Rice blast, caused by Magnaporthe o

Rice blast, caused by Magnaporthe oryzae, is a major disease of rice almost worldwide. The Chinese indica cultivar 93-11 is resistant to numerous isolates of the blast fungus in China, and can be used as broad-spectrum resistance resource, particularly in japonica rice breeding programs. In this study, we identified and mapped two blast resistance genes, Pi60(t) and Pi61(t), in cv. 93-11 using F2 and F3 populations derived from a cross between the susceptible cv. Lijiangxintuanheigu (LTH) and resistant cv. 93-11 and inoculated with M. oryzae isolates from different geographic origins. Pi60(t) was delimited to a 274 kb region on the short arm of chromosome 11, flanked by InDel markers K1-4 and E12 and cosegregated with InDel markers B1 and Y10. Pi61(t) was mapped to a 200 kb region on the short arm (near the centromere) of chromosome 12, flanked by InDel markers M2 and S29 and cosegregating with InDel marker M9. In the 274 kb region of Pi60(t), 93-11 contains six NBS-LRR genes including the two Pia/PiCO39 alleles (BGIOSGA034263 and BGIOSGA035032) which are quite close to the two Pia/PiCO39 alleles (SasRGA4 and SasRGA5) in Sasanishiki and CO39, with only nine amino acids differing in the protein sequences of BGIOSGA035032 and SasRGA5. In the 200 kb region of Pi61(t), 93-11 contains four NBS-LRR genes, all of which show high identities in protein sequence with their corresponding NBS-LRR alleles in susceptible cv. Nipponbare. Comparison of the response spectra and physical positions between the target genes and other R genes in the same chromosome regions indicated that Pi60(t) could be Pia/PiCO39 or its allele, whereas Pi61(t) appears to be different from Pita, Pita-2, Pi19(t), Pi39(t) and Pi42(t) in the same R gene cluster. DNA markers tightly linked to Pi60(t) and Pi61(t) will enable marker-assisted breeding and map-based cloning.

ผลลัพธ์ (ไทย) 1:

ข้าวระเบิด เกิดจาก Magnaporthe แห้งระดับต่าง ๆ เป็นโรคสำคัญของข้าวเกือบทั่วโลก จีน indica cultivar 93-11 จะทนต่อการแยกเชื้อราระเบิดในจีนมากมาย และสามารถใช้เป็นทรัพยากรต้านทาน broad-spectrum โดยเฉพาะอย่างยิ่งในโปรแกรมการปรับปรุงพันธุ์ข้าว japonica ในการศึกษานี้ เราระบุ และแมปสองระเบิดต้านทานยีน Pi60(t) และ Pi61(t) ในพันธุ์ 93-11 ใช้ F2 และ F3 มาข้ามระหว่างพันธุ์ไวต่อ Lijiangxintuanheigu (LTH) และพันธุ์ทน 93-11 และ inoculated กับม.แห้งระดับต่าง ๆ แยกจากต้นกำเนิดทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกัน Pi60(t) ถูกคั่นไป 274 kb บริเวณบนแขนสั้นของโครโมโซม 11 นักเครื่องหมาย InDel K1-4 และ E12 และ cosegregated มีเครื่องหมาย InDel B1 และ Y10 Pi61(t) ถูกแมปกับ 200 kb บริเวณแขนสั้น (ใกล้ centromere) ของโครโมโซม 12 นัก InDel เครื่องหมาย M2 และ S29 และ cosegregating มีเครื่องหมาย InDel M9 ในภูมิภาค 274 kb ของ Pi60(t), 93-11 ประกอบด้วย 6 ไซด์ LRR ยีนรวมทั้งสอง เปียะ/PiCO39 alleles (BGIOSGA034263 และ BGIOSGA035032) ซึ่งอยู่ใกล้กับสอง เปียะ/PiCO39 alleles (SasRGA4 และ SasRGA5) ใน Sasanishiki และ CO39 มีกรดอะมิโน 9 เท่านั้นที่แตกต่างกันในลำดับโปรตีนของ BGIOSGA035032 และ SasRGA5 ในพื้นที่ 200 kb ของ Pi61(t), 93-11 ประกอบด้วย 4 ไซด์ LRR ยีน ซึ่งทั้งหมดแสดงเอกลักษณ์สูงในลำดับโปรตีน alleles ของ LRR ไซด์ที่เกี่ยวข้องในพันธุ์ไวต่อ Nipponbare เปรียบเทียบตอบแรมสเป็คตราและตำแหน่งทางกายภาพระหว่างยีนเป้าหมายและยีน R อื่น ๆ ในภูมิภาคโครโมโซมเดียวกันระบุว่า อาจจะ Pi60(t) เปียะ/PiCO39 หรือ allele ของ ในขณะที่ Pi61(t) ปรากฏแตกต่างจาก Pita ปิตา-2, Pi19(t), Pi39(t) และ Pi42(t) ในคลัสเตอร์เดียวกัน R ยีน เครื่องหมายดีเอ็นเอที่เชื่อมโยงอย่างใกล้ชิดกับ Pi60(t) และ Pi61(t) จะทำเครื่องหมายช่วยเพาะพันธุ์และโคลนตามแผนที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 2:

ระเบิดข้าวที่เกิดจากการ Magnaporthe oryzae เป็นโรคที่สำคัญของข้าวเกือบทั่วโลก พันธุ์ indica จีน 93-11 ทนต่อไอโซเลทจำนวนมากของเชื้อราระเบิดในประเทศจีนและสามารถนำมาใช้เป็นทรัพยากรต้านทานกว้างสเปกตรัมโดยเฉพาะอย่างยิ่งใน japonica โปรแกรมการปรับปรุงพันธุ์ข้าว ในการศึกษาครั้งนี้เรามีการระบุและแมปสองยีนต้านทานระเบิด Pi60 (t) และ Pi61 (t) พันธุ์ 93-11 โดยใช้ประชากร F2 และ F3 มาจากการข้ามระหว่างพันธุ์ไวต่อ Lijiangxintuanheigu (LTH) และพันธุ์ทน 93-11 และเชื้อด้วยเอ็ม oryzae แยกจากต้นกำเนิดทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกัน Pi60 (t) ถูกคั่นด้วยไปยังพื้นที่ 274 กิโลไบต์บนแขนสั้นของโครโมโซม 11 ขนาบข้างด้วยเครื่องหมาย Indel K1-4 และ E12 และ cosegregated มีเครื่องหมาย Indel B1 และ Y10 Pi61 (t) ถูกแมปไปยังภูมิภาค 200 กิโลไบต์บนแขนสั้น (ใกล้ centromere) โครโมโซม 12 ขนาบข้างด้วยเครื่องหมาย Indel M2 และ S29 และ cosegregating กับ Indel เครื่องหมาย M9 ในภูมิภาค 274 กิโลไบต์ของ Pi60 (t) 93-11 มีหกยีน NBS-LRR รวมทั้งสองอัลลีลเพีย / PiCO39 (BGIOSGA034263 และ BGIOSGA035032) ซึ่งค่อนข้างใกล้เคียงกับทั้งสองอัลลีลเพีย / PiCO39 (SasRGA4 และ SasRGA5) ใน Sasanishiki และ CO39 มีเพียงเก้ากรดอะมิโนที่แตกต่างกันในลำดับโปรตีน BGIOSGA035032 และ SasRGA5 ในภูมิภาคกิโล 200 Pi61 (t) 93-11 มีสี่ยีน NBS-LRR ซึ่งทั้งหมดนี้แสดงให้เห็นตัวตนที่สูงในลำดับโปรตีนที่มีอัลลีลที่สอดคล้องกัน NBS-LRR พันธุ์อ่อนแอต่อ Nipponbare เปรียบเทียบสเปกตรัมการตอบสนองและตำแหน่งทางกายภาพระหว่างยีนเป้าหมายและยีนอื่น ๆ R ในภูมิภาคโครโมโซมเดียวกันชี้ให้เห็นว่า Pi60 (t) อาจเป็นเพีย / PiCO39 หรืออัลลีลของตนในขณะที่ Pi61 (t) ที่ดูเหมือนจะแตกต่างจาก Pita, Pita- 2 Pi19 (t) Pi39 (t) และ Pi42 (t) ในกลุ่มเดียวกัน R ยีน เครื่องหมายดีเอ็นเอเชื่อมโยงอย่างแน่นหนาเพื่อ Pi60 (t) และ Pi61 (t) จะช่วยให้การปรับปรุงพันธุ์เครื่องหมายช่วยและการโคลนตามแผนที่

