เงื่อนไขที่เหมาะสมสำหรับ qPCR แน่นอน ต่ำสุดและสูงสุดละลายอุณหภูมิ (Tm) ได้รับอนุญาตสำหรับไพรเมอร์ได้ 58 และ 60 ° C ตามลำดับ เปอร์เซ็นต์ต่ำสุด และสูงสุดของ C และ G ที่อยู่ตามพื้นอย่างใดอย่างหนึ่งได้ 30 และ 80% ตามลำดับ ที่สุดของสองตกใน 3′ ต้องเป็น G หรือ c ความยาวสูงสุดที่อนุญาตสำหรับแต่ละพื้น 20 ฐาน (ฐาน 9 ฐาน 40 และต่ำสุดสูงสุด) ต่ำสุดและสูงสุด Tm ได้คลิปปากตะเข้ได้ 68 และ 80 ° C ตามลำดับ เปอร์เซ็นต์ต่ำสุด และสูงสุดของ G และ C อยู่คลิปปากตะเข้ได้ 30 และ 80% ตามลำดับในช่วงความยาวของฐาน 13-30 ทำซ้ำ 3 G ไม่จำเป็นในโพรบ ความยาวภาคเอาต์อนุญาตแสก ๆ จาก 50 ไปฐาน 150.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สิบแปดลำดับ rRNA ของสายพันธุ์ไรหลักในร่มแยกถูกดึงออกมาจากฐานข้อมูล GenBank และถูกจัดชิดโดยใช้ซอฟท์แว BioEdit (ทอมฮอลล์ Ibis ชีววิทยาศาสตร์แคลิฟอร์เนีย) ในการเลือกพื้นที่ที่เหมาะสมที่สุดสำหรับการออกแบบไพรเมอร์ ลำดับชิดของพวก D. pteronyssinus (หมายเลขภาคยานุวัติ: EU152579; DQ025512; DQ025511), D. farinae (GQ864309; EU152578; GQ864309) Dermatophagoides evansi (EU152577) อ. siro (AF022023; EU152495), L. destructor (EF203771 ) และ ต. putrescentiae (DQ025510) ไพรเมอร์และวัดได้รับการออกแบบโดยใช้ไพรเมอร์เอ็กซ์เพรส® 3.0 สำหรับซอฟต์แวร์ Real-Time PCR (Applied Biosystems) ตัวแปรที่ใช้ในการออกแบบไพรเมอร์และวัดได้รับการแต่งตั้งเพื่อให้แน่ใจว่าเงื่อนไขที่ดีที่สุดสำหรับ qPCR ที่จริงที่ต่ำสุดและสูงสุดที่อุณหภูมิหลอมละลาย (TM) อนุญาตให้ไพรเมอร์มี 58 และ 60 องศาเซลเซียสตามลำดับ ต่ำสุดและสูงสุดร้อยละของ C และ G โดยมีไพรเมอร์ทั้งสองเป็น 30 และ 80% ตามลำดับสูงสุดของทั้งสองที่ตกค้างอยู่ที่ปลาย 3 'ต้องเป็น G หรือ C ระยะเวลาที่ดีที่สุดที่ได้รับอนุญาตสำหรับแต่ละไพรเมอร์เป็น 20 ฐาน ( สูงสุด 9 ฐานขั้นต่ำและฐาน 40) ต่ำสุดและสูงสุด Tm ได้รับอนุญาตให้ตรวจได้ 68 และ 80 องศาเซลเซียสตามลำดับ ร้อยละต่ำสุดและสูงสุดของ G และ C โดยมีรายได้ 30 และ 80% ตามลำดับสำหรับช่วงระยะเวลาของ 13-30 ฐาน ไม่มี 3 G ซ้ำที่จำเป็นในการสอบสวน ระยะเวลาในภูมิภาคขยายได้รับอนุญาตตั้งแต่ 50-150 ฐาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สิบแปด rRNA ลำดับของชนิดไรหลักแยกข้างในถูกดึงมาจากฐานข้อมูลของขนาดและการใช้ซอฟต์แวร์ bioedit ชิด ( ทอม ฮอลล์ ไอบิส ชีววิทยาศาสตร์ แคลิฟอร์เนีย ) เพื่อเลือกพื้นที่ที่เหมาะสมที่สุดเพื่อการออกแบบไพรเมอร์ ชิดลำดับกลุ่ม D . pteronyssinus ( บัตรเลข eu152579 ; dq025512 ; dq025511 ) , D . farinae ( gq864309 ; eu152578 ; gq864309 )dermatophagoides evansi ( eu152577 ) A . Siro ( af022023 ; eu152495 ) , L . เดสทรัคเตอร์ ( ef203771 ) , และ ต. putrescentiae ( dq025510 ) ดีเอ็นเอโพรบและถูกออกแบบโดยใช้ไพรเมอร์ด่วน®สำหรับเวลาจริงซอฟต์แวร์ PCR ( Applied Biosystems ) พารามิเตอร์ที่ใช้ในการออกแบบไพรเมอร์โพรบและถูกเลือกเพื่อให้แน่ใจว่าเงื่อนไขที่เหมาะสมสำหรับ qpcr . แน่นอนต่ำสุดและสูงสุดที่อุณหภูมิละลาย ( TM ) โดยอนุญาตให้ 58 และ 60 ° C ตามลำดับ ต่ำสุดและสูงสุดร้อยละของ C และ G ที่มีอยู่ โดยไพรเมอร์จำนวน 30 และ 80% ตามลำดับ สูงสุดสองตกค้างบน 3 นั้นจบต้องเป็น G หรือ C ที่ได้รับอนุญาตสำหรับแต่ละหลักมีความยาวฐาน 20 ( 9 ฐานขั้นต่ำ 40 ฐานสูงสุด )ขั้นต่ำและสูงสุดที่อนุญาตให้ใช้และเป็น 68 80 ° C ตามลำดับ ต่ำสุดและสูงสุดค่า G และ C อยู่ โดยวัดได้ 30 และ 80% ตามลำดับ สำหรับช่วงความยาว 13 ฐาน 30 ไม่มี 3 G ซ้ำถูกต้องในการสอบสวน การขยายเขตความยาวอนุญาตตั้งแต่ 50 ถึงฐาน
150