in C. reinhardtii (Molnar et al., 2

in C. reinhardtii (Molnar et al., 2007; Zhao et al., 2007; Yamasaki
et al., 2013; Voshall et al., 2014) and in V. carteri (Li et al., 2014),
and potential endogenous targets have been predicted by computational
approaches (Molnar et al., 2007; Zhao et al., 2007; Li
et al., 2014; Voshall et al., 2014). However, target gene identification
is a challenging problem (Thomas et al., 2010; Voshall et al.,
2014) and the false-positive prediction rate for miRNA targets in
microalgae is currently unknown. Interestingly, most characterized
land plant miRNAs appear to regulate transcripts with highly complementary
binding sites and preferentially trigger their endonucleolytic
cleavage by Argonaute proteins (Bartel, 2009; Axtell,
2013; Rogers and Chen, 2013). This also appears to be the case
for some miRNAs in both C. reinhardtii and V. carteri, where
expected target RNA cleavage products have been experimentally
detected (Molnar et al., 2007; Zhao et al., 2007; Li et al., 2014;
Voshall et al., 2014). Yet, very few of the reported Chlamydomonas
or Volvox miRNAs have identifiable targets with near perfect complementarity
(Molnar et al., 2007; Li et al., 2014; Voshall et al.,
2014) and recent evidence suggests that miRNA regulation of transcript
expression in Chlamydomonas may operate, at least for certain
targets, by translation repression (Ma et al., 2013; Yamasaki
et al., 2013; Voshall et al., 2014).
In summary, the RNA interference mechanism appears to be
entirely absent from some microalgae and its biological role(s) in
the species that possess core RNAi machinery components is
poorly understood. Limited evidence suggests that a siRNA pathway
may operate as a defense mechanism against transposon
mobilization and, possibly, in antiviral immunity. A miRNA pathway,
when present, may contribute to endogenous gene regulation.
However, the identification of genuine miRNA targets remains
challenging and, to date, no specific metabolic or physiological process
controlled or modulated by miRNAs has been clearly defined
in microalgae. Other possible functions of RNAi in phenomena such
as heterochromatin formation, DNA methylation, DNA repair, or
maintenance of genome stability, to our knowledge, have not been
explored in these aquatic organisms.
5. Gene silencing mechanisms and biofuel/biomaterial
production
Algae exhibit the potential for manufacturing a wide range of
biofuel precursors and bioproducts, and advances in algal genomics,
genetic engineering and synthetic biology may facilitate the
development of industrial strains suitable to specific production
purposes. However, a serious limitation to strain improvement is
our incomplete understanding of gene and metabolic network regulation
in most algal species. In many eukaryotes, gene silencing
mechanisms have been implicated in context-dependent reversible
gene repression, a critical component of gene networks
involved in stress responses and in developmental programs
(Law and Jacobsen, 2010; Bannister and Kouzarides, 2011;
Ohsawa et al., 2013; Derkacheva and Hennig, 2014). Interestingly,
most microalgae accumulate biofuel-precursor compounds, such
as starch and triacylglycerols (TAGs), primarily under stress conditions
(Hu et al., 2008; Radakovits et al., 2010; La Russa et al., 2012;
Liu and Benning, 2013). Transcriptome analyses in C. reinhardtii
(reviewed by Liu and Benning, 2013) have revealed that a subset
of genes involved in TAG biosynthesis, such as those encoding certain
acyl-CoA: diacylglycerol acyltransferases, display greatly
enhanced or almost exclusive expression in nitrogen-deprived
cells. These observations suggest that gene silencing mechanisms
may indeed be involved in modulating metabolic responses to
stress in microalgae. Specific genes for storage compound biosynthesis
appear to be repressed under normal environmental conditions,
when they may not be needed, and activated primarily under

