Protein spots corresponding to iden

Protein spots corresponding to identified areas of immunoreactivity on Western blots were excised from protein stained 2D-PAGE gels and tryptically digested, as described previously.
The in-gel digests were analyzed by nano-liquid chromatography–MS/MS .
The peaklist files of MS2 spectra of the excised protein spots were searched against a database (2008.03.10) with 11947 entries consisting of the NCBI reference genomes for seven strains of Francisella (NCBI ids: NC_006570, NC_007880, NC_008245, NC_008369, NC_008601, NC_009257, NC_009749) using MASCOT™ (version 2.2.03, Matrix Science, London, UK) for protein identification, as detailed previously ( Twine et al., 2010).

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

จุดโปรตีนที่สอดคล้องกับพื้นที่ที่ระบุของภูมิคุ้มกันใน blots ตะวันตกถูกตัดจากโปรตีนเปื้อนเจล 2D-PAGE และย่อย tryptically ตามที่กล่าวไว้ก่อนหน้านี้.
ย่อยในเจลที่ได้มาวิเคราะห์โดยนาโนของเหลวโค-MS / MS.
ไฟล์ peaklist ของ MS2 สเปกตรัมของจุดโปรตีนพอร์ถูกค้นกับฐานข้อมูล (2008/03/10) ที่มี 11,947 รายการประกอบด้วยจีโนมของการอ้างอิง NCBI เจ็ดสายพันธุ์ของ Francisella (IDS NCBI: NC_006570, NC_007880, NC_008245, NC_008369, NC_008601, NC_009257, NC_009749) โดยใช้ MASCOT ™ (2.2.03 Version, Matrix วิทยาศาสตร์ลอนดอนสหราชอาณาจักร) สำหรับประชาชนโปรตีนตามรายละเอียดก่อนหน้านี้ (Twine et al., 2010)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

โปรตีนจุดที่ระบุพื้นที่ของการบน blots ตะวันตกตัดจากโปรตีนเปื้อน 2D-PAGE และเจล tryptically ย่อยตามที่อธิบายไว้ก่อนหน้านี้
ในเจลย่อยมาวิเคราะห์โดยวิธีโครมาโทกราฟีของเหลว นาโน - MS / MS .
ไฟล์ peaklist MS2 ของสเปกตรัมของตัดโปรตีนจุดถูกตรวจค้นกับฐานข้อมูล ( 2008.03 .10 ) กับ 11947 รายการ ประกอบด้วย ncbi อ้างอิงหาเจ็ดสายพันธุ์ของ francisella ( ncbi รหัส : nc_006570 nc_007880 nc_008245 nc_008369 , , , , nc_009257 nc_008601 , , nc_009749 ) ใช้สำหรับ™ ( รุ่น 2.2.03 เมทริกซ์ , วิทยาศาสตร์ , อังกฤษลอนดอน ) ชนิดโปรตีน ตามรายละเอียดก่อนหน้านี้ ( เกลียว et al . , 2010 )