the main cause of slow rate of developing high sugar, high
yielding and pest tolerant varieties. Improvement in sugar
content is more desirable because much amount of sucrose in
less biomass can be produced which would result the less
cost of sugar production (Singh et al., 2005). Molecular markers
represent a valuable DNA tools as a marker .This techniques
would increase the efficiency of indirect and early molecular
selection in sugarcane which would be exert a great impact on
molecular breeding for high sugar content and could increase
the selection precision for early high sugar content. Therefore,
the molecular markers only may help to combine the desirable
traits to develop ideal varieties.
Genetic tools for sugarcane quality improvement have only
recently become adequate to quantify the effect of many
genomic regions on a trait. Molecular markers represent a
valuable tool for genome analysis, both for basic and applied
research and can be used to identify genes associated with the
high sugar traits and to find out their role in sucrose
accumulation. A number of reports on various sugarcane
molecular markers are available and include restriction
fragment length polymorphism (RFLP) (Besse and Mcintyre,
1996; Besse et al., 1996; Burnquist 1991; D’ Hont et al., 1993;
Glaszmann et al., 1989, 1990; Ming et al., 1998), Random
amplified polymorphic DNA (RAPD) (Burner et al., 1997;
Harvey and Botha, 1996; Pan et al., 1997, 2004), Amplified
fragment length polymorphism (AFLP) (Besse et al., 1998),
and genus -specific polymerase chain reaction ) (PCR) markers
from the 5S rRNA locus (D’ Hont et al., 1995; Pan et al.,
2000, 2001; Piperides et al., 2000). A few RAPD fingerprints
also were reported in sugarcane clones (Harvey and Botha
1996; Pan et al., 1997). Simple sequence repeat (SSRs), or short
tandem repeats (STRs) (Weber and May 1989; Edwards et al.,
1991) are short DNA fragments that contain various number
of tandem repeat units of di, tri- or tetra nucleotide motifs
(Edwards et al., 1991; Polymeropoulos et al., 1991). Although
numerous reports on microsatellite in other crop species
(Cordeiro et al., 2000,2001) are available, only a few have been
reported in sugarcane (Cordeiro and Henry, 2001; Cordeiro et
al., 2000, 2001,2003; Da Silva 2001; Jannoo et al., 2001; Pan et
al., 2003; Piperidis et al., 2001). To date, only a few researches,
have reported the development and use of microsatellite
markers in sugarcane. The objective of this study was to
evaluate the newly developed microsatellite markers for there
applicability on molecular genotyping of elite high sugar
commercial cultivars, sugar related traits of Saccharum Species
and existing sugarcane germplasm. This will be useful in
sugarcane germplasm evaluation, physical mapping, gene
tagging and mapping of economically important traits, variety
identity testing, and polycross paternity analysis. Further work
