genotype a crucial and necessary st

genotype a crucial and necessary step to support allelic data.
Surprisingly, anonymous markers such as random amplified
polymorphic DNA (RAPDs) have also been used in a few
instances, although these techniques are known to be prone
to inconsistencies, even when working with DNA isolated
from fresh tissues. Advantages and limitations of particular
marker types should be considered when planning palaeogenetic
studies.
Which plant parts are likely to contain aDNA?
Theoretically, plants, with their long-term storage capability,
should preserve aDNA well. As for studies using fresh material,
young, meristematic tissues with a comparatively high density
of cells could prove particularly suitable for palaeogenetic studies.
Such samples have a higher chance of containing nondegenerated
copies of target DNA fragments, in particular from the numerous
organelle genomes per cell. Similarly, tissues with protective
coverings, such as seeds and fruits, might be promising targets.
In trees, much subfossil or fossil material is available for molecular
studies, from wood to leaves and needles (Deguilloux et al.,
2002, 2003), fruits or seeds (Brown, 1999; Ziegenhagen
et al., 2003), or even single pollen grains (Suyama et al.,
1996). Pollen is one of the major sources of palaeobotanical
information, but it could also be useful for aDNA molecular
analysis. The outer walls of pollen grains are extremely resistant
to chemical and physical attack. In suitable environments,
such as the accumulating anaerobic sediments at the bottom
of small lakes, they might be preserved indefinitely. However,
to date, there has been only one published report of successful
DNA amplification from fossil pollen: in 1996, rbcL sequences
were claimed to have been amplified from isolated Japanese
Abies pollen grains dating from over 100 000 yr ago (Suyama
et al., 1996). In principle, bulked pollen samples might
also be analysed, provided that cloning procedures are used
to separate individual sequences. Plant samples from drilled
cores, however, are particularly prone to contamination
with both ancient (but from a different time period) or recent
pollen. Thus, care should be taken to unearth fossil plant
tissue outside the flowering season. Similarly, samples for
DNA extraction are best retrieved in a clean-air room under
elevated pressure, and care should be taken to avoid collecting
material from the sample surface.
Choice of sampling location
Sampling locations should be carefully selected, bearing in
mind the chance of finding sufficient numbers of wellconserved
fossils. DNA persistence is greatly reduced when
exposed to high temperatures (Wayne et al., 1999). Thus, the
most promising grounds are found in cold areas, where tissue
is likely to be well preserved at low temperature (e.g. frozen
in permafrost soil) (Hofreiter et al., 2001b; Willerslev et al.,
2003). However, very dry environments, such as deserts, have
also yielded high-quality aDNA sources (Poinar et al., 2003).
This evidence suggests that temperature might be effective
towards DNA degeneration only indirectly, through its
influence on water availability, since degradation of DNA
involves hydrolytic processes (Willerslev et al., 2004).
In formerly forested areas, sediments are most likely to contain
macro-remains of woody plant species, particularly trees.
The wealth of phylogeographic information currently available
for temperate forest trees (Tomaru et al., 1998; Cannon &
Manos, 2003; Petit et al., 2003) could serve as a starting point
for aDNA studies. The same holds for plants from the Arctic
(Abbott & Brochmann, 2003) and the Alps (Stehlik, 2003).
Preservation of macromolecules as an indication
for the presence of aDNA
Even in a priori suitable sites, aDNA appears to be retrievable
from only a small fraction of the sample material (Deguilloux
et al., 2002). Therefore, it would be desirable to classify
samples according to their prospect of containing DNA
molecules before starting genetic analyses (Bada et al., 1999).
Macroscopic sample evaluation often appears insufficient and
sample age per se is not unambiguously indicative of the
preservational state of a tissue. Rather, it is the condition of a
sample at the time of burial, its environment during early
storage and the fossilization processes involved that have the
most significant effects on DNA preservation (Yang, 1997).
Still, there is a time effect of sample age on PCR success, as
seen in a study in which wood samples were retrieved along
the cross-section of a tree trunk. Younger tissues from the
outer part of the trunk were more likely to yield DNA for
PCR amplification than were samples from older wood from
the stem’s heart, and there was a better chance of obtaining
longer amplified DNA fragments compared with the older
samples (Deguilloux et al., 2002).
