This study aimed to explore the und

This study aimed to explore the underlying molecular mechanisms of osteoarthritis (OA) by bioinformatics analysis. Synovial tissue samples from five OA and five normal donors (ND) were used to identify the differentially expressed genes (DEGs) by paired t-test. Pathway enrichment analysis of DEGs was performed, followed by construction of a protein–protein interaction (PPI) network. A functional enrichment analysis of the modules identified from the PPI network was performed, and the module with the highest enrichment scores was selected for pathway enrichment analysis. A total of 184 DEGs, including 95 up-regulated and 89 down-regulated DEGs, were identified. Up-regulated DEGs were enriched in 6 pathways, such as MAPK signaling and Wnt signaling pathway, while down-regulated DEGs were mainly enriched in glycolysis/gluconeogenesis. In the PPI network, PTTG1 with the highest connectivity degree of 18 was significantly related to nuclear division, mitosis and the cell cycle. Genes in Module A with the highest functional enrichment scores of 9.27 were mainly enriched in the pathways of oocyte meiosis, cell cycle, ubiquitin mediated proteolysis and progesterone-mediated oocyte maturation. The MAPK signaling and Wnt signaling pathways were closely associated with OA. The DEGs, such as PTTG1, MAP2K6, PPP3CC and CSNK1E, may be the potential targets for OA diagnosis and treatment.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อสำรวจกลไกระดับโมเลกุลพื้นฐานของโรคข้อเข่าเสื่อม (OA) โดยวิเคราะห์ bioinformatics ตัวอย่างเนื้อเยื่อจากห้าโอและผู้บริจาคปกติห้า (ND) ถูกใช้ในการระบุยีนที่แสดง differentially (DEGs) โดยทดสอบ t คู่ เพิ่มคุณค่าการเดินวิเคราะห์ DEGs ทำ ตาม ด้วยโปรตีน – โปรตีนเชิงโต้ตอบ (PPI) ดำเนินการวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่างานของโมดูลที่ระบุจากเครือข่าย PPI และเลือกโมดูลที่ มีคะแนนเพิ่มคุณค่าสูงสุดสำหรับการวิเคราะห์การเพิ่มคุณค่าทาง จำนวน 184 DEGs รวม 95 ขึ้นควบคุม และระบุ DEGs ควบคุมลง 89 ควบคุมค่า DEGs ได้เสริมในเส้นทางที่ 6 เช่นสัญญาณ MAPK และ Wnt ส่งสัญญาณเดิน ในขณะที่ส่วนใหญ่ถูกอุดม DEGs กำกับลงใน glycolysis/สร้าง กลูโคส ในเครือข่าย PPI, PTTG1 พร้อมเชื่อมต่อในระดับสูงสุด 18 ถูกมากเกี่ยวข้องกับนิวเคลียร์ฝ่าย ไมโทซิส และรอบเซลล์ ยีนในโมดูลกับการเพิ่มคุณค่าทำงานสูงสุดที่คะแนนของ 9.27 เทาถูกส่วนใหญ่ไปในทางเดินของ oocyte โครโมโซม วงจร ubiquitin มี proteolysis และการเจริญเติบโตมีโปรเจสเตอโร oocyte เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับโอสัญญาณ MAPK และ Wnt ทางส่งสัญญาณได้ DEGs เช่น PTTG1, MAP2K6, PPP3CC และ CSNK1E อาจเป็นเป้าหมายศักยภาพโอวินิจฉัยและรักษา

