The complete mitochondrial genome o

The complete mitochondrial genome of the sycamore lace bug, Corythucha ciliata, was sequenced in this study. It represents the first sequenced mitogenome of family Tingidae in Heteroptera. The mitogenome of C. ciliata is 15,257bp and contains 37 genes including 13 protein-coding genes (PCGs), 22 tRNA genes, two rRNA genes and a large non-coding region. Gene arrangement, nucleotide content, codon usage, and amino acid composition and asymmetry indicate a high degree of conservation with six other species of Cimicomorpha. The 13 PCGs initiated with ATN as the start codon and terminated with TAA, TA or T as stop codon. The evolutionary rate of each PCG was different, among which ATP8 showed the highest rate while ATP6 indicated the lowest rate. The 22 tRNAs genes apparently fold into a typical cloverleaf structure; however, the anticodon (TTC) of trnSer (AGN) differs from other Heteropteran insects. Secondary structure modeling of rRNA genes revealed similarity to other insects, except for two incomplete helices (H1648 and H2735) in lrRNA. The predicted secondary structure of lrRNA indicates 45 helices in six domains, whereas srRNA has 27 helices in three domains. Three potential stem-loops and two tandem repeats (-TCTAAT-) were identified in the A+T-rich region. Phylogenetic analysis indicated that C. ciliata is a sister group to other Heteroptera species based on analysis of the 13 PCGs.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

จีโนมยลสมบูรณ์ของข้อผิดพลาดลูกไม้มะเดื่อ corythucha ciliata ก็ติดใจในการศึกษานี้ มันหมายถึง mitogenome ติดใจแรกของครอบครัว tingidae ใน heteroptera mitogenome ของ C ciliata เป็น 15,257 bp และมี 37 ยีน 13 รวมทั้งยีนโปรตีนเข้ารหัส (PCGS) 22 ยีน tRNA, สองยีน rRNA และภูมิภาคท​​ี่ไม่ได้เข้ารหัสที่มีขนาดใหญ่ การจัดเรียงยีนเนื้อหาเบื่อหน่ายการใช้ codon และองค์ประกอบของกรดอะมิโนและสมส่วนระบุระดับสูงของการอนุรักษ์กับหกสายพันธุ์อื่น ๆ ของ cimicomorpha 13 PCGS ริเริ่มกับ ATN เป็นโคดอนเริ่มต้นและสิ้นสุดลงด้วย taa, ta หรือทีเป็นหยุด codon อัตราการวิวัฒนาการของ PCG แต่ละที่แตกต่างกันในระหว่างที่ atp8 แสดงให้เห็นว่าอัตราที่สูงที่สุดในขณะที่ atp6 ระบุอัตราต่ำสุด22 ยีนพับ tRNAs เห็นได้ชัดว่าเป็นโครงสร้างโคลเวอร์ทั่วไป แต่ anticodon (TTC) จาก trnser (AGN) แตกต่างจากแมลง heteropteran อื่น ๆ การสร้างแบบจำลองโครงสร้างทุติยภูมิของยีน rRNA พบว่าคล้ายคลึงกับแมลงอื่น ๆ ยกเว้นสองเอนริเก้ที่ไม่สมบูรณ์ (h1648 และ h2735) ใน lrrna โครงสร้างทุติยภูมิที่คาดการณ์ไว้จาก lrrna บ่งชี้ 45 เอนริเก้ในโดเมนหก,ในขณะที่มี srrna 27 เอนริเก้ในสามโดเมน สามห่วงก้านที่มีศักยภาพและสองซ้ำตีคู่ (-tctaat) ถูกระบุในภูมิภาคท​​ี่อุดมไปด้วย T- phylogenetic วิเคราะห์ชี้ให้เห็นว่าค ciliata เป็นกลุ่มสาวสายพันธุ์ heteroptera อื่น ๆ ตามการวิเคราะห์ของ 13 PCGS