is underway for validation of these polymorphic SSR markers
in different mapping population for the construction of genetic
map for sugar traits.
the main cause of slow rate of developing high sugar, highyielding and pest tolerant varieties. Improvement in sugarcontent is more desirable because much amount of sucrose inless biomass can be produced which would result the lesscost of sugar production (Singh et al., 2005). Molecular markersrepresent a valuable DNA tools as a marker .This techniqueswould increase the efficiency of indirect and early molecularselection in sugarcane which would be exert a great impact onmolecular breeding for high sugar content and could increasethe selection precision for early high sugar content. Therefore,the molecular markers only may help to combine the desirabletraits to develop ideal varieties.Genetic tools for sugarcane quality improvement have onlyrecently become adequate to quantify the effect of manygenomic regions on a trait. Molecular markers represent avaluable tool for genome analysis, both for basic and appliedresearch and can be used to identify genes associated with thehigh sugar traits and to find out their role in sucroseaccumulation. A number of reports on various sugarcanemolecular markers are available and include restrictionfragment length polymorphism (RFLP) (Besse and Mcintyre,1996; Besse et al., 1996; Burnquist 1991; D’ Hont et al., 1993;Glaszmann et al., 1989, 1990; Ming et al., 1998), Randomamplified polymorphic DNA (RAPD) (Burner et al., 1997;Harvey and Botha, 1996; Pan et al., 1997, 2004), Amplifiedfragment length polymorphism (AFLP) (Besse et al., 1998),and genus -specific polymerase chain reaction ) (PCR) markersfrom the 5S rRNA locus (D’ Hont et al., 1995; Pan et al.,2000, 2001; Piperides et al., 2000). A few RAPD fingerprintsalso were reported in sugarcane clones (Harvey and Botha1996; Pan et al., 1997). Simple sequence repeat (SSRs), or shorttandem repeats (STRs) (Weber and May 1989; Edwards et al.,1991) are short DNA fragments that contain various numberof tandem repeat units of di, tri- or tetra nucleotide motifs(Edwards et al., 1991; Polymeropoulos et al., 1991). Althoughnumerous reports on microsatellite in other crop species(Cordeiro et al., 2000,2001) are available, only a few have beenreported in sugarcane (Cordeiro and Henry, 2001; Cordeiro etal., 2000, 2001,2003; Da Silva 2001; Jannoo et al., 2001; Pan etal., 2003; Piperidis et al., 2001). To date, only a few researches,have reported the development and use of microsatellitemarkers in sugarcane. The objective of this study was toevaluate the newly developed microsatellite markers for thereapplicability on molecular genotyping of elite high sugarcommercial cultivars, sugar related traits of Saccharum Speciesand existing sugarcane germplasm. This will be useful insugarcane germplasm evaluation, physical mapping, genetagging and mapping of economically important traits, varietyidentity testing, and polycross paternity analysis. Further workis underway for validation of these polymorphic SSR markersin different mapping population for the construction of geneticmap for sugar traits.
