The presence of heavy metals in soi

The presence of heavy metals in soils can lead to changes in microbial community structure, characterized by the dominance of groups that are able to tolerate contamination. Such groups may provide good microbial indicators of heavy-metal pollution in soil. Through terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) profiling, changes in the bacterial community structure of an acidic forest soil that had been incubated with cadmium (Cd) for 30 days were investigated. T-RFLP revealed, in particular, three operational taxonomic units (OTUs) strongly dominating in relative abundance in the contaminated soil. By cloning of the amplified 16S rRNA genes and partial sequencing of 25 clones, these three dominant OTUs were phylogenetically characterized. One dominant OTU in the cadmium-contaminated soil was derived from Betaproteobacteria, genus Burkholderia, and the other two were from uncultured members of the class Actinobacteria, closely related to the genus Streptomyces. To confirm T-RFLP data, four primers were designed on the basis of this study's dominant sequences, targeting the OTUs corresponding to Burkholderia or Actinobacteria. Real-time PCR showed that Burkholderia target sequences were more abundant in cadmium-treated soil (7.8 × 107± 3.0 × 107 targets g−1 soil) than in untreated soil (4.0 × 106± 8.9 × 105 targets g−1 soil). It was concluded that the genus Burkholderia includes species that may be particularly dominant under cadmium contamination.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ของโลหะหนักในดินเนื้อปูนสามารถนำไปสู่การเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์ ลักษณะการครอบงำของกลุ่มที่สามารถทนต่อการปนเปื้อน กลุ่มดังกล่าวอาจมีตัวบ่งชี้จุลินทรีย์ดีมลพิษโลหะหนักในดิน ผ่านเทอร์มินัลจำกัดส่วนความยาวโพลีมอร์ฟิซึม (T-RFLP) สร้างโพรไฟล์ ถูกตรวจสอบความเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างชุมชนแบคทีเรียเป็นดินเปรี้ยวป่าที่มี incubated กับแคดเมียม (Cd) สำหรับ 30 วัน T-RFLP เปิดเผย โดยเฉพาะ 3 อนุกรมวิธานหน่วยงาน (OTUs) อำนาจเหนืออย่างยิ่งในความสัมพันธ์ในดินปนเปื้อน โดยการโคลนยีนเอาต์ 16S rRNA และลำดับบางส่วนของโคลน 25, OTUs หลักสามเหล่านี้ถูก phylogenetically ลักษณะการ หนึ่ง OTU หลักในดินที่มีแคดเมียมปนเปื้อนที่มาจาก Betaproteobacteria สกุล Burkholderia และอีกสองได้จากสมาชิกของคลา Actinobacteria สัมพันธ์ใกล้ชิดกับสกุล Streptomyces uncultured เพื่อยืนยันข้อมูล T RFLP ไพรเมอร์ 4 ถูกออกแบบตามลำดับหลักของการศึกษานี้ กำหนดเป้าหมาย OTUs ตรง Burkholderia หรือ Actinobacteria แบบเรียลไทม์ PCR พบว่า Burkholderia เป้าหมายลำดับอยู่ชุกชุมมากขึ้นถือว่าแคดเมียมดิน (7.8 × 107± 3.0 × 107 เป้าหมาย g−1 ดิน) มากกว่าในดินไม่ถูกรักษา (4.0 × 106± × 105 8.9 นอกเป้าหมาย g−1 ดิน) มีสรุปว่า ตระกูลนี้ Burkholderia รวมชนิดที่อาจโดดเด่นโดยเฉพาะอย่างยิ่งภายใต้ปนเปื้อนแคดเมียม

