For the phylogenetic analysis, simi

For the phylogenetic analysis, similarity searches for bacterial
16S rRNA gene partial sequences from the representative
OTUS (with relative abundance >0.1%) were performed
using the NCBI BLAST search program within the GenBank
database and within the SILVA databases. Recovered 16S rRNA
sequences were further aligned using the Clustal W tool and
used for the construction of a 16S rRNA gene-based phylogenetic
tree using the neighbor-joining (maximum composite
likelihood) method with the MEGA 6 package [21]. Bootstrapping
(1000 times) was performed to estimate the confidence
levels for the tree nodes. The tree was rooted using
Escherichia coli (accession number X80730).

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สำหรับการวิเคราะห์ phylogenetic คล้ายค้นหาแบคทีเรีย16S rRNA ยีนบางส่วนลำดับจากตัวแทนOTUS (ญาติมากมาย > 0.1%) ดำเนินการใช้โปรแกรมค้นหาระเบิด NCBI ภายใน GenBankฐานข้อมูล และภายใน SILVA ฐานข้อมูล กู้คืน 16S rRNAลำดับที่จัดเพิ่มเติมโดยใช้เครื่องมือ Clustal W และใช้สำหรับการก่อสร้าง 16S rRNA ที่ใช้ยีน phylogeneticต้นไม้ที่ใช้เพื่อนบ้านรวม (ประกอบสูงสุดวิธีการโอกาส) กับแพคเกจ 6 ล้าน [21] Bootstrappingดำเนินการประเมินความเชื่อมั่น (1000 ครั้ง)ระดับของโหนดแผนภูมิ ต้นไม้มีรากใช้Escherichia coli (เลขทะเบียน X80730)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สำหรับการวิเคราะห์สายวิวัฒนาการการค้นหาความคล้ายคลึงกันสำหรับแบคทีเรีย
16S rRNA ยีนลำดับบางส่วนจากตัวแทน
Otus (กับญาติอุดมสมบูรณ์> 0.1%) ได้ดำเนินการ
โดยใช้โปรแกรมค้นหา NCBI ระเบิดภายใน GenBank
ฐานข้อมูลและฐานข้อมูลภายใน SILVA กู้คืน 16S rRNA
ลำดับถูกจัดชิดต่อไปโดยใช้เครื่องมือ Clustal W และ
ใช้สำหรับการก่อสร้างสายวิวัฒนาการของ 16S rRNA ยีนตาม
ต้นไม้ใช้เพื่อนบ้านเข้า (คอมโพสิตสูงสุด
โอกาส) ด้วยวิธี MEGA 6 แพคเกจ [21] ร่วมมือ
(1000 ครั้ง) ได้ดำเนินการเพื่อประเมินความเชื่อมั่นที่
ระดับสำหรับโหนดต้นไม้ ต้นไม้ที่หยั่งรากลึกโดยใช้
เชื้อ Escherichia coli (ภาคยานุวัติจำนวน X80730)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สำหรับการวิเคราะห์ยืนยันความเหมือนค้นหาแบคทีเรียลำดับเบส 16S rRNA ยีนบางส่วนจากตัวแทนใน ( มีญาติพี่น้องมากมาย > 0.1% ) แสดงการค้นหา ncbi ระเบิดขนาดโปรแกรมภายในภายในตัวฐานข้อมูลและฐานข้อมูล หาย 16S rRNAลำดับได้โดยใช้เครื่องมือ clustal W และชิดที่ใช้สำหรับการก่อสร้างของ 16S rRNA ยีน ซึ่งตามต้นไม้ใช้เพื่อนบ้านร่วม ( สูงสุดผสมโอกาส ) กับเมก้า 6 แพคเกจ [ 21 ] bootstrapping( 1000 ครั้ง ) ได้ประเมินความมั่นใจระดับต้นโหนด ต้นไม้ที่ถูกถอนโดยใช้Escherichia coli ( เข้าเบอร์ x80730 )