Several measures relying on the preservation of biomolecules
other than nucleic acids have been proposed in order to
estimate whether the presence of aDNA is likely in a given
fossil sample (Bada et al., 1999), and such approaches should
be encouraged. For example, Poinar et al. (1996) introduced
amino acid racemization for this purpose. Racemization refers
to the change of the three-dimensional structure of amino
acids from one form into a mirror form (isomer), resulting in
measurable change in optical behavior. A sufficiently low ratio
of the -form vs the -isomer of specific amino acids is indicative
of the preservation of other macromolecules, such as
DNA (Poinar et al., 1996). Such information supports the
authenticity of subsequent PCR-based findings and precludes
the risk of circular argumentation when relying only on
DNA-based evidence (Bada et al., 1999). Nevertheless, the
analyses of such alternative biomolecules require the same
precautions, with respect to potential contamination from
contemporary tissue, as aDNA studies, and positive results will
not guarantee successful aDNA amplification.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ลักษณะทางพันธุกรรมขั้นตอนที่สำคัญ และจำเป็นเพื่อสนับสนุนข้อมูล allelicน่าแปลกใจ เครื่องหมายไม่เช่นขยายแบบสุ่มpolymorphic ดีเอ็นเอ (RAPDs) ได้ถูกใช้ในบางอินสแตนซ์ ถึงแม้ว่าเทคนิคเหล่านี้ทราบว่ามีแนวโน้มการไม่สอดคล้องกัน แม้ว่าการทำงานกับดีเอ็นเอที่แยกต่างหากจากเนื้อเยื่อสด ข้อดีและข้อจำกัดของเฉพาะควรพิจารณาเครื่องหมายชนิดเมื่อวาง palaeogeneticการศึกษาชิ้นส่วนของพืชที่มักจะประกอบด้วยแอดนาตามหลักวิชา พืช มีความสามารถเก็บระยะยาวควรรักษาแอดนาดี เป็นการศึกษาใช้วัสดุสดหนุ่ม meristematic เนื้อเยื่อ มีความหนาแน่นสูงดีอย่างหนึ่งเซลล์สามารถพิสูจน์เหมาะอย่างยิ่งสำหรับการศึกษา palaeogeneticตัวอย่างเช่นมีโอกาสสูงประกอบด้วย nondegeneratedของดีเอ็นเอเป้าหมายการกระจายตัว โดยเฉพาะอย่างยิ่งจากต่าง ๆออร์แกเนลล์ genomes ต่อเซลล์ ในทำนองเดียวกัน เนื้อเยื่อที่ มีการป้องกันปู เมล็ดพืชและผลไม้ อาจเป็นเป้าหมายของสัญญาในต้นไม้ วัสดุมาก subfossil หรือฟอสซิลมีโมเลกุลการศึกษา จากไม้ใบไม้และเข็ม (Deguilloux et al.,2002, 2003), ผลไม้หรือเมล็ด (สีน้ำตาล 1999 Ziegenhagenและ al., 2003), หรือแม้แต่เดี่ยว pollen ธัญพืช (Suyama et al.,1996) ละอองเกสรเป็นหนึ่งแหล่งสำคัญของ palaeobotanicalข้อมูล แต่มันยังอาจมีประโยชน์สำหรับแอดนาโมเลกุลวิเคราะห์ ผนังภายนอกของธัญพืชละอองเกสรจะทนมากการโจมตีทางกายภาพ และเคมี ในสภาพแวดล้อมที่เหมาะสมเช่นไม่ใช้ตะกอนสะสมที่ด้านล่างทะเลสาบขนาดเล็ก พวกเขาอาจจะเก็บรักษาไว้โดยไม่จำกัดเวลา อย่างไรก็ตามวันที่ มีเพียงหนึ่งเผยแพร่รายงานประสบความสำเร็จขยายดีเอ็นเอจากฟอสซิลละอองเกสร: 1996, rbcL ลำดับอ้างว่า ได้มีการขยายจากญี่ปุ่นแยกธัญพืช pollen Abies เดทจาก 100 000 ปีผ่านมา (Suyamaร้อยเอ็ด al., 1996) ในหลักการ ตัวอย่างละอองเกสร bulked อาจนอกจากนี้ยัง มี analysed ได้ใช้กระบวนการโคลนแยกแต่ละลำดับ ตัวอย่างพืชจากเจาะแกน อย่างไรก็ตาม มีแนวโน้มการปนเปื้อนโดยเฉพาะอย่างยิ่งมีทั้งโบราณ (แต่ จากระยะเวลาที่แตกต่าง) หรือล่าสุดละอองเกสร ดังนั้น ดูแลควรจะดำเนินการขุดพืชฟอสเนื้อเยื่อนอกฤดูดอกไม้ ในทำนองเดียวกัน ตัวอย่างสำหรับสกัดดีเอ็นเอจะเรียกส่วนในห้องแอร์สะอาดภายใต้ความดันสูง และการดูแลควรดำเนินการเพื่อหลีกเลี่ยงการเก็บรวบรวมวัสดุจากพื้นผิวตัวอย่างทางเลือกของสถานสถานการสุ่มตัวอย่างควรจะเลือกอย่างระมัดระวัง กรุณามีโอกาสค้นหาจำนวน wellconserved พอใจซากดึกดำบรรพ์ ดีเอ็นเอมีอยู่เป็นอย่างมากลดลงเมื่อสัมผัสกับอุณหภูมิสูง (Wayne et al., 1999) ดังนั้น การพบว่าเหตุผลในพื้นที่เย็น ที่เนื้อเยื่อมีแนวโน้มที่จะรักษาอย่างดีที่อุณหภูมิต่ำ (เช่นแช่แข็งในดิน permafrost) (Hofreiter et al., 2001b Willerslev et al.,2003) อย่างไร ตาม สภาพแวดล้อมที่แห้งมาก เช่นทะเลทราย มียัง หาแหล่งแอดนาคุณภาพสูง (Poinar et al., 2003)หลักฐานนี้ชี้ให้เห็นว่า อุณหภูมิอาจมีผลต่อดีเอ็นเอเสื่อมเฉพาะทางอ้อม ทางการอิทธิพลน้ำค่ะ ตั้งแต่ของดีเอ็นเอเกี่ยวข้องกับกระบวนการไฮโดรไลติก (Willerslev et al., 2004)ในพื้นที่ป่าเดิม ตะกอนมักมีแมโคร-ยังคงพันธุ์พืชวู้ดดี้ โดยเฉพาะอย่างยิ่งต้นไม้ความมั่งคั่งของข้อมูล phylogeographic ที่อยู่ในป่าซึ่งต้นไม้ (โทมารุและ al., 1998 ปืนใหญ่และManos, 2003 เพทิท et al., 2003) สามารถทำหน้าที่เป็นจุดเริ่มต้นแอดนาศึกษา เดียวกันถือสำหรับพืชจากอาร์กติก(Abbott & Brochmann, 2003) และเทือกเขาแอลป์ (Stehlik, 2003)อนุรักษ์ของ macromolecules เป็นตัวบ่งชี้สำหรับสถานะของแอดนาแม้ในเว็บไซต์เหมาะกับ priori แอดนาปรากฏเป็น retrievableจากเพียงส่วนเล็ก ๆ ของวัสดุตัวอย่าง (Deguillouxและ al., 2002) ดังนั้น มันจะต้องจัดประเภทตัวอย่างตามโอกาสการบรรจุดีเอ็นเอโมเลกุลก่อนที่จะเริ่มวิเคราะห์ทางพันธุกรรม (Bada et al., 1999)ตัวอย่าง macroscopic ประเมินมักจะปรากฏไม่เพียงพอ และตัวอย่างอายุต่อ se ไม่ได้เป็นตัวชี้ให้เห็นอย่างชัดเจนของการเนื้อเยื่อ preservational รัฐ ค่อนข้าง มันเป็นเงื่อนไขของการตัวอย่างที่ฝังศพ สภาพแวดล้อมในระหว่างช่วงเวลาจัดเก็บและ fossilization กระบวนการเกี่ยวข้องที่มีการผลกระทบที่สำคัญที่สุดในการเก็บรักษาดีเอ็นเอ (ยาง 1997)ยัง มีผลเวลาของอายุตัวอย่างที่สำเร็จ PCR เป็นเห็นในการศึกษาในตัวอย่างไม้ที่ถูกดึงมาตามระหว่างส่วนของลำตัว เนื้อเยื่อที่อ่อนกว่าวัยจากการส่วนภายนอกของลำต้นมีแนวโน้มให้ผลผลิตดีเอ็นเอสำหรับPCR ขยายกว่าได้ตัวอย่างจากไม้เก่าหัวใจของก้าน และมีโอกาสดีกว่าขอรับต่อเอาต์ดีเอ็นเอชิ้นส่วนเมื่อเทียบกับตัวเก่าตัวอย่าง (Deguilloux et al., 2002)มาตรการหลายอย่างที่อาศัยการอนุรักษ์ชื่อโมเลกุลชีวภาพอื่นมีกรดนิวคลีอิก การนำเสนอเพื่อประมาณว่า ของแอดนามีแนวโน้มในการกำหนดตัวอย่างฟอสซิล (Bada et al., 1999), และวิธีดังกล่าวควรได้ใจ ตัวอย่าง Poinar และ al. (1996) นำกรดอะมิโน racemization สำหรับวัตถุประสงค์นี้ อ้างอิง racemizationการเปลี่ยนแปลงของโครงสร้างสามมิติของอะมิโนกรดจากฟอร์มหนึ่งเป็นแบบกระจก (หลัง), ในวัดการเปลี่ยนแปลงในพฤติกรรมแสง อัตราส่วนต่ำสุดเพียงพอเทียบกับแบบฟอร์ม-ไอโซเมอร์ของกรดอะมิโนเฉพาะเป็นตัวชี้ให้เห็นของ macromolecules อื่น ๆ การบำรุงรักษาเช่นดีเอ็นเอ (Poinar et al., 1996) สนับสนุนข้อมูลดังกล่าวนี้ความถูกต้องของการค้นพบผลต่อมา และไม่สามารถความเสี่ยงของ argumentation กลมเมื่ออาศัยตามดีเอ็นเอตามหลักฐาน (Bada et al., 1999) อย่างไรก็ตาม การวิเคราะห์ชื่อโมเลกุลชีวภาพทดแทนดังกล่าวจำเป็นต้องเหมือนกันข้อควรระวัง เกี่ยวกับการปนเปื้อนที่อาจเกิดขึ้นจากเนื้อเยื่อที่ทันสมัย แอดนาศึกษา และผลบวกจะไม่รับประกันการขยายแอดนาประสบความสำเร็จ

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

genotype เป็นขั้นตอนที่สำคัญและจำเป็นในการสนับสนุนข้อมูล allelic.
น่าแปลกเครื่องหมายที่ไม่ระบุชื่อเช่นขยายสุ่ม
ดีเอ็นเอ polymorphic (RAPDs) ได้ถูกนำมาใช้ในไม่กี่
กรณีแม้ว่าเทคนิคเหล่านี้เป็นที่รู้จักกันจะมีแนวโน้ม
ที่จะไม่สอดคล้องกันแม้เมื่อทำงานกับดีเอ็นเอที่แยก
จากเนื้อเยื่อสด ข้อดีและข้อ จำกัด ของโดยเฉพาะอย่างยิ่ง
ประเภทเครื่องหมายควรพิจารณาเมื่อมีการวางแผน palaeogenetic
การศึกษา.
ชิ้นส่วนพืชซึ่งมีแนวโน้มที่จะมีadnÃ?
ทฤษฎีพืชมีความสามารถในการจัดเก็บข้อมูลระยะยาวของพวกเขา
ควรรักษาadnÃดี ในฐานะที่เป็นสำหรับการศึกษาโดยใช้วัสดุสด
หนุ่มเนื้อเยื่อเจริญที่มีความหนาแน่นสูงเมื่อเทียบกับ
ของเซลล์สามารถพิสูจน์ได้ว่าเหมาะอย่างยิ่งสำหรับการศึกษา palaeogenetic.
ตัวอย่างดังกล่าวมีโอกาสสูงในการที่มี nondegenerated
สำเนาของดีเอ็นเอเป้าหมายโดยเฉพาะอย่างยิ่งจากหลาย
จีโนมเนลล์ต่อเซลล์ . ในทำนองเดียวกันกับเนื้อเยื่อป้องกัน
ปูเช่นเมล็ดพืชและผลไม้อาจจะเป็นเป้าหมายที่มีแนวโน้ม.