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

in C. reinhardtii (Molnar et al., 2007; Zhao et al., 2007; Yamasakiet al., 2013; Voshall et al., 2014) and in V. carteri (Li et al., 2014),and potential endogenous targets have been predicted by computationalapproaches (Molnar et al., 2007; Zhao et al., 2007; Liet al., 2014; Voshall et al., 2014). However, target gene identificationis a challenging problem (Thomas et al., 2010; Voshall et al.,2014) and the false-positive prediction rate for miRNA targets inmicroalgae is currently unknown. Interestingly, most characterizedland plant miRNAs appear to regulate transcripts with highly complementarybinding sites and preferentially trigger their endonucleolyticcleavage by Argonaute proteins (Bartel, 2009; Axtell,2013; Rogers and Chen, 2013). This also appears to be the casefor some miRNAs in both C. reinhardtii and V. carteri, whereexpected target RNA cleavage products have been experimentallydetected (Molnar et al., 2007; Zhao et al., 2007; Li et al., 2014;Voshall et al., 2014). Yet, very few of the reported Chlamydomonasor Volvox miRNAs have identifiable targets with near perfect complementarity(Molnar et al., 2007; Li et al., 2014; Voshall et al.,2014) and recent evidence suggests that miRNA regulation of transcriptexpression in Chlamydomonas may operate, at least for certaintargets, by translation repression (Ma et al., 2013; Yamasakiet al., 2013; Voshall et al., 2014).In summary, the RNA interference mechanism appears to beทั้งหมดมาจาก microalgae บางและบทบาทของชีวภาพในเป็นชนิดที่มีส่วนประกอบเครื่องจักรหลักของ RNAiเข้าใจงาน หลักฐานที่จำกัดแนะนำที่เป็นทางเดิน siRNAอาจมีเป็นกลไกป้องกันกับ transposonเคลื่อนไหว และ อาจจะ ภูมิคุ้มกันต้านไวรัส ทางเดิน miRNAเมื่อปัจจุบัน อาจนำไปสู่การควบคุมยีน endogenousอย่างไรก็ตาม รหัสของแท้ miRNA เป้าหมายยังคงท้าทาย และ วัน ที่ กระบวนการเผาผลาญ หรือสรีรวิทยาไม่เฉพาะควบคุม หรือสันทัดโดย miRNAs มีการกำหนดอย่างชัดเจนใน microalgae ฟังก์ชันอื่น ๆ สามารถของ RNAi ในปรากฏการณ์ดังกล่าวเป็นผู้แต่ง heterochromatin ปรับ ซ่อม แซมดีเอ็นเอ หรือไม่ได้บำรุงรักษาเสถียรภาพจีโนม การเพิ่มอุดมในสิ่งมีชีวิตเหล่านี้น้ำ5. ยีน silencing กลไกและเชื้อเพลิง ชีวภาพ/biomaterialผลิตสาหร่ายแสดงศักยภาพในการผลิตหลากหลายเชื้อเพลิงชีวภาพ precursors และ bioproducts และความก้าวหน้าใน algal genomicsพันธุวิศวกรรมและชีววิทยาสังเคราะห์อาจอำนวยความสะดวกการพัฒนาสายพันธุ์อุตสาหกรรมเหมาะสมกับการผลิตวัตถุประสงค์ อย่างไรก็ตาม มีจำกัดต้องใช้การปรับปรุงอย่างจริงจังเราเข้าใจที่สมบูรณ์ของยีนและการควบคุมเครือข่ายเผาผลาญในสายพันธ์สุด algal ในหลาย eukaryotes ยีน silencingกลไกมีการเกี่ยวข้องในการกลับขึ้นอยู่กับบริบทยีนปราบปราม ส่วนประกอบสำคัญของเครือข่ายยีนinvolved in stress responses and in developmental programs(Law and Jacobsen, 2010; Bannister and Kouzarides, 2011;Ohsawa et al., 2013; Derkacheva and Hennig, 2014). Interestingly,most microalgae accumulate biofuel-precursor compounds, suchas starch and triacylglycerols (TAGs), primarily under stress conditions(Hu et al., 2008; Radakovits et al., 2010; La Russa et al., 2012;Liu and Benning, 2013). Transcriptome analyses in C. reinhardtii(reviewed by Liu and Benning, 2013) have revealed that a subsetof genes involved in TAG biosynthesis, such as those encoding certainacyl-CoA: diacylglycerol acyltransferases, display greatlyenhanced or almost exclusive expression in nitrogen-deprivedcells. These observations suggest that gene silencing mechanismsmay indeed be involved in modulating metabolic responses tostress in microalgae. Specific genes for storage compound biosynthesisappear to be repressed under normal environmental conditions,when they may not be needed, and activated primarily under

