In this study, we challenge current

In this study, we challenge current ideas about the mechan- ism of translocation. The paradigm shift we propose follows from our observations that intracellular EF-G is likely to be in the GDP-bound form, that the GDP form of the factor can rapidly enter the preT ribosome complex, and that the preT ribosome acts as the GEF for EF-G, similar to the way that the post-termination ribosome acts as the GEF for the peptide-release factor RF3 [9,10]. Our results, partially based on the use of A-site-specific cleavage of mRNA by the bacterial toxin RelE [11] to monitor the position of the mRNA at various translocation steps, show that the exchange of GDP for the non-cleavable GTP analog GDPNP on EF-G bound to the preT complex drives the ribosome into an intermediate translocation state (transT*), wherein the tRNA2-mRNA complex has moved in relation to the 30S subunit. The removal of EF-G•GDPNP from a transT* ribo- some by addition of excess GDP brings the ribosome back to its preT state, while GTP addition brings it to the postT state. From these and previous biochemical data [8], in con- junction with cryo-electron microscopy (cryo-EM) recon- structions of functional ribosomal complexes [5], we provide a mechanistic reinterpretation of the major steps of translocation.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ในการศึกษานี้ เราขอท้าความคิดปัจจุบันเกี่ยวกับ ism mechan ของการสับเปลี่ยน กระบวนทัศน์ที่เราเสนอดังนี้จากการสังเกตของเราที่ EF-G intracellular จะอยู่ในรูปผูกกับ GDP ว่า ตัว GDP ตัวอย่างรวดเร็วสามารถป้อนไรโบโซม preT ซับซ้อน และการที่ไรโบโซม preT ทำหน้าที่เป็น GEF สำหรับ EF-G คล้ายกับวิธีการที่ไรโบโซมหลังจ้างทำหน้าที่เป็น GEF สำหรับสัดส่วนของเพปไทด์รุ่น rf3 หรือตู้ [9,10] ของเราผล บางส่วนจากการใช้เฉพาะ A ไซต์ปริของ mRNA โดยพิษแบคทีเรีย RelE [11] เพื่อตรวจสอบตำแหน่งของ mRNA ในขั้นตอนการสับเปลี่ยนต่าง ๆ แสดงว่า อัตราแลกเปลี่ยนของ GDP สำหรับการไม่ cleavable GTP อนาล็อก GDPNP บน EF G กับไดรฟ์ซับซ้อน preT ที่ไรโบโซมเป็นสถานะการสับเปลี่ยนกลาง (transT *), นั้นได้ย้ายในความสัมพันธ์ซับซ้อน tRNA2 mRNA ไปย่อย 30S การเอาออกของ EF-G•GDPNP จาก transT * ribo แบบ บาง โดยการเพิ่มของ GDP ส่วนเกินนำไรโบโซมกลับสู่สถานะ preT ขณะนี้ GTP นำรัฐ postT จากเหล่านี้ และข้อมูลก่อนหน้านี้ชีวเคมี [8], ในคอนเชื่อมต่อกับอิเล็กตรอน cryo microscopy (cryo-EM) กระทบ-structions ของคอมเพล็กซ์ ribosomal