ในต้นไม้ subfossil มากหรือวัสดุฟอสซิลสามารถใช้ได้สำหรับโมเลกุล
ศึกษาจากไม้ใบและเข็ม (Deguilloux et al.,
2002, 2003), ผลไม้ หรือเมล็ด (สีน้ำตาล, 1999; Ziegenhagen
et al., 2003) หรือแม้แต่ละอองเรณูเดียว (. Suyama, et al,
1996) เรณูเป็นหนึ่งในแหล่งสำคัญของ palaeobotanical
ข้อมูล แต่มันก็อาจจะมีประโยชน์สำหรับโมเลกุลadnÃ
วิเคราะห์ ผนังด้านนอกของละอองเรณูมีความทนทานมาก
ต่อการโจมตีทางเคมีและกายภาพ ในสภาพแวดล้อมที่เหมาะสม
เช่นการสะสมตะกอนแบบไร้อากาศที่ด้านล่าง
ของทะเลสาบขนาดเล็กที่พวกเขาอาจจะมีการเก็บรักษาไว้อย่างไม่มีกำหนด แต่
วันที่ได้มีการเพียงหนึ่งรายงานที่ตีพิมพ์ที่ประสบความสำเร็จ
ขยายดีเอ็นเอจากเกสรฟอสซิล: ในปี 1996 ลำดับ rbcL
ถูกอ้างว่าจะได้รับการขยายจากแยกญี่ปุ่น
เกสร Abies ธัญพืชสืบมาจากกว่า 100 000 ปีที่ผ่านมา (Suyama
, et al. 1996) ในหลักการที่มีเนื้อมีหนังตัวอย่างเกสรอาจจะ
ยังได้รับการวิเคราะห์โดยมีเงื่อนไขว่าขั้นตอนการโคลนถูกนำมาใช้
ในการแยกลำดับของแต่ละบุคคล ตัวอย่างพืชจากเจาะ
แกน แต่โดยเฉพาะอย่างยิ่งมีแนวโน้มที่จะปนเปื้อน
กับทั้งโบราณ (แต่จากช่วงเวลาที่แตกต่างกัน) หรือล่าสุด
เกสร ดังนั้นควรดูแลการพบฟอสซิลพืช
เนื้อเยื่อนอกฤดูการออกดอก ในทำนองเดียวกันตัวอย่างสำหรับการ
สกัดดีเอ็นเอจะถูกดึงที่ดีที่สุดในห้องสะอาดอากาศภายใต้
ความดันสูงและการดูแลจะต้องดำเนินการเพื่อหลีกเลี่ยงการเก็บรวบรวม
วัสดุจากพื้นผิวตัวอย่าง.
การเลือกสถานที่ตั้งการสุ่มตัวอย่าง
สถานที่เก็บตัวอย่างควรจะเลือกอย่างระมัดระวังแบริ่งใน
ใจของโอกาส หาตัวเลขที่เพียงพอ wellconserved
ฟอสซิล วิริยะดีเอ็นเอจะลดลงอย่างมากเมื่อ
สัมผัสกับอุณหภูมิสูง (เวย์น et al., 1999) ดังนั้น
บริเวณที่มีแนวโน้มมากที่สุดที่พบในบริเวณที่เย็นที่เนื้อเยื่อ
มีโอกาสที่จะได้รับการเก็บรักษาไว้อย่างดีที่อุณหภูมิต่ำ (เช่นแช่แข็ง
ในดิน permafrost) (Hofreiter และคณะ, 2001b;.. Willerslev, et al,
2003) แต่สภาพแวดล้อมที่แห้งมากเช่นทะเลทรายได้
นอกจากนี้ยังส่งผลให้ผู้ที่มีคุณภาพสูงแหล่งadnà (Poinar et al., 2003).
หลักฐานนี้แสดงให้เห็นว่าอุณหภูมิอาจจะมีประสิทธิภาพ
ต่อการเสื่อมสภาพของดีเอ็นเอเพียงทางอ้อมผ่าน
อิทธิพลกับความพร้อมน้ำเนื่องจากการย่อยสลาย ของดีเอ็นเอ
ที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการย่อยสลาย (Willerslev et al., 2004).
ในพื้นที่ป่าเดิมตะกอนมีแนวโน้มที่จะมี
ซากแมโครของพันธุ์พืชไม้โดยเฉพาะอย่างยิ่งต้นไม้.
ความมั่งคั่งของข้อมูล phylogeographic ปัจจุบันที่มีอยู่
สำหรับต้นไม้ป่าหนาว (Tomaru และ อัล, 1998;. แคนนอนและ
Manos,. 2003; Petit et al, 2003) สามารถใช้เป็นจุดเริ่มต้น
สำหรับการศึกษาadnà เดียวกันถือสำหรับพืชจากอาร์กติก
(แอ็บบอทและ Brochmann 2003) และเทือกเขาแอลป์ (Stehlik 2003).
การดูแลรักษาของโมเลกุลเป็นตัวบ่งชี้
การปรากฏตัวของadnÃ
แม้ในเบื้องต้นสถานที่ที่เหมาะสมadnÃดูเหมือนจะกลับคืน
จากเพียง ส่วนเล็ก ๆ ของวัสดุตัวอย่าง (Deguilloux
et al., 2002) ดังนั้นมันจะเป็นที่น่าพอใจในการจำแนก
กลุ่มตัวอย่างตามความคาดหวังของพวกเขาที่มีดีเอ็นเอ
โมเลกุลก่อนที่จะเริ่มการวิเคราะห์ทางพันธุกรรม (Bada et al., 1999).
