The basic interaction unit in STRIN

The basic interaction unit in STRING is the functional
association, i.e. a specific and productive functional relationship
between two proteins, likely contributing to a common
biological purpose. Interactions are derived from multiple
sources: (i) known experimental interactions are imported
from primary databases, (ii) pathway knowledge is
parsed from manually curated databases, (iii) automated
text-mining is applied to uncover statistical and/or semantic
links between proteins, based on Medline abstracts and
a large collection of full-text articles, (iv) interactions are
predicted de novo by a number of algorithms using genomic
information (23–25) as well as by co-expression
analysis and (v) interactions that are observed in one organism
are systematically transferred to other organisms,
via pre-computed orthology relations. STRING centers
on protein-coding gene loci––alternative splice isoforms or
post-translationally modified forms are not resolved, but
are instead collapsed at the level of the gene locus. All
sources of interaction evidence are benchmarked and calibrated
against previous knowledge, using the high-level
functional groupings provided by the manually curated Kyoto
Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway
maps (5).
As of the current update to version 10.0, the number of
organisms covered by STRING has increased to 2031, almost
doubling over the previous release. The update alsosources again, re-running all prediction algorithms and reexecuting
the entire text-mining pipeline with new dictionaries
and extended text collections. Many of the features
and interfaces of STRING have already been described previously
(26–28). Below, we have given a short overview of
the resource and describe recent additions and modifications.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

หน่วยพื้นฐานโต้ตอบสตริงเป็นการทำงานสมาคม เช่นประสิทธิภาพ และการทำงานความสัมพันธ์ระหว่างสองโปรตีน มีแนวโน้มสนับสนุนทั่วไปเป็นวัตถุประสงค์ทางชีวภาพ โต้มาจากหลายแหล่งที่มา: (i) เรียกว่า โต้ตอบทดลองนำเข้าจากหลักฐานข้อมูล มีความรู้ทางเดิน (ii)แยกจากฐานข้อมูลด้วยตนเอง curated, (iii) โดยอัตโนมัติใช้การทำเหมืองข้อความการค้นพบทางสถิติ และ/หรือความหมายเชื่อมโยงระหว่างโปรตีน ตามบทคัดย่อจาก Medline และคอลเลกชันขนาดใหญ่ของข้อความบทความ การโต้ตอบ (iv) มีคาดการณ์ de novo โดยอัลกอริทึมที่ใช้ genomicข้อมูล (23-25) และตาม ด้วยนิพจน์ร่วมด้วยโต้ตอบการวิเคราะห์และ (v) ที่พบในสิ่งมีชีวิตหนึ่งมีระบบโอนย้ายไปยังสิ่งมีชีวิตอื่น ๆผ่านความสัมพันธ์ orthology คำนวณล่วงหน้า สายศูนย์ในรหัสโปรตีนยีน loci – – isoforms ประกบอื่น หรือไม่ ใช้แบบฟอร์ม post-translationally ปรับเปลี่ยนแก้ไข แต่แต่ถูกยุบระดับของโลกัสโพลยีน ทั้งหมดแหล่งที่มาของหลักฐานโต้ benchmarked และปรับเทียบกับความรู้ก่อนหน้า การใช้ในระดับสูงการจัดกลุ่มงานโดยเกียวโต curated ด้วยตนเองสารานุกรมของยีนและ Genomes (KEGG) ทางเดินแผนที่ (5)ณ ปัจจุบันปรับปรุงเวอร์ชัน 10.0 จำนวนสิ่งมีชีวิตที่ครอบคลุม โดยสายขึ้นไป 2031 เกือบจะมากกว่ารุ่นก่อนหน้านี้ การปรับปรุง alsosources อีกครั้ง การใช้อัลกอริทึมการคาดเดาทั้งหมด และ reexecutingขั้นตอนการทำเหมืองข้อความทั้งหมด ด้วยพจนานุกรมใหม่และขยายคอลเลกชันข้อความ ลักษณะการทำงานมากมายและอินเตอร์เฟสของสตริงที่มีอยู่แล้วได้อธิบายก่อนหน้านี้(26-28) ด้านล่าง เราได้รับภาพรวมโดยย่อของทรัพยากร และอธิบายเพิ่มเติมล่าสุดและปรับเปลี่ยน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