การแปล กรุณารอสักครู่..
สาเหตุหลักของอัตราที่ช้าของการพัฒนาน้ำตาลสูงสูงที่ให้ผลผลิตและพันธุ์ที่ทนต่อศัตรูพืช ปรับปรุงในน้ำตาลเนื้อหาเป็นที่น่าพอใจมากขึ้นเพราะจำนวนมากของน้ำตาลซูโครสในชีวมวลน้อยสามารถผลิตได้ซึ่งจะส่งผลน้อยกว่าค่าใช้จ่ายในการผลิตน้ำตาล(Singh et al., 2005) เครื่องหมายโมเลกุลเป็นตัวแทนของเครื่องมือที่มีคุณค่าดีเอ็นเอเป็นเครื่องหมายเทคนิคประเภทนี้จะเพิ่มประสิทธิภาพของโมเลกุลทางอ้อมและต้นเลือกในอ้อยซึ่งจะเป็นออกแรงผลกระทบต่อการเพาะพันธุ์โมเลกุลปริมาณน้ำตาลสูงและสามารถเพิ่มความแม่นยำในการเลือกสำหรับเนื้อหาน้ำตาลสูงในช่วงต้น. ดังนั้นเครื่องหมายโมเลกุลอาจช่วยในการรวมเป็นที่น่าพอใจลักษณะการพัฒนาสายพันธุ์ที่เหมาะ. เครื่องมือทางพันธุกรรมสำหรับการปรับปรุงคุณภาพอ้อยได้เพียงเมื่อเร็ว ๆ นี้เพียงพอที่จะหาจำนวนผลของหลายภูมิภาคจีโนมในลักษณะ เครื่องหมายโมเลกุลเป็นตัวแทนของเครื่องมือที่มีคุณค่าสำหรับการวิเคราะห์จีโนมทั้งพื้นฐานและประยุกต์ใช้งานวิจัยและสามารถนำมาใช้ในการระบุยีนที่เกี่ยวข้องกับลักษณะน้ำตาลสูงและเพื่อหาบทบาทของตนในซูโครสสะสม จำนวนของรายงานต่างๆอ้อยเครื่องหมายโมเลกุลที่มีอยู่และรวมถึงข้อ จำกัด แตกต่างส่วนระยะเวลา (RFLP) (Besse และ Mcintyre, 1996; Besse et al, 1996;. Burnquist 1991; D 'Hont et al, 1993;. Glaszmann et al, 1989, 1990;. หมิง, et al, 1998), สุ่มดีเอ็นเอpolymorphic ขยาย (RAPD) (Burner, et al, 1997;. ฮาร์วีย์และ Botha 1996. แพน et al, 1997, 2004), ขยายส่วนความแตกต่างความยาว(AFLP ) (Besse, et al, 1998). และประเภทปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอ -specific) (PCR) เครื่องหมายจากสถานที่rRNA 5S (D 'Hont, et al, 1995;. แพน, et al. 2000, 2001; Piperides et al, , 2000) ลายนิ้วมือดีเอ็นเอไม่กี่ยังได้รับรายงานในโคลนอ้อย (ฮาร์วีย์และ Botha 1996. แพน, et al, 1997) ซ้ำลำดับง่าย (SSRs) หรือสั้นซ้ำควบคู่(STRs) (เวเบอร์และพฤษภาคม 1989. เอ็ดเวิร์ดส์, et al, 1991) มีดีเอ็นเอสั้น ๆ ที่มีจำนวนที่แตกต่างกันของหน่วยงานที่ทำซ้ำตีคู่ดิ, ไตรเตตร้าหรือลวดลายเบื่อหน่าย(เอ็ดเวิร์ด et al, 1991;.. Polymeropoulos, et al, 1991) แม้ว่ารายงานจำนวนมากเกี่ยวกับไมโครพืชชนิดอื่น ๆ (. Cordeiro, et al, 2000,2001) ที่มีอยู่เพียงไม่กี่ได้รับการรายงานในอ้อย(Cordeiro และเฮนรี่ 2001; Cordeiro et al, 2000, 2001,2003. ดาซิลวา 2001 Jannoo et al, 2001;. แพน et al, 2003;.. Piperidis, et al, 2001) ในวันที่มีเพียงไม่กี่วิจัยได้มีการรายงานการพัฒนาและการใช้งานของไมโครเครื่องหมายในอ้อย วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้คือการประเมินที่พัฒนาขึ้นใหม่สำหรับเครื่องหมายไมโครมีการบังคับใช้ในgenotyping โมเลกุลของชนชั้นสูงน้ำตาลพันธุ์เชิงพาณิชย์น้ำตาลลักษณะที่เกี่ยวข้องกับสายพันธุ์Saccharum และพันธุ์อ้อยที่มีอยู่ นี้จะเป็นประโยชน์ในการประเมินเชื้อพันธุกรรมอ้อยทำแผนที่ทางกายภาพของยีนการติดแท็กและการทำแผนที่ของลักษณะที่สำคัญทางเศรษฐกิจที่หลากหลายในการทดสอบตัวตนและการวิเคราะห์พ่อpolycross ทำงานต่อไปนี้กำลังอยู่ระหว่างการตรวจสอบของสำหรับเครื่องหมาย SSR polymorphic เหล่านี้ในการทำแผนที่ประชากรที่แตกต่างกันสำหรับการก่อสร้างทางพันธุกรรมแผนที่ลักษณะน้ำตาล