ผลลัพธ์ (ไทย) 3:

ระเบิดข้าวที่เกิดจาก magnaporthe oryzae เป็นโรคที่สำคัญของข้าวเกือบทั่วโลก จีนผลิตพันธุ์ 93-11 ป้องกันหลายสายพันธุ์ของเชื้อราในจีนระเบิด และสามารถใช้เป็นแหล่งต่อต้านในวงกว้าง โดยเฉพาะในข้าวญี่ปุ่นโปรแกรมการปรับปรุงพันธุ์ ในการศึกษานี้เราระบุและแมปสองยีนต้านทานระเบิด pi60 ( , T ) และ pi61 ( T ) , พันธุ์93-11 ใช้ F2 และ F3 ประชากรที่มาจากข้ามระหว่างพันธุ์ที่อ่อนแอ . lijiangxintuanheigu ( lth ) และพันธุ์ต้านทาน 93-11 และหัวเชื้อกับ M . oryzae สายพันธุ์จากแหล่งกำเนิดทางภูมิศาสตร์ที่แตกต่างกัน pi60 ( T ) ได้แก่ พื้นที่ 274 KB บนแขนสั้นของโครโมโซมคู่ที่ 11 , ขนาบข้างด้วยเครื่องหมาย k1-4 INDEL และและกับ e12 cosegregated INDEL เครื่องหมายและ B1 y10 .pi61 ( t ) เป็นแมปไปยังภูมิภาค 200 KB บนแขนสั้น ( ใกล้เซนโตรเมียร์ ) ของโครโมโซมคู่ที่ 12 , ขนาบข้างด้วย INDEL เครื่องหมาย M2 และ s29 cosegregating กับ M9 INDEL และเครื่องหมาย ในเขตของ pi60 274 KB ( T )93-11 ประกอบด้วยหก nbs-lrr ยีนรวมทั้งสองเปีย / pico39 อัลลีล ( bgiosga034263 และ bgiosga035032 ) ซึ่งค่อนข้างใกล้เคียงกับสองเปีย / pico39 อัลลีล ( sasrga4 และ sasrga5 ) และซาซานิชิกิ co39 ที่มีเพียงเก้ากรดอะมิโนในโปรตีนที่มีลำดับของ bgiosga035032 และ sasrga5 . ในบางครั้งพื้นที่ pi61 ( T ) , 93-11 ประกอบด้วยสี่ nbs-lrr ยีนซึ่งทั้งหมดแสดงอัตลักษณ์ในลำดับสูงโปรตีนที่มีอัลลีลที่สอดคล้องกันของพวกเขาใน nbs-lrr ต่อพันธุ์ nipponbare . การเปรียบเทียบสเปกตรัมการตอบสนองและตำแหน่งทางกายภาพระหว่างเป้าหมายยีนและยีน R อื่น ๆ ในภูมิภาคของโครโมโซมเดียวกัน พบว่า pi60 ( T ) อาจจะเปีย / pico39 หรือของกลุ่ม ในขณะที่ pi61 ( T ) จะแตกต่างจาก Pita , pita-2 pi19 ( , T ) ,pi39 ( T ) และ pi42 ( T ) ในกลุ่ม R ยีนเดียวกัน เครื่องหมายดีเอ็นเอให้เชื่อมโยงกับ pi60 ( T ) และ pi61 ( T ) จะช่วยให้ดีเอ็นเอเครื่องหมายช่วยผสมพันธุ์ และแผนที่การใช้