หน่วยพื้นฐานในการทำงานร่วมกันเป็น STRING การทำงาน
ของสมาคมคือความสัมพันธ์การทำงานที่เฉพาะเจาะจงและมีประสิทธิผล
ระหว่างสองโปรตีนน่าจะเอื้อต่อการร่วมกัน
เพื่อจุดประสงค์ทางชีวภาพ ปฏิสัมพันธ์จะได้มาจากหลาย
แหล่งที่มา: (i) ที่รู้จักกันในการโต้ตอบการทดลองที่นำเข้า
จากฐานข้อมูลหลัก (ii) ความรู้ทางเดินจะ
แยกวิเคราะห์จากฐานข้อมูล curated ด้วยตนเอง (iii) อัตโนมัติ
ข้อความการทำเหมืองแร่ถูกนำไปใช้ในการค้นพบทางสถิติและ / หรือความหมาย
เชื่อมโยงระหว่างโปรตีน บนพื้นฐานของบทคัดย่อเมดและ
คอลเลกชันขนาดใหญ่ของบทความฉบับเต็ม (iv) การปฏิสัมพันธ์จะ
คาดการณ์โนโวโดยจำนวนของขั้นตอนวิธีการใช้จีโนม
ข้อมูล (23-25) เช่นเดียวกับผู้ร่วมการแสดงออก
และการวิเคราะห์ (V) การมีปฏิสัมพันธ์ที่ มีการตั้งข้อสังเกตในชีวิตหนึ่ง
จะถูกโอนเป็นระบบเพื่อชีวิตอื่น ๆ
ผ่านทางก่อนคำนวณความสัมพันธ์ orthology ศูนย์ STRING
ในตำแหน่งของยีนโปรตีนเข้ารหัส - ไอโซฟอร์มประกบทางเลือกหรือ
การโพสต์รูปแบบ translationally ปรับเปลี่ยนไม่ได้รับการแก้ไข แต่
จะทรุดตัวลงแทนในระดับของสถานทียีน ทุก
แหล่งที่มาของหลักฐานที่จะวัดประสิทธิผลการทำงานร่วมกันและการสอบเทียบ
กับความรู้ก่อนโดยใช้ระดับสูง
การจัดกลุ่มการทำงานให้โดย curated ตนเองเกียวโต
สารานุกรมของยีนและจีโนม (KEGG) เดิน
แผนที่ (5).
ในฐานะของการปรับปรุงปัจจุบันกับรุ่น 10.0 จำนวน
สิ่งมีชีวิตที่ครอบคลุมโดย STRING ได้เพิ่มขึ้นถึง 2031 เกือบ
สองเท่าในช่วงการเปิดตัวก่อนหน้านี้ การปรับปรุง alsosources อีกครั้งอีกครั้งที่ทำงานอยู่ทั้งหมดขั้นตอนวิธีการทำนายและ reexecuting
ท่อส่งข้อความทั้งหมดที่มีการทำเหมืองแร่พจนานุกรมใหม่
และขยายคอลเลกชันข้อความ หลายคุณสมบัติ
และการเชื่อมต่อของ STRING ได้รับการอธิบายไว้ก่อนหน้า
(26-28) ด้านล่างนี้เราได้ให้ภาพรวมสั้นของ
ทรัพยากรและอธิบายเพิ่มเติมล่าสุดและการปรับเปลี่ยน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

หน่วยพื้นฐานการทำงานร่วมกันในสตริงเป็นสมาคมการทำงาน
คือที่เฉพาะเจาะจงและมีประสิทธิภาพการทำงานความสัมพันธ์
ระหว่างโปรตีนทั้งสองน่าจะเอื้อต่อการร่วมกัน
ชีวภาพ วัตถุประสงค์ ปฏิสัมพันธ์จะได้มาจากหลายแหล่ง
: ( ผม ) รู้จักทดลองปฏิสัมพันธ์นำเข้า
จากฐานข้อมูลหลัก ( 2 ) ความรู้ทางคือ
แจงด้วยตนเอง curated จากฐานข้อมูล( 3 ) การใช้ข้อความอัตโนมัติ
ค้นพบทางสถิติ และ / หรือการเชื่อมโยงความหมาย
ระหว่างโปรตีนจาก Medline จาก
คอลเลกชันขนาดใหญ่ของบทความแบบเต็ม ( 4 ) ปฏิสัมพันธ์เป็น
ทำนายอีกครั้ง โดยจำนวนของขั้นตอนวิธีโดยใช้ข้อมูลจีโนม
( 23 – 25 ) รวมทั้งการวิเคราะห์การแสดงออก
โดย โคบอลต์ ( V ) ปฏิกิริยาที่พบในสิ่งมีชีวิต
เป็นระบบโอนไปยังสิ่งมีชีวิต อื่น ๆ ,
ผ่านก่อนคำนวณ orthology ความสัมพันธ์ ข้อความในรหัสของยีน––ศูนย์

โพสต์ translationally ทดแทนประกบกันต่อ หรือปรับเปลี่ยนรูปแบบการแก้ไขไม่ได้โปรตีนแต่
แทนยุบระดับของยีนโลคัส . แหล่งที่มาของหลักฐานการปฏิสัมพันธ์มีทั้งหมด

เทียบและปรับเทียบกับความรู้เดิมโดยใช้พื้นฐาน
กลุ่มการทำงาน โดยตนเอง curated เกียวโต
สารานุกรมของยีนและจีโนม ( KEGG เป็นต้น ) แผนที่เส้นทาง

เป็น ( 5 ) ของการปรับปรุงในปัจจุบันรุ่น 10.0 , จํานวนของ
สิ่งมีชีวิตครอบคลุมโดยเชือกมีเพิ่มขึ้น 2574 เกือบ
สองเท่ามากกว่ารุ่นก่อนหน้า การปรับปรุง alsosources อีกครั้ง Re ใช้ขั้นตอนวิธีการพยากรณ์และ reexecuting
ทั้งหมดเหมืองท่อที่มีข้อความใหม่พจนานุกรม
และขยายคอลเลกชันข้อความ หลายคุณสมบัติ
และอินเทอร์เฟซของสตริงได้อธิบายไว้ก่อนหน้านี้
( 26 - 28 ) ด้านล่าง , เราให้ภาพรวมสั้น ๆของ
ทรัพยากรและอธิบายเพิ่มล่าสุดและการปรับเปลี่ยน