All the archaeal genomes sequenced

All the archaeal genomes sequenced to date contain a single Type 2 RNase H gene. We found that the genome of a halophilic archaeon, Halobacterium sp. NRC-1, contains an open reading frame with similarity to Type 1 RNase H. The protein encoded by the Vng0255c gene, possessed amino acid sequence identities of 33% with Escherichia coli RNase HI and 34% with a Bacillus subtilis RNase HI homologue. The B. subtilis RNase HI homologue, however, lacks amino acid sequences corresponding to a basic protrusion region of the E. coli RNase HI, and the Vng0255c has the similar deletion. As this deletion apparently conferred a complete loss of RNase H activity on the B. subtilis RNase HI homologue protein, the Vng0255c product was expected to exhibit no RNase H activity. However, the purified recombinant Vng0255c protein specifically cleaved an RNA strand of the RNA/DNA hybrid in vitro, and when the Vng0255c gene was expressed in an E. coli strain MIC2067 it could suppress the temperature-sensitive growth defect associated with the loss of RNase H enzymes of this strain. These results in vitro and in vivo strongly indicate that the Halobacterium Vng0255c is the first archaeal Type 1 RNase H. This enzyme, unlike other Type 1 RNases H, was able to cleave an Okazaki fragment-like substrate at the junction between the 3′-side of ribonucleotide and 5′-side of deoxyribonucleotide. It is likely that the archaeal Type 1 RNase H plays a role in the removal of the last ribonucleotide of the RNA primer from the Okazaki fragment during DNA replication.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ทั้งหมดจีโนม archaeal ติดใจจนถึงปัจจุบันมีชนิดเดียว 2 RNase H ยีน เราพบว่าจีโนมของ archaeon ชอบเกลือ, Halobacterium SP nrc-1 มี open reading frame ที่มีความคล้ายคลึงกันในการพิมพ์ 1 RNase H โปรตีนเข้ารหัสโดยยีน vng0255c สิงอัตลักษณ์ลำดับกรดอะมิโน 33% ด้วย Escherichia coli RNase hi และ 34% ด้วย Bacillus subtilis ที่คล้ายคลึงกัน RNase hib subtilis RNase hi คล้ายคลึงกัน แต่ขาดลำดับกรดอะมิโนที่สอดคล้องกับภูมิภาคท​​ี่ยื่นออกมาพื้นฐานของ e coli RNase hi และ vng0255c มีการลบที่คล้ายกัน การลบนี้เห็นได้ชัดว่าการประชุมสูญเสียที่สมบูรณ์ของกิจกรรม RNase เอชข subtilis RNase โปรตีนที่คล้ายคลึงกัน hi, ผลิตภัณฑ์ vng0255c ที่คาดว่าจะไม่แสดงกิจกรรม RNase H อย่างไรก็ตามโปรตีนบริสุทธิ์ vng0255c recombinant เฉพาะแยกเส้นใยอาร์เอ็นเอของ RNA / DNA ไฮบริดในหลอดทดลองและเมื่อยีน vng0255c ถูกแสดงใน e โคไลสายพันธุ์ mic2067 มันอาจระงับข้อบกพร่องการเจริญเติบโตไวต่ออุณหภูมิที่เกี่ยวข้องกับการสูญเสียของเอนไซม์ RNase H จากสายพันธุ์นี้ผลลัพธ์เหล่านี้ในหลอดทดลองและในร่างกายอย่างมากแสดงให้เห็นว่า Halobacterium v​​ng0255c เป็นชนิดแรก archaeal RNase 1 ชั่วโมง เอนไซม์นี้แตกต่างจากชนิดอื่น ๆ 1 ชั่วโมง rnases ก็สามารถที่จะยึดสารตั้งต้น Okazaki ส่วนเหมือนที่สถานีชุมทางระหว่าง 3'-ข้าง ribonucleotide และ 5'-ข้าง deoxyribonucleotideก็มีแนวโน้มว่าชนิดที่ 1 archaeal RNase H มีบทบาทในการกำจัดของ ribonucleotide ล่าสุดของไพรเมอร์อาร์เอ็นเอจากเศษ Okazaki ในระหว่างการจำลองดีเอ็นเอ.