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การปรากฏตัวของโลหะหนักในดินที่สามารถนำไปสู่​​การเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างกลุ่มจุลินทรีย์โดดเด่นด้วยการครอบงำของกลุ่มที่มีความสามารถที่จะทนต่อการปนเปื้อน กลุ่มดังกล่าวอาจจัดให้มีตัวชี้วัดที่ดีของจุลินทรีย์มลพิษโลหะหนักในดิน ผ่านส่วนข้อ จำกัด แตกต่างขั้วระยะเวลา (T-RFLP) โปรไฟล์การเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างชุมชนแบคทีเรียในดินที่เป็นกรดป่าที่ได้รับการบ่มกับแคดเมียม (Cd) เป็นเวลา 30 วันถูกตรวจสอบ T-RFLP เปิดเผยโดยเฉพาะอย่างยิ่งสามหน่วยอนุกรมวิธานการดำเนินงาน (Otus) ขออำนาจเหนือในความอุดมสมบูรณ์ญาติในดินที่ปนเปื้อน โดยการโคลนยีน 16S rRNA ขยายและลำดับบางส่วน 25 โคลนทั้งสามที่โดดเด่น Otus มีลักษณะ phylogenetically OTU หนึ่งที่โดดเด่นในแคดเมียมปนเปื้อนในดินได้มาจาก Betaproteobacteria สกุล Burkholderia และอีกสองคนจากสมาชิกไม่มีมารยาทของการเรียน actinobacteria ที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับสกุล Streptomyces เพื่อยืนยันข้อมูลที่ T-RFLP สี่ไพรเมอร์ได้รับการออกแบบบนพื้นฐานของการศึกษาลำดับที่โดดเด่นนี้กำหนดเป้​​าหมาย Otus สอดคล้องกับ Burkholderia หรือ actinobacteria PCR แบบ Real-time แสดงให้เห็นว่าลำดับ Burkholderia เป้าหมายได้มากยิ่งขึ้นในดินที่ได้รับแคดเมียม (7.8 × 107 ± 3.0 × 107 เป้าหมาย-1 กรัมของดิน) กว่าในดินได้รับการรักษา (4.0 × 106 ± 8.9 × 105 กรัมเป้าหมาย-1 ดิน) ก็สรุปได้ว่าเชื้อชนิดรวมถึงสายพันธุ์ที่อาจจะโดดเด่นโดยเฉพาะอย่างยิ่งภายใต้การปนเปื้อนแคดเมียม

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การปรากฏตัวของโลหะหนักในดินที่สามารถนำไปสู่การเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างชุมชนจุลินทรีย์ ลักษณะการปกครองของกลุ่มที่สามารถทนต่อการปนเปื้อน กลุ่มดังกล่าวอาจให้จุลินทรีย์บ่งชี้ที่ดีของมลพิษโลหะหนักในดิน ผ่านเทอร์มินัลจำกัด fragment length polymorphism ( t-rflp ) การการเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างชุมชนแบคทีเรียของกรดดินป่าที่ถูกบ่มกับแคดเมียม ( ซีดี ) เป็นเวลา 30 วัน คือ t-rflp เปิดเผย โดยเฉพาะหน่วยอนุกรมวิธานสามปฏิบัติการ ( ใน ) ขอครอบครองในความอุดมสมบูรณ์สัมพัทธ์ในดินปนเปื้อน . โดยการโคลนยีน 16S rRNA ลำดับไพรและบางส่วนของ 25 โคลนทั้งสามมีลักษณะเด่นใน phylogenetically . คนเด่น otu ในแคดเมียมที่ปนเปื้อนในดินที่ได้มาจาก betaproteobacteria สกุล , Burkholderia และอีกสองคนจากไร้การศึกษาสมาชิกของชั้นเรียนแอคติโนมัยสีทที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับสกุล Streptomyces . เพื่อยืนยันข้อมูล t-rflp สี่ชนิดถูกออกแบบบนพื้นฐานของการศึกษาก็เด่นลำดับสอดคล้องกับเป้าหมายในการเกิดพยาธิสภาพหรือแอคติโนมัยสีท . เวลาจริง PCR พบว่ามีปริมาณมากใน Burkholderia เป้าหมายลำดับการรักษาดิน ( 7.8 ± 3.0 ×× 107 107 เป้าหมาย G − 1 ดิน ) มากกว่าในดินดิบ ( 4.0 × 106 ± 8.9 × 105 เป้าหมาย G − 1 ดิน ) สรุปได้ว่า ประเภท Burkholderia รวมถึงชนิดที่อาจจะโดยเฉพาะอย่างยิ่งเด่นภายใต้การปนเปื้อนแคดเมียม