All members of the ‘Polynucleobacte

All members of the ‘Polynucleobacter subcluster D’ possessed the oligonucleotide sequence 59-AA(T/G)CCCT(A/T)AGGGGGAAA-39 within the 16S rRNA gene (E. coli positions 181–197). In almost all cases, the presence of this sequence could be determined by fluorescent in situ hybridization of whole cells by using a mixture of the fluorescently labelled oligonucleotide probes PnecD1-181 and PnecD2-181 (Hahn et al., 2005). The sequences of these two probes differ in the second variable position (E. coli position 188) of the diagnostic sequence, but not in the first variable position (E. coli position 183). Analysis of 104 sequences forming the phylogenetic cluster representing the proposed new taxon, Polynucleobacter
cosmopolitanus sp. nov., demonstrated that only one of the novel strains differed from the probe sequences in the first variable position of the diagnostic sequence. Besides the FISH probe, a reverse line blot hybridization probe for the detection of the proposed new taxon in environmental samples has been developed and applied successfully.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

สมาชิกทั้งหมดของการ 'Polynucleobacter subcluster D' ครอบครอง oligonucleotide การลำดับ 59 AA(T/G) CCCT (a/t) AGGGGGAAA-39 ภายในยีน 16S rRNA (E. coli ตำแหน่ง 181-197) ในเกือบทุกกรณี การปรากฏตัวของลำดับนี้อาจถูกกำหนด โดยฟลูออเรสเซนต์ใน situ hybridization ของเซลล์ทั้งหมดโดยใช้ส่วนผสมของ oligonucleotide fluorescently คเกอร์ probes PnecD1 181 และ PnecD2-181 (Hahn et al. 2005) ลำดับที่หัวสองเหล่านี้แตกต่างกัน ในตำแหน่งที่สองตัวแปร (E. coli ตำแหน่ง 188) ของลำดับการวินิจฉัย แต่ไม่ได้อยู่ ในตำแหน่งแรกของตัวแปร (E. coli ตำแหน่ง 183) วิเคราะห์ลำดับที่ 104 รูปทางคลัสเตอร์แทนเสนอใหม่เกิน Polynucleobactercosmopolitanus sp.พ.ย. แสดงให้เห็นว่า หนึ่งในสายพันธุ์ใหม่ที่แตกต่างจากลำดับที่สอบสวนในตำแหน่งแรกของตัวแปรของลำดับการวินิจฉัย นอกจากหัวปลา โพรบ hybridization น้าย้อนกลับบรรทัดสำหรับตรวจหามันใหม่เสนอในตัวอย่างสิ่งแวดล้อมได้รับการพัฒนา และใช้เรียบร้อย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

สมาชิกทั้งหมดของ 'Polynucleobacter subcluster D' สิงลำดับ oligonucleotide 59-AA (T / G) CCCT (A / T) AGGGGGAAA-39 ภายในยีน 16S rRNA ( E. coli ตำแหน่ง 181-197) ในเกือบทุกกรณีการปรากฏตัวของลำดับนี้จะถูกกำหนดโดยการเรืองแสงในการผสมพันธุ์แหล่งกำเนิดของเซลล์ทั้งหมดโดยใช้ส่วนผสมของที่มีข้อความ fluorescently probes oligonucleotide PnecD1-181 และ PnecD2-181 (Hahn et al., 2005) ลำดับของทั้งสองฟิวส์แตกต่างกันในตำแหน่งที่สองตัวแปร ( E. coli ตำแหน่ง 188) ของลำดับการวินิจฉัย แต่ไม่ได้อยู่ในตำแหน่งที่ตัวแปรแรก ( E. coli ตำแหน่ง 183) การวิเคราะห์ลำดับ 104 รูปคลัสเตอร์สายวิวัฒนาการที่เป็นตัวแทนของแท็กซอนเสนอใหม่ Polynucleobacter
cosmopolitanus SP พฤศจิกายน, แสดงให้เห็นว่าเป็นเพียงหนึ่งในสายพันธุ์ที่แตกต่างจากนวนิยายลำดับการสอบสวนในตำแหน่งตัวแปรแรกของลำดับการวินิจฉัย นอกจากนี้การสอบสวนปลาเส้น blot hybridization สอบสวนย้อนกลับสำหรับการตรวจสอบของแท็กซอนเสนอใหม่ในตัวอย่างสิ่งแวดล้อมได้รับการพัฒนาและนำไปใช้ประสบความสำเร็จ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

สมาชิกทั้งหมดของ " polynucleobacter subcluster D " ครอบครอง ซึ่งลำดับ 59-aa ( T / g ) ccct ( A / T ) agggggaaa-39 16S rRNA ยีนในเชื้อ E . coli ตำแหน่ง 181 ( 197 ) ในเกือบทุกกรณี การปรากฏตัวของลำดับนี้จะถูกกำหนดโดยเรืองแสงใน situ hybridization ของทั้งเซลล์ โดยใช้ส่วนผสมของ fluorescently ข้อความ ซึ่งวิธีการและ pnecd1-181 pnecd2-181 ( Hahn et al . , 2005 ) ลำดับของทั้งสองจึงแตกต่างกันในตำแหน่ง ตัวแปรที่สอง ( E . coli ตำแหน่ง 188 ) ของลำดับการวินิจฉัย แต่ไม่ได้อยู่ในตำแหน่งของตัวแปรแรก ( E . coli ตำแหน่ง 183 ) การวิเคราะห์ลำดับการขึ้นรูป ซึ่งเป็นตัวแทนของ 104 กลุ่มเสนอ polynucleobacter ชนิดใหม่ ,cosmopolitanus sp . พ.ย. พบว่ามีเพียงหนึ่งในสายพันธุ์ใหม่ที่แตกต่างไปจากการสอบสวนลำดับตามตำแหน่งแรกของการวินิจฉัย นอกจากปลาเส้น blot hybridization probe , ย้อนกลับตรวจสอบสำหรับการตรวจสอบของที่เสนอใหม่ ชนิดในตัวอย่างสิ่งแวดล้อมมีการพัฒนาและประยุกต์เรียบร้อยแล้ว