การประเมินผลตัวอย่างด้วยตาเปล่ามักจะปรากฏไม่เพียงพอและ
ต่อ se อายุตัวอย่างไม่ได้อย่างไม่น่าสงสัยที่บ่งบอกถึง
สถานะของ preservational เนื้อเยื่อ แต่มันเป็นเงื่อนไขของ
กลุ่มตัวอย่างในเวลาที่ฝังศพ, สภาพแวดล้อมในช่วงแรก
การจัดเก็บข้อมูลและกระบวนการที่เกี่ยวข้องกับกลไกที่มี
ผลกระทบอย่างมีนัยสำคัญมากที่สุดในการเก็บรักษา (DNA ยาง, 1997).
ยังคงมีผลบังคับใช้ช่วงเวลาของอายุของกลุ่มตัวอย่าง กับความสำเร็จ PCR เป็น
เห็นในการศึกษาในกลุ่มตัวอย่างซึ่งไม้ที่ถูกดึงมาพร้อม
ข้ามส่วนของลำต้นของต้นไม้ เนื้อเยื่อน้องจาก
ส่วนนอกของลำต้นมีแนวโน้มที่จะให้ผลผลิตดีเอ็นเอ
ขยาย PCR กว่าเป็นตัวอย่างจากไม้เก่าจาก
หัวใจลำต้นของและมีโอกาสที่ดีกว่าของการได้รับ
การขยายดีเอ็นเออีกต่อไปเมื่อเทียบกับรุ่นเก่า
ตัวอย่าง (Deguilloux และคณะ ., 2002).
มาตรการหลายพึ่งพาการเก็บรักษาของสารชีวโมเลกุล
อื่นที่ไม่ใช่กรดนิวคลีอิกได้รับการเสนอเพื่อ
ประเมินว่าการปรากฏตัวของadnÃมีโอกาสในการได้รับ
ตัวอย่างฟอสซิล (Bada et al., 1999) และวิธีการดังกล่าวควร
จะเป็น การสนับสนุน ตัวอย่างเช่น Poinar และคณะ (1996) แนะนำ
racemization กรดอะมิโนเพื่อการนี้ Racemization หมายถึง
การเปลี่ยนแปลงของโครงสร้างสามมิติของอะมิโน
กรดจากรูปแบบหนึ่งในรูปแบบกระจก (isomer) มีผลใน
การเปลี่ยนแปลงในพฤติกรรมที่วัดแสง อัตราส่วนต่ำเพียงพอ
ของแบบ vs -isomer ของกรดอะมิโนที่เฉพาะเจาะจงเป็นตัวบ่งชี้
ของการเก็บรักษาของโมเลกุลอื่น ๆ เช่น
ดีเอ็นเอ (Poinar et al., 1996) ข้อมูลดังกล่าวสนับสนุน
ความถูกต้องของผลการวิจัยที่ตามมา PCR-based และติ๊ด
ความเสี่ยงของการอภิปรายวงกลมเมื่ออาศัยเฉพาะใน
หลักฐานดีเอ็นเอที่ใช้ (Bada et al., 1999) อย่างไรก็ตาม
การวิเคราะห์ของสารชีวโมเลกุลทางเลือกเช่นเดียวกันต้อง
ระมัดระวังเกี่ยวกับการปนเปื้อนที่อาจเกิดขึ้นจาก
เนื้อเยื่อร่วมสมัย, การศึกษาadnÃและผลในเชิงบวกจะ
ได้รับประกันการขยายadnÃที่ประสบความสำเร็จ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

จีโนไทป์ที่สําคัญและจำเป็นขั้นตอนเพื่อสนับสนุนข้อมูล allelic .
อย่างแปลกใจ เครื่องหมาย นิรนาม เช่น สุ่ม polymorphic DNA ขยาย
( rapds ) ยังถูกใช้ในไม่กี่
กรณี แม้ว่าเทคนิคเหล่านี้เป็นที่รู้จักกันเป็นเสี่ยง
ความไม่สอดคล้องกัน แม้เมื่อทำงานกับดีเอ็นเอที่แยก
จากเนื้อสด ข้อดีและข้อจำกัดของเฉพาะ
ประเภทคะแนนควรพิจารณาเมื่อการวางแผนการศึกษา palaeogenetic
.
ส่วนพืชมีแนวโน้มที่จะมีแอ็ดน่า ?
ตามหลักวิชา , พืชที่มีความสามารถในการจัดเก็บข้อมูลระยะยาวของพวกเขา
แอดนา ควรเก็บรักษาไว้เป็นอย่างดี โดยการศึกษาใช้สดวัสดุ
เด็ก เนื้อเยื่อที่มีความหนาแน่นสูง meristematic
เปรียบเทียบเซลล์สามารถพิสูจน์โดยเฉพาะอย่างยิ่งเหมาะสำหรับ palaeogenetic การศึกษา .
