Suppressive subtractive hybridizati

Suppressive subtractive hybridization (SSH) is a technique
that can identify DNA segments, which are present
in one bacterial genome but absent from another
closely related genome or a group (Peng et al. 2011).
SSH is utilized to compare the genomic content of
closely related bacterial species. Strain-specific DNA
fragments can be isolated by this method and compared
to sequences of known genes or proteins, thus linking
functional data to unique DNA fragments within the
compared genomes. Galbraith et al. (2004) performed
SSH using total genomic DNA isolated from rumen
fluid samples of two hay-fed steers, arbitrarily designated
as tester or driver. A total of 96 subtraction DNA
fragments from the tester metagenome were amplified
and cloned, and the DNA sequences were determined.
Tester-specific SSH fragments were found in 95 of 96
randomly selected clones. DNA sequences analysis of
subtraction fragments revealed that large differences
exists in archaeal community structure between the rumen
of two steers fed identical diets and housed together.
In another study, Peng et al. (2011) developed and
validated a qPCR method based on a strain-specific
DNA fragment identified by SSH that has applications
in sensitive monitoring of Propionibacterium acidipropionici
P169 in both animal feed and rumen fluid.
Authors claimed that SSH-generated sequence can be
employed as a strain-specific molecular marker.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

Suppressive subtractive hybridization (SSH) เป็นเทคนิคการที่สามารถระบุส่วน ดีเอ็นเอที่มีอยู่ในจีโนมแบคทีเรียหนึ่งแต่มาจากกลุ่มที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดหรือกลุ่ม (Peng et al. 2011)SSH ใช้เพื่อเปรียบเทียบเนื้อหาของ genomicสายพันธุ์แบคทีเรียที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิด ต้องใช้เฉพาะดีเอ็นเอสามารถจะแยกต่างหาก โดยวิธีนี้ และเปรียบเทียบการลำดับรู้จักยีนหรือโปรตีน การเชื่อมโยงดังนั้นชิ้นส่วนดีเอ็นเอเฉพาะข้อมูลทำงานภายในเปรียบเทียบ genomes ทำ Galbraith et al. (2004)SSH ใช้ genomic DNA ทั้งหมดที่โดดเดี่ยวต่อตัวอย่างของเหลวสองเลี้ยงเฮย์สำเร็จ โดยกำหนดเป็นเครื่องวัดหรือโปรแกรมควบคุม จำนวน 96 ลบดีเอ็นเอจากการทดสอบ metagenome ถูกขยายและ โคลน และมีกำหนดลำดับดีเอ็นเอพบชิ้นส่วนเครื่องวัดเฉพาะ SSH ใน 95 96โคลนแบบสุ่มเลือก การวิเคราะห์ลำดับดีเอ็นเอของเปิดเผยบางส่วนของลบที่แตกต่างขนาดใหญ่มีอยู่ในโครงสร้างชุมชน archaeal ระหว่างต่อสองปัญหาอาหารเลี้ยงดูเหมือนกัน และห้องพักด้วยกันในการศึกษาอื่น Peng et al. (2011) พัฒนา และตรวจสอบวิธี qPCR ตามหนึ่ง ๆ ต้องใช้ส่วนดีเอ็นเอระบุ SSH ที่มีโปรแกรมประยุกต์ตรวจสอบสำคัญของ Propionibacterium acidipropioniciP169 ในน้ำมันอาหารและต่อทั้งสัตว์ผู้เขียนอ้างว่า ลำดับสร้าง SSH สามารถทำงานเป็นการเฉพาะต้องใช้โมเลกุลเครื่องหมาย

