The use of biotin hydrazide was cru

The use of biotin hydrazide was crucial in the discovery of patterns of
protein damagewithin the proteome. However, these studies were limited
by the presence of high background due to the lack of an efficient way
to elute adduction proteins from affinity columns as well as to crossreactivity
of biotin hydrazide with endogenous carbonyls [43,44]. Additionally,
the inability to remove the biotin moiety from target protein adducts
makes mass spectrometry analyses of isolated proteins difficult. This occurs
because the biotin appendage alters MS/MS fragmentation patterns
and prevents the identification of peptide adduction sites [44,49]. In
order to reduce high background proteins in proteomic adduct inventories,
it was necessary to synthesize a biotin linker that could be easily released
from target protein adducts to improve MS/MS identification of
adducted proteins. A newly synthesized click reagent containing azido
and biotin groups separated by a photocleavable linker improves upon
these preliminary affinity purification studies and allows the isolation of
a protein mixture enriched in adducted proteins (Fig. 4) [50]. Importantly,
by removing the biotinmoiety, this approach allowed the LC–MS/MS detection
of specific modification sites on proteins. Thus, such affinity
purification-photorelease strategies improve the capability to isolate
and identify specific lipid electrophile modifications to proteins from
complex biological mixtures.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การใช้ไบโอติน hydrazide เป็นสิ่งสำคัญในการค้นพบรูปแบบของโปรตีน damagewithin proteome การ อย่างไรก็ตาม การศึกษาเหล่านี้ถูกจำกัดโดยสถานะของพื้นหลังที่สูงเนื่องจากขาดวิธีที่มีประสิทธิภาพการ elute adduction โปรตีนจากความเกี่ยวข้องของคอลัมน์เช่นเป็น crossreactivityของ hydrazide ไบโอตินกับ carbonyls endogenous [43,44] นอกจากนี้ไม่สามารถออก moiety ไบโอตินโปรตีนเป้าหมาย adductsทำให้ mass spectrometry วิเคราะห์ของโปรตีนแยกยาก นี้เกิดขึ้นเนื่องจากในไบโอตินเพียงอวัยวะประกอบเปลี่ยนแปลงรูปแบบการกระจายตัวของ MS/MSและป้องกันไม่ให้รหัสของเพปไทด์ adduction ไซต์ [44,49] ในสั่งลดโปรตีนสูงพื้นหลังใน proteomic adduct คงก็จำเป็นต้องสังเคราะห์ตัวเชื่อมโยงข้อมูลกับไบโอตินที่ไม่ได้ปล่อยจากเป้าหมาย โปรตีน adducts เพื่อปรับปรุงรหัส MS/MSโปรตีน adducted สังเคราะห์ใหม่คลิรีเอเจนต์ที่ประกอบด้วย azidoและไบโอตินกลุ่มคั่น ด้วยตัวเชื่อมโยงข้อมูล photocleavable เพิ่มขึ้นฟอกความสัมพันธ์เบื้องต้นเหล่านี้ศึกษา และช่วยให้โดดเดี่ยวส่วนผสมโปรตีนอุดมไปใน adducted โปรตีน (Fig. 4) [50] ที่สำคัญโดยการเอาออก biotinmoiety วิธีการนี้สามารถตรวจหา LC – MS/MSของเว็บไซต์แก้ไขเฉพาะในโปรตีน ดังนั้น เช่นความสัมพันธ์ฟอก photorelease กลยุทธ์ปรับปรุงความสามารถในการแยกและระบุเฉพาะไขมัน electrophile ปรับเปลี่ยนโปรตีนจากส่วนผสมทางชีวภาพที่ซับซ้อน