ตัวอย่าง เช่น มีโอกาสสูงที่ nondegenerated
ชุดของชิ้นส่วนดีเอ็นเอเป้าหมาย โดยเฉพาะจากมากมาย
ออร์แกเนลล์จีโนม ต่อเซลล์ ในทำนองเดียวกันเนื้อเยื่อด้วย coverings ป้องกัน
, เช่น เมล็ดพืช และผลไม้ ที่อาจเป็นเป้าหมายของสัญญา .
ในต้นไม้ subfossil หรือวัสดุฟอสซิลมากสามารถใช้ได้สำหรับโมเลกุล
ศึกษา จาก ไม้ ใบไม้ และเข็ม ( deguilloux et al . ,
2002 , 2003 )เมล็ดหรือผลไม้ ( น้ำตาล , 1999 ; ziegenhagen
et al . , 2003 ) หรือแม้แต่ธัญพืช pollen เดี่ยว ( suyama et al . ,
1996 ) เกสรเป็นหนึ่งในแหล่งที่มาของข้อมูล palaeobotanical
แต่มันก็ยังเป็นประโยชน์สำหรับการวิเคราะห์โมเลกุล
แอ็ดน่า . ผนังด้านนอกของเรณูแสนทน
และสารเคมีในการโจมตีทางกายภาพ
ในสภาพแวดล้อมที่เหมาะสมเช่นการสะสมตะกอนที่ก้นถัง
ของทะเลสาบเล็ก ๆ พวกเขาอาจจะถูกดองไม่มีกำหนด อย่างไรก็ตาม
วันที่มีเพียงหนึ่งที่ตีพิมพ์รายงานของดีเอ็นเอจากซากฟอสซิลเรณูสำเร็จ (
: ในปี 1996 rbcl ลำดับ
ถูกอ้างว่าได้ถูกขยายจากแยกญี่ปุ่น
abies เรณูเดทจากกว่า 100 , 000 ปีมาแล้ว ( suyama
et al . , 1996 ) ในหลักการยกตัวอย่างละอองเรณูอาจ
ยังถูกวิเคราะห์ โดยขั้นตอนการใช้
แยกลำดับแต่ละ โรงงานตัวอย่าง จากเจาะ
แกน , อย่างไรก็ตาม , โดยเฉพาะอย่างยิ่งมักจะปนเปื้อน
ทั้งโบราณ ( แต่จากช่วงเวลาที่แตกต่างกัน ) หรือเกสรล่าสุด

ดังนั้น จึงควรดูแลการขุดเนื้อเยื่อพืช
ฟอสซิลนอกฤดูออกดอก . ตัวอย่าง
ในทํานองเดียวกันการสกัดดีเอ็นเอที่ดีที่สุดออกมาในอากาศสะอาดในห้องใต้
ยกระดับแรงดัน และควรดูแลเพื่อหลีกเลี่ยงการเก็บรวบรวมวัสดุจากพื้นผิวตัวอย่าง
.

เลือกที่ตั้งสถานที่ตัวอย่างการสุ่มตัวอย่างควรจะเลือกอย่างระมัดระวัง เรืองในจิตโอกาสในการหาตัวเลขที่เพียงพอของ wellconserved
ซากฟอสซิล เก็บรักษาดีเอ็นเอจะลดลงเมื่อ
อย่างมากสัมผัสกับอุณหภูมิสูง ( เวย์น et al . , 1999 ) ดังนั้น เหตุผลที่เป็นไปได้มากที่สุด
พบในพื้นที่อากาศหนาวเย็นที่เนื้อเยื่อ
มีแนวโน้มที่จะถูกเก็บรักษาไว้อย่างดีที่อุณหภูมิต่ำ ( เช่นแช่แข็ง
ใน permafrost ( ดิน ) hofreiter et al . , 2001b ;
willerslev et al . , 2003 ) อย่างไรก็ตาม สภาพแวดล้อมที่แห้งมาก เช่น ทะเลทรายมี
ยังให้ผลแอดนา คุณภาพสูง ( แหล่ง พอยนาร์ et al . , 2003 ) .
หลักฐานนี้ชี้ให้เห็นว่า อุณหภูมิอาจจะมีประสิทธิภาพต่อ DNA ของเซลล์เท่านั้น

ในทางอ้อม ผ่านอิทธิพลของน้ำไปใช้ เนื่องจากการย่อยสลายของดีเอ็นเอที่เกี่ยวข้องกับกระบวนการย่อยสลาย (
willerslev et al . , 2004 ) .