การแปล กรุณารอสักครู่..
สาเหตุหลักของอัตราที่ช้าของการพัฒนาสูง น้ำตาลสูงหยุ่นและศัตรูพืชใจกว้างพันธุ์ เพิ่มในน้ำตาลเนื้อหาเป็นที่พึงปรารถนาเพราะจำนวนมากของน้ำตาลซูโครสในสามารถผลิตชีวมวลน้อยลงซึ่งจะส่งผลน้อยกว่าต้นทุนการผลิตน้ำตาล ( Singh et al . , 2005 ) โมเลกุลเครื่องหมายเป็นเครื่องมือที่มีคุณค่าเป็นดีเอ็นเอเครื่องหมาย นี้ เทคนิคจะเพิ่มประสิทธิภาพของอ้อมและต้นของโมเลกุลการคัดเลือกอ้อยซึ่งต้องออกแรงผลกระทบที่ดีบนพันธุ์โมเลกุลสำหรับปริมาณน้ำตาลสูงและสามารถเพิ่มความแม่นยำการเลือกต้นตาลสูงเนื้อหา ดังนั้นเครื่องหมายโมเลกุลเท่านั้นอาจช่วยรวมที่พึงประสงค์คุณลักษณะเพื่อพัฒนาสายพันธุ์ที่เหมาะ .เครื่องมือทางพันธุกรรมเพื่อการปรับปรุงคุณภาพอ้อยเท่านั้นเมื่อเร็ว ๆ นี้จะเพียงพอที่จะหาผลของหลายภูมิภาคสร้างในลักษณะที่ โมเลกุลเครื่องหมายแทนเครื่องมือที่มีคุณค่าสำหรับการวิเคราะห์จีโนม ทั้งพื้นฐานและประยุกต์การวิจัยและสามารถใช้ในการระบุยีนที่เกี่ยวข้องกับน้ำตาลสูงและคุณลักษณะเพื่อหาในบทบาทของน้ำตาลซูโครสการสะสม หมายเลขของรายงานต่างๆ อ้อยโมเลกุลเครื่องหมายที่มีอยู่และรวมถึงการ จำกัดfragment length polymorphism ( RFLP ) ( เบส และ แมคอินไตย์ ,1996 ; เบส et al . , 1996 ; burnquist 1991 ; D ' hont et al . , 1993 ;glaszmann et al . , 1989 , 1990 ; หมิง et al . , 1998 ) , สุ่มขยาย Polymorphic DNA ( RAPD ) ( เตา et al . , 1997 ;ฮาร์วีย์และ Botha , 1996 ; แพน et al . , 1997 , 2004 ) , อัตราfragment length polymorphism ( AFLP ) ( เบส et al . , 1998 )และ สกุล - เฉพาะการใช้ปฏิกิริยาลูกโซ่โพลีเมอเรส ( พีซีอาร์ ) ) เครื่องหมายจาก 5S rRNA โลคัส ( D ' hont et al . , 1995 ; แพน et al . ,2000 , 2001 ; piperides et al . , 2000 ) มีเพียงไม่กี่ ลายนิ้วมือนอกจากนี้ มีรายงานในโคลนพันธุ์อ้อย ( ฮาร์วีย์และ Botha1996 ; แพน et al . , 1997 ) ทำซ้ำลำดับง่าย ( ssrs ) หรือสั้นตีคู่ซ้ำ ( strs ) ( เวเบอร์และพฤษภาคม 1989 ; เอ็ดเวิร์ด et al . ,1991 ) สั้นดีเอ็นเอที่ประกอบด้วยหมายเลขต่าง ๆตีคู่ซ้ำของหน่วยใน Tri - เตตร้านิวคลีโอไทด์ หรือลวดลาย( เอ็ดเวิร์ด et al . , 1991 ; polymeropoulos et al . , 1991 ) ถึงแม้ว่ารายงานหลายชนิดในชนิดพืชอื่น ๆ( คอร์ดิโล et al . , 2000 , 2001 ) มีอยู่เพียงไม่กี่ได้รับรายงานในอ้อย ( กอเดโรและเฮนรี่ , 2001 ; กอเดโรและal . , 2000 , 20012003 ; ดา ซิลวา 2001 jannoo et al . , 2001 ; แพนและal . , 2003 ; piperidis et al . , 2001 ) เพื่อวันที่เพียงไม่กี่เกี่ยวกับรายงานการพัฒนาและใช้ไมโครแซเทลไลต์เครื่องหมายในอ้อย วัตถุประสงค์ของการศึกษานี้คือประเมินใหม่ให้มีเครื่องหมายไมโครแซทเทลไลท์แนวทางการส่งเสริมยอดสูงบนโมเลกุลของน้ำตาลพันธุ์การค้าที่เกี่ยวข้องกับลักษณะของพันธุ์อ้อย น้ำตาลและ เชื้อพันธุกรรมอ้อยที่มีอยู่ นี้จะเป็นประโยชน์ในอ้อยพันธุ์ ด้านการทำแผนที่ทางกายภาพของยีนการติดแท็กและการทำแผนที่ของลักษณะที่สำคัญทางเศรษฐกิจต่าง ๆการทดสอบและการวิเคราะห์ความเป็นตัวตน polycross . งานเพิ่มเติมเป็นกําลังสําหรับการตรวจสอบเหล่านี้ที่มีเครื่องหมาย SSRในประชากรที่แตกต่างกันสำหรับการสร้างแผนที่พันธุกรรมแผนที่สำหรับน้ำตาล . .
การแปล กรุณารอสักครู่..