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ใช้ hydrazide ไบโอตินมีความสำคัญในการค้นพบรูปแบบของ
โปรตีน damagewithin โปรตีน อย่างไรก็ตามการศึกษาเหล่านี้ถูก จำกัด
ด้วยการปรากฏตัวของพื้นหลังที่สูงเนื่องจากการขาดวิธีที่มีประสิทธิภาพ
ในการชะโปรตีน adduction จากคอลัมน์สัมพันธ์ที่ใกล้ชิดเช่นเดียวกับ crossreactivity
ของ hydrazide ไบโอตินที่มีสำเนาภายนอก [43,44] นอกจากนี้
ไม่สามารถที่จะเอาครึ่งหนึ่งไบโอตินจาก adducts โปรตีนเป้าหมาย
ทำให้มวลสารวิเคราะห์ของโปรตีนที่แยกยาก นี้เกิดขึ้น
เพราะรยางค์ไบโอติน alters MS / MS รูปแบบการกระจายตัว
และป้องกันไม่ให้บัตรประจำตัวของเว็บไซต์เปปไทด์ adduction [44,49] ใน
การสั่งซื้อเพื่อลดโปรตีนพื้นหลังที่สูงในสินค้าคงเหลือดึงเข้าหาโปรตีโอมิ
มันเป็นสิ่งจำเป็นในการสังเคราะห์ไบโอตินตัวเชื่อมโยงที่อาจได้รับการปล่อยตัวได้อย่างง่ายดาย
จาก adducts โปรตีนเป้าหมายที่จะปรับปรุงการระบุ MS / MS ของ
โปรตีน adducted น้ำยาคลิกสังเคราะห์ใหม่ที่มี azido
กลุ่มและไบโอตินแยกจากกันโดยลิงเกอร์ photocleavable ปรับปรุงเมื่อ
ศึกษาความสัมพันธ์ของการทำให้บริสุทธิ์เบื้องต้นเหล่านี้และช่วยให้แยก
ส่วนผสมโปรตีนที่อุดมด้วยโปรตีน adducted (รูปที่ 4). [50] ที่สำคัญ
โดยการเอา biotinmoiety วิธีการนี้ได้รับอนุญาต LC-MS / MS การตรวจสอบ
เว็บไซต์ที่เฉพาะเจาะจงในการปรับเปลี่ยนโปรตีน ดังนั้นสัมพันธ์ที่ใกล้ชิดเช่น
บริสุทธิ์ photorelease กลยุทธ์การปรับปรุงความสามารถในการแยก
และระบุการปรับเปลี่ยน electrophile ไขมันที่เฉพาะเจาะจงกับโปรตีนจาก
สารผสมทางชีวภาพที่ซับซ้อน

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ใช้ไบโอตินไฮดราไซด์เป็นสําคัญในการค้นพบรูปแบบของโปรตีน ซึ่งโปรตีน damagewithin
. อย่างไรก็ตาม การศึกษาเหล่านี้ถูก จำกัด โดยมีพื้นหลัง
สูงเนื่องจากการขาดของวิธีที่มีประสิทธิภาพเพื่อ elute
โปรตีนหุบจากคอลัมน์ความสัมพันธ์ ตลอดจน crossreactivity
ของไฮดราไซด์กับไบโอตินใน carbonyls [ 43,44 ] นอกจากนี้
ไม่สามารถลบเป้าหมายโปรตีนไบโอตินกึ่งหนึ่งจาก adducts
ทำให้มวลสารการวิเคราะห์โปรตีนที่แยกได้ยาก ปัญหานี้เกิดขึ้นเนื่องจาก biotin รยางค์ไป

MS / MS รูปแบบการกระจายตัวและป้องกันไม่ให้ตัวของเปปไทด์ adduction เว็บไซต์ [ 44,49 ] ใน
เพื่อลดพื้นหลังสูงในโปรตีนโปรตีน
แอดดักต์สินค้าคงคลังมันเป็นสิ่งจำเป็นที่จะสังเคราะห์ไบโอตินโปรแกรมเชื่อมโยงที่สามารถได้อย่างง่ายดายออก
จาก adducts โปรตีนเป้าหมายเพื่อปรับปรุง MS / MS ตัว
adducted โปรตีน สังเคราะห์สารเคมีที่มีใหม่คลิก azido
และกลุ่มเซเลบริตี้แยกจากกันโดยโปรแกรมเชื่อมโยง photocleavable ปรับปรุงเมื่อ
เหล่านี้การศึกษาความสัมพันธ์และบำบัดน้ำเสียเบื้องต้นให้แยก
โปรตีนผสมที่อุดมด้วยโปรตีนใน adducted ( รูปที่ 4 ) [ 50 ] ที่สําคัญ
โดยเอา biotinmoiety วิธีการนี้อนุญาตให้ LC MS / MS และการปรับเปลี่ยนเว็บไซต์
เฉพาะโปรตีน ดังนั้น เช่น affinity
ฟอก photorelease กลยุทธ์ปรับปรุงความสามารถในการแยกและระบุการปรับเปลี่ยนฝาในไขมัน

โดยเฉพาะโปรตีนจากส่วนผสมทางชีวภาพที่ซับซ้อน .