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

จีโนม mitochondrial สมบูรณ์ของบัก sycamore ลูกไม้ Corythucha ciliata ถูกเรียงลำดับในการศึกษานี้ มันแสดงถึง mitogenome ตามลำดับแรกของตระกูล Tingidae ในแมงดานา Mitogenome ของ C. ciliata เป็น 15, 257bp และประกอบด้วยยีน 37 รวมทั้งยีนที่ 13 รหัสโปรตีน (PCGs), 22 tRNA ยีน ยีน rRNA สอง และภูมิภาคขนาดใหญ่ไม่ใช่โค้ด ยีนเรียง นิวคลีโอไทด์เนื้อหา การ ใช้รหัสพันธุกรรม และองค์ประกอบของกรดอะมิโน และ asymmetry ระบุระดับสูงการอนุรักษ์มีหกชนิดอื่น ๆ ของ Cimicomorpha 13 PCGs เริ่ม ด้วยเอทีเอ็นเป็นรหัสพันธุกรรมเริ่มต้น และสิ้นสุดกับแหลมยายณี TA หรือ T เป็นรหัสพันธุกรรมหยุด อัตราวิวัฒนาการของ PCG แต่ละแตกต่างกัน ระหว่าง ATP8 ซึ่งพบอัตราสูงสุดในขณะที่ ATP6 ระบุอัตราต่ำสุด ยีน tRNAs 22 พับเห็นได้ชัดว่าเป็นโครงสร้างทั่วไป cloverleaf อย่างไรก็ตาม anticodon (ทีทีซีจำกัด) ของ trnSer (AGN) แตกต่างจากแมลงอื่น Heteropteran โมเดลโครงสร้างรองของ rRNA เปิดเผยคล้ายกับแมลงอื่น ๆ เว้นสองสมบูรณ์ helices (H1648 และ H2735) ใน lrRNA โครงสร้างรองการคาดการณ์ของ lrRNA ระบุว่า helices 45 ในโดเมน 6 ในขณะที่ srRNA มี 27 helices ในโดเมนที่สาม ระบุศักยภาพ 3 ลูปก้านและทำซ้ำตัวตามกันไปสอง (- TCTAAT-) ใน A T-ริชภูมิภาค ระบุวิเคราะห์ phylogenetic ciliata ที่ C. เป็นกลุ่มพันธุ์แมงดานาอื่น ๆ ตามการวิเคราะห์ของ 13 PCGs

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

mitochondrial ยีนที่สมบรูณ์แบบของบั๊กลูกไม้มะเดื่อที่ว่า corythucha เป็นอักษรเรียงลำดับ\ในการศึกษานี้ มันเป็นครั้งแรกที่ mitogenome เรียงซีเควนซ์ของ tingidae ในแบบครอบครัวใน heteroptera mitogenome ของว่า C คือ 15,257 BP และประกอบด้วย 37 ยีนรวมถึงยีนโปรตีน 13 - การเข้ารหัส( pcgs ): 22 ยีนสอง trna rrna ยีนและเขตพื้นที่ไม่มีการเข้ารหัสขนาดใหญ่ การจัดเตรียมยีนเนื้อหา nucleotideการใช้งานและความอสมมาตร codon องค์ประกอบและกรดอะมิโนแสดงถึงระดับที่สูงมากในการอนุรักษ์พร้อมด้วย 6 สายพันธุ์อื่นๆของ cimicomorpha 13 pcgs ที่เริ่มดำเนินการมาพร้อมด้วย atn เป็น codon เริ่มต้นและสิ้นสุดลงด้วยต้องการ TAA หรือไม่ตาหรือ T เป็น codon หยุด อัตราวิวัฒนาการของ PCG แต่ละตัวก็แตกต่างกันซึ่ง ATP 8 มีอัตราสูงสุดในขณะที่ ATP 6 ระบุอัตราดอกเบี้ยต่ำสุด22 ยีน trnas เท่าที่เห็นได้ชัดว่าเข้าไปในโครงสร้างตามแบบดอกจิกแต่ถึงอย่างไรก็ตาม anticodon ( ttc )ของ trnser ( AGN )แตกต่างจาก heteropteran แมลงอื่นๆ การสร้างแบบจำลองโครงสร้างรองของยีน rrna เผยให้เห็นความละม้ายคล้ายคลึงกับแมลงอื่นยกเว้นสำหรับสองไม่สมบูรณ์วงก้นหอย( H 1648 และ H 2735 )ใน lrrna คาดว่าโครงสร้างรองของ lrrna แสดง 45 วงก้นหอยในโดเมนในขณะที่ srrna มี 27 วงก้นหอยในสามโดเมน สามมี ศักยภาพ พร้อมก้านไมโครโฟน - กราวนด์ลูปและสองตัว:เล่นซ้ำ( - tctaat - )ได้รับการระบุว่าในเขตพื้นที่ที่ T - ที่หลากหลาย การวิเคราะห์ phylogenetic ระบุว่าว่า C .เป็นกลุ่มในเครือที่เป็นสายพันธุ์ heteroptera อื่นๆที่ใช้ในการวิเคราะห์ของ 13 pcgs. ได้