Erythrose 4-phosphate and phosphoenolpyruvate[edit]
Phenylalanine, tyrosine, and tryptophan are known as the aromatic amino acids. The synthesis of all three share a common beginning to their pathways; the formation of chorismate from phosphoenolpyruvate (PEP) and erythrose 4- phosphate (E4P). The first step, condensation of 3-deoxy-D-arabino-heptulosonic acid 7-phosphate (DAHP) from PEP/E4P, uses three isoenzymes AroF, AroG, and AroH. Each one of these has its synthesis regulated from tyrosine, phenylalanine, and tryptophan, respectively. These isoenzymes all have the ability to help regulate synthesis of DAHP by the method of feedback inhibition. This acts in the cell by monitoring the concentrations of each of the three aromatic amino acids. When there is too much of any one of them, that one will allosterically control the DAHP synthetase by “turning it off”. With the first step of the common pathway shut off, synthesis of the three amino acids can not proceed. The rest of the enzymes in the common pathway (conversion of DAHP to chorismate) appear to be synthesized constitutively, except for shikimate kinase which can be inhibited by shikimate through linear mixed-type inhibition. If too much shikimate has been produced then it can bind to shikimate kinase to stop further production.
Besides the regulations described above, each amino acids terminal pathway can be regulated. These terminal pathways progress from chorismate to the final end product, either tyrosine, phenylalanine, or tryptophan. Each one of these pathways is regulated in a similar fashion to the common pathway; with feedback inhibition on the first committed step of the pathway.
Tyrosine and phenylalanine share the same initial step in their terminal pathways, chorismate converted to prephenate which is converted to an amino acid-specific intermediate. This process is mediated by a phenylalanine (PheA) or tyrosine (TyrA) specific chorismate mutase-prephenate dehydrogenase. The reason for the amino acid-specific enzymes is because PheA uses a simple dehydrogenase to convert prephenate to phenylpyruvate, while TyrA uses a NAD-dependent dehydrogenase to make 4-hydroxylphenylpyruvate. Both PheA and TyrA are feedback inhibited by their respective amino acids. Tyrosine can also be inhibited at the transcriptional level by the TyrR repressor. TyrR binds to the TyrR boxes on the operon near the promoter of the gene that it wants to repress.
In the terminal-tryptophan synthesis pathway, the initial step converts chorismate to anthranilate using anthranilate synthase. This enzyme requires either ammonia or glutamine as the amino group donor. Anthranilate synthase is regulated by the gene products of trpE and trpD. trpE encodes the first subunit, which binds to chorismate and moves the amino group from the donor to chorismate. trpD encodes the second subunit, which is simply used to bind glutamine and use it as the amino group donor so that the amine group can transfer to the chorismate. Anthranilate synthase is also regulated by feedback inhibition. The finished product of tryptophan, once produced in great enough quantities, is able to act as the co-repressor to the TrpR repressor which represses expression of the trp operon.