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สมบูรณ์ของเราความเข้าใจของยีนและการควบคุมในเครือข่ายการสลาย
ชนิดของสาหร่ายมากที่สุด ในหลายยูแคริโอต ยีน silencing
กลไกได้รับการเกี่ยวข้องในบริบทแบบผันกลับได้
ยีนถูกปราบปราม เป็นองค์ประกอบที่สำคัญของเครือข่ายที่เกี่ยวข้องกับการตอบสนองความเครียดและยีน

( โปรแกรมในการพัฒนากฎหมายและ Jacobsen , 2010 ; บันได และ kouzarides 2011 ;
โอซาว่า et al . , 2013 ;C . reinhardtii ( โมลเนอร์ et al . , 2007 ; Zhao et al . , 2007 ; ยามาซากิ
et al . , 2013 ; voshall et al . , 2010 ) และ V . carteri ( Li et al . , 2010 ) ,
และเป้าหมายในศักยภาพได้ถูกคาดการณ์โดยวิธีการเชิงคำนวณ
( โมลเนอร์ et al . , 2007 ; Zhao et al . , 2007 ; Li
et al . , 2014 ; voshall et al . , 2010 ) อย่างไรก็ตาม เป้าหมายของการเป็นปัญหาที่ท้าทาย
( โทมัส et al . , 2010voshall et al . ,
2014 ) และการพยากรณ์อัตรา false-positive สำหรับ mirna เป้าหมาย
สาหร่ายขนาดเล็กเป็นหลักแหล่ง ที่น่าสนใจมากที่สุด ลักษณะที่ดิน mirnas
พืชปรากฏควบคุมบันทึกกับประกอบอย่างมาก
ผูกพันเว็บไซต์และ preferentially ก่อความแตกแยก endonucleolytic
โดยโปรตีน argonaute ( บาร์เทิล , 2009 ; แอกซ์เทลล์
, 2013 ; โรเจอร์ และ เฉิน , 2013 )นี้ยังปรากฏเป็นกรณี
บาง mirnas ทั้ง C และ reinhardtii โวลต์ carteri ที่
คาดว่าเป้าหมายอาร์เอ็นเอตัวผลิตภัณฑ์มีขนาด
ตรวจพบ ( โมลเนอร์ et al . , 2007 ; Zhao et al . , 2007 ; Li et al . , 2014 ;
voshall et al . , 2010 ) แต่มากน้อยของรายงานคลาไมโดโมแนส
หรือ volvox mirnas มีเป้าหมายระบุตัวที่อยู่ใกล้ที่สมบูรณ์แบบข้อมูล
( โมลเนอร์ et al . , 2007 ;ชนิดที่มีส่วนประกอบหลัก RNAi เครื่องจักร
ไม่ค่อยเข้าใจ . หลักฐานที่ชี้ให้เห็นว่าบริษัทเส้นทางจำกัด
อาจทำงานเป็นกลไกการป้องกันต่อต้านการ ? ? ? ? ?
และอาจในภูมิคุ้มกันต่างๆ เป็น mirna ทางเดิน
เมื่อปัจจุบันอาจมีผลต่อการควบคุมยีนโครงสร้าง .
แต่กำหนดเป้าหมาย mirna แท้ยังคง
ท้าทายและวันที่ไม่เฉพาะการเผาผลาญอาหารหรือกระบวนการทางสรีรวิทยา
ควบคุมหรือปรับโดย mirnas ได้ชัดเจน
ใน Server ฟังก์ชั่นอื่น ๆที่เป็นไปได้ของ RNAi ในปรากฏการณ์ดังกล่าว
เป็นการดีเอ็นเอ methylation ซ่อมแซมดีเอ็นเอสปีชีส์ หรือ รักษาเสถียรภาพ
( เพื่อความรู้ของเรา ได้สำรวจสิ่งมีชีวิตเหล่านี้
.
5 ยีนไซเลนซิง กลไก และเชื้อเพลิงชีวภาพ /
ิน