AbstractA total of 2414 new di-, tr

Abstract
A total of 2414 new di-, tri- and tetra-nucleotide non-redundant SSR primer pairs, representing
2240 unique marker loci, have been developed and experimentally validated for rice (Oryza sativa L.).
Duplicate primer pairs are reported for 7% (174) of the loci. The majority (92%) of primer pairs were
developed in regions flanking perfect repeats ≥ 24 bp in length. Using electronic PCR (e-PCR) to align
primer pairs against 3284 publicly sequenced rice BAC and PAC clones (representing about 83% of the
total rice genome), 65% of the SSR markers hit a BAC or PAC clone containing at least one genetically
mapped marker and could be mapped by proxy. Additional information based on genetic mapping and
“nearest marker” information provided the basis for locating a total of 1825 (81%) of the newly designed
markers along rice chromosomes. Fifty-six SSR markers (2.8%) hit BAC clones on two or more different
chromosomes and appeared to be multiple copy. The largest proportion of SSRs in this data set correspond
to poly(GA) motifs (36%), followed by poly(AT) (15%) and poly(CCG) (8%) motifs. AT-rich microsatellites
had the longest average repeat tracts, while GC-rich motifs were the shortest. In combination with
the pool of 500 previously mapped SSR markers, this release makes available a total of 2740 experimentally
confirmed SSR markers for rice, or approximately one SSR every 157 kb.
Key words: simple sequence repeats (SSR); rice (Oryza sativa L.); electronic PCR (e-PCR)

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

บทคัดย่อจำนวน 2414 ใหม่ di- tri - และนิวคลีโอ ไทด์ tetra ไม่ซ้ำ SSR พื้นคู่ แทน2240 เครื่องหมายเฉพาะ loci มีการพัฒนา และตรวจในข้าว (Oryza ซา L.) experimentallyคู่รองพื้นซ้ำรายงาน 7% (174) loci ส่วนใหญ่ (92%) คู่รองพื้นได้พัฒนาในภูมิภาค flanking ทำซ้ำโก≥ 24 bp ความยาว ใช้ PCR อิเล็กทรอนิกส์ (อี-PCR) ตำแหน่งรองพื้นคู่กับ 3284 ตามลำดับเผยข้าวบัคและแพ็กโคลน (ประมาณ 83% ของตัวแทนข้าวรวมกลุ่ม), 65% เครื่องหมาย SSR ตีราคาโคลนบัคหรือแพ็กประกอบด้วยอย่างน้อยหนึ่งแปลงพันธุกรรมเครื่องหมายแมป และไม่สามารถแมป โดยพร็อกซี ข้อมูลเพิ่มเติมตามแผนที่ทางพันธุกรรม และ"ใกล้เครื่องหมาย" ข้อมูลเป็นข้อมูลพื้นฐานสำหรับการค้นหาทั้งหมด 1825 (81%) ของการออกแบบใหม่เครื่องหมายตามข้าว chromosomes เครื่องหมาย SSR เอ็ด (2.8%) ตีบัคโคลนสอง หรือแตกต่างกันมากchromosomes และปรากฏ ว่าถ่าย สัดส่วนที่ใหญ่ที่สุดของ SSRs ในชุดข้อมูลนี้สอดคล้องความ poly(GA) (36%), ตาม ด้วย poly(AT) (15%) และ poly(CCG) (8%) ความ Microsatellites อุดมไปด้วยมีสูงเฉลี่ยซ้ำรามิด ขณะที่ความรวย GC สั้นที่สุด ร่วมกับสระว่ายน้ำ 500 ก่อนหน้านี้แมปเครื่องหมาย SSR รุ่นนี้ทำให้มีจำนวน 2740 experimentallyยืนยันเครื่องหมาย SSR ข้าว หรือประมาณหนึ่ง SSR kb ทุก 157คำสำคัญ: ลำดับซ้ำ (SSR); ข้าว (Oryza ซา L.); PCR อิเล็กทรอนิกส์ (อี-PCR)

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

บทคัดย่อรวม 2414 ดิใหม่ไตรและเตตร้าเบสไพรเมอร์-SSR ที่ไม่ซ้ำซ้อนคู่คิดเป็นตำแหน่งที่ไม่ซ้ำกันเครื่องหมาย2240, ได้รับการพัฒนาและตรวจสอบทดลองข้าว (Oryza sativa L. ). ซ้ำคู่ไพรเมอร์จะมีการรายงาน 7 % (174) ของตำแหน่ง ส่วนใหญ่ (92%) ของคู่ไพรเมอร์ที่ได้รับการพัฒนาในภูมิภาคขนาบซ้ำที่สมบูรณ์แบบ≥ 24 bp ยาว ใช้วิธี PCR อิเล็กทรอนิกส์ (E-PCR) เพื่อให้สอดคล้องคู่ไพรเมอร์กับ3284 ข้าวติดใจสาธารณชนบัคและโคลน PAC (คิดเป็น 83% ของจีโนมข้าวทั้งหมด) 65% ของเครื่องหมาย SSR ตีบัคหรือ PAC โคลนที่มีอย่างน้อยหนึ่งพันธุกรรมแมปเครื่องหมายและสามารถแมปโดยการมอบฉันทะ สำหรับข้อมูลเพิ่มเติมเกี่ยวกับการทำแผนที่ตามทางพันธุกรรมและ"เครื่องหมายที่ใกล้ที่สุด" ข้อมูลพื้นฐานสำหรับการตั้งรวมของ 1825 (ที่ 81%) ของการออกแบบใหม่เครื่องหมายพร้อมโครโมโซมข้าว ห้าสิบหกเครื่องหมาย SSR (2.8%) ตีโคลนบัคที่สองหรือมากกว่าที่แตกต่างกันโครโมโซมและดูเหมือนจะเป็นสำเนาหลาย สัดส่วนที่ใหญ่ที่สุดของ SSRs ในข้อมูลชุดนี้ตรงไปที่โพลี(จอร์เจีย) ลวดลาย (36%) ตามด้วยโพลี (AT) (15%) และโพลี (CCG) (8%) ลวดลาย ที่อุดมไปด้วยไมโครมีสถานที่ซ้ำเฉลี่ยที่ยาวที่สุดในขณะที่ลวดลาย GC-ที่อุดมไปด้วยเป็นที่สั้นที่สุด ร่วมกับสระว่ายน้ำ 500 แมปก่อนหน้านี้เครื่องหมาย SSR ที่รุ่นนี้ทำให้มีจำนวนทั้งสิ้น 2,740 ทดลองยืนยันเครื่องหมายSSR ข้าวหรือประมาณหนึ่ง SSR ทุก 157 กิโลไบต์. คำสำคัญ: ลำดับที่เรียบง่ายซ้ำ (SSR); ข้าว (Oryza sativa L. ); PCR อิเล็กทรอนิกส์ (E-PCR)

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ฉันไม่เก่งภาษาอังกฤษ