ในพื้นที่ป่าเดิม ตะกอนมักจะประกอบด้วย
Macro ยังคงอยู่ของสายพันธุ์พืช โดยเฉพาะต้นไม้
วู้ดดี้ .ความมั่งคั่งของข้อมูลที่สามารถใช้ได้สำหรับป่าไม้เมืองหนาว
phylogeographic ( tomaru et al . , 1998 ; ปืนใหญ่&
มือ , 2003 ; Petit et al . , 2003 ) สามารถใช้เป็นจุดเริ่มต้น
สำหรับแอ็ดน่าศึกษา เดียวกันถือสำหรับพืชจากขั้วโลกเหนือ
( Abbott & brochmann , 2003 ) และเทือกเขาแอลป์ ( stehlik , 2003 ) .
รักษาของโมเลกุลเป็นข้อบ่งชี้สำหรับการปรากฏตัวของแอ็ดน่า

แม้ใน priori เหมาะเว็บไซต์แอดนา ปรากฏเป็น retrievable
จากเพียงส่วนเล็ก ๆของวัสดุตัวอย่าง ( deguilloux
et al . , 2002 ) ดังนั้น มันก็คงจะถูกใจแบ่ง
ตัวอย่างตามหันหน้าที่มีดีเอ็นเอ
โมเลกุลก่อนที่จะเริ่มวิเคราะห์พันธุกรรม ( บาดา et al . , 1999 ) .
ประเมินผลตัวอย่างมีไม่เพียงพอและมักจะปรากฏ
ตัวอย่างอายุต่อ se ไม่ได้กัน
preservational บ่งบอกถึงสภาพของเยื่อ แต่มันเป็นเงื่อนไขของ
ตัวอย่างตอนงานศพ สภาพแวดล้อมในช่วงต้น
กระเป๋าและซากดึกดำบรรพ์เกี่ยวข้องกับกระบวนการที่มีผลสำคัญในการเก็บรักษา DNA ( Yang , 1997 ) .
ยัง มีเวลา ผลของอายุใน PCR ตัวอย่างความสำเร็จ ตามที่
เห็นในการศึกษาตัวอย่างไม้ที่ถูกดึงตาม
ขนาดของลำต้นไม้ น้องใช้
ส่วนด้านนอกของลำต้นมีแนวโน้มผลผลิต PCR DNA amplification
กว่าตัวอย่างจากไม้เก่า
หัวใจของลำต้น และมีโอกาสได้รับ
อีกต่อไปขยายดีเอ็นเอเปรียบเทียบกับตัวอย่างเก่า
( deguilloux et al . , 2002 ) .
มาตรการหลายอย่างอาศัยการเก็บรักษาของสารชีวโมเลกุล กรดนิวคลีอิก
นอกจากได้รับการเสนอเพื่อประเมินว่า

มีแอดนา มีโอกาสในได้รับ
ซากดึกดำบรรพ์ตัวอย่าง ( บาดา et al . , 1999 ) , และวิธีการดังกล่าวควร
ได้รับการส่งเสริม ตัวอย่างเช่น พอยนาร์ et al . ( 1996 ) แนะนำ
ราเซไมด์เซชันกรดอะมิโนเพื่อวัตถุประสงค์นี้
ราเซไมด์เซชัน หมายถึงการเปลี่ยนแปลงของโครงสร้างสามมิติของโปรตีน
กรดจากรูปแบบหนึ่งเป็นกระจกรูปแบบ ( เซ็นเตอร์ ) ส่งผล
เปลี่ยนพฤติกรรมที่วัดได้ในแสง ต่ำเพียงพอ อัตราส่วนของ
- vs - ไอโซเมอร์ของรูปแบบเฉพาะกรดอะมิโนบ่งบอกถึง
การอนุรักษ์ของโมเลกุลใหญ่อื่น ๆเช่น
( ดีเอ็นเอ พอยนาร์ et al . , 1996 ) ข้อมูลดังกล่าวสนับสนุน
ความถูกต้องของวิธี PCR ที่ตามมาจากการพบและขจัดความเสี่ยงของการโต้แย้ง เมื่อวงกลม

อาศัยเฉพาะในดีเอ็นเอตามหลักฐาน ( บาดา et al . , 1999 ) อย่างไรก็ตาม การวิเคราะห์ทางเลือกสารชีวโมเลกุล เช่น

ต้องปลอดภัยไว้ก่อน ส่วนการปนเปื้อนที่อาจเกิดขึ้นจาก
เนื้อเยื่อร่วมสมัยเป็นแอ็ดน่าศึกษาและผลในเชิงบวกจะไม่รับประกัน
( แอดนา ประสบความสำเร็จ