erythrose 4 ฟอสเฟตและ Phosphoenolpyruvate [แก้ไข]
นิลอะลาซายน์และโพรไบโอเป็นที่รู้จักกันเป็นกรดอะมิโนที่มีกลิ่นหอม การสังเคราะห์ของทั้งสามร่วมกันจุดเริ่มต้นร่วมกันในการทางเดินของพวกเขา; การก่อตัวของ chorismate จาก Phosphoenolpyruvate (PEP) และ erythrose 4- ฟอสเฟต (E4P) ขั้นตอนแรกการรวมตัวของ 3-deoxy-D-arabino-heptulosonic กรด 7-ฟอสเฟต (DAHP) จาก PEP / E4P, ใช้สาม isoenzymes AroF, AroG และ AroH แต่ละคนเหล่านี้ได้รับการควบคุมการสังเคราะห์จากซายน์, เฟนนิลและโพรไบโอตามลำดับ เหล่านี้ isoenzymes ทุกคนมีความสามารถในการช่วยควบคุมการสังเคราะห์ DAHP โดยวิธีการของการยับยั้งข้อเสนอแนะ นี้ทำหน้าที่ในเซลล์โดยการตรวจสอบความเข้มข้นของแต่ละสามกรดอะมิโนที่มีกลิ่นหอม เมื่อมีมากเกินไปของหนึ่งของพวกเขาใด ๆ ที่หนึ่ง allosterically จะควบคุม synthetase DAHP โดย "เปิดออก" ด้วยขั้นตอนแรกของทางเดินร่วมกันปิดการสังเคราะห์ในสามของกรดอะมิโนไม่สามารถดำเนินการต่อไป ส่วนที่เหลือของเอนไซม์ในทางเดินร่วมกัน (แปลง DAHP เพื่อ chorismate) ดูเหมือนจะสังเคราะห์ constitutively ยกเว้นไคเนส shikimate ซึ่งสามารถยับยั้งโดย shikimate ผ่านการยับยั้งผสมชนิดเชิงเส้น หาก shikimate มากเกินไปได้รับการผลิตก็สามารถผูกกับ shikimate ไคเนสจะหยุดการผลิตต่อไป. นอกจากนี้กฎระเบียบที่อธิบายข้างต้นแต่ละกรดอะมิโนทางเดินสถานีสามารถควบคุมได้ ทางเดินเหล่านี้ขั้วความคืบหน้าจาก chorismate กับผลิตภัณฑ์สุดท้ายปลายทั้งซายน์, ฟีนิลหรือโพรไบโอ แต่ละคนของทางเดินเหล่านี้ถูกควบคุมในลักษณะคล้ายกับทางเดินร่วมกัน; ด้วยการยับยั้งความคิดเห็นเกี่ยวกับขั้นตอนแรกของการมุ่งมั่นเดิน. ไทโรซีนและส่วนแบ่งฟีนิลขั้นตอนแรกเหมือนกันในทางเดินของพวกเขา terminal, chorismate แปลง prephenate ซึ่งจะถูกแปลงเป็นกรดอะมิโนที่เฉพาะเจาะจงกลาง กระบวนการนี้เป็นผู้ไกล่เกลี่ยโดยฟีนิล (PheA) หรือซายน์ (Tyra) เฉพาะ chorismate dehydrogenase mutase-prephenate เหตุผลสำหรับเอนไซม์เฉพาะกรดอะมิโนเป็นเพราะ PheA ใช้ dehydrogenase ง่ายในการแปลง prephenate เพื่อ phenylpyruvate ขณะ Tyra ใช้ dehydrogenase NAD ขึ้นอยู่กับที่จะทำให้ 4 hydroxylphenylpyruvate ทั้ง PheA และข้อเสนอแนะ Tyra จะยับยั้งโดยกรดอะมิโนของตน ไทโรซีนนอกจากนี้ยังสามารถยับยั้งในระดับการถอดรหัสโดย TyrR อดกลั้น TyrR ผูกกับกล่อง TyrR ใน Operon ใกล้โปรโมเตอร์ของยีนที่มันต้องการที่จะระงับ. ในการสังเคราะห์ทางเดินสถานีโพรไบโอ, ขั้นตอนแรกที่จะแปลง chorismate anthranilate ใช้ synthase anthranilate เอนไซม์นี้จะต้องมีทั้งแอมโมเนียหรือ glutamine เป็นกลุ่มอะมิโนที่ผู้บริจาค เทส anthranilate ถูกควบคุมโดยยีนของผลิตภัณฑ์ trpE และ trpD trpE encodes subunit แรกซึ่งผูกกับ chorismate และย้ายกลุ่มอะมิโนจากผู้บริจาคเพื่อ chorismate trpD encodes subunit ที่สองซึ่งถูกนำมาใช้เพียงเพื่อผูก glutamine และใช้เป็นกลุ่มอะมิโนที่บริจาคเพื่อให้กลุ่มเอสามารถถ่ายโอนไป chorismate เทส anthranilate ถูกควบคุมโดยการยับยั้งข้อเสนอแนะ ผลิตภัณฑ์สำเร็จรูปของโพรไบโอเมื่อผลิตในปริมาณที่มากพอที่ดีสามารถที่จะทำหน้าที่เป็นผู้ร่วมอดกลั้นที่จะอดกลั้น TrpR ซึ่งปิดกั้นการแสดงออกของ Operon TRP
การแปล กรุณารอสักครู่..