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

Genomes archaeal ทั้งหมดที่เรียงลำดับวันที่ประกอบด้วยยีน H RNase 2 ชนิดเดียว เราพบว่า กลุ่มของ archaeon ชอบเกลือ sp. Halobacterium NRC-1 ประกอบด้วยกรอบการเปิดอ่าน ด้วยคล้ายกับ H. RNase 1 ชนิด โปรตีนถูกเข้ารหัส โดยยีน Vng0255c ต้องมีกรดอะมิโนลำดับรหัสประจำตัว 33% ด้วย Escherichia coli RNase HI และ 34% มี subtilis คัด RNase HI homologue Homologue RNase HI subtilis เกิด อย่างไรก็ตาม ไม่มีกรดอะมิโนลำดับที่สอดคล้องกับภูมิภาค protrusion พื้นฐานของ HI RNase E. coli และ Vng0255c มีการลบเหมือนกัน เป็นการลบนี้เห็นได้ชัดว่าปรึกษาสูญเสียกิจกรรม RNase H subtilis เกิด RNase HI homologue โปรตีนสมบูรณ์ ผลิตภัณฑ์ Vng0255c ถูกต้องแสดงกิจกรรมไม่ RNase H อย่างไรก็ตาม โปรตีน Vng0255c recombinant บริสุทธิ์แหวกสแตรนด์อาร์เอ็นเอในอาร์เอ็นเอ/ดีเอ็นเอไฮบริ และ เมื่อยีน Vng0255c ได้แสดงออกใน E. coli ต้องใช้ MIC2067 จะสามารถระงับความบกพร่องเติบโตตรงตามอุณหภูมิที่เกี่ยวข้องกับการสูญเสียเอนไซม์ RNase H ของนี้ต้องใช้โดยเฉพาะ ผลลัพธ์เหล่านี้ในหลอดทดลอง และในสัตว์ทดลองขอบ่งชี้ว่า Halobacterium Vng0255c archaeal แรก H. RNase 1 ชนิด เอนไซม์นี้ ซึ่งแตกต่างจากอื่น ๆ ชนิด 1 RNases H ได้แบะเป็นโอะเหมือนส่วนพื้นผิวที่เชื่อมต่อระหว่างฝั่ง 3′ ของ ribonucleotide และ 5′ ด้านของ deoxyribonucleotide เป็นไปได้ว่า archaeal ชนิด 1 RNase H มีบทบาทในการกำจัด ribonucleotide สุดท้ายพื้นอาร์เอ็นเอจากส่วนโอะระหว่างการจำลองดีเอ็นเอ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

genomes archaeal ทั้งหมดเรียงซีเควนซ์ในวันที่ประกอบด้วย rnase H ยีนเดี่ยว ประเภท ที่ 2 เราพบว่ายีนของ archaeon halophilic ที่ halobacterium sp . กอส. - 1 ,ประกอบด้วยที่เปิดให้บริการการอ่านเฟรมด้วยกันในการพิมพ์ 1 rnase H .ที่เข้ารหัสโดยที่โปรตีน vng 0255 คยีน,ยึดกรดอะมิโนลำดับเอกลักษณ์ของ 33% พร้อมด้วยริคีอาผล rnase Hi และ 34% ด้วยเชื้อ subtilis rnase Hi สิ่งที่เทียบเคียงกันได้.สิ่งที่เทียบเคียงกันได้ B . C . subtilis rnase สูงอย่างไรก็ตามไม่มีกรดอะมิโน rnase ฮีที่เกี่ยวข้องเพื่อไปยังเขตพื้นที่แบบเรียบง่ายที่โผล่ออกมาจากช่องเพียงเล็กน้อยของผลที่ลำดับและ vng 0255 C ที่มีการลบความเหมือนที่ ในการลบให้แก่การสูญเสียนี้เห็นได้ชัดว่าสมบรูณ์แบบของการทำงานชั่วโมง rnase โปรตีนในสิ่งที่เทียบเคียงกันได้ B . subtilis rnase Hi ผลิตภัณฑ์ vng 0255 C ที่มีแนวโน้มที่จะจัดแสดงนิทรรศการไม่มีการทำกิจกรรม H rnase แต่ถึงอย่างไรก็ตามที่กรองแล้ว poxvaccine vng 0255 C โปรตีนเฉพาะติดที่ rna เกลียวของ rna /ไฮบริดดีเอ็นเอใน Vitro ,และเมื่อได้ vng 0255 C ยีนมีกล่าวไว้ในที่ E .ผลความเมื่อยล้า MIC 2067 มันไม่สามารถระงับการที่ อุณหภูมิ - ที่สำคัญการขยายตัวของข้อบกพร่องที่เชื่อมโยงกับการสูญเสียของ rnase ชั่วโมงด้วยเอนไซม์ของนี้ความเมื่อยล้า.ผลการทดสอบนี้ใน Vitro และอยู่ในเกณฑ์ดีไปยังสถานี Vivo แสดงว่า halobacterium vng 0255 C ที่มี archaeal เป็นครั้งแรกให้พิมพ์ 1 rnase H เอนไซม์นี้ไม่เหมือนกับ H 1 ประเภท rnases อื่นๆก็สามารถติดอยู่บนไดย์สักเท่าไหร่ - เหมือน okazaki ที่ทางแยกระหว่าง 3 ' - ด้านข้างของ ribonucleotide และ 5 ' - ด้านข้างของ deoxyribonucleotideเป็นไปได้ว่า archaeal ประเภท ที่ 1 ที่ rnase H มีบทบาทในการขจัด ribonucleotide สุดท้ายของเชื้อปะทุ rna จากแยกส่วน okazaki ในระหว่างปฏิบัติงานดีเอ็นเอ.