หน้าที่ [5], เรามีขั้นตอนสำคัญของการสับเปลี่ยนสถาปัตยกรรมการกลไกการทำงาน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ในการศึกษานี้เราท้าทายความคิดในปัจจุบันเกี่ยวกับลัทธิกลไกของการโยกย้าย ปรับเปลี่ยนกระบวนทัศน์เรานำเสนอต่อไปนี้จากการสังเกตของเราว่า EF-G ภายในเซลล์มีแนวโน้มที่จะอยู่ในรูปแบบของจีดีพีที่ถูกผูกไว้ที่รูปแบบของ GDP ปัจจัยอย่างรวดเร็วสามารถป้อนไรโบโซม Pret ซับซ้อนและที่ทำหน้าที่ไรโบโซม Pret เป็น GEF สำหรับ EF-G, คล้ายกับวิธีการที่ไรโบโซมโพสต์บอกเลิกทำหน้าที่เป็น GEF สำหรับปัจจัยเปปไทด์ปล่อย RF3 [9,10] ผลของเราขึ้นอยู่บางส่วนในการใช้สถานที่เฉพาะความแตกแยกของ mRNA จากสารพิษของแบคทีเรีย Rele [11] เพื่อตรวจสอบตำแหน่งของ mRNA ที่ขั้นตอนการโยกย้ายต่าง ๆ แสดงให้เห็นว่าการแลกเปลี่ยนของ GDP สำหรับไม่ใช่ Cleavable อนาล็อกฉี่ GDPNP ใน EF-G ผูกพันกับไดรฟ์ที่มีความซับซ้อน Pret ไรโบโซมเป็นรัฐโยกย้ายกลาง (transT *) ในประเด็นที่ซับซ้อน tRNA2-mRNA ได้ย้ายในความสัมพันธ์กับ subunit 30S การกำจัดของ EF-G • GDPNP จาก transT * ribo- บางส่วนโดยการเพิ่มของ GDP ส่วนเกินนำไรโบโซมกลับสู่สภาพ Pret ในขณะที่นอกจากฉี่นำมันไปรัฐ postT จากข้อมูลเหล่านี้และทางชีวเคมีที่ก่อนหน้านี้ [8] ในทางแยกทำาด้วยกล้องจุลทรรศน์อิเล็กตรอน Cryo (Cryo-EM) คํา recon- คอมเพล็กซ์โซมอลทำงานได้ [5] เราให้ตีความกลไกในขั้นตอนที่สำคัญของการโยกย้าย

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ในการศึกษานี้ เราท้าทายความคิดปัจจุบันเกี่ยวกับกลศาสตร์ภาวะการเคลื่อนย้าย . การปรับเปลี่ยนกระบวนทัศน์จากการสังเกตของเราที่เรานำเสนอคือการ ef-g น่าจะอยู่ใน GDP ไว้ฟอร์มว่า GDP รูปแบบปัจจัยอย่างรวดเร็วสามารถป้อนเปรตไรโบโซม และว่า เปรตไรโบโซมทำหน้าที่เป็น ef-g GEF เพื่อ ,คล้ายกับวิธีที่สิ้นสุดหลังไรโบโซมทำหน้าที่เป็นเจฟสำหรับเปปไทด์ปล่อยปัจจัย rf3 [ 9,10 ] ผลงานบางส่วนจากการใช้ a-site-specific รอยปริแยกของ mRNA โดยแบคทีเรียสารพิษ rele [ 11 ] เพื่อตรวจสอบตำแหน่งของ mRNA ที่ขั้นตอนการโยกย้ายต่าง ๆแสดงให้เห็นว่า การแลกเปลี่ยนอัตราการ cleavable ไม่ใช่ GTP อนาล็อก gdpnp บน ef-g ผูกพันกับเปรตที่ไดรฟ์ไรโบโซมเป็นรัฐโยกย้ายระดับกลาง ( transt * ) ซึ่ง trna2 mRNA ที่ได้ย้ายกับหน่วยย่อย 30s . การกำจัด ef-g - gdpnp จาก transt * ribo - บาง โดยการเพิ่มของ GDP เกินทำให้ไรโบโซมกลับสู่สภาพเปรต ,ในขณะที่นอกจากนี้ GTP นำให้ postt รัฐ จากข้อมูลเหล่านี้ และก่อนหน้านี้ทางชีวเคมี [ 8 ] ในคอน - ชุมทางด้วยเครื่อง Cryo จุลทรรศน์อิเล็กตรอน ( เครโอเอ็ม ) ข้อมูล - structions ของการทำงาน Protein complexes [ 5 ] ที่เรามีให้โชว์ฉบับตีความใหม่ กลไกของขั้นตอนที่สำคัญของการโยกย้าย .