Transcriptional profiling was perfo

Transcriptional profiling was performed using the TOM2 long oligonucleotide
array platform consisting of 12,000 unigene sequences(www.ted.bti.
cornell.edu). Biological replication for transcriptome analysis was created
using a minimum population of six plants per genotype further sorted into
pairs of plants. From each plant within a given pair, three fruit were
collected and pooled to generate a biological replicate of six pooled fruit. A
minimum of three such pools were generated for each genotype from fruit
harvested at the mature green, breaker, and ripe stages. Pericarp tissue
(including the peel) was prepared from fruit using a freezer mill as
described earlier. The expression profiling experiments were designed
for thecomparison of each DET1transgenic genotype at each fruit stage to
the respective T56 fruit stage as the control. Data were generated from a
minimum of three biological replicates, each with a duplicate dye swap
and creating a total of between six and eight hybridizations.ฃ

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สร้างโพรไฟล์ transcriptional ทำใช้ oligonucleotide ยาวของ TOM2แพลตฟอร์มอาร์เรย์ที่ประกอบด้วยลำดับ unigene 12,000 (www.ted.bticornell.edu) สร้างการจำลองแบบทางชีววิทยาสำหรับการวิ transcriptomeโดยใช้จำนวนประชากรพืชหกต่อยีนเพิ่มเติม เรียงลำดับเป็นขั้นต่ำคู่ของพืช จากแต่ละโรงงานภายในกำหนดคู่ ผลไม้สามได้รวบรวม และรวมในการสร้างแบบจำลองแบบชีวภาพผลไม้ pooled ที่หก Aอย่างน้อยสามแห่งดังกล่าวสร้างขึ้นสำหรับแต่ละจีโนไทป์จากผลไม้เก็บเกี่ยวที่สีเขียวแก่ ๆ เบรกเกอร์ และขั้นตอนสุก เนื้อเยื่อของเปลือก(รวมเปลือก) จัดทำจากผลไม้ที่ใช้ตู้แช่โรงสีเป็นอธิบายไว้ก่อนหน้านี้ นิพจน์การออกแบบการทดลองครบสำหรับ thecomparison ของจีโนไทป์ DET1transgenic แต่ละที่แต่ละขั้นตอนผลไม้เกี่ยวข้อง T56 ผลไม้เวทีเป็นตัวควบคุม สร้างขึ้นจากข้อมูลอย่างน้อยสามทางชีวภาพ replicates, swap ย้อมซ้ำกันแต่ละและการสร้างการรวมระหว่างหก และแปด hybridizations.ฃ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

โปรไฟล์ถอดรหัสได้รับการดำเนินการโดยใช้ oligonucleotide ยาว TOM2
แพลตฟอร์มอาร์เรย์ประกอบด้วย 12,000 ลำดับ Unigene (www.ted.bti.
cornell.edu) การจำลองแบบทางชีวภาพสำหรับการวิเคราะห์ยีนที่ถูกสร้างขึ้น
โดยใช้ประชากรน้อยหกพืชต่อจีโนไทป์เรียงต่อไปเป็น
คู่ของพืช จากโรงงานในแต่ละคู่ได้รับสามผลไม้ที่ถูก
เก็บรวบรวมและรวบรวมเพื่อสร้างซ้ำทางชีวภาพของผลไม้หก pooled
ขั้นต่ำสามสระดังกล่าวถูกสร้างขึ้นสำหรับแต่ละจีโนไทป์จากผลไม้
ที่เก็บเกี่ยวที่ผู้ใหญ่สีเขียว, เบรกและขั้นตอนสุก เนื้อเยื่อเปลือก
(รวมทั้งเปลือก) ถูกจัดทำขึ้นจากผลไม้โดยใช้โรงงานแช่แข็งเป็น
อธิบายไว้ก่อนหน้า การแสดงออก profiling ทดลองได้รับการออกแบบ
สำหรับ thecomparison ของแต่ละจีโนไทป์ DET1transgenic ในแต่ละขั้นตอนผลไม้
ขั้นตอนผลไม้ T56 นั้นเป็นตัวควบคุม ข้อมูลที่ถูกสร้างขึ้นจาก
อย่างน้อยสามซ้ำชีวภาพแต่ละคนมีสลับสีย้อมที่ซ้ำกัน
และการสร้างทั้งหมดระหว่างหกสิบแปด hybridizations. ฃ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ลองใช้โปรไฟล์การ tom2 ซึ่งยาวเรย์แพลตฟอร์มประกอบด้วย 12 , 000 unigene ลำดับ ( www.ted.bti .คอร์เนลล์ . edu ) การจำลองทางชีวภาพสำหรับการวิเคราะห์ทราน ริปโตมถูกสร้างขึ้นโดยใช้ประชากรอย่างน้อยหกพืชต่อเรียงเป็นพันธุกรรม เพิ่มเติมคู่ของพืช จากแต่ละโรงงาน ภายใน ให้ คู่ สาม ผลคือรวบรวมและรวมเพื่อสร้างทางชีวภาพเลียนแบบหกด้านผลไม้ เป็นอย่างน้อยสามประเภทดังกล่าวถูกสร้างขึ้นสำหรับแต่ละจีโนไทป์จากผลไม้การเก็บเกี่ยวที่ mature green , เบรกเกอร์ , และระยะสุก เนื้อเยื่อเปลือก( รวมเปลือก ) เตรียมได้จากการใช้ตู้แช่ผลไม้บดเป็นที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้ การแสดงออกลักษณะการทดลองออกแบบสำหรับการเปรียบเทียบของแต่ละ det1transgenic จีโนไทป์ ในแต่ละช่วง ผลไม้ตาม t56 ผลไม้ขั้นตอนการควบคุม ข้อมูลที่ถูกสร้างขึ้นจากอย่างน้อยสามแบบชีวภาพด้วยซ้ำ แต่ละสี สลับและการรวมระหว่างหกและแปด hybridizations . ฃ