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ไฮบริปราบ subtractive (SSH) เป็นเทคนิค
ที่สามารถระบุส่วนดีเอ็นเอซึ่งมีอยู่
ในจีโนมของเชื้อแบคทีเรียหนึ่ง แต่ขาดจากที่อื่น
จีโนมที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดหรือกลุ่ม (Peng et al. 2011).
SSH ถูกนำมาใช้เพื่อเปรียบเทียบเนื้อหาของจีโนม
อย่างใกล้ชิด สายพันธุ์แบคทีเรียที่เกี่ยวข้อง ดีเอ็นเอสายพันธุ์เฉพาะ
ชิ้นส่วนที่สามารถแยกได้โดยวิธีการนี้และเมื่อเทียบกับ
การลำดับของยีนที่เป็นที่รู้จักหรือโปรตีนจึงเชื่อมโยง
ข้อมูลที่ทำงานเพื่อดีเอ็นเอซ้ำกันภายใน
จีโนมเปรียบเทียบ Galbraith และคณะ (2004) ดำเนินการ
SSH โดยใช้ดีเอ็นเอทั้งหมดที่แยกได้จากกระเพาะรูเมน
ตัวอย่างน้ำลายของทั้งสองโคฟางเลี้ยงกำหนดโดยพล
เป็นผู้ทดสอบหรือคนขับ ทั้งหมดจาก 96 ลบดีเอ็นเอ
ชิ้นส่วนจาก metagenome ทดสอบถูกขยาย
และโคลนและลำดับดีเอ็นเอได้รับการพิจารณา.
เศษ SSH Tester เฉพาะที่พบใน 95 จาก 96
โคลนสุ่มเลือก ดีเอ็นเอวิเคราะห์ลำดับของ
ชิ้นส่วนการลบเปิดเผยว่าแตกต่างกันมาก
มีอยู่ในโครงสร้างชุมชน archaeal ระหว่างกระเพาะรูเมน
ของทั้งสองโคได้รับอาหารที่เหมือนกันและอยู่ด้วยกัน.
ในการศึกษาอื่น Peng และคณะ (2011) การพัฒนาและ
การตรวจสอบวิธีการ qPCR ขึ้นอยู่กับสายพันธุ์เฉพาะ
ชิ้นดีเอ็นเอระบุ SSH ที่มีการใช้งาน
ในการตรวจสอบที่มีความสำคัญของ Propionibacterium acidipropionici
P169 ในอาหารสัตว์และกระเพาะของเหลว.
ผู้เขียนอ้างว่าลำดับ SSH สร้างสามารถ
ใช้เป็น เครื่องหมายโมเลกุลสายพันธุ์เฉพาะ

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ปราบปรามการหักออก hybridization ( SSH ) เป็นเทคนิคที่สามารถระบุกลุ่ม

ดีเอ็นเอซึ่งมีอยู่ในจีโนมแบคทีเรีย แต่ขาดอีก
เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดจีโนมหรือกลุ่ม ( Peng et al . 2011 )
SSH คือใช้การเปรียบเทียบจีโนมของแบคทีเรีย
เนื้อหาที่เกี่ยวข้องอย่างใกล้ชิดชนิด สายพันธุ์เฉพาะดีเอ็นเอ
เศษที่สามารถแยกได้โดยวิธีนี้ และเมื่อเปรียบเทียบ
การลำดับของยีนหรือโปรตีนที่รู้จักกัน ดังนั้น การเชื่อมโยงข้อมูลการทำงานเพื่อกันเศษ

เทียบดีเอ็นเอในจีโนม . กัลเบรธ et al . ( 2547 ) การใช้รวม
SSH ดีเอ็นเอที่แยกได้จากตัวอย่างของเหลวอาหาร
2 หญ้าเลี้ยงโค , พลเขต
เป็นเครื่องวัด หรือคนขับรถ ทั้งหมด 96 ลบ DNA
เศษจากเครื่องวัด metagenome ถูกขยายและโคลน
,และลำดับดีเอ็นเอวิเคราะห์ .
ทดสอบเฉพาะชิ้นส่วน SSH พบ 95 96
สุ่มเลือกโคลน การวิเคราะห์ลำดับเบสดีเอ็นเอพบว่า

ลบความแตกต่างขนาดใหญ่ที่มีอยู่ในโครงสร้างชุมชน archaeal ระหว่าง Rumen
2 เพศผู้ที่ได้รับอาหารที่เหมือนกันและตั้งอยู่ด้วยกัน
ในการศึกษาอื่น Peng et al . ( 2011 ) พัฒนาและ
เป็นวิธีการตรวจสอบ qpcr ตามสายพันธุ์ที่เฉพาะเจาะจง
ดีเอ็นเอระบุ SSH มีการตรวจสอบความไวของเชื้อ Propionibacterium acidipropionici

p169 ทั้งอาหารสัตว์และอาหารเหลว .
ผู้เขียนอ้างว่า SSH สามารถใช้สร้างลำดับ
สายพันธุ์เฉพาะโมเลกุลเครื่องหมาย