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

การศึกษาครั้งนี้มีวัตถุประสงค์เพื่อสำรวจกลไกระดับโมเลกุลพื้นฐานของโรคข้อเข่าเสื่อม (OA) โดยการวิเคราะห์ชีวสารสนเทศ ตัวอย่างเนื้อเยื่อจากไขข้อห้าโอเอและห้าผู้บริจาคปกติ (ND) ถูกนำมาใช้ในการระบุการแสดงออกของยีนที่แตกต่างกัน (degs) โดยจับคู่ t-test การวิเคราะห์ทางเดินเพิ่มคุณค่าของ degs ได้ดำเนินการตามการก่อสร้างของการปฏิสัมพันธ์โปรตีนเครือข่าย (PPI) การวิเคราะห์การเพิ่มปริมาณการทำงานของโมดูลที่ระบุจากเครือข่าย PPI ได้รับการดำเนินการและโมดูลที่มีคะแนนเพิ่มปริมาณสูงสุดที่ได้รับเลือกสำหรับการวิเคราะห์ทางเดินการเพิ่มปริมาณ รวมเป็น 184 degs รวมทั้ง 95 ขึ้นควบคุมและ 89 degs ควบคุมลงได้ระบุ ขึ้นควบคุม degs ถูกอุดมใน 6 ทุลักทุเลเช่น MAPK การส่งสัญญาณและการส่งสัญญาณ wnt ทางเดินในขณะที่ degs ควบคุมลงผสานส่วนใหญ่ใน glycolysis / gluconeogenesis ในเครือข่ายของ PPI ที่ PTTG1 ที่มีระดับการเชื่อมต่อสูงสุด 18 มีความสัมพันธ์อย่างมีนัยสำคัญไปสู่​​การแบ่งนิวเคลียร์เซลล์และวงจรเซลล์ ยีนในโมดูลที่มีคะแนนเพิ่มปริมาณการทำงานสูงสุดของ 9.27 ส่วนใหญ่ที่อุดมด้วยทางเดินของเซลล์ชนิดหนึ่งเซลล์วัฏจักรของเซลล์ ubiquitin proteolysis ไกล่เกลี่ยและ progesterone พึ่งการเจริญเติบโตของเซลล์ สัญญาณ MAPK และ Wnt เส้นทางการส่งสัญญาณที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดกับโอเอ degs เช่น PTTG1, MAP2K6, PPP3CC และ CSNK1E, อาจจะเป็นเป้าหมายที่มีศักยภาพสำหรับการวินิจฉัยและการรักษาที่โอเอ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

การศึกษานี้มุ่งที่จะศึกษาถึงกลไกระดับโมเลกุลของโรคข้อเข่าเสื่อม ( OA ) โดยการวิเคราะห์ชีวสารสนเทศ synovial เนื้อเยื่อตัวอย่างจากห้า OA และห้าผู้บริจาคปกติ ( ND ) ถูกใช้เพื่อระบุแสดงออกแตกต่างกันยีน ( degs ) โดยใช้ paired t-test การวิเคราะห์เส้นทางของการ degs ได้ดําเนินการ ตามด้วยการสร้างโปรตีนและโปรตีนปฏิสัมพันธ์ ( PPI ) เครือข่าย การวิเคราะห์การทำหน้าที่ของโมดูลที่ระบุจากเครือข่ายการ PPI และโมดูลที่มีคะแนนสูงสุดการเลือกวิเคราะห์เสริมเส้นทาง ทั้งหมด 184 degs รวมทั้งสามารถควบคุมและ 95 89 ลง degs , ระบุ ขึ้นเป็นระเบียบ degs มีอุดมใน 6 เส้นทาง เช่น mapk Signaling และส่งสัญญาณทางช่อง WNT ในขณะที่ลงระเบียบ degs ส่วนใหญ่อุดมสมบูรณ์ในไกลโคไลสิส / กลูโคนีโอเจเนซิส . ในประเทศเครือข่าย pttg1 กับการเชื่อมต่อสูงสุดระดับ 18 มีความสัมพันธ์กับการแบ่งนิวเคลียส เซลล์และวัฏจักรของเซลล์ ยีนในโมดูลที่มีสูงสุดการทำงานเสริมคะแนน 9.27 ส่วนใหญ่อุดมสมบูรณ์ในทางเดินของไข่ระยะไมโอซิสเซลล์วงจรข้างนอกโดยโปรตีโ ลซิสและฮอร์โมนไข่เพื่อบ่ม การ mapk ส่งสัญญาณช่อง WNT สัญญาณเซลล์และมีสัมพันธ์อย่างใกล้ชิดกับ OA การ degs เช่น pttg1 map2k6 ppp3cc , และ , csnk1e อาจเป็นเป้าหมายที่มีศักยภาพสำหรับการวินิจฉัยโรค OA และการรักษา